收藏 分销(赏)

基于生物信息数据库分析前列腺癌组织特异性lncRNA表达及临床意义.pdf

上传人:自信****多点 文档编号:2900812 上传时间:2024-06-11 格式:PDF 页数:7 大小:3.64MB
下载 相关 举报
基于生物信息数据库分析前列腺癌组织特异性lncRNA表达及临床意义.pdf_第1页
第1页 / 共7页
基于生物信息数据库分析前列腺癌组织特异性lncRNA表达及临床意义.pdf_第2页
第2页 / 共7页
基于生物信息数据库分析前列腺癌组织特异性lncRNA表达及临床意义.pdf_第3页
第3页 / 共7页
亲,该文档总共7页,到这儿已超出免费预览范围,如果喜欢就下载吧!
资源描述

1、232前列腺癌专题基于生物信息数据库分析前列腺癌组织特异性IncRNA表达及临床意义陈平舟,许清江,林煌,黄翔,吴翔1(1.福建省立医院泌尿外科,福建福州350 0 0 4;2.福建医科大学附属南平市第一医院泌尿外科,福建南平3530 0 0)Analysis of the expression and clinical significance of prostate cancer tissue-specificIncRNAs based on bioinformatics databasesCHEN Pingzhou,XU Qingjiang,LIN Huang,HUANG Xiang,W

2、U Xiang(1.Department of Urology,Fujian Provincial Hospital,Fuzhou 350004;2.Department of Urology,NanpingFirst Hospital Affiliated to Fujian Medical University,Nanping 353000,China)ABSTRACT:Objective To explore the expression and clinical significance of prostate cancer tissue-specific IncRNAs.Method

3、s The gene differences of 492 prostate cancer tissues and 152 adjacent tissues in TCGA and GEO genomic databaseswere analyzed with bioinformatics methods.A total of 5 lncRNAs were screened out,and their specificity in prostate tissues andimpact on the prognosis of patients were analyzed.ResultsThe 5

4、 IncRNAs included PCAT14,PCA3,CTBP1-AS,DRAIC,and GPC5-AS1.PCAT14 and PCA3 were specifically expressed in prostate cancer tissues,and elevated expression was related tothe prognosis.Moreover,they were well corelated with prostate cancer-specific antigens such as KLK3,AMACR,SLC45A3,and so on.GO functi

5、on enrichment analysis and KEGG pathway enrichment analysis showed that the differential expression ofPCA3 was closely related to phagocytosis,cell recognition,defense response to bacteria,immunoglobulin complex,Golgiapparatus,antigen binding,chemokine receptor binding,white matter digestion and abs

6、orption,renin-angiotensin system andother signaling pathways,while the differential expression of PCAT14 was closely related to the activity of Golgi apparatus andion channels,renin secretion,cAMP signaling pathway,and gonadotropin secretion-related signaling pathway.Conclusion PCA3and PCAT14 are sp

7、ecifically expressed in prostate cancer tissues,not in normal tissues,which can be used as potential indicatorsfor the diagnosis of prostate cancer.KEY WORDS:prostate cancer;bioinformatics;lncRNA;PCAT14;PCA3摘要:目的研究前列腺癌组织特异性长链非编码RNA(lncRNA)表达及其临床意义。方法利用生物信息学方法深人分析TCGA及GEO基因组数据库,对数据库收录的49 2 例前列腺癌组织和15

8、2 例癌旁组织做基因差异分析,筛选出差异表达的IncRNA,并进一步分析上述IncRNA的前列腺组织特异性及对前列腺癌患者预后的影响。结果筛选出差异表达的5个IncRNA包括:前列腺相关转录因子14(PCAT14)、前列腺抗原3(PCA3)、C末端结合蛋白1-AS(CTBP1-AS)、D R A IC、G PC5-AS1。其中,PCAT14、PC A 3在前列腺癌组织中特异性表达,二者升高提示与前列腺癌预后相关,且二者与激肽释放酶相关肽酶3(KLK3)、-甲基酰基辅酶A消旋酶(AMACR)、溶质转运蛋白家族45A3(SL C45A 3)等前列腺癌特异抗原相关性好。针对PCAT14、PCA 3进

