TRIP13通过同源重组通路提高肺腺癌细胞的放射抗性.pdf

中国肺癌杂志2024年月第27卷第期Chin J Lung Cancer,January 2024,Vol.27,No.基 础 研究TRIP13通过同源重组通路提高肺腺癌细胞的放射抗性葛舒童 谷润川 杨雄涛 许长丹 王诗杰 朱广迎【摘要】背景与目的 放疗是非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer,NSCLC）最常用的治疗手段之一。然而，一部分肿瘤细胞对放射线的不敏感是放疗疗效差、患者预后不良的重要原因之一，探究放射抵抗背后的深层机制是解决这一临床难题的关键。本研究旨在寻找与肺腺癌（lung adenocarcinoma,LUAD）放射抵抗相关的分子，初步经数据库筛选锁定甲状腺素受体结合因子3（thyroid hormone receptor interactor 3,TRIP3）为主要研究对象，并探索TRIP3是否与LUAD的放射抵抗有关及具体机制，以期为临床接受放疗的LUAD患者的联合治疗提供理论依据和潜在靶点。方法 选取基因表达综合数据库（Gene Expression Omnibus,GEO）中的GSE8842、GSE988和GSE33532共3个数据集，借助R 4.3软件分别筛选3个数据集中差异表达的基因（|log FC|.5,P.5,P.5，P0.05。而后，使用Venn diagram在线工具（bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/）获取3个数据集共同差异表达的基因。使用STRING在线网站（version-2-0.string-db.org/）分析基因之间的潜在关系，绘制蛋白质相互作用网络图。随后，通过使用Cytoscape软件中的MCONE聚类算法功能获得蛋白质相互作用网络中更为核心的模块。使用Kaplan-Meier Plotter数据库（ 4.3软件的Survival包在GSE68465数据集中验证此前的分析结果，并使用enrichplot包进行基因富集分析。1.2 细胞培养和相关试剂 人LUAD细胞系H292购于国家实验细胞资源共享平台北京协和细胞资源中心。H292细胞培养于含有0%胎牛血清和%双抗的RPMI-640培养基中。RPMI-640培养基（货号：SH30809.0）和胎牛血清（货号：SH30406.05）购于美国HyClone公司；青链霉素混合液（货号：54022）和胰酶（货号：25200056）购于美国Gibco公司；转染试剂Lipofectamine 3000（货号：L300005）购于美国Thermo Fisher公司；Opti-MEM I减血清培养基（货号：3985-070）购于美国Invitrogen公司。细胞计数试剂盒-8（cell counting kit-8,CCK-8）（货号：BS350B）购于Biosharp公司；Transwell小室（货号：353097）购于美国BD公司（Becton,Dickinson and Company）。GAPDH（货号：sc-47724，:000）、TRIP3（货号：sc-54285，:000）、p-ATM（货号：sc-47739，:000）、ATM（货号：sc-377293，:000）和REV7（货号：sc-35977，:000）抗体购于Santa cruz公司；RAD5（货号：A00088，:000）购于武汉Boster生物公司，HRP标记的山羊抗鼠（货号：ab6789，:0,000）、兔IgG二抗（货号:ab672，:0,000）购于美国Abcam公司。1.3 人LUAD H292细胞系放射抗性表型构建方法 取生长状态良好的H292细胞，使用60 kV X线生物辐照仪（RAD SOURCE 2000pro）分别对细胞给予0、2、4、6、8和0 Gy不同的放射线剂量照射。将照射后的细胞重新放于细胞培养箱中培养，此后每隔2-3 d进行传代培养并确定H292细胞的亚致死性剂量为6 Gy。每照射一次细胞后需待细胞逐渐恢复至正常的生长速度后再给予下一次放射线照射，亚致死性照射剂量重复照射6次以上，大约3个月完成照射后停止照射并稳定传代5代以上即视为具有放射抗性表型，并将其称之为H292DR细胞系。1.4 CCK-8细胞增殖实验验证放射抗性表型 取对数生长期的H292细胞和H292DR细胞，以每孔2000个/00 L的细胞密度接种于96孔板中，测量0 h时间点的450 nm波长处的吸光度值并记录。翌日，待细胞贴壁24 h后，对孔板给予单次6 Gy的X射线照射。此后，依次测量24、48、72和96 h时间点的450 nm波长处吸光度值，绘制折线图并进行计算。1.5 克隆形成实验验证放射抗性表型 取对数生长期的H292细胞和H292DR细胞，按计划照射的0、2、4、6、8 Gy放射线剂量分别铺300、600、900、200和500个细胞于2孔板中，每个剂量每组设置3个复孔。翌日，不同组分别接受不同剂量的放射线照射。此后，放回培养箱中静置培养8-0 d直至形成肉眼可见的克隆。