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植物小肽信号生物学功能及其在作物改良中研究进展.pdf

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资源描述

1、Hereditas(Beijing)2023 年 9 月,45(9):813828 收稿日期:20230621;修回日期:20230808;网络发布日期:20230818 基金项目:国家重点研发计划项目(编号:2018YFA0900603),国家自然科学基金重大项目(编号:31991183)和名贵中药资源可持续利用能力建设项目(编号:2060302)资助 Supported by the National Key R&D Program of China(No.2018YFA0900603),the Major Research Plan of National Natural Science

2、 Foundation of China(No.31991183),and the Ability Establishment of Sustainable Use for Valuable Chinese Medicine Resources(No.2060302)作者简介:吕倩雯,博士研究生,专业方向:植物分子遗传育种。E-mail: 通讯作者:杨永芳,博士,副研究员,研究方向:植物发育与环境适应性机制。E-mail: DOI:10.16288/j.yczz.23-169 综 述 植物小肽信号生物学功能及其在作物改良中研究进展 吕倩雯1,2,杨永芳1 1.中国科学院遗传与发育生物学研究所,

3、植物基因组学国家重点实验室,北京 100101 2.中国科学院大学,北京 101408 摘要:作为植物体内一类重要的信号分子,小肽在飞摩尔(fmol)级的浓度下被相应的细胞质膜类受体激酶识别并结合,开启小肽-受体介导的细胞间信号转导过程,从而调控植物干细胞的生长与增殖,调节根、茎、叶、花和果实等多种植物器官的发育,协调植物响应生物和非生物胁迫等多种生理过程。随着研究的不断深入,越来越多的报道揭示了小肽在水稻(Oryza sativa)、玉米(Zea mays)、马铃薯(Solanum tuberosum)及番茄(Solanum lycopersicum)等多种作物农艺性状中的重要调控功能,暗示

4、着小肽信号在作物遗传改良中的巨大应用潜力。本文系统总结了小肽-受体介导的信号转导模式在植物中的生物学功能及分子机制,重点综述了小肽在调控作物产量、品质和抗性等重要农艺性状中的研究进展,并讨论了小肽信号应用于作物育种改良的策略,最后提出了小肽研究的未来方向。关键词:小肽信号;植物中的功能机制;作物农艺性状调控;作物改良策略 The biological functions of peptide signaling in plant and the advances on its utilization for crop improvement Qianwen Lv1,2,Yongfang Yan

5、g1 1.State Key Laboratory of Plant Genomics,Institute of Genetics and Developmental Biology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100101,China 2.University of Chinese Academy of Sciences,Beijing 101408,China Abstract:As the important signaling molecules in plants,peptides at femtomolar levels are reco

6、gnized and bound by the corresponding plasma membrane-localized receptor-like kinases.This triggers the peptide-receptor-mediated intercellular signal transduction for regulation of the stem cell growth and proliferation,modulation of the development of plant organs(such as roots,stems,leaves,flower

7、s,and fruits)as well as coordinating plant responses to biotic and abiotic stresses.With the advancement of in-depth research,an increasing number of studies have 814 Hereditas(Beijing)2023 第 45 卷 revealed the crucial role of peptides in regulating agronomic traits of various crops,including rice(Or

8、yza sativa),maize(Zea mays),potato(Solanum tuberosum)and tomato(Solanum lycopersicum).These findings suggest the great potentials of utilizing the peptide signaling for genetic improvement of crops.In this review,we provide a comprehensive overview of the biological function and molecular mechanism

9、of peptide-receptor signaling in plants,and highlight the advances in research of peptides in regulating crop yield,quality and resistance.Then,we discuss the strategies for the application of peptide signaling in crop improvement.Finally,we point out some future directions for peptide research in p

