收藏 分销(赏)

基于宏基因组学测序技术分析3个轮次高温大曲微生物群落.pdf

上传人:自信****多点 文档编号:2341165 上传时间:2024-05-28 格式:PDF 页数:8 大小:4.26MB
下载 相关 举报
基于宏基因组学测序技术分析3个轮次高温大曲微生物群落.pdf_第1页
第1页 / 共8页
基于宏基因组学测序技术分析3个轮次高温大曲微生物群落.pdf_第2页
第2页 / 共8页
基于宏基因组学测序技术分析3个轮次高温大曲微生物群落.pdf_第3页
第3页 / 共8页
亲,该文档总共8页,到这儿已超出免费预览范围,如果喜欢就下载吧!
资源描述

1、220 2023,Vol.44,No.16 食品科学 生物工程基于宏基因组学测序技术分析3 个轮次 高温大曲微生物群落王国峥,陈 笔,卢建军,陈良强,张巧玲,罗 寒*(贵州茅台股份有限公司,贵州省酿酒工程技术研究中心,贵州 遵义 564501)摘 要:使用宏基因组测序技术对3 个轮次大曲微生物群落进行解析,获取其群落结构及功能组成,旨在为提升大曲发酵质量提供理论依据。结果表明:25 个大曲测序样品平均组装长度为100.5 Mb,共检测到基因目录 43.9万 个,鉴定出5 104 个物种。物种注释结果显示,Kroppenstedtia eburnea为优势菌种,多种芽孢杆菌共同为亚优势种,下沙与

2、1轮次群落多样性水平无显著差异,造沙群落多样性高于其他轮次;功能基因注释结果显示,大曲中最丰富的是代谢相关基因,其中最具代表为碳水化合物代谢与氨基酸代谢;3 个轮次中,造沙大曲糖苷水解酶相关基因数最多且相关酶活力最高。上述结果表明,3 个轮次大曲群落结构与功能组成基本一致,但在功能表现上造沙与其余2 个轮次存在差异。关键词:高温大曲;酱香型白酒;宏基因组;微生物群落Analysis of Microbial Communities in Three Rounds of High-temperature Daqu Using Metagenomic TechnologyWANG Guozheng

3、,CHEN Bi,LU Jianjun,CHEN Liangqiang,ZHANG Qiaoling,LUO Han*(Kweichow Moutai Distillery Co.Ltd.,Kweichow Brewing Engineering Technology Center,Zunyi 564501,China)Abstract:Metagenomic sequencing technology was used to analyze the microbial community structures and functional composition in three round

4、s of Daqu.The results showed that the average assembly length of the 25 samples was 100.5 Mb,a total of 439 000 gene catalogs were detected,and 5 104 species were identified.The results of species annotation showed that Kroppenstedtia eburnea was the dominant species,and the subdominant species were

5、 multiple Bacillus species.There was no significant difference in microbial community diversity between samples from the first feeding(Xiasha)and those from the first round of fermentation,and the-diversity of the microbial community in samples from the second feeding(Zaosha)was higher than that in

6、samples from Xiasha and the first round of fermentation.The results of gene functional annotation showed that the most abundant genes in Daqu were related to metabolism,while the most representative genes were related to carbohydrate metabolism and amino acid metabolism.The number of glycoside hydro

7、lase genes in Zaosha samples was largest and the activities of related enzymes were highest.The above results indicated that the microbial community structures and functional composition in the three rounds of Daqu were basically consistent,whereas there was a difference in functional performance be

8、tween the Zaosha samples and the other two samples.Keywords:high-temperature Daqu;Jiang-flavor baijiu;metagenomics;microbial communityDOI:10.7506/spkx1002-6630-20220804-054中图分类号:TS261.1 文献标志码:A 文章编号:1002-6630(2023)16-0220-08引文格式:王国峥,陈笔,卢建军,等.基于宏基因组学测序技术分析3 个轮次高温大曲微生物群落J.食品科学,2023,44(16):220-227.DOI:

9、10.7506/spkx1002-6630-20220804-054.http:/WANG Guozheng,CHEN Bi,LU Jianjun,et al.Analysis of microbial communities in three rounds of high-temperature Daqu using metagenomic technologyJ.Food Science,2023,44(16):220-227.(in Chinese with English abstract)DOI:10.7506/spkx1002-6630-20220804-054.http:/收稿日