结晶紫室温染色5 min后洗净并拍照计数。1.6 Western blot检测蛋白表达 取对数生长期的H292细胞和H292DR细胞，使用RIPA裂解液提总蛋白并进行BCA蛋白浓度定量，加入5Loading buffer煮沸使蛋白变性，而后采用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳以分离目标蛋白，00 V恒压转膜，5%脱脂牛奶室温封闭 h后，一抗4 oC孵育过夜，翌日TBST洗3次后室温孵育二抗 h，而后曝光显影。1.7 小干扰RNA（small interfering RNA,siRNA）转染细胞 转染前一天，将H292DR细胞按205个/mL铺于2孔板中，次日细胞密度约为70%。将细胞分为阴性对照组（转染siRNA-negative control，即NC）、si组（转染靶向TRIP13的第条siRNA）和si2（转染靶向TRIP13的第2条siRNA）3组。按照Lipofectamine 3000说明书将siRNA转染至H292DR细胞中。转染6-8 h后更换成完全培养基。此后收取24、48、72 h时间点的细胞，进行Western blot验证转染效果。靶向TRIP13的siRNA及对照siRNA的序列由上海吉凯基因化学技术有限公司合成。TRIP13的2条有效干扰靶点序列（5-3）分别为AGCTACTCAACAGACATAATATT和CTCGATTATGTGATGACAACTTT。1.8 Transwell细胞迁移实验 取24孔板，孔板内加入完全培养基，将Transwell小室轻柔放入。取siRNA处理后的H292DR细胞，使用无血清培养基清洗3次并重悬后种至4中国肺癌杂志2024年月第27卷第期Chin J Lung Cancer,January 2024,Vol.27,No.小室中。随后将放有Transwell小室的孔板置于孵箱中。48 h后，取出小室，使用结晶紫染液进行室温染色20 min，清洗晾干后置于显微镜下拍照计数。1.9 统计学方法 采用SPSS 26.0和GraphPad Prism 8.0进行本研究的数据分析及绘图。采用Kaplan-Meier方法分析TRIP3与患者的总生存期（overall survival,OS）的关系，采用Spearman相关分析检测TRIP13基因与其他基因之间的相关性。单因素和多因素Cox回归分析评估多个因素对LUAD患者OS的影响。两组间计量资料的比较采用t检验。P0.05为差异具有统计学意义。2 结果2.1 筛选3个GEO数据集以获得共同差异表达基因 本次使用的所有GEO数据集的信息如表所显示。使用Limma包分析GSE8842、GSE988、GSE33532 3个数据集分别得到48、203和37个表达上调的基因，以及775、564和689个表达下调的基因。使用Venn diagram绘制Venn图后获得了52个共同差异表达的基因，其中有64个共同表达上调的基因，357个共同表达下调的基因（图）。2.2 差异基因的初步生存分析发现TRIP13与LUAD患者的不良预后有关 将上述获得的52个差异表达的基因上传至STRING在线网站，绘制蛋白质相互作用网络图，联合使用Cytoscape软件，进一步可视化基因间的相关性，并使用MCONE功能进一步获得了一个包含85个基因的核心模块（图2），这85个基本全部为表达上调的差异基因。随后，使用Kaplan-Meier Plotter网站对该85个基因进行生存分析，对某一基因进行数据分析过程中，均以该基因表达量的中位值为界，将患者分为高表达组和低表达组。结果显示，该85个基因中84个基因均与NSCLC患者的OS有关，其中75个基因与LUAD患者的OS有关（表2）。在该条件下进一步将条件限制在接受放疗的肺癌患者人群中，发现TRIP3的表达仍与接受放疗的肺癌患者的生存预后有关（图3A）。而据Kaplan-Meier Plotter数据库分析显示，TRIP3表达量与肺鳞癌（lung squamous cell carcinoma,LUSC）患者的生存预后无关（P=0.820，图3B）；使用含有66例LUSC的GSE37745数据集再次进行验证，结果同样显示TRIP3的表达量与LUSC患者的生存预后无关（P=0.60，图3C）。这种在肺癌不同病理亚型中的差异可能是因为肿瘤异质性所导致的，故此后将研究重点放在了TRIP3与LUAD之间的关系上。为验证TRIP3表达量与LUAD以及接受放疗的LUAD患者生存预后之间的关系，又选择在含有443例LUAD样本和9例正常组织样本表达数据的GSE68465数据集进行了表 1 本研究所用的GEO数据集信息Tab 1 Information on the GEO dataset used in this studyGEO datasetCancer tissueNormal tissueTotalGSE18842464591GSE191889165156GSE335328020100GSE6846544319462GSE377451960196GEO:Gene Expression Omnibus;GSE:Gene Expression Omnibus Series.GSE18842 GSE19188 GSE33532GSE18842 GSE19188 GSE335321182571111647891711193935712849155AB图 1 3个数据集共同表达上调的164个基因和共同表达下调的357个基因。