10、lant.Keywords:peptide signal;functional mechanism in plant;regulation of crops agronomic traits;strategies for crop improvement 小肽是一类广泛存在于真核生物、长度通常为2100 个氨基酸的小分子1。在过去的 20 多年里,研究发现小肽作为信号分子广泛参与植物的生长发育、免疫及环境适应性的调控24。近年来,研究人员 通 过 建 立 肽 基 因 组 学 在 模 式 植 物 拟 南 芥(Arabidopsis thaliana)中鉴定到 2000 多个常规肽和1000 多个

11、非常规肽,表明其在植物体内发挥着重要作用5。大多数小肽由前体基因编码,典型的小肽前体都有 C 端的家族特异性保守序列,这些小肽前体通过蛋白酶剪切和翻译后修饰,产生成熟的功能性小肽激素6。大部分成熟的小肽可通过细胞分泌途径分泌到细胞外,被邻近细胞的质膜表面类受体激酶的胞外结构域识别并与之结合,或进行长距离的运输后再与相应的受体胞外域结合,诱导激活受体胞内蛋白激酶域,通过磷酸化激活 MAPK 级联信号和转录因子等下游信号因子7,8,进而调控植物干细胞增殖,根、茎、叶、花、果实、种子等器官发育过程,以及病虫害、干旱、盐胁迫等逆境胁迫的响应914。不同植物中小肽的同源基因结构域高度保守,除了在模式植物

12、拟南芥中,多种小肽分子也在各类农作物中被陆续鉴定出来。作物中小肽信号的生物学功能与其在拟南芥中的功能类似,参与作物产量、品质和抗逆性等重要农艺性状的调控过程,例如每穗粒数、果实大小、芒的发育、花器官脱落、病虫害抗性、耐旱性等,这些研究表明小肽信号在作物遗传改良中具有潜在应用价值1519。本文全面总结了小肽-类受体激酶信号转导途径在调控植物生长发育和环境适应性过程中的分子机制,着重介绍了小肽信号在调控作物产量、品质和抗性等重要农艺性状中的研究进展,简要探讨了小肽信号应用于作物改良的几种策略,并对小肽信号通路未来的研究方向进行了展望。1 小肽-类受体激酶调控植物生长发育与环境适应性 小肽在极低的浓

13、度下被细胞质膜类受体激酶(receptor-like kinases,RLKs)识别并结合,打开下游信号转导途径,介导了细胞间、组织间以及器官间的通讯交流,从而调控植物生长、发育、胁迫反应。富亮氨酸重复类受体激酶(leucine-rich repeat receptor-like protein kinases,LRR-RLKs)是植物中最大的类受体激酶亚家族,包含细胞外 LRR 结构域、跨膜结构域和胞内激酶结构域,这些结构域在小肽配体和LRR 结构域结合时被激活,调控植物各种生理活动20。目前,拟南芥中已鉴定出约 4000 个包括常规肽和非常规肽在内的小肽分子和超 600 个类受体激酶5,7

14、,其中 PSK(Phytosulfokine)、IDA(INFLORESCENCE DEFICIENT IN ABSCISSION)、PEP1(PLANT ELICITOR PEPTIDE 1)、TDIF(TRACHEARY ELEMENT DIFFERENTIATION INHIBITORY FACTOR)和 RALF(RAPID ALKALINIZATION FACTOR)等小肽的晶体结构及其与受体的结合已被解析,但仍然有大量的小肽-受体配对模式及其在植物体内的调控作用未被发现和研究2026。本文系统总结了已报道的一些重要的小肽-类受体激酶信号转导途径在植物干细胞维持与分化,植物根系发育、

15、气孔发育、种子和胚胎发育,植物生殖发育以及植物响应生物与非生物胁迫过程的分子机理(图 1)。第9期 吕倩雯等:植物小肽信号生物学功能及其在作物改良中研究进展 815 图 1 小肽-受体激酶调控植物生长发育和环境适应性的分子机制 Fig.1 Molecular mechanism of peptide-receptor kinases in regulating plant growth,development and environmental adaptation SAM:茎尖分生组织(shoot apical meristem);RAM:根尖分生组织(root apical meriste