9、行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析提示:PCA3差异表达与吞噬作用、细胞识别、对细菌的防御反应、免疫球蛋白复合物、高尔基体、抗原结合、趋化因子受体结合、蛋白质消化吸收、肾素-血管紧张素系统等信号通路等密切相关;PCAT14差异表达与高尔基体、离子通道的活动相关通路,同时与肾素分泌、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、促性腺激素分泌相关信号通路等密切相关。结论PCA3、PC A T 14在前列腺癌组织中特异性表达,在正常组织中基本不表达,可以作为前列腺癌诊断的潜在指标。关键词:前列腺癌;生物信息学;lncRNA;前列腺相关转录因子14;前列腺抗原3中图分类号:R737.25前列腺癌是泌尿外科一

10、种常见的恶性肿瘤,当前我国前列腺癌的发病率及致死率呈现明显上升趋势,收稿日期:2 0 2 3-0 6-2 5基金项目:福建省科技创新联合资金项目(No.2020Y9024)通信作者:吴翔,副主任医师,硕士生导师。E-mail.:作者简介:陈平舟,硕士学位,住院医师。研究方向:泌尿生殖系肿瘤。E-mail:J Mod Urol,Vol.29 No.3 Mar.2024文献标志码:AD0l:10.3969/j.issn.1009-8291.2024.03.007应积极完善前列腺癌的防治措施,加强对于6 0 岁以上男性进行前列腺癌的筛查来保障男性的健康1-2目前前列腺癌的早期筛查诊断,很大程度上还是

11、依靠修回日期:2 0 2 3-10-0 8于血清前列腺特异性抗原(prostate specific antigen,PSA)筛查。但是随着近年来PSA正常的前列腺癌病例不断被发现,预示着单靠血清PSA检测无法筛出所有的早期前列腺癌患者3。http:/;zgmnwk.cug.top现代泌尿外科杂志长度超过2 0 ont的长链非编码RNA(lo n g n o n-coding RNA,lncRNA)的异常表达,近年来被认为与肿瘤的发生发展关系密不可分,其作为肿瘤的潜在诊断手段被广泛研究。随着科学技术的发展,学科研究日益深人,越来越多的lncRNA被证实参与包括肿瘤在内的多种疾病进程4-5。PS

12、A联合其他生物标志物例如lncRNA进行筛查,可以提高癌症诊断的特异性,并且可有效指导临床对前列腺癌患者进行危险分层,改善预后6。本研究利用公共数据库TCGA及GEO中提供的前列腺癌RNA-Seq数据,筛选潜在的前列腺癌相关lncRNA,为临床医生对前列腺癌患者的风险评估、分层治疗提供参考依据。1材料与方法1.1数据库信息对TCGA数据库收录的49 2 例前列腺癌组织和152 例癌旁组织做基因差异分析,同时结合GEO基因组数据库的芯片,筛选出差异表达的lncRNA。利用TCGA数据库分析lncRNA组织特异性、lncRNA对前列腺癌患者无疾病进展生存期(disease free surviva

13、l,DFS)的影响及与经典的前列腺癌抗原的相关性。1.2利用差异表达基因行富集分析根据前列腺相关转录因子 14(prostate cancer-associated transcrip-tion factors 14,PCAT14)、前列腺抗原 3(prostatecancergene 3,PC A 3)的表达量以第一四分位数(2 5%)和第三四分位数(7 5%)将TCGA数据库中的前列腺癌患者分为高低表达两组,使用limma R包对PCAT14及PCA3高低表达组进行差异表达分析,基于2 倍或更大的倍数变化(上调或下调)及P0.05来识别显著差异表达的基因。对差异表达的基因采用cluster

14、ProfilerR包进行GO和KEGG富集分析,基于P0.05来识别显著富集的功能与通路。2结 果2.1前列腺癌对癌旁组织的差异IncRNA分析利用GEO基因组数据库的芯片(芯片号:GSE179321)进一步分析前列腺癌对癌旁组织基因表达差异,并筛选差异基因,结果如图1A所示:其中上调最明显的10个差异基因为 OR52R1、A M A C R、C I Q T NF3-A M-ACR、PC A 3、A L D H 3B2、O R 51G 2、O R 51S1、O R 51G 1、ACSM1、O R 51E2;下调最明显的10 个差异基因为ID4、K R T 14、K R T 15、R P11-1