A：3个数据集共同表达的上调基因的数量；B：3个数据集共同表达的下调基因的数量。Fig 1 164 genes co-expressed up-regulated and 357 genes co-expressed down-regulated in the three datasets.A:The amount of up-regulated genes co-expressed in the three datasets;B:The amount of down-regulated genes co-expressed in the three datasets.图 2 Cytospace分析后所得的85个核心基因Fig 2 85 core genes from Cytospace analysis5中国肺癌杂志2024年月第27卷第期Chin J Lung Cancer,January 2024,Vol.27,No.表 2 Kaplan-Meier Plotter分析84个基因与与LUAD生存预后之间的关系Tab 2 Correlation between 84 genes and survival prognosis in LUAD analyzed by Kaplan-Meier PlotterCategoryGenesCountWith significant relationship between gene expression and survival(P0.05)CDCA7,RAD51AP1,FAM83D,CENPK,POLE2,STIL,FEN1,HMMR,CKS1B 9LUAD:lung adenocarcinoma.TRIP13HR=1.92(1.08-3.42)P=0.023ExpressionLowHighSurvival probability1.00.80.60.40.20.0Number at risk0 20 40 60 80 100 120TRIP13HR=0.97(0.77-1.23)P=0.820Survival probability1.00.80.60.40.20.01.000.750.500.250.00Survival probabilityExpressionLowHigh0 50 100 150 200 0 50 100 150 200 Follow up time(mon)Number at risk262 90 25 7 1262 89 29 8 3StrataTRIP13=highTRIP13=lowNumber at riskP=0.610StrataTRIP13=highTRIP13=low33 13 5 2 033 13 5 3 0ABC 0 50 100 150 200 Follow up time(mon)StrataTRIP13=highTRIP13=low 0 20 40 60 80 100 120 32 23 20 10 7 3 1 33 23 13 7 4 2 0Strata 0 50 100 150 200 TRIP13=highTRIP13=lowFollow up time(mon)Follow up time(mon)Follow up time(mon)Follow up time(mon)图 3 TRIP13的表达和肺癌患者生存预后之间的关系。A：Kaplan-Meier Plotter数据库显示的TRIP13的表达与接受放疗的肺癌患者（n=65）的生存预后有关；B、C：Kaplan-Meier Plotter数据库（n=524）和GSE37745数据集（n=66）双重证明TRIP13与LUSC患者的生存预后无明显的关联。Fig 3 Relationship between TRIP13 expression and survival prognosis of lung cancer patients.A:Significant correlation between TRIP13 expression and survival prognosis of lung cancer patients(n=65)treated with radiotherapy as shown in the Kaplan-Meier Plotter database;B,C:Dual demonstration of no significant correlation between TRIP13 and survival prognosis of patients with LUSC as shown in the Kaplan-Meier Plotter database(n=524)and the GSE37745 dataset(n=66).HR:hazard ratio;LUSC:lung squamous cell carcinoma.