10、期:2022-08-04第一作者简介:王国峥(1994)(ORCID:0000-0003-1920-4380),男,助理工程师,硕士研究生,研究方向为白酒酿造微生物。E-mail:*通信作者简介:罗寒(1983)(ORCID:0000-0001-7948-3778),男,助理工程师,学士,研究方向为白酒酿造与品质。E-mail:生物工程 食品科学 2023,Vol.44,No.16 221曲是我国传统白酒酿造的重要原料,曲研究对于酿酒乃至整个传统酿造行业都有十分重要的意义1-2。酱香型白酒风味复杂,这与其发酵过程中曲用量高密切 相关2,其生产可分为下沙、造沙、17轮次,每个轮次都需要添加大量曲

11、粉作为糖化剂与发酵剂,但各轮次生产因所处的环境气候不同可能导致大曲微生物群落结构与功能出现差异3。下沙、造沙轮次是酱香型白酒生产的投粮阶段,高粱糊化程度较低4,1轮次在9 个轮次中环境均温最低、环境湿度最低5,这些不利因素都会阻碍发酵进程,因此大曲的功能在前期轮次的生产中更为重要,不仅直接决定发酵的进程,也关系到后期轮次微生物代谢产物、前体物质及香味物质的积累与形成6。因此本研究选取这3 个生产轮次的生产用曲作为实验对象,进行微生物群落结构及功能分析。随着现代分子生物学技术的发展,高通量测序技术逐渐被用于食品微生物的研究中7-8,旨在全面揭示微生物群落结构与功能信息。目前对酿造微生物菌群结构及

12、功能研究大多采用扩增子测序技术9-15,例如Wang Li等15 利用16S rRNA扩增子测解析茅台酒发酵过程中细菌群落动态变化。然而扩增子测序得到的分子信息较为简单16,难以精细解析大曲微生物群落特征,而宏基因组学测序技术则是通过获取样品中全部基因序列解析微生物群落信息方法,可以准确获取大量生态信息数据。宏基因组测序已成为研究微生物多样性和群落特征的重要手段17,相比于高通量测序技术,宏基因组测序技术可以更为全面挖掘出微生物基因组信息,便于研究者挖掘菌群的生物多样性、群落结构、功能特性和相互关系18。现已有一些学者将宏基因组测序应用于酿造微生物群落的研究当中18-23,其中也可见一些高温大

13、曲的研究,例如 Fan等18利用宏基因组测序技术对汾酒大曲进行全面解析,发现乳酸菌是群落中的主要物种,而酿酒酵母仅为群落总数的0.005%,Yang Yang等19通过宏基因组测序技术解析了中温大曲发酵过程中微生物群的分类和功能谱。目前还鲜有学者利用宏基因组测序技术对不同轮次的高温大曲群落进行比较研究,导致对高温大曲微生物群落的认识的短缺。因此本研究基于宏基因组学技术对3 个轮次(下沙、造沙、1 轮次)高温大曲群落进行精细解析,挖掘其群落结构与功能,并对不同轮次大曲间结构和功能差异进行分析,旨在为高温大曲的品质提升及生产优化提供理论依据。1 材料与方法1.1 材料与试剂大曲样本于2021202

14、2年在贵州茅台酒厂采集,参考并优化麻颖垚等23-24采样方法,分别在下沙(XS)、造沙(ZS)、1轮次(YLC)取得25 个大曲样本,其中下沙轮次7 个(采样时间为10月5日10月30日),造沙轮次9 个(采样时间为11月10日12月10日),1轮次9 个(采样时间为12月25日1月20日),装入无菌自封袋中。样品采集之后置于冰盒回实验室后迅速放 入80 冰箱保存。氢氧化钠、氯化钠、邻苯二甲酸氢钾、可溶性淀粉、己酸、无水乙醇、葡萄糖 上海阿拉丁试剂有限公司;E.Z.N.A.Soil DNA Kit 美国Omega BioTek公司;琼脂糖 生工生物工程(上海)股份有限公司;FastPfu Po

15、lymerase 北京全式金生物技术有限公司;AxyPrep DNA Gel Extraction Kit 美国Axygen公司。1.2 仪器与设备NanoDropTM 8000超微量分光光度计、VeritiPro聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)仪 美国Thermo Fisher Scientific公司;ExperionTM全自动电泳系统 美国Bio-Rad公司;高速台式冷冻离心机 湖南湘仪仪器有限公司;MGISEQ-2000测序仪 深圳华大智造公司。1.3 方法1.3.1 大曲样品DNA提取与检测取2.0 g大曲样品置于50 mL离心管中,加入2