16、m)。1.1 小肽-类受体激酶调控植物干细胞维持与分化 植物的组织器官源于植物分生组织中的干细胞,因此干细胞的维持及分化对于植物的生长发育至关重要。植物地上部主要由茎尖分生组织(shoot apical meristem,SAM)分化形成,而茎尖干细胞的维持与分化主要由经典的 CLAVATA(CLV)-WUSCHEL(WUS)负反馈调节回路精确调控。在该负反馈调节回路中,CLE(CLAVATA3/EMBRYO SURROUNDING REGION-RELARED)基因家族成员 CLV3(CLAVATA3)基因受茎尖分生组织中心特异表达的 WUS 转录因子诱导,在中心区的干细胞中表达,经加工后分

17、泌到细胞外并扩散到组织中心,被多个质膜定位的类受体蛋白(CLV1、CLV2、CRN、BAMs、RPK、CIK)识别并结合,反过来抑制 WUS 基因的表达,进而维持 SAM的稳定发育2731。研究表明,WUS 在 CLV3 增强子区域结合一个由 5 个间隔的顺式元件组成的顺式调控模块(cis-regulatory module,CRM),该 CRM 可以在低浓度 WUS 条件下介导 CLV3 的激活,在高浓度WUS 条件下介导 CLV3 的抑制作用。生化分析表明,WUS 在低浓度下以单体形式结合顺式元件;随着其浓度的增加,WUS 以二聚体/多聚体的形式结合,表明高水平的 WUS 二聚化/多聚化可

18、抑制 CLV3 的表达,因此 WUS 的单体和二聚体的协同调控能够实现CLV3 在 SAM 中依赖于 WUS 浓度的时空表达模 816 Hereditas(Beijing)2023 第 45 卷 式32,33。此外,干细胞的关键激活与维持因子 STM(SHOOTMERISTEMLESS)也参与了 CLV3-WUS 负反馈调节回路。通过直接与 STM 相互作用形成异源二聚体,WUS 蛋白能够增强其与 CLV3 启动子的结合速度,并激活其表达,从而增强茎尖干细胞的活性34。近期研究发现,SAM 的发育稳健性还受到多个 CLE配体协同调控。当番茄(Solanum lycopersicum)CLV3基

19、因突变后,其同源“备胎”基因 CLE9 将发生剧烈的转录上调,补偿 CLV3 的功能缺失,以维持 SAM 发育稳健性35。CLE 小肽间的功能协调作用和补偿机制揭示了小肽信号在干细胞内稳态的重要作用。植物的地下部分主要由根尖分生组织(root apical meristem,RAM)发育形成。CLE 小肽和根分生组织生长因子 RGF(ROOT MERISTEM GROWTH FACTOR)参与 RAM 发育过程。在 RAM 中,CLE40小肽的功能类似于 SAM 的 CLV3 小肽。通过与受体激酶 ACR4(ARABIDOPSIS CRINKLY 4)/CLV1 结合,CLE40 能够控制 W

20、US 同源基因 WOX5(WUSCHEL-HELRELATED HOMEOBOX 5)在静止中心表达,促进干细胞分化,从而调控 RAM36,37。在此过程中,WOX5 在静止中心发挥作用并产生其他短程信号,这些信号不仅抑制分化,还能促进相邻细胞的干细胞分裂38。最近有研究发现,CLE40 小肽在通过ACR/CLV1 受体抑制静止中心特异基因在远端区域表达的同时,也能通过 CLV2 受体促进 WOX5 在近端分生组织中表达,从而决定静止中心在根中的位置38。RGF1小 肽 可 以 被 受 体RGFRs/RGIs(RECEPTOR OF RGFs/RGF1 INSENSITIVEs)和共受体 SE