15、12 318.1、K R T 5、H O XA 11-AS1_3、A C 0 92 6 35.1、R L N1、NEFH、A C 0 0 0 0 35.3。基于TCGA数据库分析前列腺癌对癌旁组织基因表达差异,结果如图1B显示:其中上调最明显的2024年3月第2 9 卷第3期http:/jmurology.xjtu.edu,cn;zgmnwk.cug.top23310 个差异基因为 WFDC2、K R T 5、SC G B1A 1、G PX2、KRT13、A C T C 1、SL C 39 A 2、SER PI NA 5、SEM G 2、SEMG1;下调最明显的10 个差异基因为AC09253

16、5.5、DLX1、R PL 7 P16、O R 51E2、A R L NC1、PCA 3、PCA T 14、AMACR、A P0 0 6 7 48.1、H PN。结合上述两个数据库的差异基因数据,共筛选出了33个具有意义的差异基因,其中有PCA3、C末端结合蛋白 1-AS(C-te r m in a l b in d in g p r o te in l,CTBP1-AS)、D R A I C、PC A T 14、G PC 5-A S1 共 5 个lncRNA在前列腺癌与癌旁组织中表达有差异(图1C)。2.2差异IncRNA与前列腺癌抗原相关性分析采用TCGA数据库分析在前列腺癌组织中PCA3

17、、PCAT14与经典前列腺癌抗原激肽释放酶相关肽酶3(kallikrein related peptidase 3,KLK3)、-甲基酰基辅酶A消旋酶(Alpha-methylacyl-CoAracemase,AMACR)、溶质转运蛋白家族45A3(s o lu t e c a r r i e r s45A3SLC45A3)的相关性,结果显示P均 0.0 5,提示PCA3、PC A T 14可作为前列腺癌诊断的重要潜在生物学标志物,增加诊断的准确性及敏感性(图2)。2.3差异 IncRNA对前列腺癌患者 DFS的影响进一步分 析 PCA3、CT BP1-A S、D R A I C、PCA T

18、14、GPC5-AS15个lncRNA在前列腺癌中的潜在作用,联合GTEx数据库的正常组织样本扩大样本量分析,结果提示仅PCA3、D R A I C、PC A T 14在前列腺癌Us.癌旁组织表达差异中有显著意义(图3A)。分 析 PCA3、C T BP1-A S、D R A I C、PC A T 14、GPC5-AS1对前列腺癌患者DFS的影响结果提示:PCA3、PC A T 14与前列腺癌的预后生存相关(图3B)。通过分析5个lncRNA的组织特异性结果提示,仅有PCA3、PC A T 14在肿瘤组织中特异性表达,在正常组织中基本不表达,同时几乎仅在前列腺癌中表达,这提示PCA3、PC A

19、 T 14可能是前列腺癌极为重要的预测指标(图3C)。2.4差异基因PCA3、PC A T 14的 GO及KEGG富集分析将PCA3、PCA T 14分为高低表达组,采用TCGA数据库将PCA3、PC A T 14高低表达后差异基因进行GO的富集分析,包括生物过程(biologicalprocess,BP)、细胞组分(cellular component,CC)和分子功能(molecular function,M F),并进行KEGG富集分析。结果显示当PCA3差异表达时,吞噬作用、细胞识别、对细菌的防御反应、免疫球蛋白复合物、高尔基体、抗原结合、趋化因子受体结合等GO富集通路发生明显改变;K

20、EGG富集分析则提示PCA3表达差异与蛋白质消化吸收、肾素-血管紧张素系统等信号通路密切相关(图4A)。当PCAT14差异表达时,GO功能主要富集于高尔基体、离子通道的活234动相关通路;KEGG富集分析提示PCAT14与肾素分泌、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,GroupExpressionAMACR0CIQTNF3-AMACRCENOmalGroupTumorPCA3ALDH3B2OR51G2OR51S1OR51G1ACSMIOR51E21D4KRT14KRT15RP11-112318.1KRT5HOXAIl-ASI_3AC092635.1RLN1

21、NEFHAC000035.3GSE179321TCGA25733InCRNA:PCA3CTBPI-ASDRAICPCAT14GPCS-AS1A:采用GSE179321芯片分析前列腺癌 s.癌旁组织差异基因;B:采用TCGA数据库分析前列腺癌Us.癌旁组织差异基因;C:采用TCGA及GSE179321芯片筛选的差异基因进行交集寻找潜在的IncRNA。PCAT14:前列腺相关转录因子14;PCA3:前列腺抗原3;CTBP1-AS:C末端结合蛋白1-AS。p-value=o864J Mod Urol,Vol.29 No.3 Mar.2024cAMP)信号通路、血管平滑肌收缩、库欣综合症、促性腺激素分