16、0 mL磷酸盐缓冲液(phosphate buffered saline,PBS),涡旋混匀10 min,然后2 000 r/min、4 离心5 min,将上清液转移至100 mL离心管中。收集到的上清液于12 000 r/min、4 离心10 min,沉淀用10 mL PBS洗涤一次,再2 000 r/min、4 离心10 min,收集沉淀,最后将收集的沉淀用1mL的PBS重悬备用。重悬的沉淀采用E.Z.N.A.Soil DNA Kit进行提取,详细的实验步骤参照该试剂盒说明书,提取的DNA用50 L RNA free water溶解,经1%琼脂糖凝胶电泳和分光光度计检测浓度及纯度。按照上述

17、步骤重复提取大曲样品总DNA 3 次,将3 次提取的DNA样品混合并混匀,于80 保存备用。1.3.2 宏基因组测序文库构建:取1 g大曲基因组DNA,使用超声波仪打断,打断后的样品用磁珠进行片段选择,使得样品条带集中在200400 bp左右;修复双链cDNA末端,并在3末端加上A碱基并对连接产物进行扩增,扩增产物用磁珠进行产物纯化回收;将回收后的扩增产物变性为单链,接着在环化反应体系中充分混匀适温反应一定时间,可得到单链环形产物,消化掉未被环化的线性DNA分子后,即得到最终的文库并进行检测。DNBSEQ平台测序:检测合格文库安排上机测序(DNBSEQ),单链环状DNA分子通过滚环复制形成一个

18、包含多个拷贝的DNA纳米球,接着将得到的DNB采用高密度DNA纳米芯片技术,加到芯片上的网状小222 2023,Vol.44,No.16 食品科学 生物工程孔内,通过联合探针锚定聚合技术进行测序(送深圳华大基因测序),测序数据已上传至NCBI(项目编号:PRJNA884532)。1.3.3 大曲酶活力测定采取二硝基水杨酸法25,分别对大曲糖化酶与-淀粉酶活力进行检测。1.3.4 生物信息分析测序数据质控:剔除含有10%不确定碱基(N碱基)的reads;剔除含有测序接头序列的reads(有15 个碱基或更长区域比对到接头序列);剔除含有50%以上低质量碱基(Q20碱基)的reads。序列拼接组装

19、:使用Megahit拼接软件对Clean Data进行拼接组装,过滤掉300 bp以下的片段。非冗余基因集的构建:将所有样品的预测基因序列用CD-HIT软件进行聚类,构建非冗余基因集。将样品所有的高质量reads与非冗余基因集进行比对,统计基因在对应样品中的丰度信息从而构建geneprofile。基因预测:使用MetaGeneMark(http:/topaz.gatech.edu/GeneMark/meta_gmhmmp.cgi)对拼接结果中的contig进行基因预测,并将其翻译为氨基酸序列。基因预测是指通过对组装的基因组序列进行分析,根据已知生物的基因结构知识或数据库序列识别其所包含的基因等

20、功能区域;编码基因预测是识别基因组序列上所包含的蛋白质编码区域,通过在基因组序列上寻找开放阅读框实现。而高质量基因集Gene Catalogs则是在基因预测基础上进行去冗余操作得到。物种稀疏性曲线分析:为验证本次大曲样本数量具有足够的物种覆盖程度,从样本中随机抽取一定数量的个体,统计出这些个体所代表物种数目,并以个体数与物种数构建曲线。它可以用来比较测序数量不同的样本物种的丰富度,也可以用来说明样本的取样大小是否合理。分析采用对样本进行随机抽样的方法,以抽到的样本的物种个数构建稀疏曲线,末端部分呈现上升的趋势表明抽样量不足,当曲线末端上升趋势趋于平缓时则表明采样量足够。物种注释与分析:使用软件

21、Kraken226对宏基因组数据物种注释,获得物种的表达丰度,分析不同样品或者分组间的相似或差异性。宏基因组物种分析包括物种丰度的柱状图和热图分析、多样性指数(Shannon指数)、多样性分析(Bray-Curtis距离)和线性判别分析(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)19。基因功能注释与分析:对非冗余基因使用软件Diamond(https:/ Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)28及碳水化合物-活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZy)29,并对注释结果进