21、RKs(SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASEs)识别,促进下游 RITF1(RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 1)基因的表达,导致 ROS(reactive oxygen species)在根发育区域的重新分布,进而控制根发育的主要调节因子 PLT(PLETHORA)家族成员 PLT1/2 蛋白的稳定性,在维持干细胞活性中发挥着至关重要的作用3941。维管形成层是植物维管系统发育的起始中心,同样也具有干细胞的特征。研究发现由 CLE41 和CLE44 基因编码产生的 TDIF 小肽能够在植物茎的韧 皮 部 合 成 并

22、移 动 到 形 成 层,通 过 与 其 受 体TDR(TDIF RECEPTOR)/PXY(PHLOEM INTER-CALATED WITH XYLEM)相互作用,调控下游WOX基因家族成员 WOX4 和 WOX14 的表达水平,进而抑制形成层干细胞分化和促进干细胞分裂增殖,维持形成层的干细胞库4244。1.2 小肽-类受体激酶调控植物多个器官发育 多种小肽信号参与植物根系的生长发育,包括根维管发育和侧根发育等过程。在根维管发育过程中,一类韧皮部富集 Dof 转录因子 phloem-Dof 可以激活 CLE25/26/45 小肽,使其分泌到胞外并被受体BAM/CIK(BARELY ANY M

23、ERISTEM/CLAVATA3 INSENSITIVE RECEPTOR KINASE)捕获,随后该信号通路反过来抑制 Dof 蛋白的稳定性,从而抑制原形成层分化和韧皮部形成45。需要注意的是,Dof蛋白存在自激活和互相激活过程,且不直接受 CLE小肽的抑制,使得本应该形成韧皮部细胞的部位不受 CLE 小肽信号通路的调控45。此外,CLE9/10 小肽通过与 BAM 类受体激酶结合,抑制木质部前体细胞的平周分裂,从而调控根的木质部发育过程46。IDA 和 RALF 小肽参与了植物侧根发育过程。在侧根原基出现初期,IDA 小肽前体基因被在侧根原基细胞中积累的生长素诱导表达,随后 HAE(HAE

24、SA)和 HSL2(HAESA-LIKE 2)受体感知并识别 IDA 小肽,通过下游 MPK3/MPK6 级联反应,激活细胞壁重塑基因,诱导细胞壁降解以促进侧根出现47。研究发现,在侧根发育早期,ralf34 突变体表现为侧根原基异常和细胞的不对称分裂,THE1(THESEUS1)作为RALF34 的 pH 依赖性受体,可能与 RALF34 在侧根起始期间协调细胞壁完整性和调控细胞分裂,或者通过调控质外体 pH 值干扰生长素作用,进而影响侧根起始的细胞分裂模式48。植物气孔是植物与外界环境进行气体和水分交换 的 重 要 途 径。表 皮 模 式 因 子(EPIDERMAL PATTERNING

25、FACTOR,EPF)家族小肽成员 EPF1、EPF2、EPFL9(EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-LIKE 9)通过与 TMM(TOO MANY MOUTHS)和ER(ERECTA)家族受体激酶共受体复合物结合,调控气孔发育过程49。其中,EPF1 和 EPF2 具有较高的同源性,分别被 ERL1(ERECTA RECEPTOR-LIKE 1)和 ERL2 受体识别,负调控气孔密度,抑制气孔发育50,51。另外一项研究则发现STOMAGEN分泌肽,也被称作 EPFL9,与 EPF2 一样可以与 TMM 和 ER 第9期 吕倩雯等:植物小肽信号生物学功能及其在作物改良中

26、研究进展 817 受体直接结合,STOMAGEN 竞争性地替代 EPF2 与ER 家族受体的结合,削弱了 EPF2 引起的下游信号分子磷酸化反应,从而正调控气孔的发育52。小肽作为关键信号参与了被子植物种子和胚胎发育的不同过程。拟南芥通过 EPF/EPFL 小肽家族成员 EPFL2 及其受体 ERL1 和 ERL2 以及 EPFL9-ER信号传导途径共同协调胚珠的排列模式和果实生长,其中,EPFL2 是联系胚珠间距和果实生长的关键因子,而 EPFL9 拮抗 EPFL2 的作用,主要促进果实的生长16。拟南芥 CIF(CASPRIANSTRIP INTEGRITY FACTOR)家族成员 TWS

