泛癌中 CCL18 的差异表达、预后及其与免疫细胞浸润的相关性分析.pdf

本文引文格式:董明右,王俊利,廖陆升,等.泛癌中C C L1 8的差异表达、预后及其与免疫细胞浸润的相关性分析J.右江民族医学院学报,2 0 2 3,4 5(4):5 8 3-5 9 3.【论著与临床报道】泛癌中C C L1 8的差异表达、预后及其与免疫细胞浸润的相关性分析董明右1,2,王俊利1,2,廖陆升1,2,陈祥凤1,2,罗艳红1,吴艳柳1(1.右江民族医学院医学检验学院,广西 百色 5 3 3 0 0 0;2.右江民族医学院生物医药与大健康现代产业学院,广西 百色 5 3 3 0 0 0)摘 要:目的 旨在通过多数据库的分析来揭示C C L1 8在3 3种癌症类型中的表达、预后及其与免疫细胞浸润的相关性。方法 通过G T E x数据库、C C L E数据库、T C GA数据库综合分析C C L1 8在泛癌中的表达模式。单因素C o x回归用于分析C C L1 8在泛癌中的生存和预后。通过T I ME R 2.0数据库分析C C L1 8与免疫微环境的关系。分析了C C L1 8与免疫检查点基因表达谱、D NA错配修复基因(MMR s)和甲基转移酶编码基因的关系。S p e a r m a n用于分析C C L1 8表达水平与肿瘤突变负荷(TMB)和微卫星不稳定性(M S I)的关系。结果 在本研究中,发现C C L1 8在大多数癌症中异常过表达。C C L1 8与肿瘤患者的年龄、性别、肿瘤分期和免疫亚型等临床参数密切相关。单因素回归分析表明C C L1 8表达与患者在A C C、D L B C、L AML、UVM、C E S C和L G G中的不良预后密切相关。在大多数癌症中,C C L1 8的表达与2 8种免疫细胞亚型、免疫相关通路、肿瘤微环境呈正相关。C C L1 8与主要组织相容性复合体、免疫激活剂、免疫抑制剂、趋化因子和趋化因子受体相关基因共表达。此外,C C L1 8与许多癌症中的肿瘤新抗原、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性以及免疫检查点、错配修复和D NA甲基化转移酶相关基因的表达显著有关。G S E A分析表明C C L1 8表达显著富集了大多数肿瘤中的几种癌症相关通路和免疫相关通路。结论 C C L1 8可能是确定癌症预后和免疫浸润的潜在分子生物标志物。关键词:C C L1 8;预后;免疫浸润;免疫相关途径;泛癌中图分类号:R 7 3 0.5 1 文献标识码:A 文章编号:1 0 0 1-5 8 1 7(2 0 2 3)0 4-0 5 8 3-1 1d o i:1 0.3 9 6 9/j.i s s n.1 0 0 1-5 8 1 7.2 0 2 3.0 4.0 0 7A n a l y s i so fd i f f e r e n t i a l e x p r e s s i o n,p r o g n o s i so fC C L1 8a n d i t sc o r r e l a t i o nw i t h i mm u n e c e l l i n f i l t r a t i o n i np a n-c a n c e rD o n gM i n g y o u1,2,W a n gJ u n l i1,2,L i a oL u s h e n g1,2,C h e nX i a n g f e n g1,2,L u oY a n h o n g1,WuY a n l i u1(1.S c h o o l o fM e d i c a lL a b o r a t o r y,Y o u j i a n gM e d i c a lU n i v e r s i t yf o rN a t i o n a l i t i e s,B a i s e5 3 3 0 0 0,G u a n g x i,C h i n a;2.S c h o o l o fB i o m e d i c i n ea n dM o d e r nI n d u s t r yo fG r e a tH e a l t h,Y o u j i a n gM e d i c a lU n i v e r s i t yf o rN a t i o n a l i t i e s,B a i s e5 3 3 0 0 0,G u a n g x i,C h i n a)A b s t r a c t:O b j e c t i v e T or e v e a l t h ee x p r e s s i o na n dp r o g n o s i so fC C L1 8 i n3 3c a n c e r t y p e sa n d i t sa s s o c i a-t i o n w i t hi mm u n ec e l li n f i l t r a t i o nt h r o u g h m u l t i-d a t a b a s ea n a l y s i s.M e t h