22、行功能差异分析,主要包括主坐标分析(principal co-ordinates analysis,PCoA)、Anosim组间(内)差异分析。2 结果与分析2.1 大曲宏基因组测序与组装质量分析本次宏基因组测序共25 个样品,平均组装长度为100.5 Mb,共检测到的基因目录为438 720 个。表1是对大曲样本测序数据进行组装分析以及基因预测和去冗余后的结果,显示随着轮次的进行,大曲样本的组装总长、基因数及去冗余基因数呈现递增趋势。表 1 大曲测序数据组装以及基因集结果统计Table 1 Statistics of sequencing data and gene assembly of

23、microbial community in Daqu样本组装总长/Mbcontig N50/bpreads利用率/%预测基因数/个去冗余后基因数/个XS82.64 2 37065.64 125 36898 134ZS102.36 2 26563.79 145 890115 267YLC116.50 1 62352.21 167 462130 567平均100.502 08660.55 146 240114 656本 次 宏 基 因 测 序 样 本 基 因 片 段 长 度 集 中 在02 000 nt范围内,短片段长度基因占据大多数(图1a);Venn图显示各轮次样本基因种类具有较大差别(图1

24、b);物种稀释曲线分析(图1c)表明3 个轮次的样本数量均具有足够物种覆盖度,说明其鉴定结果总体结果具备统计学意义,能够代表每个轮次的物种组成。0150 000250 000a225 648208 22171 59222 6696 8052 5181 0591 021135143200 000100 00050 000?/nt0?199200?499500?9991 000?1 4991 500?1 9992 000?2 4992 500?2 9993 000?4 9995 000?9 99910 000?14 999?15 000XS81 50518 369125 510128 58013

25、51662 973109 232bZSYLC生物工程 食品科学 2023,Vol.44,No.16 2233 0005 0004 5004 0003 500?12345678XSYLCcZS9a.大曲基因长度分布图;b.基因Venn分析图;c.物种稀释曲线图。图 1 大曲样本基因预测分析 Fig.1 Gene prediction analysis of microbial community in Daqu 2.2 大曲样本多样性分析BacillusProteusCorynebacteriumGeobacillusEnterococcusUreibacillusPseudomonasSacc

26、haropolysporaLeuconostocStreptococcusClostridiumAeribacillusCompanilactobacillusParageobacillusTalaromycesothersKroppenstedtiaStaphylococcusVirgibacillusAspergillusOceanobacillusPediococcusStreptomycesPaenibacillusSaccharomonosporaWeissellaThermoactinomycesLentibacillusAlkalihalobacillusBrevibacteri

27、umLigilactobacillus0ZS1XS1XS2XS3XS4XS5XS6ZS4ZS5ZS6ZS7XS7ZS9ZS8YLC1YLC2YLC3YLC4YLC5YLC6YLC7YLC8YLC9ZS2ZS3100a507525?/%?BacillusProteusCorynebacteriumGeobacillusEnterococcusUreibacillusPseudomonasSaccharopolysporaLeuconostocStreptococcusClostridiumAeribacillusCompanilactobacillusParageobacillusTalarom

28、ycesothersKroppenstedtiaStaphylococcusVirgibacillusAspergillusOceanobacillusPediococcusStreptomycesPaenibacillusSaccharomonosporaWeissellaThermoactinomycesLentibacillusAlkalihalobacillusBrevibacteriumLigilactobacillus0XS100b507525?/%ZSYLC?a.所有样本;b.各轮次平均值。图3同。图 2 大曲样本微生物群落在属水平上的组成Fig.2 Microbial comp

29、osition at genus level in Daqu通过Kraken2软件解析大曲在种水平上的物种结构组成,首次将多个轮次高温大曲微生物结构进行解析,共鉴定出5 104 个物种。图2为大曲群落在属水平上的丰度前30的堆积图,可以发现大曲中主要以克罗彭斯特菌属(Kroppenstedtia)和芽孢杆菌属(Bacillus)为优势菌种。图3显示丰度前30的种,3 个轮次大曲种组成基本相同,但丰度稍有差异,大曲样本中优势菌种主要为K.eburnea和芽孢杆菌(B.sonorensis、B.velezensis、B.licheniformis),其中丰度最高的为K.eburnea,该菌种在芝麻

