微生物进化与分类学.doc

第十章 微生物进化与分类学一、名词解释1. 菌株； 2.GC比 3.种 4.模式菌株 5.亚种或变种 6.型 7.菌株或品系8培养物 9. 群 10. 系统发育树 11.分类单元 12. 数值分类 二、填空1、微生物分类学的三个具体任务为 、 、 。2、大量资料表明：功能重要的分子或功能重要的分子区域比功能不重要的大分子或大分子区域进化变化的 。3、微量多项试验鉴定系统，实际上是一类专门设计制作的 特征检测卡。4、微生物种的学名由 和 两部分构成。5、伯杰氏系统细菌学手册第一版分 卷出版，它将原核生物分成 组。6、分类学的内容涉及3个互相依存又有区别的组成部分，即 、命名和 。7、如果相似性系数（SAB）等于1，说明所比较的两菌株rRNA序列 ，若SAB值小于0.1，则表明两菌株亲缘关系 。8、API/ATB是微量多项试验鉴定系统，它包括众多的 ，共计有几百种生理生化反应，可鉴定几乎所有常见的 。9、微孔滤膜菌落计数板是一种可携带的检测水中大肠菌数的大肠菌测试卡，适于 工作和 使用，因可以放在人体内衣口袋中培养。10、伍斯用寡核苷酸序列编目分析法对微生物的16SrRNA序列进行比较后，提出将生物分成三界（域）： 、 、和 。11、伍斯为了避免把古细菌也看作是细菌的一类，他又把三界（域）改称为： 、 、 和 。并构建了三界（域）生物的系统树。7、根据在分类过程中采用特征的种类，通常把微生物分类分成4个不同的水平： 、 、 和 。8、 简单来讲，数值分类过程主要可分为五步，即 、 、 、 和 。9、 自20世纪60年代以来，核酸分析已经成为微生物、尤其是原核微生物分类不可缺少的指标，主要包括 、 和 。10、 1987年国际系统细菌学委员会规定，DNA同源性( )%，杂交分子的热解链温度相差（ Tm） 为细菌种的界限。11、 关系密切的生物应该具有相似的细胞蛋白质。蛋白图谱的比较可以采用 或 ，常用的方法是 。12、微生物种以上的分类单位从小到大依次为: 、 、 、 、 、 和 。13、 亚种以下具有相同或相似特性的一个或一组菌株称为“型”,如：具有特殊的生物化学或生理特性的菌株群，被称为 型；能产生特殊化学物质的菌株群,被称为 型；具有特殊培养性状的菌株群,被称为 ；具有特殊抗原特征的菌株群，被称为 。14、如果某一细菌没有种名，或不特指某一个种时，可在属名后加sp.或spp.表示，它们分别代表 缩写的单数或复数，例如Pseudomonas sp.表示 ，Micrococcus spp.表示 。15、按照“国际命名法规”，新的微生物分类单元必须在国际公认的刊物发表才能有效，如细菌新分类单元必须在 杂志发表，才被学术界承认。新的分类单元在发表时要指定新分类单元的 ，分类单元的模式培养物要存放在国际供认的菌种保藏机构，以便科学界的交流使用。16 、原核生物包括 域与 域，前者目前已记载 种，后者截止2000年已记载 种。三、选择1、伯杰氏系统细菌学手册第二版把葡萄球菌属和微球菌属分别放在不同的门中，最可能的原因是（ ）。（1）生理生化特征不同 （2）DNADNA杂交同源性不同（3）革兰氏染色反应不同 （4）G+C含量和rRNA序列不同2、如果需要查阅枯草芽孢杆菌及相关种的分类学资料，并假定伯杰氏系统细菌手册第二版已经全部出版，你将选择该书的（）。（1）第一卷 （2）第三卷 （3）第四卷 （4）第五卷3、血清学试验，尤其在医学细菌的分类鉴定中的重要意义，但它主要用于划分（ ）。（1）种内血清型 （2）种间血清型 （3）属间血清型 （4）属以上血清型4、根据你所掌握的知识，认为形态学特征学特征在以下几类微生物中的哪严分类鉴定中显得更加重要？