o d s T h ee x p r e s s i o np a t t e r no fC C L1 8 i np a n-c a n c e rw a sa n a l y z e du s i n gt h eG T E xd a t a b a s e,C C L Ed a t a b a s ea n dT C GAd a t a b a s e.U n i v a r i a t eC o xr e g r e s s i o nw a su s e dt oa n a l y z et h es u r v i v a la n dp r o g n o s i so fC C L1 8 i np a n-c a n c e r.T h er e l a t i o n s h i pb e-t w e e nC C L1 8a n dt h e i mm u n em i c r o e n v i r o n m e n tw a sa n a l y z e db yT I ME R2.0d a t a b a s e.M o r e o v e r,t h es t u d ye x a m i n e dt h ec o r r e l a t i o nb e t w e e nC C L1 8a n d i mm u n ec h e c k p o i n tg e n ee x p r e s s i o np r o f i l e s,D NA m i s m a t c hr e-p a i rg e n e s(MMR s)a n dm e t h y l t r a n s f e r a s ec o d i n gg e n e s.S p e a r m a nc o r r e l a t i o nw a su s e dt oa n a l y z et h er e l a-t i o n s h i pb e t w e e nC C L1 8e x p r e s s i o nl e v e l sa n dt u m o rm u t a t i o nb u r d e n(TMB)a n d m i c r o s a t e l l i t ei n s t a b i l i t y385第4 5卷 第4期 右江民族医学院学报 V o l.4 5N o.42 0 2 3年8月 J o u r n a l o fY o u j i a n gM e d i c a lU n i v e r s i t yf o rN a t i o n a l i t i e s A u g.2 0 2 3基金项目:广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2 0 2 2 KY 0 5 3 2);右江民族医学院科研项目(y y 2 0 2 0 k y 0 3 9);百色市科学研究与技术开发计划(2 0 2 1 2 3 4 7)第一作者简介:董明右(1 9 9 0-),男,博士,讲师,研究方向:肝癌诊断和预后标志物的鉴定及功能研究,E-m a i l:2 4 3 1 7 1 5 5 5q q.c o m(M S I).R e s u l t s T h es t u d yf o u n dt h a tC C L1 8w a sa b n o r m a l l yo v e r e x p r e s s e d i nm o s tc a n c e r sa n dc l o s e l yr e-l a t e dt oc l i n i c a l p a r a m e t e r s s u c ha s a g e,g e n d e r,t u m o r s t a g ea n d i mm u n e s u b t y p e.U n i v a r i a t e r e g r e s s i o na n a l-y s i ss h o w e dt h a tC C L1 8e x p r e s s i o nw a ss i g n i f i c a n t l ya s s o c i a t e dw i t hp o o rp r o g n o s i s i nA C C,D L B C,L AML,UVM,C E S C,a n dL G G.A d d i t i o n a l l y,C C L1 8e x p r e s s i o ns h o w e dp o s i t i v ec o r r e l a t i o n sw i t h2 8i mm u n ec e l ls u b t y p e s,i mm u n e-r e l a t e dp a t h w a y s,a n dt u m o rm i c r o e n v i r o n m e n t i nm o s tc a n c e r s.T h e n,i tw a sf o u n dt h a tC C