22、泌相关信号通路密切相关(图4B)。GroupOR52R1290145920样本量332图1前列腺癌对癌旁组织的差异IncRNA分析p-valu86WFDC2ExpressionKRTS2Group0SCGBIAINormalTumorGPX2KRT13ACTC1SLC39A2SERPINA5SEMG2SEMG1AC092535.5DLXIRPL7P16OR51E2ARLNCIPCA3PCAT14AMACRAP006748.1HPN290125GSE179321TCGA3491p-value=o864B22209101112133.14151og2(KLK3 TPM)10p-value=1.7e

23、-058642910 1112 13 14 15log2(KLK3 TPM)A:PCA3与KLK3表达相关性;B:PCA3与AMACR表达相关性;C:PCA3与SLC45A3表达相关性;D:PCAT14与KLK3表达相关性;E:PCAT14与AMACR表达相关性;F:PCAT14与SLC45A3表达相关性。PCA3:前列腺抗原3;PCAT14:前列腺相关转录因子14;KLK3:激肽释放酶相关肽酶3;AMACR:-甲基酰基辅酶A消旋酶;SLC45A3:溶质转运蛋白家族45A3。0A1080642.图2 育前列腺癌组织中差异IncRNA与前列腺癌抗原相关性分析http:/jmurology.xjt

24、u.edu,cn;zgmnwk.cug.top04681012?log2(AMACRTPM)-valuee=5.9e-104681012?log2(AMACRTPM)56789910.111og2(SLC45A3TPM)10p-value=0.000528642OL5678910111og2(SLC45A3TPM)现代泌尿外科杂志PCA3108642080.6存10.40.2OE0PCA3肿瘤组织正常组织201002024年3月第2 9 卷第3期CTBP1-AS4320EPRAD1.00.8$0.6存10.40.2oE0GPC5-AS11.0LoWGPC5-ASITPMHighGPC5-ASI

25、TPMLogrankP-0.064HR(high)-1.5.0.8P(HR)-0.065n(high)-244n(low)-24550100DFS/月235前列腺癌组织(n=492)1癌旁组织(n=152)DRAICPCAT14810686442200EPRADPRADPCA3LoWPCA3TPMHighPCA3TPMLogrankP-0.011HR(high)-0.58PCHR)-0.013n(high)-246m(low)-24650100DFS/月1.00.8$0.6存0.40.2oE1500700肿瘤组织60正常组织501403020100GPC5-AS18.6.20PRADPCAT1

26、41.0LOWPCAT14TPMHighPCAT14TPMLogrank P-0.058HR(bigh)-0.670.8P(HR)-0.06n(high)-246nflow)-246$0.6存10.40.2F0E1500CTBP1-ASLOWCTBPI-ASTPMHighCTBPI-ASTPMLogrankP-0.14.HR(high)-1.4.P(HR)-0.15n(high-246-n(low)-246150DFS/月PCAT14PRAD50100DFS/月1.00.80.6存0.40.20E100150150DRAICLOWDRAICTPMHighDRAICTPMLogrankP=0.4

27、9HR(high)-0.86P(HR)-0.49n(high)-246n(loW)-246050DFS/月GPC5-AS10.5肿瘤组织0.4正常组织0.30.20.1100150肿瘤类型0.5F0.40.20.1A:结合TCGA及GTEx正常组织数据分析5个潜在IncRNA在前列腺癌组织Us.癌旁正常组织的差异表达;B:采用TCGA数据库分析5个潜在IncRNA在前列腺癌中DFS的差异;C:采用TCGA数据库观察5个1ncRNA在人体不同器官的肿瘤组织和配对正常组织的基因表达谱。PCAT14:前列腺相关转录因子14;PCA3:前列腺抗原3;CTBP1-AS:C末端结合蛋白1-AS;*P 0.