30、香型白酒高温大曲中也有发现,在系统发育中属于高温放线菌科(Thermoactinomycetaceae),能够较好地适应大曲高温发酵30,在本研究中发现其为酱香型高温大曲的主要菌种,且在样本中占比的相似度最高。0ZS1XS1XS2XS3XS4XS5XS6ZS4ZS5ZS6ZS7XS7ZS9ZS8YLC1YLC2YLC3YLC4YLC5YLC6YLC7YLC8YLC9ZS2ZS3100a507525?/%?Kroppenstedtia_eburneaStaphylococcus_sciuriWeissella_cibariaStaphylococcus_pettenkoferiOceanobac

31、illus_iheyensisBacillus_paralicheniformisVirgibacillus_sp.6RVirgibacillus_necropolisLactobacillus_acidipiscisStaphylococcus_lentusBacillus_glycinifermentansProteus_mirabilisBacillus_cereusParus_major_densovirusVirgibacillus_sp.SK37othersBacillus_sonorensisBacillus_velezensisBacillus_licheniformisBac

32、illus_amyloliquefaciensBacillus_thermoamylovoransBacillus_subtilisAspergillus_oryzaeStaphylococcus_xylosusPediococcus_acidilacticiBacillus_coagulansThermoactinomyces_vulgarisSaccharomonospora_viridisOceanobacillus_sp.160Staphylococcus_cohniiStreptomyces_sp.NHF165Kroppenstedtia_eburneaStaphylococcus_

33、sciuriWeissella_cibariaStaphylococcus_pettenkoferiOceanobacillus_iheyensisBacillus_paralicheniformisVirgibacillus_sp.6RVirgibacillus_necropolisLactobacillus_acidipiscisStaphylococcus_lentusBacillus_glycinifermentansProteus_mirabilisBacillus_cereusParus_major_densovirusVirgibacillus_sp.SK37othersBaci

34、llus_sonorensisBacillus_velezensisBacillus_licheniformisBacillus_amyloliquefaciensBacillus_thermoamylovoransBacillus_subtilisAspergillus_oryzaeStaphylococcus_xylosusPediococcus_acidilacticiBacillus_coagulansThermoactinomyces_vulgarisSaccharomonospora_viridisOceanobacillus_sp.160Staphylococcus_cohnii

35、Streptomyces_sp.NHF1650XS100b507525?/%ZSYLC?图 3 大曲样本微生物群落在种水平上的组成Fig.3 Microbial composition at species level in Daqu224 2023,Vol.44,No.16 食品科学 生物工程通过计算Shannon指数得出各轮次多样性指数(图4a),发现各轮次大曲样品内多样性水平基本一致。而根据丰度矩阵计算各轮次内样本间Bray-Curtis距离衡量多样性(图4b),发现造沙多样性较其他2 个轮次高,推测该轮次作为下沙与1轮次之间的过渡所致,造沙阶段(1112月)气候波动较大导致群落干扰程度

36、增加,根据群落中度干扰理论31,大曲中不同样本间物种多样性会更丰富。LEfSe(图5)可知,造沙差异微生物只有2 种,1轮次有17 种,说明造沙轮次与其余2 个轮次的群落物种差异较小,而1轮次与其余2 个轮次的群落差异较大,具有更多统计学差异的生物标识13。3.2XS4.6a4.23.63.84.04.43.4Shannon?ZSYLCnsnsns?0XS50b20304010Bray-Curtis?ZSYLC*nsns?a.多样性;b.多样性。图 4 大曲样本多样性Fig.4 Diversity of microbial community in Daqu samples0.02.04.03

37、.53.02.51.51.00.5KroppenstedtiaThermoactinomycetaceaeKroppenstedtia_eburneaWeissellaWeissella_cibariaShotokuviraeParvoviridaeParus_major_densovirusPiccoviralesQuintoviricetesCossaviricotaPediococcus_pentosaceusStaphylococcus_kloosiiLactiplantibacillusLactococcusStreptococcaceaeWeissella_confusaMicro

38、cocalesStaphylococcus_simulansBacillus_velezensisStaphylococcus_xylosusBacillus_subtilis?lgLDA?XSZSYLC图 5 不同轮次生产用曲的标记微生物Fig.5 Marker microorganisms in Daqu samples2.3 大曲宏基因功能注释与分析2.3.1 基因集KEGG注释结果将大曲基因集注释到KEGG二级功能分类的19 条通路途径中,全局和概述图谱被注释到的基因数最多,其次是碳水化合物代谢与氨基酸代谢,三者均属于KEGG一级功能“代谢”分类下的二级代谢功能(图6)。全局和概述图谱

