文献信息分析软件RefViz的使用与实践ppt课件.ppt

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,.,*,文献信息分析软件RefViz的使用与实践,云南大学图书馆,陈 强,2011年11月16日,“金钥匙讲坛”文献管理软件系列之四,.,前言：科研工作者的四项信息修炼,文献检索,文献管理,信息分析,协作分享,图书馆资源,检索基本知识,常用数据库,RSS订阅,搜索引擎,EndNote X4,NoteExpress 2.6,Quosa,HistCite,TDA,Citespace,RefViz,OmniViz,Mendeley,Zotero,共享协作平台,.,导入：数字化时代科研人员的“困扰”,传统的文献存储方式：遗忘丢失，重复下载,低效的文献阅读方式：耗力费时，无法整合,落后的论文写作方式：手工编排，枯燥易错,.,“困扰”的根源和解决方案,.,内容提要,RefViz简介、作用、适用人群,RefViz工作原理,软件下载与安装,主界面介绍,从EndNote、Reference Manager无缝导入数据,关键词分析,其他功能（同义词定义工具）,上机实习,小结,.,1.1 RefViz简介,RefViz 是由 Thomson 公司和 ominiviz 公司合作开发用于文献信息分析的软件。,网络可以帮助我们获取大量的信息，当信息多到一定的程度的时候，我们不可能逐一阅读；另外，即使文献的数量不是太多，可以阅读，也会耗费大量的时间，同时也会大幅降低我们获取信息的效率。,怎样从这些信息中快速找到相关的信息，怎样快速把握这些信息的主要内容，是当今每位科研工作者都面临的问题。,.,1.2 RefViz的作用,RefViz 可以帮助我们分析、组织和管理大量的文献。通过采取与我们阅读文献类似的方式：通读所有文献、找出关键信息，然后进行归类，并以,可视化的图形方式,将归类的结果展示出来。,可以帮助我们发现研究热点，找出文献间的相互关系，快速了解某一领域的整体情况等。,可以帮助我们确定研究方向，开拓研究思路，寻找新的解决方案和突破口等。,不管你是初涉科研的学生，还是一位资深的研究人员，我们都建议你去学习和掌握这款软件。它可以帮助你快速处理海量信息，让你在竞争中领先一步。,.,1.3 RefViz的适用人群,第一次接触陌生课题,研究生撰写开题报告,老板突发奇想，让我们做一些“开创性的工作”,平时有文献管理需求的师生,想要读博或继续深造的师生,不想淹没在科研大军中，一辈子“默默无闻”，如何出奇制胜，增加文章的被引次数，投稿到影响因子较高的期刊,.,2.1 RefViz工作原理,与平时阅读文献的过程类似，reading-finding-dividing,并不是单纯通过词频来统计，而是通过一种数学模式找出哪些词是最重要的，哪些是次重要的，哪些是无关紧要的，然后利用这两种词对每篇文章进行标识，再通过标准的聚类方法将这批文献分成若干组(Group),.,2.2 RefViz的软件架构,.,2.3 RefViz能告诉我们什么？,通过图示的方式将这些组的文献根据相互间的关系呈现出来，每个文件夹图标表示一组文献，每组文献之间根据相互的类似程度进行排列,图标的大小代表文章数的多少，分布的位置靠得越近，内容越相似；文件夹越密集，说明这些方面的文献越多，是这批文献中研究的热点方向,.,Galaxy图示,.,Pop-up浮动窗口,.,3 软件下载与安装,EndNote X4超级试用版,RefViz 2.1超级试用版,安装运行比较简单，从网站(,www.RefV,)下载试用版，或购买正式版，点击RVINSTALL.EXE即可进行安装。,第一次运行会提醒你输入序列号,.,4 RefViz主界面介绍,第一次运行软件，程序会自动打开sampleview的文件,主界面分为四部分：,1,显示分析结果的窗口，有两种视图显示方式，,Galaxy,视图和,Matrix,视图,2topic,区域，从左往右是,major topic,、,minor topic,、,descriptive terms,3,当前选择的所有文献列表,4,软件的提示区域，帮助信息,.,.,5.1 三种来源文献的分析,执行联网检索,File-new view-create new view-searching datebase(s)using reference retriever,直接分析文献管理软件中的数据库(推荐),EndNote 7以上的版本、Reference Manager 11以上的版本,利用文件进行分析,File-new view-create new view-Using reference file(s)选择预存的文件,.,从EN或RM无缝导入数据,RefViz 可以实现与Endnote 和RM 的无缝连接，即我们可以将手头的 Endnote 数据库和RM 数据库直接导入。,RefViz 的PDF Help 中介绍了通过下载多种数据库文件后建库的方法，不再赘述。,.,从EN或RM无缝导入数据,这里介绍一下与参考文献管理软件之间嵌入的方法。,在 RM 或Endnote 的安装目录下，均有一个文件Configure DataViz.exe，运行此文件后，按照Wizard 的提示，找到 RefViz 安装目录下的RefViz.exe 文件，然后按照提示就可建立链接。,打开RM，可以看到工具栏中已经出现RefViz 的链接工具，点击该工具栏，RefViz会开始自动建立相关数据库（注意此时新建的数据库自动保存在X:RefVizdatasets文件夹中）。