L1 8w a sc o-e x p r e s s e dw i t h m a j o rh i s t o c o m p a t i b i l i t yc o m p l e x,i mm u n ea c t i v a t o r s,i mm u n o s u p p r e s s a n t s,c h e m o k i n e s,a n dc h e m o k i n e r e c e p t o r-r e l a t e dg e n e s.I na d d i t i o n,C C L1 8w a s s i g n i f i c a n t l ya s s o c i a t e dw i t ht u m o rn e o a n t i g e n s,t u m o rm u t a t i o nl o a d,m i c r o s a t e l l i t e i n s t a b i l i t y,a n dt h ee x p r e s s i o no fg e n e sa s s o c i a t e dw i t hi m-m u n ec h e c k p o i n t s,m i s m a t c hr e p a i r,a n dD NA m e t h y l t r a n s f e r a s ei nv a r i o u sc a n c e r s.G S E Aa n a l y s i ss h o w e dt h a tC C L1 8 e x p r e s s i o nw a s s i g n i f i c a n t l ye n r i c h e d i ns e v e r a l c a n c e r-r e l a t e da n d i mm u n e-r e l a t e dp a t h w a y s i nm o s tt u m o r s.C o n c l u s i o n T h e f i n d i n g ss u g g e s t t h a tC C L1 8m a ys e r v e a s ap o t e n t i a lm o l e c u l a rb i o m a r k e r f o r c a n c-e rp r o g n o s i sa n d i mm u n e i n f i l t r a t i o n.K e yw o r d s:C C L1 8;p r o g n o s i s;i mm u n e i n f i l t r a t i o n;i mm u n e-r e l a t e dp a t h w a y s;p a n-c a n c e r C C L1 8是来自-趋化因子亚家族成员,它在N端具有-C y s-C y s-m o t i f,主要在乳腺肿瘤相关巨噬细胞(T AM s)中 表 达,其 别 名 包 括:C K b 7、P A R C、AM-A C 1、D C C K 1、M I P-4、AMA C-1、D C-C K 1和S C YA 181-5。在多种癌症中已经观察到C C L1 8的上调,例如口腔鳞状细胞癌6、喉部鳞状细胞癌7、卵巢上皮细胞癌8、肺癌9、卵巢癌1 0和乳腺癌1 1。C C L1 8的高表达与癌症患者的较差生存率是相关的6-8。C C L1 8已经被证 明 在 肿 瘤 微 环 境1 2-1 3,上 皮 间 质 转 化 和 转移8-9,1 1,1 4、肿瘤增殖1 5和血管生成1 6中发挥着重要的作用。然而,C C L1 8在肿瘤免疫学中的潜在机制仍不清楚。癌症是一种涉及肿瘤与免疫系统相互作用的复杂疾病,肿瘤微环境(TME)也已被公认为癌症发生和发展的主要因素1 7。采用细胞疗法、治疗性疫苗、免疫检查点抑制剂等治疗策略提高了恶性肿瘤患者的存活率1 8。许多研究表明,TME中各种浸润性免疫细胞的积累直接关系到患者的预后和免疫治疗效果,如肿瘤相关巨噬细胞、中性粒细胞、调节性T细胞、B细胞和自然杀伤细胞等,它们可以在癌症免疫逃逸中发挥重要作用1 9-2 1。免疫检查点(I C)与其配体之间的相互作用负向调节参与针对特定抗原的生理免疫反应的T细胞活化途径2 2。I C s及其配体在各种恶性肿瘤的肿瘤微环境(TME)中经常被上调以实现肿瘤免疫逃避2 3。本研究分析了C C L1 8在泛癌中的表达模式、临床意义和预后价值。还分析了C C L1 8表达与潜在分子机制、肿瘤浸润免疫细胞、免疫相关基因、免疫新抗原、免疫检查点基因、癌症中TMB和微卫星不稳定性的关系。还研究了C C L1 8表达是否影响泛癌中D NA修复相关基因和D NA甲基化转移酶相关基因的表达。同时,还进行了基因集富集分析(G S E A)来研究C C L1 8在不同类型肿瘤中的生物学功能和信号转导通路。研究结果揭示了C C L1 8在癌症中的可能作用,表明C C L1 8是一种潜在的预后生物标志物。