27、1(TWISTED SEED 1)小肽和 GASSHO 类受体激酶 GSO1 和 GSO2 参与调控胚胎角质层的完整性。研究表明,TWS1 前体蛋白和GASSHO 受体在胚中产生并向胚乳扩散。胚乳中的类 枯 草 杆 菌 丝 氨 酸 蛋 白 酶 ALE1(ABNORMAL LEAF SHAPE 1)加工 TWS1 前体并产生活性肽,随后成熟的 TWS1 扩散回到胚胎,进一步激活胚中依赖于 GASSHO 受体的角质层形成过程。一旦完整的胚胎角质层形成,ALE1 与其底物将彻底分开,从而终止信号传导53。1.3 小肽-类受体激酶调控植物生殖发育 在开花植物中,植物生殖发育需要经历花粉-柱头相互作用,

28、花粉管萌发和导向,雌配子体对花粉管的接收以及配子融合过程。在授粉后,来自花粉外被的 PCP-B(POLLEN COAT PROTEIN-B)小肽通过与柱头自身分泌的 RALF33 小肽竞争性结合ANJ/FER(ANJEA/FERONIA)受体,阻断了乳突细胞中活性氧产生通路,导致柱头中的活性氧水平降低,进而促进花粉水合54。而在芸薹属植物中,当自交不亲和的花粉接触到柱头时,花粉表面的 S 位点富含 半 胱 氨 酸 小 肽SCR(S-LOCUS CYSTENINE-RICH PROTEIN)/SP11(S-LOCUS PROTEIN 11)被雌蕊表面的 SRK(S-LOCUS RECEPTOR

29、KINASE)类受体激酶特异性识别,传递自交不亲和信号,使得柱头乳突细胞产生一系列变化,阻止花粉水合等过程,从而决定植物的自交不亲和现象5559。在受精过程中,植物通过 RALF4/19 与 RALF34 之间竞争 性 结 合 花 粉 管 膜 上 的 ANX1-BUPS2(ANXUR 1-BUDDHA S PAPER SEAL 2)受体,能够精确调控花粉管细胞完整性与精细胞释放过程60。此外,RALF 小肽及其受体 FER-ANJ-HERK1(HERCULES RECEPTOR KINASE 1)介导的信号通路能够调控植物防止多精受精61。拟南芥助细胞分泌的防御素样(DEFENSIN-LIKE

30、,DEFL)小肽 AtLURE1 及其受体PRK6(POLLEN RECEPTOR KINASE 6)信号通路在促进自身花粉管生长的同时,能够在珠孔处优先吸引同种花粉管,形成由 AtLURE1/PRK6 信号通路介导的同种花粉优先的生殖隔离机制,在花粉管对胚珠的吸引过程中发挥重要作用62。进一步研究发现,在 atluer1 缺失突变体背景中突变 4 个 XIUQIU 基因,植株育性下降,胚珠败育,表明非物种特异的吸引花粉管的小肽 XIUQIUs 能够与物种特异的吸引花粉管的小肽 AtLURE 共同调控花粉管导向过程63。1.4 小肽-类受体激酶调控植物免疫和非生物胁迫响应 植物在被病原菌侵染后

31、会释放包括小肽在内的多种信号分子以抵抗病原菌的侵染。在番茄中,PSK小肽通过其受体 PSKR1 与钙离子依赖性蛋白激酶CPK28(CALCIUM-DEPENDENT PROTEIN KINASE 28)相互作用,磷酸化氮同化 GS/GOGAT 循环中的关键酶 GS2 的 Ser-334 和 Ser-360 位点,以维持植物的防御反应和植物生长平衡64。RGF7 小肽作为一种新的损伤相关分子模式,能够被 RGI4 和 RGI5 受体识别,与共受体 SERK4 和 BAK1(BRAS-SINOSTEROID INSENSITIVE 1-ASSOCIATED KINASE 1)一起,诱导拟南芥免疫应