生存分析。此外，由于R软件在进行生存分析过程中自动将TRIP3表达量的中位值舍弃，并将剩余数据分为TRIP3表达量高和表达量低的两组，故图中显示的总病例数比实际病例数少例（图4）。结果显示，TRIP3表达水平与LUAD患者的OS率有关（P0.00），TRIP3表达量越高的患者，OS率越低。为进一步观察TRIP13基因的表达是否与接受过放疗的LUAD患者的生存预后相关，筛选了该数据集中65例接受过放疗的LUAD患者，对这一部分人群再次进行生存分析，发现TRIP13的基因表达量与这65例患者的OS率有关（P=0.037）。这些结果表明，TRIP3或许可作为LUAD患者（包含既往接受过放疗）预后的分子标志物。2.3 TRIP3可能参与DSB后的重组修复 为进一步观察TRIP13基因可能参与的信号通路，在仅含有正常肺组织和LUAD组织的mRNA数据的GSE68465数据集中，通过使用R软件的enrichplot包对TRIP13基因进行了基因富集分析，结果发现，TRIP13基因与细胞周期检查点信号通路、DNA复制以及DSB的HR修复有密切关系（图5）。其中，HR修复是放射线作用于癌细胞并引起癌细胞发生DSB事件后最主要的修复方式之一，也与肿瘤的放射抵抗有密切关系。由此可见，TRIP3可能与LUAD的发生发展有关，并且很大程度上可能与LUAD的放疗抗性有关，或可成为临床上LUAD治疗的潜在靶点和预后标志物。根据以上分析提示的TRIP3与DNA损伤修复之6中国肺癌杂志2024年月第27卷第期Chin J Lung Cancer,January 2024,Vol.27,No.0 50 100 150 200 0 25 50 75 100 1501.000.750.500.250.000001.000.750.500.250.00-StrataTRIP13=highTRIP13=lowStrataTRIP13=highTRIP13=lowSurvival probabilitySurvival probabilityFollow up time(mon)Number at riskStrataTRIP13=highTRIP13=low220 87 25 7 1222 123 19 4 0 0 50 100 150 200 Follow up time(mon)Follow up time(mon)Number at riskStrataTRIP13=highTRIP13=low32 18 9 4 2 032 23 15 8 3 1 0 25 50 100 150 200 Follow up time(mon)P=7e-04P=0.037AB图 4 GSE68465数据集验证TRIP13与LUAD（n=442）（A）以及其中接受放疗的LUAD患者（n=64）（B）的生存预后之间的关系。因R软件在进行生存分析过程中，自动将TRIP13表达量的中位值舍弃，再将剩余数据分为TRIP13表达量高和表达量低的两组，故图中显示的总病例数比实际病例数少1例。Fig 4 GSE68465 dataset validation of the association between TRIP13 and survival prognosis in LUAD(n=442)(A)and in those of LUAD patients treated with radiotherapy(n=64)(B).Because the R software automatically discarded the median value of TRIP13 expression during survival analysis,and then the remaining data were divided into two groups with high and low TRIP13 expression,the total number of cases shown in the figure is one less than the actual number of cases.间可能存在的联系，通过TIMER在线数据库分析了TRIP13基因与HR信号通路的多个基因之间的相关性，结果（Spearman相关分析）发现，在LUAD中TRIP13与HR通路的多个基因之间存在明显的正相关，例如重组酶RAD5（RAD5 recombinase,RAD51）基因（r=0.780,P0.00）、乳腺癌号（breast cancer,BRCA1）基因（r=0.782,P0.00）、核酸外切酶I（exonuclease,EXO1）基因（r=0.803,P0.00）以及乳腺癌2号（breast cancer 2,BRCA2）基因（r=0.59,P0.00）等，提示在LUAD中，TRIP3可能会促进放疗后的HR，与肿瘤的放疗抵抗、患者的不良预后有关。