1 材料与方法1.1 数据收集及整理 从G T E x数据库(h t t p s:/g t e x p o r t a l.o r g/)获得3 1个正常组织的C C L1 8表达数据,并 通 过T C GA数 据 库(h t t p s:/p o r t a l.g d c.c a n c e r.g o v/)下载所有癌症的临床信息和表达矩阵。2 1个肿瘤细胞系的C C L1 8表达数据从C C L E数据库(h t t p s:/p o r t a l s.b r o a d i n s t i t u t e.o r g/)获得。通过将来自t h eG T E xd a t a b a s e的正常组织数据与t h eC a n c-e rG e n o m eA t l a s(T C GA)的数据相结合,分析了癌症和正常组织之间C C L1 8表达的差异。所有表达数据均通过l o g 2转换进行标准化。并使用l i mm aRp a c k-a g e进行差异表达分析。1.2 C C L1 8表达水平与生存或临床病理特征的相关性分析 单因素回归分析被用于分析3 3种癌症类型中C C L1 8表达水平与患者预后之间的相关性。用于患者预后的术语包括以下四个:总生存期(O S)、疾病特异性生存期(D S S)、无进展间隔期(P F I)和无疾病间隔期(D F I)。单变量生存分析用于计算危险比(HR)和9 5%置信区间。使用L o g-r a n kt e s t研究了C C L1 8表达与临床病理特征(年龄、性别和病理阶段)的相关性。在泛癌样本中检测6种免疫类型(C 1C 6)。调整后的P0.0 5被认为是显著的。1.3 C C L1 8表达与免疫相关因子的相关性 使用C I B E R S O R T2 4计算2 8种免疫细胞亚型的浸润比例,这 是 预 测 免 疫 细 胞 表 型 的 工 具。使 用MC P-C OUNT E R、QUANT I S E Q、T I ME R和X C E L L的算法对其进行了验证。使用g g p l o t 2,g g p u b r和g g E x t r aRp a c k a g e s分析C C L1 8表达与免疫细胞浸润之间的相关性,P0.0 0 1被用作截止值。使用E S T I MAT Ea l g o r i t h m2 5计算所有癌症组织的免疫评分、基质评分4852 0 2 3年 右江民族医学院学报 第4期和E S T I MAT E评分。通过S p e a r m a nsm e t h o d分析C C L1 8表 达 水 平 与 免 疫 评 分、基 质 评 分 和E S T I-MAT E评分的相关性。P0.3被视为筛选标准标准,并且|R|0.6被认为是强相关的。此外,对C C L1 8和免疫相关基因进行了共表达分析,包括编码主要组织相容性复合体(MHC)、免疫激活、免疫抑制、趋化 因子和趋化 因子 受 体 蛋 白 的 基 因,“l i mm a”、“r e s h a p e 2”和“R C o l o r B r e y e r”R包被用于结果的可视化。1.4 C C L1 8表达与免疫新抗原和免疫检查点的相关性 肿瘤细胞中由突变基因编码的新抗原,主要由点突变、缺失突变和基因融合等生物学事件产生。使用s c a n n e oRp a c k a g e分别统计每个肿瘤样本的新抗原数量,并分析C C L1 8表达与抗原数量的关系。此外,收集了4 0多个免疫检查点基因,并使用S p e a r m a n统计方法分析了C C L1 8基因表达与免疫检查点基因表达之 间 的 关 系。相 关 热 图 由r e s h a p e 2和R C o l o r-B r e w e rR包绘制。1.5 C C L1 8与肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性的相关性 肿瘤突变负荷(TMB)作为可量化的生物标志物,可用于反映肿瘤细胞中包含的突变数量2 6。微卫星不稳定性(M S I)是指与正常组织相比,在肿瘤中,由于重复单元的插入或缺失引起的微卫星长度的任何改变,都会出现新的微卫星等位基因现象2 7。在这里,本研究通过t h eM a f t o o l sR包分别计算了每个肿瘤样本的TMB和M S I,并基于S p e a r m a n统计方法分析了C C L1 8表达与TMB和M S I之间的关系。1.6 C C L1 8与D NA错配修复相关基因及D NA甲基转移酶相关基因的相关性 从T C GA数据库获得5个错配修复(MMR)基因(M LH1、M SH2、M SH6、P MS2和E P C AM)的突变水平。S p e a r m a n统计方法用于评估C C L1 8表达与MMR基因突变水平之间的关系。在本研究中,使用S p e a r m a n统计方法来估计C C L1 8表达与4种甲基转移酶(D NMT 1、D NMT 2、D NMT 3 A和D NMT 3 B)之间的关系。可视化分析由t h eg g p l o tRp a c k a g e执行。当P0.2 0时,相关性被认为是显著的。