32、答并增强其对病原菌的抗性65。拟南芥损伤或受病原菌侵染时,Ca2+会流入胞内并激活植物半胱氨酸蛋白酶 Metaca-spase 家族成员 MC4,剪切附着在液泡膜胞质侧的Peps(plant elicitor peptides)前体蛋白使其释放,随后Peps 被两个类受体激酶 PEPR1 和 PEPR2 感知,诱导病原体防御相关基因表达,以增强植物抗病力66。此外,有研究发现,Peps 能够激活保卫细胞 S 型阴离子通道并排出阴离子,介导气孔关闭以防止病原微生物进入植物体内67。然而长时间的气孔关闭会减少光合作用和蒸腾作用,而水分的过度积累会促进病原体的定殖。SCREW(SMALL PHYTO

33、-CYTOKINES REGULATING DEFENSE AND WATER LOSS)小肽能够被其受体 NUT(PLANT SCREW UNRESPONSIVE RECEPTOR)识别,负调 818 Hereditas(Beijing)2023 第 45 卷 控 ABA 信号通路和 MAMP(microbe-associated molecular pattern),抑制气孔闭合和介导气孔重新开放,加快质外体水分流失,进而限制病原体的定殖,从而起到免疫作用68。植物非生物胁迫会严重影响植物的生长发育。通 过 调 节 体 内PSY(PLANT PEPTIDE CONTAINING SULFA

34、TED TYROSINE)小肽的浓度,植物可以平衡生长和逆境响应过程。正常生长的情况下,PSY 小肽通过与受体 PSYR1,PSYR2 和PSYR3 结合,抑制 PSYR 下游信号通路,促进植物生长;一旦遭遇胁迫,植物体内由于胁迫造成的细胞损伤会导致邻近细胞质外体中 PSY 小肽浓度的下降,未结合 PSY 的 PSYR 可以激活抗逆反应相关基因的表达,触发逆境胁迫响应机制6。CLE25 能够在根部感受植物缺水信号,并通过维管束长距离运输到叶片,与叶片中的受体 BAM 结合,激活生物合成酶 NCED3(9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase 3),影响脱落酸的合成,并

35、诱导气孔关闭,从而增强植物 抗 旱 性69。小 肽PIP3(PAMP-INDUCED SECRETED PEPTIDE 3)前体基因 prePIP3 的表达受盐胁迫显著诱导。成熟的 PIP3 小肽将分泌到胞外区域,与 类 受 体 激 酶RLK7(RECEPTOR-LIKE KINASE 7)在盐胁迫作用下形成复合物,并通过下游MPK3 和 MPK6 级联反应放大植物的耐盐胁迫信号以增强植物的耐盐性70。此外,盐胁迫还可以诱导AtPep3 小肽前体基因 AtPROPEP3 的表达,拟南芥AtPROPEP3 敲低转基因植株在盐胁迫下表现出高度敏感的表型。AtPep3 受体突变体功能分析表明,AtP

36、ep3 能够被其受体 PEPR1 识别,以响应盐胁迫过程71。低磷胁迫下,CLE14 小肽被 CLV2 和 PEPR2受 体 感 知 后,触 发 RAM 分 化,并 抑 制 SHR(SHORTROOT)/SCR(SCARECROW)和 PIN/AUXIN信号通路,导致植株主根变短,侧根和不定根增多,最终影响根系结构以适应低磷环境72。氮饥饿信号能 够 诱 导CEPs(C-TERMINALLY ENCODED PEPTIDEs)在根中的表达,随后导致地上部分的缺氮响应。CEPs 被转运到地上部分后,被其受体CEPR1(CEP RECEPTOR 1)和 CEPR2 识别,随后上调氮转运相关基因的表

