pubmed操作过程和操作习题.ppt

PubMed数据库NCBI(National Center for Biotechnology Information)Email:Dept.of Medical InformationDept.of Medical Information2020/4/1712024/5/8 周三 NCBI网站(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov)All DatabasesDept.of22024/5/8 周三文献型数据库数值型数据库辅助数据库Dept.of32024/5/8 周三Dept.of42024/5/8 周三Dept.of52024/5/8 周三一、PubMed 数据来源及收录范围（1 1）MedlineMedline（2 2）Premedline-In Process CitationsPremedline-In Process Citations（3 3）Publisher Supplied CitationsPublisher Supplied CitationsDept.of62024/5/8 周三一、PubMed数据来源及收录范围(1)Medline50005000余种生物医学期刊余种生物医学期刊 起始时间起始时间:1950-:1950-年报道量年报道量:约约4040万条万条 英文英文:占占88%88%内容涉及：内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽医学等医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽医学等专业。专业。记录标注记录标注:PubMed-indexed for MEDLINEDept.of72024/5/8 周三一、PubMed数据来源及收录范围(2)Premedline最新文献临时库：最新文献临时库：收集未正式给予收集未正式给予MeSHMeSH词、出版类型等深度标引信息的期词、出版类型等深度标引信息的期刊文献。刊文献。“PubMedPubMed计划计划”：出版商提交期刊论文题录给出版商提交期刊论文题录给PubMedPubMed，加入到，加入到PreMedlinePreMedline库中。这些文献被标引了库中。这些文献被标引了MeSHMeSH词等信息后，转入词等信息后，转入MEDLINEMEDLINE，同，同时从时从PreMedlinePreMedline中删去。中删去。记录标注：记录标注：PubMed-in processDept.of82024/5/8 周三一、PubMed数据来源及收录范围(3)Publisher Supplied Citations MedlineMedline未收录的文献未收录的文献 出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分没有被出版商提供的是整本期刊的信息，若有部分没有被MEDLINEMEDLINE收录，收录，PubMedPubMed仍保存。仍保存。记录标注：记录标注：PubMed-as supplied by publisherDept.of92024/5/8 周三PubMed检索结果页面Dept.of102024/5/8 周三二、PubMed主页构成自由词检索框辅助检索区信息提示区检索功能键Dept.of112024/5/8 周三 三、PubMed自由词检索检索词的输入形式：（1）单词、短语、缩写 如，interleukin；stomach cancer；AIDS（2）著者姓名：如，Smith W（3）期刊相关信息：刊名全称、缩写、ISSN 如，Cancer Research、JAMA、0741-5400Dept.of122024/5/8 周三 自由词检索规则截词检索 bacter*，disease?bacter disease bacteria diseases bacterium作者检索 smith ja;jones k julia s wong;wong julia s(2002年始）逻辑运算 and(空格)、or、not词语检索“single cell”；“World War I”字段限止检索 liver cancertiDept.of132024/5/8 周三 PubMed检索字段 Dept.of142024/5/8 周三 例：肝癌的化学治疗Dept.of152024/5/8 周三四、PubMed检索功能键 Limits（限制）Preview/Index（预览/索引）History（检索史）Clipboard（剪贴板）Details（明细栏）Dept.of162024/5/8 周三Limits（限制）Dept.of172024/5/8 周三 Limits：限定检索词在文献某部分出现(字段限定检索)Dept.of182024/5/8 周三 Limits：限定检索词在文献某部分出现（字段限定检索）Dept.of192024/5/8 周三 Limits：限定文献类型、语种、出版日期、年龄、性别、研究对象等Dept.of202024/5/8 周三用Limit限止“年令、性别、人类或动物、出版物类型”会排除“premedline”和“supplied by publisher”子集中的文献Dept.of212024/5/8 周三Preview/Index（预览/索引）Dept.of222024/5/8 周三 Preview/Index Preview:预览检索结果Dept.of232024/5/8 周三 Preview/Index Index:在索引词表中选择检索词Lead poisoningDept.of242024/5/8 周三 Preview/Index Pubmed的索引可以分字段显示Lead poisoning选择字段Dept.of252024/5/8 周三History（显示检索史、逻辑运算）最多存贮检索式数为最多存贮检索式数为100100个，存贮时间为个，存贮时间为8 8小时。小时。Dept.of262024/5/8 周三Clipboard（剪贴板）Dept.of272024/5/8 周三 Clipboard（剪贴板）最多存放最多存放500500条，保条，保存时间为存时间为8 8小时小时Dept.of282024/5/8 周三 Details（明细栏）Dept.of292024/5/8 周三列出系统实际运行的检索式和检索词Dept.of302024/5/8 周三PubMed智能检索词语自动匹配检索对于输入检索框中的非限定检索词，系统将依次到MeSH词转换表、刊名转换表、短语表以及作者索引表中进行词语匹配查找。