1.7 功能富集分析 本研究计算了不同癌症组织的5 0个h a l l m a r k信 号 通 路 的G S VA评 分,并 使 用S p e a r m a n统计方法来估计C C L1 8表达与这些途径评分之间的相关性(F D R0.0 5)。1.8 统计学方 法 K r u s k a l W a l l i st e s t用 于 分 析C C L1 8在不同正常组织和不同肿瘤细胞系中的表达水平。在评估肿瘤组织和正常组织中C C L1 8表达水平的差异时,如果数据服从正态分布,采用t检验进行统计;如果数据不服从正态分布,采用W i l c o x o n秩和检验。使用L o g-r a n kt e s t研究了C C L1 8表达与临床病理特征(年龄、性别和病理阶段)的相关性。采用U n i v a r i a t es u r v i v a l分析C C L1 8表达与患者生存的相关性。T h eS p e a r m a n r a n k用于计算C C L1 8表达与肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性、MMR基因突变水平、甲基转移酶水平和免疫检查点标志物水平之间的关系。当P0.2 0时,被认为是显著且正相关的。对于所有统计分析,P0.0 5被认为差异具有统计学意义。2 结果2.1 C C L1 8在泛癌中的差异表达 首先,本研究使用G T E x数据库分析了3 1个组织中C C L1 8的表达。研究发现C C L1 8在肺癌中高表达,在骨髓、大脑、子宫颈、肌肉和其他正常组织中低表达(见图1 A)。此外,从C C L E数据库中下载了肿瘤细胞系的数据,并分析了2 1个肿瘤细胞中C C L1 8的表达。研究发现C C L1 8在所有2 1种肿瘤细胞中均有表达(见图1 B)。为了确定肿瘤和正常组织中C C L1 8表达的差异,使用T C-GA数据库分析了2 0种癌症类型的不同肿瘤和正常组织 中 的C C L1 8mR NA水 平。结 果 显 示,B L C A、CHO L、C OA D、E S C A、G BM、HN S C、K I CH、K I R C、K I R P、L G G、L I HC、P R A D、S T A D、THC A和U C E C中的C C L1 8mR NA水平 显 著 高 于 正 常 组 织(见 图1 C)。考虑到T C GA中正常样本数量较少,本研究整合了G T E x数据库和T C GA数据库,分析了C C L1 8在2 7种癌症类型中的表达差异。本研究发现C C L1 8在2 4种 肿 瘤 中 存 在 显 著 差 异 表 达,包 括B L C A、B R C A、C E S C、CHO L、C OA D、E S C A、G BM、HN S C、K I CH、K I R C、K I R P、L AML、L G G、L I HC、L U S C、OV、P AA D、P R A D、S K CM、S T A D、T G C T、THC A、U C E C和U C S(见图1 D)。这些结果表明C C L1 8在人类泛癌中异常过表达。2.2 C C L1 8与肿瘤临床特征及预后的相关性 使用T C GAd a t a s e t研究C C L1 8在泛癌预后中的作用。使用单因素回归分析C C L1 8-r e l a t e ds u r v i v a lO S,D S S,D F I和P F I。结果发现,C C L1 8表达水平与A C C中的D F I相关,与A C C、C E S C、D L B C、K I R P和UVM中的D S S相关,与A C C、D L B C和UVM中的O S相关,与A C C、C E S C、K I R P和L G G中的P F I相关(见图2 A图2 D)。同时,C C L1 8在U C S、OV、S A R C、C OA D、S T A D和L UA D的老年患者中差异高表达,而 在B R C A老 年 患 者 中 表 达 较 低(见 图3 A)。L AML、L G G、K I R P、K I R C的男性中C C L1 8表达较高(见图3 B)。此外,C C L1 8表达与某些癌症的肿瘤分期显著相关,包括CHO L、K I CH、B L C A、THC A、C OA D和K I R P(见图3 C)。还研究了C C L1 8表达与5852 0 2 3年 右江民族医学院学报 第4期泛癌中6种免疫亚型的关联。结果表明,C C L1 8与1 7种癌 症 类 型 的 免 疫 亚 型 密 切 相 关,包 括B R C A、CHO L、U C S、K I CH、P C P G、S T A D、T G C T、UVM、C E S E、B L C A、L I HC、U E C E、S A R C、C OA D、R E A D、L UA D和L U S C(见图3 D)。注:A.C C L1 8在包含3 1个组织的数据集中的表达水平,来源于G T E x;B.C C L1 8在包含2 1个组织的肿瘤细胞系的数据集中的表达水平,来源于C C L E数据库;C.C C L1 8在肿瘤和配对的邻近非癌症组织中的表达水平,包含2 0个组织,来自T C GA;D.