28、0 5。图3考差异IncRNA对前列腺癌患者无疾病进展生存期(DFS)、组织特异性的影响http:/jmurology.xjtu.edu,cn;zgmnwk.cug.top肿瘤类型CTBP1-AS肿瘤组织正常组织REAC肿瘤类型肿瘤类型DRAIC20r肿瘤组织15正常组织10肿瘤类型236J Mod Urol,Vol.29 No.3 Mar.2024PhagocytosisrecognitionCell recognitionDefense response to bacteriumPhagocytosis,engulfmentPlasmamembraneinvagination-Comple

29、ment activation,classicalpathwayMembrane invaginationHumoral immuneresponseHumoral immuneresponsemediatedbycirculating immunoglobulinComplementactivationAntigen binding-Immunoglobulin receptor bindingChemokinereceptorbindingProtease bindingCCR chemokinereceptor bindingCarbohydrate:cation symporterac

30、tivityExopeptidaseactivityRacemase andepimeraseactivityHeparan sulfate proteoglycan bindingExtracellularmatrix structuralconstituentMelaninbiosyntheticprocessMelaninmetabolic process.SecondarymetabolicbiosyntheticprocessNeural retinadevelopmentNegativeregulation,ofaxon extensioninvolvedinaxonguidanc

31、eRegulation ofaxon extension inyolvedinaxonguidanceRegulationofanatomical structuresizeAxonextension involvedin.axonguidanceNeuron projectionextension inyglvedinneuron projectionguidanceCellfate specification.Gatedchannel activityAminoacyltransferaseactivityIonchannel activityGlucuronosyltransferase

32、activityCationchannelactivityChannel activityPassivetransmembranetransporteractivityLigand-gated cation channel activity-longated channel activity-UPD-glycosyltrans ferase activity-A:前列腺抗原3(PCA3)高低表达后差异基因进行GO、K EG G 富集分析;B:前列腺相关转录因子14(PCAT14)高低表达后差异基因进行GO、K EG G 富集分析。BP:生物过程;CC:细胞组分;MF分子功能。Immunoglo

33、bulincomplex,circulating-ImmunoglobulincomplexCountBloodmicroparticle-福External sideofplasmamembrane567Golgi lumen-P-valueCollagen trimer00.010.020.030.040.050.040.06基因比率0.02 0.04 0.06 0.08 0.10 0.12基因比率0.040.060.08-0.100.12基因比率0.04.0.06基因比率图4差异基因PCA3、PCA T 14的GO及KEGG富集分析http:/;zgmnwk.cug.topCount6P

34、-value0.01Keratinfilament-0.020.03Lamellar body0.040.05Collagen-containing extracellularmatrixApicalplasmamembrane-0.08Proteindigestion andabsorptionRenin-angiotensin system-CountMucin typeO-glycan biosynthesis-0ECM-receptorinteraction214P-value0F0.010.02F0.030.040.05Count3456780P-value00.010.020.03

35、0.040.05Count723456P-value00.010.020.030.040.050.080.100.020.04 0.06 0.080.10 0.12基因比率BilesecretionMalariaProximal tubulebicarbonatereclamationDrug metabolism-cytochromeP450TyrosinemetabolismTGF-beta signaling pathwayCollagen-containing extracellularmatrixGolgi lumenDopaminergic synapse-Serine-typep

36、eptidasecomplex-L-typevoltage-gated calcium channelcomplexChromatoid bodyLow-density lipoprotein particle-Anchored componentofsynapticvesiclemembraneNeuronal dense corevesiclePhospholipid-translocatingATPasecomplex0.020.040.060.08基因比率Renin secretioncAMP signalingpathwayVascular smoothmusclecontracti

37、on-Cushing syndrome-GnRHsecretioncGMP-PKGsignaling pathwayCortisol synthesis andsecretionAxon guidanceInsulin secretionBilesecretion-Count23456P-value00.010.020.03F0.040.050.020.040.060.08基因比率0.060.08 0.100.12基因比率Count-2345.6P-value0-0.010.02-0.03-0.04L0.05Count2.02.53.03.54.0P-value0.010.020.030.04