2.4 TRIP3表达量与接受放疗的LUAD患者临床预后有关 Kaplan-Meier生存分析的结果显示，TRIP3高表达组的患者预后较差，提示TRIP3可作为LUAD患者临床预后的潜在指标。GSE68465数据集中包含65例既往接受过辅助放疗的NSCLC患者的临床数据，对这些临床数据进行单因素和多因素Cox回归分析（表3），以更好地了解TRIP3与既往接受过放疗的LUAD患者的生存预后之间的关系，结果表明TRIP3表达量、肿瘤原发灶-淋巴结-转移（tumor-node-metastasis,TNM）分期、是否接受过辅助化疗和肿瘤组织分化程度对LUAD患者的OS有影响（P，P0.05，患者的OS较短；而接受过辅助化疗显示是患者的保护性因素（HR=0.50,95%CI:0.280-0.932），患者的OS较长。然而，将单因素分析显示的与患者预后有关的因素纳入多因素Cox分析，仅TNM分期对患者的预后有影响（HR=2.2,P=0.04）；TRIP3的表达量虽不再对患者的OS有影响（P=0.068），但仍在一定程度上是LUAD患者的危险因素，TRIP3高表达患者的死亡风险是低表达患者的.74倍。2.5 构建具有放射抗性的人LUAD细胞系 为确定TRIP3分子与LUAD放疗抵抗之间的相关性，首先构建了具有放射抗性表型的人LUAD细胞系H292DR。此后为了验证放射抗性表型的成功构建，对H292DR细胞和H292细胞进行了CCK-8细胞增殖实验和克隆形成实验验证。相较于H292细胞而言，H292DR细胞形成的克隆更大更多；由于高剂量组在开始时所接种的细胞多，虽6和8 Gy等高剂量组相较于低剂量组而言形成的克隆数较多，但存活分数随着放射剂量的升高而逐渐降低；并且随着X射线剂量的增加，相较于H292细胞而言，H292DR的克隆形成率更高，两组具有统计学差异（图6A、6B）。CCK-8实验结果同样表明，H292DR在不同剂量的X射线照射下具有更强的细胞增殖能力（图6C），表明放射抗性细胞系构建成功。显微镜明场下观察，H292DR细胞在形态上也发生了些许改变，体积稍变大（图6D）。随后，为了观察在具有放射抗性的细胞中TRIP3蛋白的表达情况，Western blot检测H292细胞和H292DR细胞中TRIP3的蛋白含量，发现H292-IR细胞中TRIP3蛋白水平相较于H292细胞而言有轻微升高的趋势，但没有统计学差异（图6E）。7中国肺癌杂志2024年月第27卷第期Chin J Lung Cancer,January 2024,Vol.27,No.2.6 沉默TRIP3后能够减弱H292DR细胞的克隆形成和迁移能力 为了观察TRIP3在放射抵抗的LUAD细胞中的作用，使用2条siRNA沉默H292DR细胞中的TRIP3。Western blot检测siRNA作用24、48和72 h后TRIP3的表达情况，发现在3个时间点，相较于NC组而言，2条siRNA均能明显降低H292DR细胞中TRIP3蛋白水平的表达（图7A）。随后，再次重复对TRIP3分子的敲减，并收取siRNA作用24 h后的H292DR细胞进行克隆形成实验和Transwell细胞迁移实验。克隆形成实验分成两组，一组不接受放射线处理，每孔铺300个细胞至2孔板中；另一组，每孔铺500个细胞至2孔板中，次日在细胞贴壁24 h后给予单次6 Gy的放射线处理。此后，两组继续培养直至形成肉眼可见的克隆。实验结果表明，沉默TRIP3后，不论是否有放射线的干预，均能降低放射抗性H292DR细胞的克隆形成能力，对照组和siRNA敲减组之间差异具有统计学意义（P0.05，图7B、7C）。细胞迁移实验结果显示，沉默H292DR细胞中TRIP3表达后，能够明显削弱H292DR细胞的迁移能力（P0.05，图7D），这一结果与平板克隆的实验结果相吻合。以上结果表明，沉默TRIP3不仅可以增加具有放射抗性的TRIP13 GSEA-KEGG.dot plotProteasomeDNA replicationRibosome biogenesis in eukaryotesSpliceosomeParkinson diseaseAmyotrophic lateral sclerosisCell cycleNucleocytoplasmic transportHuntington diseaseAlzheimer diseaseCount 30 60 90120P adjust2.783e-09TRIP13 GSEA-KEGGRunning enrichment score0.750.500.250.00Ranked list metric 1.0 0.5 0.0-0.52500 5000 7500 10,000 12,500Rank in ordered datasetGene ratio0.4 0.5 0.6 0.7 0.8 0.9Alzheimer diseaseAmyotrophic lateral