整合G T E x数据库中正常组织数据和T C G A肿瘤组织数据的2 7个肿瘤中C C L1 8的表达差异。*P0.0 5,*P0.0 1,*P0.0 0 1。图1 C C L1 8在泛癌中的表达6852 0 2 3年 右江民族医学院学报 第4期注:A为D F I;B为D S S;C为O S;D为P F I。红色表示C C L1 8属于风险基因。绿色表示C C L1 8是一个保护基因。图2 单变量C o x回归分析的森林图注:A.年龄与C C L1 8的相关性;B.性别与C C L1 8的相关性;C.肿瘤分期与C C L1 8的相关性;D.C C L1 8表达与免疫浸润亚型的关系。图3 泛癌中C C L1 8的表达与肿瘤患者预后的关系2.3 C C L1 8与免疫细胞浸润、免疫相关通路和免疫微环境的关系 本研究评估了C C L1 8表达与免疫细胞浸润,免 疫 相 关 通 路,免 疫 微 环 境 的 关 系。使 用S a n g e r b o x在线分析平台进一步分析2 8种免疫细胞亚型浸润与C C L1 8表达的相关性。除L AML和L G G外,C C L1 8表达水平与大多数浸润性免疫细胞水平显著相关,特别是在B细胞、C D 4+T细胞、C D 8+T细胞、树突状细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、调节性T细胞、7852 0 2 3年 右江民族医学院学报 第4期自然杀伤细胞和滤泡辅助T细胞中(见图4 A)。随后,研究了3 3个肿瘤中C C L1 8表达与免疫相关通路之间的关联。在许多恶性肿瘤中,C C L1 8表达与A PM,C D 8 T效 应 器、免 疫 检 查 点、P a n F T B R s和TME s c o r e AC I R途径呈正相关,但是与碱基切除修复、细胞周期、D D R、F G F R 3相关、同源重组、组蛋白、错配修复、核苷酸切除修复和WNT目标途径呈负相关。此外,在P AA D、UVM、CHO L、C OA D、R E A D、L U S C、E S C A、HN S C、K I CH、OV、L I HC和L UA D中,C C L1 8表达与EMT 1、EMT 2、EMT 3、p a nFT B R和TME s c o r e BC I R通路呈正相关(见图4 B)。C C L1 8表达水平与除L AML、L G G以外的3 1种癌症的免疫评分、2 5种癌症类型的基质评分和除L AML、L G G、THYM以外的3 0种癌症类型的E S T I MAT Es c o r e呈正相关(见图4 C)。注:A.C C L1 8的表达与泛癌中的免疫浸润水平的相关性;B.泛癌中C C L1 8的表达与免疫相关途径的相关性;C.C C L1 8的表达与肿瘤环境的相关性。图4 C C L1 8表达与免疫浸润水平和免疫相关途径以及肿瘤微环境的相关性2.4 C C L1 8与免疫激活剂、免疫抑制剂、趋化因子及趋化因子受体的相关性 本研究通过基因共表达分析在3 3个肿瘤中评估了免疫相关基因与C C L1 8表达的相关性。结果表明,除L AML和L G G外,大多数癌症中C C L1 8基因表达与C D 2 4 4、C D 2 7 4、C D 9 6、C S F 1 R、C T L A 4、HAV C R 2、I L 1 0、P D C D 1 L G 2、T I G I T等免疫相关基因密切相关(见图5 A)。在除D L B C、G BM、K I R C、L AML、THYM、A C C和L G G之外的大多数癌症中,C C L1 8基因表达与MHC显著相关,包括HL A-DMA、HL A-DMB、HL A-D OA、HL A-D O B、HL A-D P A 1、HL A-D P B 1、HL A-D QA 1、HL A-D Q B 1(见 图5 B)。在除THYM、L AML和L G G之外的大多数癌症中,C C L1 8基因表达与包括C C R 1、C C R 2、C C R 4、C C R 5、C C R 7、C C R 8、C X C R 3、C X C R 4、C X C R 6、X C R 1在内的趋化因子受体密切相关(见图5 C)。在许多癌症中,C C L1 8基因 表 达 与 包 括C D 2 7、C D 2 8、C D 4 8、C D 8 0、C D 8 6、I C O S、I L 2 R A、T N F R S F 8、T N F R S F 9、T N F S F 1 3 B、T N F S F 1 4在内的免疫激活基因呈正相关(见图5 D)。在B L C A、C OA D、R E A D、D L B C、T G C T、HN S C、L U S C、S T A D、U C E C、C E S C、E S C A、CHO L、UVM、B R C A和U C S中,C C L1 8基因表达与趋化因子 密 切 相 关,包 括C X C L 1 0、C C L 3、C C L 4、C C L 5、C C L 8、C C L 1 3(见图5 E)。