检索词加入任何限定（截词,字段限止,引号等）自动匹配检索功能关闭 例：heart diseaseti heart disease?ti“orld War I”Dept.of312024/5/8 周三自动匹配检索功能关闭Dept.of322024/5/8 周三Pubmed功能键Dept.of332024/5/8 周三五、主题词检索（MeSH Database）Dept.of342024/5/8 周三 医学主题词表 （Medical Subject Headings,MeSH）主题词字顺表主题词字顺表副主题词表副主题词表主题词树状结构表主题词树状结构表（分类表）分类表）Dept.of352024/5/8 周三主题词字顺表Dept.of362024/5/8 周三副主题词表(Subheadings)Abnormalities、Administration&Dosage、Adverse Effects、Analysis、Anatomy&Histology、Biosynthesis、Blood、Complication、Congenital、Cytology、DiagnosisDiagnosis use、Diet therapy、Drug therapy、Epidemiology、Etiology、Genetics、Immunology、Injuries、Metabolism、Microbiology、Mortality、Pathology、Psychology、Surgery、Therapeutic Use、Therapy.Dept.of372024/5/8 周三主题词的树状结构(Tree Structures)Dept.of382024/5/8 周三例:肝癌的手术治疗Dept.of392024/5/8 周三Dept.of402024/5/8 周三Dept.of412024/5/8 周三Dept.of422024/5/8 周三例:胃肿瘤的CT诊断Dept.of432024/5/8 周三Dept.of442024/5/8 周三Dept.of452024/5/8 周三Dept.of462024/5/8 周三全部副主题词Dept.of472024/5/8 周三Dept.of482024/5/8 周三注意:主题词检索会排除“premedline”和“supplied by publisher”子集中的文献Dept.of492024/5/8 周三六、检索结果处理Display(Display(显示显示)Sort(Sort(排序排序)Send to(Send to(输出输出)Dept.of502024/5/8 周三1.Display检索结果显示Dept.of512024/5/8 周三Summary格式（默认格式）文献标记Dept.of522024/5/8 周三Abstract格式全文链接Dept.of532024/5/8 周三Dept.of542024/5/8 周三2.Sort By检索结果排序(按默认)默认:按PMID号排序(PMID:Pubmed文献标识号)Dept.of552024/5/8 周三2.Sort检索结果排序(按作者)Dept.of562024/5/8 周三3.Send to检索结果的输出Send to text:保存当页显示的记录保存当页显示的记录Send to file:可保存全部记录可保存全部记录Send to RSS Feed:检索结果的检索结果的RSS订阅订阅Dept.of572024/5/8 周三七、其他辅助检索工具Dept.of582024/5/8 周三1、期刊数据库（Journal Database）可以从期刊的名称(全称或缩写)、ISSN号来查找期刊信息。主要用途：查期刊全称。例：Dept.of592024/5/8 周三 检索期刊“JAMA”的全称Dept.of602024/5/8 周三JAMA检索结果链 接 到JAMA网 站检索刊登在JAMA上的文献Dept.of612024/5/8 周三2.临床问题（Clinical Queries）Search by Clinical Study Category 专为临床医生设计的查找有关某一疾病的治专为临床医生设计的查找有关某一疾病的治疗、诊断、病因、预后等与临床密切相关问题的疗、诊断、病因、预后等与临床密切相关问题的文献。文献。Find Systematic Reviews 检索系统评价检索系统评价(循证医学证据循证医学证据)Dept.of622024/5/8 周三 3.引文匹配器（Citation Matcher）引文匹配器可通过已知的刊名、日期、卷、期、首页码、作者名等任一项信息查找文献的详细信息。经常用于核对参考文献。Dept.of632024/5/8 周三查找引文信息 1、Gene Therapy,1999,and the title words,mitochondrial gene therapy.2、Arthritis Rheum,1982,page 1271 3、V.Lee,Biochemical Pharmacology,vol.29,issue 14 4、A powder formulation of measles vaccine for aerosol deliveryDept.of642024/5/8 周三Dept.of652024/5/8 周三八、Pubmed的链接功能相关文献链接全文文献链接NCBI数据库链接外部资源链接Dept.of662024/5/8 周三相关文献链接(Related Articles)Dept.of672024/5/8 周三全文文献链接Dept.of682024/5/8 周三NCBI数据库链接Dept.of692024/5/8 周三外部资源链接(Link Out)Dept.of702024/5/8 周三九、个性化设置（My NCBI)My NCBIMy NCBI功能：功能：检索策略保存检索策略保存 追踪某一个学科专题的进展情况。追踪某一个学科专题的进展情况。个性化界面设置个性化界面设置 Dept.of712024/5/8 周三检索策略保存(随时跟踪某一专题的新文献)Dept.of72Dept.of732024/5/8 周三Dept.of742024/5/8 周三Dept.of752024/5/8 周三界面个性化设置Dept.of762024/5/8 周三Dept.of772024/5/8 周三Dept.of782024/5/8 周三Tutorial和HelpDept.of792024/5/8 周三Pubmed特点(比较Medline)免费免费收录范围广收录范围广更新及时更新及时词汇自动转换功能词汇自动转换功能广泛的链接功能广泛的链接功能个性化功能个性化功能Dept.of802024/5/8 周三请补全下述文献题录信息请补全下述文献题录信息(题目、著者、刊名、题目、著者、刊名、年、卷、期、页年、卷、期、页)：1、Arthritis Rheum,1982,page 1271 2、V.Lee,Biochemical Pharmacology,vol.29,issue 14 3、A powder formulation of measles vaccine for aerosol deliveryDept.of81Thanks!Dept.of Medical InformationDept.of Medical Information2020/4/1782