,此外，可以通过导出RM 或Endnote 数据库为RIS 格式的文本文档，然后在RefViz 中导入。,.,方法一：在EndNote(版本7以前)文件下，找到Configure DataViz.exe，然后按照提示建立链接,.,方法二：EndNote X4-Tools-Data Visualization,.,5.2 视图创建的过程,词库的创建,移除终止词(about/either/also/very/who/these等),安装目录下stopwords文件夹，default.stop.txt是设置终止词的默认文件，一行一词,主词提取,计算不同词的权重，确定主词和辅词,分辨同义词，识别主词之间的相互关系,主词仅由标题和摘要中的词决定，若无摘要则调用Notes中的内容,作者不会出现在主词中,创建文件组(根据标准聚类分析的方法创建文献组),视图展示(根据文献亲近关系，排列在Galaxy视图和Matrix视图中),.,5.2.1 Galaxy视图,打开Galaxy视图,Galaxy视图中的信息,Galaxy视图中的操作,选择文献和文献组(Edit-Select All、Ctrl+A),取消选择(Edit-Clear Selections、Ctrl),显示文献和文献组信息,基本操作(移动、放大缩小、全窗口、复位到初始状态),利用Galaxy视图挖掘信息,创建子视图(File-Create Subset View),反选除掉边缘文献(Edit-invert selections),直接检索(topic窗口，search tool),直接阅读文献信息(reference viewer窗口，双击打开详细信息),个性化设置(Edit-Preferences，设置Galaxy视图的颜色),.,5.2.2 Matrix视图,Matrix视图显示的是文献组与主词或主词与主词之间的相互关系,列总是代表主词，而行既可以代表文献组也可以代表主词,可以快速了解到主词在不同组中被讨论的情况，快速发现哪些概念通常在一起讨论，哪些概念之间有相似性等,.,5.2.2 Matrix视图,当行代表文献组时(默认设置)，Matrix视图提供的信息是每个概念会在哪些组中被讨论,可以选择颜色代表相关性，也可以用颜色代表文献的数量,默认设置用颜色代表相关性，即主词与每组所有文献之间或主词之间相关联的程度,红色表示关联性强，蓝色表示没有关联,如果用颜色表示数量，则白色表示零，黑色表示最大。白色表示没有相关性，黑色表示强相关性,.,5.2.2 Matrix视图,Matrix视图的排序,Matrix视图的操作,利用指示窗浏览Matrix视图,判断行列主题间的相关性,.,6.1 RefViz的其它功能,分类之后，还可以通过一系列的工具去影响它的分类，如通过调整major topic，或者定义同义词thesaurus等，可实现交互式的分类。,也可以通过辅助工具找出某些概念之间的相互关系，以及与某篇文章相关的其它文献等。,.,6.2 RefViz的其它功能,主词工具(topic tool),通过主词影响文献分类,搜索工具(search tool),如何进行检索,快速检索(quick search),同义词(tool-thesaurus),终止词和其它词汇,.,同义词定义工具,.,例1：利用RefViz分析“转基因食品”的研究趋势,7.1 实例演示(I),.,1.从EndNote中导入题录,.,Note：可能有部分文献因无题名或无摘要而无法导入（默认设置，View Creation Preferences中可修改）,.,导入完成后，进入RefViz,.,1975-2011年转基因食品研究趋势,1975-1999年,1975-2009年,1975-2011年,.,例2：利用RefViz分析SELEX的发展趋势,7.2 实例演示(II),.,例2结果解读,由上图中可以看出，红色椭圆选中的区域是 2007 年明显占优势的区域，2007 年在该领域发表的文章远远超过了 1992-2006年文章的总和。,分别查看红色框中的主题词分布和所有文献的主题词分布，如下图所示：,.,例2：利用RefViz分析SELEX的发展趋势,.,例2结果解读,比较排列在前面的主词，可以发现 2007 年排在 1、2 位的主词在所有文献中分列 3、1位，变化不大；2007 年排在 3、4 位的主词，在所有文献中列在 11、12 位，有较大提前；比较明显的变化是 2007 年排在第五位的 detection，在所有主词中排在很靠后的位置；这表明 detection 是 2007 年这些文献中的一个热点。进一步查看文献信息发现 2007 年发表的文章中有相当大的一部分是关于检测（detection）的。,可以通过以下途径验证以上判断，分别检索 2007 年发表的文章共 181 篇，所有关于detection 的文章 81 篇，包含 detection 或2007 年发表的文章共计 215 篇，由此可以得出 2007年发表的关于 detection 的文章有 181+81-215=47 篇，占 47/81=58%，即关于 detection 的文章 2007 年发表的文章占总 detection文章数的 58%。,所以通过以上途径，我们可以很快把握科学发展的动向。知道哪些是当前比较热门的方向，从而为自己确定研究方向服务。,.,8 小结,RefViz简介、工作原理、软件下载与安装,主界面介绍,三种来源文献的分析及其视图创建的过程,RefViz其它功能,2个实例的演示,答疑,上机实习,.,谢谢！,欢迎大家继续关注文献管理软件系列讲座7005128,.,