38、0.05B现代泌尿外科杂志3讨 论前列腺癌是一种临床高发的恶性肿瘤,是男性癌症死亡的第3大原因,严重危害男性健康门。2017年全球疾病负担报告中指出前列腺癌的新发病例高于130 万人,死亡病例41.6 万人。目前临床上采用PSA进行前列腺癌筛查,但近些年PSA正常的人群前列腺癌发病率明显升高。血清PSA水平容易受前列腺体积、药物、射精情况、膀胱镜、导尿、直肠指诊、前列腺穿刺活检等因素影响。特别是 PSA处于正常水平的前列腺癌,与良性前列腺增生较难分别,可能造成误诊,从而延误患者的最佳治疗时机。如果早期确诊并及时治疗,可显著延长患者的生存,所以临床急需找到除了PSA以外的快速检验手段来辅助诊断早

39、期前列腺癌或PSA正常的前列腺癌。近年来,长度超过2 0 0 nt的lncRNA的异常表达,被认为与肿瘤的发生发展关系密切,其作为肿瘤的潜在诊断及治疗靶点被广泛研究4-5.8。1ncRNA在肿瘤生物学的调节过程中具有关键作用,与肿瘤的复发、转移和预后密切相关。然而目前研究探讨lncRNA在前列腺癌中作为临床预测指标的报道仍有很大空白。本文利用生物信息数据分析出PCA3、CTBP1-AS、D R A I C、PC A T 14、G PC 5-A S1 等 5 个IncRNA在前列腺癌us.癌旁组织表达有差异。同时对上述5个lncRNA组织特异性进行分析,结果提示PCA3、PC A T 14 在肿

40、瘤组织中特异性表达,在正常组织中基本不表达,探讨在前列腺癌中lncRNA的表达变化,为后期临床肿瘤靶向治疗提供依据。目前关于前列腺癌诊断的生物标志物主要有:PSA、A M A CR、SL C45A 3等10-12。PSA是临床上广泛应用的前列腺癌特异性的生物标志物,由前列腺上皮细胞表达并分泌到精液中,灵敏度高且特异性好,与直肠指检联合用于前列腺癌诊断。KLK3为PSA的编码基因13-14。AMACR参与脂肪酸和胆汁酸中间产物的氧化,是一种线粒体及过氧化物酶体酶。约80%的前列腺癌患者在前列腺上皮细胞上出现AMACR过表达,通过免疫组化检测AMACR可鉴别前列腺良性肿瘤和前列腺癌15。SLC45

41、A3主要在前列腺上皮细胞的高尔基体中表达,用于区分其他肿瘤类型和转移性前列腺癌。SLC45A3可能在PSA阴性前列腺肿瘤中表达,因此联合检测这些肿瘤标志物可以增加识别前列腺癌转移的灵敏度16。PCA3、PCA T 14在前列腺癌组织中特异性表达,2024年3月第2 9 卷第3期http:/;zgmnwk.cug.top237二者与目前经典的肿瘤标志物前列腺抗原之间是否存在相关性?本文通过利用公共数据库 TCGA,对PCA3、PC A T 14与经典前列腺癌抗原KLK3、AMACR、SL C 45A 3进行相关性分析,结果显示P均0.05,故二者可作为前列腺癌诊断潜在生物学标志物,极大增加前列腺

42、癌诊断的准确性及敏感性。由于PCA3在前列腺癌组织中的表达明显高于非肿瘤性前列腺组织或其他组织,所以只要能检测到前列腺肿瘤细胞的样本中一般都能检出PCA3,例如前列腺癌患者的前列腺液、精液、前列腺细胞组织、尿液及血液中。相比于前列腺增生组织,PCAT14在前列腺肿瘤组织中表现为高灵敏度和高特异度,表明PCAT14是一个很好的诊断生物标志物。一系列实验证明PCAT14 的表达与前列腺癌患者预后、无肿瘤进展生存期、无肿瘤转移生存期相关17。本文主要利用生物信息学对前列腺癌的相关数据库数据进行了分析,但未使用本中心的前列腺癌患者的样本进行相应指标的验证,因此在后续的研究中,我们将进一步临床验证本文预

43、测的相关前列腺癌生物标志物。此外,文中的生物标志物仅仅针对的是前列腺癌的肿瘤标本,缺少对前列腺癌患者及健康人群血液及尿液中相关指标的检测及数据分析,因此在后续研究中,我们将进一步开展血液及尿液相关指标的研究,拟为前列腺癌的诊断及预后判断提供可能的生物学标志物,以期弥补PSA正常的前列腺癌诊断的缺陷。本文利用生物信息数据库分析出PCA3、CTBP1-AS、D R A I C,PC A T 14,G PC 5-A S1 5 个 lncRNA在前列腺癌与癌旁组织表达有差异。组织特异性分析结果提示,PCA3、PC A T 14在肿瘤组织中特异性表达,在正常组织中基本不表达,且二者升高提示与前列腺癌预后