2.6 C C L1 8与肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性的相关性 肿瘤突变负荷(TMB)和微卫星不稳定性(M S I)被认为是影响肿瘤发生和进展的重要因素。本研究分析了3 3种常见癌症中TMB与C C L1 8表达的相关性,以探讨泛癌中C C L1 8活性与突变之间的关系。结果表明,在G BM、L I HC和THYM中,C C L1 8表达与TMB呈负相关。而在B L C A、B R C A、C OA D、L AML、OV、P R A D、S A R C、S T A D、U C E C和U C S中,C C L1 8表达与TMB呈正相关(见图6 A)。也发现C OA D中C C L1 8表达与M S I呈正相关。而在HN S C、K I R C、L G G、L I HC、L UA D、L U S C和T G C T中,C C L1 8表达与M S I呈负相关(见图6 B)。8852 0 2 3年 右江民族医学院学报 第4期注:A.泛癌中C C L1 8的表达与免疫抑制物水平的相关性;B.C C L1 8的表达和MHC在泛癌中的相关性;C.泛癌中C C L1 8的表达与受体之间的相关性;D.泛癌中C C L1 8的表达与免疫刺激物水平的相关性;E.泛癌中C C L1 8的表达与趋化因子的相关性。图5 C C L1 8的表达与免疫刺激因子、免疫抑制因子、趋化因子和MHC的相关性9852 0 2 3年 右江民族医学院学报 第4期注:A.使用S p e a r m a nsr a n k相关系数描述泛癌和TMB中C C L1 8表达的相关分析结果;B.使用S p e a r m a nsr a n kc o r r e l a t i o nc o e f f i c i e n t描述C C L1 8在泛癌和M S I中的表达的相关分析结果。图6 C C L1 8在泛癌和TMB、M S I中表达的相关性分析2.7 C C L1 8表达与D NA错配修复相关基因及D NA甲基转移酶相关基因的相关性 为了评估C C L1 8在肿瘤发 生 中 的 作 用,本 研 究 分 析 了C C L1 8表 达 与D NA错配修复相关基因之间的相关性。结果表明,C C L1 8的表达与B R C A、C OA D、HN S C、K I R P、L U-A D、L U S C和THC A的5个MMR基因突变水平相关(见图7 A)。结果发现接下来研究了C C L1 8表达与4种D NA甲基转移酶表达之间的相关性,结果发现C C L1 8表达与B L C A、B R C A、C OA D、HN S C、L UA D、L U S C、P R A D、S K CM、S T A D、T G C T和THC A中的D NA甲基转移酶表达密切相关(见图7 B)。2.8 泛癌中C C L1 8参 与的信号通 路 为了 研 究C C L1 8在癌症中的作用机制,计算了每位癌症患者的这5 0条通路的G S VA评分。结果发现大多数通路富集水平与多种癌症类型的异体移植排斥反应、血管生成、细胞凋亡、凝血、补体、上皮间质转化、I L 2S T AT 5标志、I L 6J AKS T AT 3标志、炎症反应、干扰素反应、干扰素反应、K R A S信号传导等信号通路正相关(见图8)。3 讨论C C L1 8是以两个相邻的半胱氨酸为特征的蛋白质,该基因编码的细胞因子对新生T细胞、C D 4+和C D 8+T细胞和非活化淋巴细胞显示趋化活性,但对单核细胞或粒细胞不显示趋化活性。已有研究表明在癌症病人中,C C L1 8促进EMT1 4、细胞生长和转移1 5、和肿瘤进展1 6。尽管C C L1 8已在多种癌症中得到广泛研究,但其在泛癌中的作用以及是否可以用作生物标志物仍是未知数。本研究是基于T C GA数据库对恶性肿瘤中的C C L1 8进行了泛癌分析。注:A.5个MMR的基因表达水平与C C L1 8表达的相关性分析;B.C C L1 8的表达与4种甲基转移酶的表达之间的相关性分析。D NMT 1被染成红色,D NMT 2被染,成蓝色D NMT 3 a被染成绿色,D NMT 3 b被染成紫色。图7 C C L1 8在泛癌中的表达与D NA修复基因和甲基转移酶的表达水平之间的相关性分析0952 0 2 3年 右江民族医学院学报 第4期图8 不同癌症中C C L1 8和5 0条信号通路之间的关系 本研究发现了C C L1 8在2 4种肿瘤中存在差异表达。根据文献检索结果,在许多癌症患者中发现了较高的C C L1 8表达6-8。通过使用单因素回归分析表明,C C L1 8与C E S C和K I R P具 有 更 好 的 生 存 率,A C C、D L B C、L AML、UVM、C E S C和L G G与更差预后相关。已有研究表明C C L1 8的高表达与口腔鳞状细胞癌6,喉部鳞状细胞癌7和上皮性卵巢癌8更差的预后是相关的,这些结果与本次研究结果一致。本次研究了C C L1 8与各种临床