39、的KEGG三级功能分类包括主要代谢通路,其次是碳代谢、翻译、单向转导、折叠、分选和降解以及其他次生代谢的生物合成途径,包含生物生存所必须的主要代谢功能或过程,因此在大部分研究中其分析结果基因数目最多25。大曲原料主要为小麦,其含有较为丰富的碳水化合物与蛋白质,因此碳水化合物代谢与氨基酸代谢相关基因也会比较丰富。20 00015 00010 0005 000?XS1 2791 4021 3281 0331 0858082 5552 9222 5845706054262 5332 7962 8521 4381 5881 5632 0292 2622 2248299109161 3361 5161

40、4803 8124 2584 1783 4043 8364 0462 2282 4552 3518695766316815801561781721 3371 4631 47819 35221 57420 9381 7731 9531 6521081221223 1313 4603 3526877671 6021 8061 8416827598457017566616 4037 1496 9611 0981 2291 2295 3876 0215 908207225197794ZSYLC?-?图 6 KEGG二级分类注释图Fig.6 Secondary classification annota

41、tion in KEGG2.3.2 基因集CAZy注释及淀粉水解相关酶活力测定CAZy数据库中主要涵盖6 大功能类:糖苷水解酶(glycoside hydrolases,GHs),糖基转移酶(glycosyl transferases,GTs),多糖裂合酶(polysaccharide lyases,PLs),碳水化合物酯酶(carbohydrate esterases,CEs),辅助氧化还原酶(auxiliary activities,AAs)和碳水化合物结合模块(carbohydrate-binding modules,CBMs)。如图7a所示,在CAZy注释6大功能中,GHs注释结果最多

42、,说明大曲在执行碳水化合物代谢功能中,GHs是促进多糖的水解为主要酶系。大曲中淀粉降解相关的关键酶主要为-淀粉酶和糖化酶32-33,酶活力检测结果显示(图7b),造沙大曲糖化酶和 生物工程 食品科学 2023,Vol.44,No.16 225-淀粉酶活力最高,下沙和造沙酶活力显著高于1轮次(P0.05),造沙轮次GHs相关基因数目为2 050,高于其余2 个轮次。2 0001 5001 000500?XS49a49471 3131 2351 2672 0501 9021 91128326728288282187214413190ZSYLCPLsGTsGHsCEsCBMsAAsXS304.338

43、6.3122.714.541.07.7ZSYLC0?-?500400300200100?/?U/g?ba.CAZy分类注释图;b.大曲淀粉水解相关酶活力。图 7 碳水化合物代谢功能分析Fig.7 Functional analysis of carbohydrate metabolism2.3.3 大曲基因功能差异分析0300a20025015010050Shannon?BetweenXSZSYLCCEsAAsCBMsGHsXSYLCZSGTsPLsb?0.04?0.02?0.3?0.2?0.10.00.10.20.30.020.04c0.00PC2?3.08%?PC1?96.29%?ZSXS

44、YLC0300d20025015010050Shannon?BetweenXSZSYLCZSYLCXS?e?0.050?0.025?0.4?0.20.00.20.40.0250.050f0.000PC2?3.9%?PC1?96.01%?ZSXSYLCa.CAZy注释功能Anosim分析图;b.CAZy注释功能Cicros图;c.CAZy注释功能PCoA聚类分析图;d.KEGG注释功能Anosim分析图;e.KEGG注释功能Cicros图;f.KEGG注释功能PCoA聚类分析图。图 8 功能差异分析Fig.8 Functional difference analysis不同轮次大曲的主要功能基本

45、一致(图8),但在不同轮次间存在差异。从图8a、d可以看出,大曲功能基因数组间组内差异基本一致,组间差异(蓝色柱子)显著大于下沙和1轮次组内差异,但与造沙相比无显著226 2023,Vol.44,No.16 食品科学 生物工程差异。在图8c、f显示出相似规律,下沙和1轮次在功能聚类上有显著差别,这可能是下沙轮次主要生产时间(10月份)与1轮次生产(1月份)处于温湿度差异比较大的2 个阶段所致。虽主要功能种类二者无异,但在功能基因数上还是有较为显著差异(图8b、e),造沙作为1轮次和下沙之间的过渡轮次,其组内与组间差异一致(图8a、d),在PCoA聚类分析上造沙轮次包含其余2 个轮次,而其余2