sclerosisCell cycleDNA replicationHuntington diseaseNucleocytoplasmic transportParkinson diseaseProteasomeRibosome biogenesis in eukaryotesSpliceosome0.60.40.20.0 1.0 0.5 0.0-0.52500 5000 7500 10,000 12,500Rank in ordered datasetRunning enrichment scoreRanked list metricProteasome complexOrganellar ribosomeTelomere maintenanceMitotic sister chromatid segregationNuclear chromosomeRecombinational repairDouble-strand break pair via homologous recombinationCell cycle checkpoint signalingNuclear divisionMicrotubule cytoskeletonorganizationCount 40 60 80100120P adjust5.918e-09Cell cycle checkpoint signalingDouble-strand break pair via homologous recombinationMicrotubule cytoskeleton organizationMitotic sister chromatid segregationNuclear chromosomeNuclear divisionOrganellar ribosomeProteasome complexRecombinational repairTelomere maintenanceTRIP13 GSEA-GO0.3 0.4 0.5 0.6 0.7 0.8Gene ratioTRIP13 GSEA-GO.dot plot图 5 使用GSE68465数据集对TRIP13进行单基因的GSEA分析Fig 5 GSEA analysis of TRIP13 as a single gene using the GSE68465 dataset8中国肺癌杂志2024年月第27卷第期Chin J Lung Cancer,January 2024,Vol.27,No.H292DR细胞对放射线的敏感性，还可抑制其迁移能力。2.7 沉默TRIP3后削弱放射抗性LUAD细胞的HR修复能力 由于此前对TRIP13在LUAD中的单基因富集分析的结果提示，TRIP13很有可能与HR修复有密切关系。为进一步地观察沉默TRIP3后具有放射抗性表型的LUAD细胞的DNA损伤修复能力是否会受到影响。于是，在使用siRNA成功敲低TRIP3后，同步检测ATM、p-ATM、RAD5以及REV7这4个HR修复通路关键分子的蛋白表达变化，结果（图8）显示，沉默TRIP3的表达后总ATM的表达没有明显变化，而p-ATM（S98）的磷酸化水平、RAD5和REV7的表达水平均出现了明显的降低。该结果提示，TRIP3可能与HR修复密切相关，沉默TRIP3后或可通过削弱LUAD细胞的DNA修复能力来增加放射抗性细胞对放射线的敏感性。3 讨论肿瘤细胞是一个异质性很强的群体，部分肿瘤细胞对放射线不敏感，在反复放射线照射的刺激下获得生存优势，放射抗性的相关基因组突变得以积累，是导致临床上恶性肿瘤患者放疗疗效不佳、生存预后差的一个重要原因。近年来，国内外也已有大量的基础研究5,6围绕着恶性肿瘤的放疗抵抗问题开展。在本研究中，我们首先通过分析GEO数据库中与肺癌有关的数据，经筛选以及外部数据集验证，发现TRIP13基因在NSCLC中表达上调，并与患者的不良预后有关。进一步分析发现，TRIP13基因与NSCLC中的LUAD亚型关系更为密切；并且在接受过放疗的LUAD人群中，TRIP13基因的高表达患者的总生存率亦有显著的降低（P0.05）。对TRIP13进行GSEA分析发现，TRIP13可能参与DSB后的HR修复，提示这可能是接受放疗后TRIP3高表达的LUAD人群预后不良的原因。TRIP3是ATP酶中AAA(+)ATP酶家族成员之一，参与减数分裂和有丝分裂，在细胞分裂过程中发挥了重要作用7,8。在减数分裂的G2前期，大量DSB的积累引发了染色体重组检查点的激活，TRIP3参与调控同源染色体重组并促进了DSB修复，以保证细胞分裂的顺利进行；而在有丝分裂期间，TRIP3则主要参与了检查点信号通路、DSB修复等，此外，TRIP3还通过改变有丝分裂阻滞缺陷蛋白2（closed-mitotic arrest deficient protein 2,C-MAD2）构象，释放细胞分裂周期蛋白20（cell division cycle 20,CDC20），以激活有丝分裂后期促进复合物/细胞周期体（anaphase-promoting complex/cyclosome,APC/C）来推动细胞分裂进入后期7,9。