（ ）（1）病毒 （2）细菌 （3）酵母菌 （4）霉菌5、在下列4种细菌中，哪一种最有可能属于伯杰氏系统细菌学手册第一版第5组“兼性厌氧的革兰氏阴性杆菌”？（ ）（1）梅毒密螺旋体 （2）枯草芽孢杆菌 （3）大肠埃希氏菌 （4）金黄色葡萄球菌6、如果你在实验室用牛肉膏蛋白胨培养基和常规平板法分离到一株不产芽孢、始终呈杆状的细菌，只要进行以下哪一组试验就可以确定它属于33组中的某一组？（ ）（1）革兰氏染色和厌氧生长试验 （2）革兰氏染色、光能和化能自养生长试验（3）革兰氏染色和运动性试验 （4）革兰氏染色、好氧、厌氧和兼性厌生长试验7、现在自动化程度最高、功能最多的微生物专用检测仪是（ ）（1）气相色谱仪 （2）高压液相色谱仪（3）自动微生物检测仪 （4）激光拉曼光谱仪8、目前微生物的快速检测和自动化分析中，广泛地采用的免疫学技术是（ ）。（1）DNA探针 （2）聚合酶链反应技术（3）DNA芯片 （4）酶联免疫吸附测定法四、是非题1、“大肠埃希氏菌”才是俗称“大肠杆菌”的学名。2、所谓“模式菌株”通常是指一个细菌的种内了具代表的菌株。3、两种细菌的G+C含量相近，说明它们亲缘关系近，反之，G+C含量差别大说明它们亲缘关系远。4、DNADNA杂交主要用于种、属水平上的分类研究，而进行亲缘关系更远（属以上等级）分类单元的比较，则需进行DNArRNA杂交。5、数值分类由于采用了先进的计算想技术，减少了大量的特征测定的实验操作，所以它是比较科学的现代微生物系统分类方法。6、物理、化学、材料、电子信息等科学和技术领域通常使用的分析、测量物质成分、结构、性能和各种信息的自动化的精密仪器和设备，几乎都能用于微生物的快速鉴定和自动化分析。7、“吹口气查胃病”的原理是：幽门螺杆菌具有人体不具有的尿素酶，受检者口服13C标记的尿素，如有该菌感染，则尿素被尿素酶分解生成NH3和13CO2，用质谱仪能快速灵敏地测出受检者呼气中13CO2的量，准确地鉴定是否被幽门螺杆菌感染。8、亚种名为三元式组合，即由科名、属名加词和亚种名加词构成。9、现代微生物生理生化特征的比较也是对微生物基因组的间接比较，加上测定生理生化特征比直接分析基因组要容易得多，因此生理生化特征对于微生物的系统仍然是有意义的。10、蛋白质氨基酸顺序的进化速率大体上是恒定的，但功能不同的蛋白质常以不同的速率进化。功能重要的分子序列或序列区域往往进化变化速率高。五、简答题1、分类学有哪些组成部分？2、微生物有哪些常用的分类鉴定依据和方法？3、蛋白质和核酸分子被用作微生物进化谱系分析所依据的原理是什么？4、为什么16S（18）rRNA目前被挑选作为研究微生物进化的主要对象？5、试述古生菌和细菌的主要区别。6、为什么在从事微生物的工作中不仅要注意种名还要注意菌株名称？7、 为什么真核生物进化成功后，并不能取代原核生物？8、作为衡量生物物种间真正进化关系的生物进化时钟的生物大分子必须满足哪些条件？六、论述题1、外单位送来一个细菌培养物要求鉴定，你如何将其鉴定到种？2、现代微生物分类主要根据基因型特征来建立分类单元，基因型特征的测定通常都需要高新的复杂技术，而以实用为目的菌种鉴定却希望采用更易于测定的表型特征，你认为如何解决这一矛盾？3、为什么人们推测在生物进化过程中有一个RNA生命时代的存在？4、在生物进化研究中，选择rRNA基因序列作为进化时钟的主要依据是什么？5、通过rRNA基因序列的研究，提出了哪些主要的进化现象，与传统的生物进化观点有什么主要区别？6、采用哪些分析指标推测微生物的系统发育关系？简述测定各种指标的实验原理和步骤。7、何谓微生物的学名？试举一具体细菌种名说明之。