46、个轮次区分度较高,在聚类上进一步反映了造沙作为过渡轮次用曲的功能特点。3 结 论本研究基于宏基因组技术分析高温大曲的微生物群落结构与功能,挖掘不同轮次生产用曲群落多样性信息与功能特征,得出如下主要结论:1)本研究将宏基因组学技术应用于多轮次高温大曲微生物结构及其功能解析,补充高温大曲在种水平上的研究结果,明确高温大曲中以K.eburnea为优势菌种,多种芽孢杆属细菌为亚优势种共同构建酱香型大曲微生物群落;不同大曲物种多样性水平基本一致,造沙多样性略高于其余2 个轮次;1轮次差异物种最丰富,具有更多统计学差异的生物标识。2)通过KEGG与CAZy 2 个通用数据库对大曲基因功能进行注释与分析,发

47、现各轮次大曲主要执行代谢功能,碳水化合物代谢与氨基酸代谢为其中最主要的功能;淀粉水解相关酶系中,GHs被注释到的基因数最多;不同轮次大曲功能种类基本一致,但功能基因数目存在差异,其中下沙与1轮次大曲存在差异,造沙与其余2 个轮次无明显差异,可能由于造沙处于其余2 个轮次的过渡阶段所致。3)本研究只采用了生产过程中前3 个轮次的大曲样本,发现不同轮次大曲微生物群落结构与功能组成基本一致,在实际使用过程中功能表现出现差异可能是受到生产环境干扰,该研究结果为后续大曲微生物资源保护、开发大曲判别标准及生产质控奠定了一定研究基础。后续研究中可进一步对优势菌株进行筛选应用,分析优势菌株在主要代谢通路中的作

48、用,并进一步验证受到干扰条件下关键酶基因的应激表达情况,以期为大曲的品质提升、酒体品质的提升、微生物功能基因库的挖掘等方面提供更加系统的理论依据。参考文献:1 班世栋.酱香大曲中霉菌类群和酶系研究D.贵阳:贵州大学,2015.2 刘效毅,郭坤亮,辛玉华.高温大曲中微生物的分离与鉴定J.酿酒科技,2012(6):52-55.DOI:10.13746/j.njkj.2012.06.045.3 周楠,黄钧,文平,等.季节及制曲工艺对麸醋曲微生物群落结构及代谢组分的影响J.食品工业科技,2022,43(1):155-162.DOI:10.13386/j.issn1002-0306.2021050223

49、.4 涂昌华,郝飞,汪地强,等.酱香型白酒下沙、造沙轮次堆积发酵过程中酒醅温度与微生物的变化规律分析J.酿酒科技,2020(2):60-64.DOI:10.13746/j.njkj.2019341.5 杨旭剑,吕云怀.浅谈茅台酒生产工艺的系统性J.酿酒科技,2007(6):54-55;58.DOI:10.13746/j.njkj.2007.06.012.6 吕锡斌,吴耀领,郝飞,等.高通量测序技术分析酱香型白酒下造沙轮次的微生物多样性J.酿酒科技,2019(3):52-58;64.DOI:10.13746/j.njkj.2019031.7 WU Q,ZHU Y,FANG C,et al.Can

50、 we control microbiota in spontaneous food fermentation?Chinese liquor as a case exampleJ.Trends in Food Science&Technology,2021,110:321-331.DOI:10.1016/j.tifs.2021.02.011.8 丁啸.基于序列特征的宏基因组数据分析方法研究D.南京:东南大学,2016.9 吕成龙,田雨,陈芳慧,等.采用16S rRNA高通量测序技术分析鲜奶中微生物的多样性J.南京农业大学学报,2020,43(1):145-150.DOI:10.7685/jna

展开阅读全文
相似文档                                   自信AI助手自信AI助手
猜你喜欢                                   自信AI导航自信AI导航
搜索标签

当前位置:首页 > 学术论文 > 论文指导/设计

移动网页_全站_页脚广告1

关于我们      便捷服务       自信AI       AI导航        获赠5币

©2010-2024 宁波自信网络信息技术有限公司  版权所有

客服电话:4008-655-100  投诉/维权电话:4009-655-100

gongan.png浙公网安备33021202000488号   

icp.png浙ICP备2021020529号-1  |  浙B2-20240490  

关注我们 :gzh.png    weibo.png    LOFTER.png 

客服