然而，近些年来，越来越多的研究20-22发现TRIP3也参与到癌症发生发展中。TRIP3的表达量与恶性肿瘤患者的不良预后以及与放疗、化疗敏感性之间的关系也已在文献3中得到了初步的报道与证实。表 3 GSE68465数据集中65例接受过放疗的LUAD患者预后因素的单因素和多因素Cox回归分析Tab 3 Univariate and multivariate Cox regression analyses of prognostic factors in 65 patients with LUAD who had received radiotherapy in the GSE68465 datasetParameters Univariate analysisMultivariate analysisHR(95%CI)PHR(95%CI)P GenderFemaleReferenceMale1.126(0.622-2.040)0.695Age(yr)60Reference601.280(0.696-2.353)0.428TNM stagel-llReferencelll2.170(1.230-3.829)0.0082.112(1.161-3.850)0.014DifferentiationWell-moderateReferencePoor2.011(1.127-3.589)0.0181.348(0.737-2.465)0.330Adjuvant chemotherapyNoReferenceYes0.510(0.280-0.932)0.0290.531(0.280-1.010)0.054Smoking historyNoReferenceYes2.235(0.883-5.652)0.090TRIP13 expressionLowReferenceHigh1.813(1.026-3.206)0.0411.714(0.960-3.061)0.068HR:hazard ratio;CI:confidence interval;TNM:tumor-node-metastasis.9中国肺癌杂志2024年月第27卷第期Chin J Lung Cancer,January 2024,Vol.27,No.多项研究3,4,20-22表明TRIP3在不同的癌症类型（如乳腺癌、前列腺癌、肺癌、骨髓瘤、头颈癌等）中存在过表达或异常扩增，提示它可能具有致癌特性。例如，Kang等23通过在36例NSCLC患者的样本中进行高分辨率微阵列比较基因组杂交技术，以期发现早期NSCLC遗传学事件，结果显示50%的NSCLC患者存在TRIP13拷贝数异常，而此比例在I期NSCLC患者中则更高（68%）。Clairmont等4的研究表明，TRIP3通过催化前NEHJ因子REV7发生失活构象改变，可抑制NHEJ并促进HR的发生；并发现TRIP3的高表达促进了HR、介导了聚（腺苷二磷酸）-核糖聚合酶poly ADP(adenosine diphosphate)-ribose polymerase,PARP抑制剂的耐药性，与BRCA缺陷型乳腺癌患者的不良预后相关。Banerjee等3的研究则是发现TRIP3在头颈癌中过表达，促进癌症的发生发展，并通过促进NHEJ来介导癌细胞对顺铂以及放射线的耐受性，造成癌细胞对放化疗的抗性。而Wang的研究团队24则通过晶体结构鉴定，预测并验证了靶向TRIP3分子抑制剂DCZ045的存在，该抑制剂通过抑制NEHJ过程和核因子B（nuclear factor kappa-B,NF-B）活性，发挥了良好的抗骨髓瘤治疗活性。目前已发表的研究20,25结果，也与我们通过生存分析所显示的TRIP3的高表达与LUAD患者的不良预后有关相吻合，额外的生存分析以及针对TRIP13的单基因富集分析结果提示TRIP13的异常扩增可能通过促进放疗后的DNA损伤修复，导致接受放疗的LUAD患者预后不良。但目前TRIP3与LUAD的放疗抗性之间的关系尚无报道。为了明确TRIP3分子和LUAD放疗抗性之间的关系，我们首先通过亚致死剂量照射法构建了具有放射抗性的人LUAD细胞系，并将其称之为H292DR。通过检测H292细胞和H292DR细胞中TRIP3蛋白的表达，发现TRIP3蛋白的表达水平在H292DR有轻微的升高趋势。随后，通过设计siRNA靶向敲低H292DR细胞中TRIP3的表达，观察到，敲减TRIP3的表达后能显著降低H292DR细胞的克隆形成能力和迁移能力（P0.05）。由于前期数据分析结果提示TRIP3可能参与促进DSB后的HR修复，而ATM、REV7、BRCA2和RAD5等是参与DSB后HR修复的0 Gy 2 Gy 4 Gy 6 Gy 8 Gy1.251.000.750.500.250.00 0 1 2 3 4 CCK-8Time(d)Relative OD450 valueH292H292DR1.00.80.60.40.20.00 2 4 6 8 10 H292DRH292Surv