44、相关,同时二者与KLK3、A M A C R、SLC45A3等前列腺癌特异抗原相关性好,可作为前列腺癌诊断潜在指标。此外,富集分析提示PCA3差异表达与吞噬作用、细胞识别、对细菌的防御反应、免疫球蛋白复合物、高尔基体、抗原结合、趋化因子受体结合、蛋白质消化吸收、肾素-血管紧张素系统等信号通路密切相关;PCAT14差异表达与高尔基体、离子通道的活动、肾素分泌、cAMP信号通路、促性腺激素分泌相关信号通路等密切相关。综上所述,PCA3、PCAT14可以作为除PSA外的前列腺癌潜在筛查指标。(下转第2 6 7 页)现代泌尿外科杂志5J LIU CX,CHEN LL.Circular RNAs:cha

45、racterization,cellularroles,and applicationsLJJ.Cell,2022,185(12):2016-2034.6J ZHOU H,ZHENG XD,LIN CM,et al.Advancement and prop-erties of circular RNAs in prostate cancer:an emerging and com-pelling frontier for discoveringJJ.Int J Biol Sci,2021,17(2):651-669.7J WANG Z,BENOIT G,LIU J,et al.Structur

46、e and function ofNURR1 identifies a class of ligand-independent nuclear receptorsJ.Na t u r e,2 0 0 3,42 3(6 9 39):555-56 0.8J SHANG W,LIANG X,LI S,et al.Orphan nuclear receptorNURR1 promotes Helicobacter pylori-associated gastric carcino-genesis by directly enhancing CDK4 expression J.eBioMedi-cine

47、,2020,53:102672.9 INAMOTO T,CZERNIAK BA,DINNEY CP,et al.Cytoplasmicmislocalization of the orphan nuclear receptor NURRl is a prog-nostic factor in bladder cancerJJ.Cancer,2010,116(2):340-346.1oJ WANG Z,WU D,NG CF,et al.Nuclear receptor profiling inprostatospheroids and castration-resistant prostate

48、cancer JJ.Endocr Relat Cancer,2018,25(1):35-50.11 CHEN H,LI Y.Circular RNA hsa_circ_0000915 promotes prop-ranolol resistance of hemangioma stem cells in infantile haeman-giomasJJ.Hum Genomics,2022,16(1):43.12J GENG X,ZHANG Y,LI Q,et al.Screening and functional(上接第2 37 页)参考文献:1J PARKER C,CASTRO E,FIZ

49、AZI K,et al.Prostate cancer:ESMO clinical practice guidelines for diagnosis,treatment andfollow-upJJ.Ann Oncol,2020,31(9):1119-1134.2 LIJ,XU C,LEE HJ,et al.A genomic and epigenomic atlas ofprostate cancer in Asian populations JJ.Nature,2020,580(7801):93-99.3 THOMPSON IM,PAULER DK,GOODMAN PJ,et al.Pr

50、eva-lence of prostate cancer among men with a prostate-specificantigen level or=,4.O ng per milliterJJ.N Engl J Med,2004,35022):2 2 39-2 2 46.4J CHEN Y,LI Z,CHEN X,et al.Long non-coding RNAs:fromdisease code to drug roleJJ.Acta Pharm Sin B,2021,11(2):340-354.5J BHAN A,SOLEIMANI M,MANDAL SS.Long non-

展开阅读全文
相似文档                                   自信AI助手自信AI助手
猜你喜欢                                   自信AI导航自信AI导航
搜索标签

当前位置:首页 > 学术论文 > 论文指导/设计

移动网页_全站_页脚广告1

关于我们      便捷服务       自信AI       AI导航        获赠5币

©2010-2024 宁波自信网络信息技术有限公司  版权所有

客服电话:4008-655-100  投诉/维权电话:4009-655-100

gongan.png浙公网安备33021202000488号   

icp.png浙ICP备2021020529号-1  |  浙B2-20240490  

关注我们 :gzh.png    weibo.png    LOFTER.png 

客服