37、达量,介导氮饥饿信号传导73,74。2 小肽信号调控作物农艺性状研究进展 随着基因组学、肽组学和遗传学等学科的不断发展,大量小肽信号分子除了在模式植物拟南芥中被鉴定发现,在作物中也越来越多地被挖掘、鉴定及功能研究。本文综述了近年来报道的小肽信号调控水稻、玉米(Zea mays)、番茄、马铃薯(Solanum tuberosum)、油菜(Brassica napus)和棉花(Gossypium hirsutum)等作物的产量、品质、抗病虫以及抗逆性等重要农艺性状的研究进展(图 2),旨在为小肽信号应用于作物遗传改良提供参考。2.1 小肽信号调控作物产量性状 水稻产量性状主要由分蘖数、每穗粒数和粒

38、重3 个要素构成。研究发现,水稻中 GAD1(GRAIN NUMBER,GRAIN LENGTH AND AWN DEVELOP-MENT1)基因编码一个预测的富含半胱氨酸的分泌肽,与拟南芥中的 EPFL 家族小肽具有较高的同源性,参与调控水稻驯化过程中每穗粒数、粒型的变化和芒的发育17,75。GAD1 基因的一个移码插入突变导致水稻出现每穗粒数增加、籽粒变短以及短芒或无芒的表型,表明 GAD1 小肽负调控水稻每穗粒数,粒型等产量性状75。近期,研究人员以水稻OsEPF/EPFLs 小肽家族为切入点,发现水稻中OsEPFL6、OsEPFL7、OsEPFL8、OsEPFL9 成熟小肽能够被下游

39、OsER1 受体识别,从而激活 MAPK级联信号通路,负调控水稻每穗粒数,同时发现OsEPFL8 特异性参与水稻育性调控。因此,利用CRISPR/Cas9 技术创制的 osepfl6 osepfl7 osepfl9 三重突变体能够在不影响育性的情况下,优化水稻穗型,进一步提高了水稻产量15。该研究通过特异性抑制 OsEPFL6-OsER1、OsEPFL7-OsER1 和 OsEPFL9-OsER1 小肽-受体,克服了水稻产量性状之间的偶联性,从而优化水稻穗型结构,塑造高产的理想穗型,为未来作物分子设计育种提供新的分子模块。此外,CEP 小肽家族在作物产量性状中发挥重要的调控作用。在水稻中过表达

40、 OsCEP6.1 基因使得水稻分蘖数减少,株高变矮,籽粒变小,穗粒数和粒重均显著降低76。在玉米中过表达 ZmCEP1 基因能够降低玉米的株高、穗高和穗长,减小籽粒大小和百粒重。第9期 吕倩雯等:植物小肽信号生物学功能及其在作物改良中研究进展 819 图 2 小肽信号在作物产量、品质和抗性调控中的研究进展 Fig.2 The advances on peptides research in crop yield,quality and stress resistance 利用 CRISPR/Cas9 技术敲除 ZmCEP1 基因能够显著改善玉米株型,增加籽粒大小和百粒重,提高玉米产量;转录组

41、分析显示,ZmCEP1 的敲除突变体中,部分参与氮化合物代谢、硝酸盐转运、糖转运和生长素应答等途径的基因上调,从而调控玉米植株的生长和籽粒发育77。作物在驯化和改良中的一些产量性状受分生组织发育的影响。水稻 FON4(FLORAL ORGAN NUMBER 4)是拟南芥 CLV3 的同源基因,fon4 突变体表现出茎秆变厚,花分生组织增大,花序及花器官数目增加等表型78。进一步研究发现,FON4 基因的不同位点突变可以对小穗分生组织的确定性产生不同影响,导致小穗内小花数目不确定,获得形成多花小穗的潜力,进而形成多个籽粒79。以上研究表明 CLE 小肽可以通过调控水稻分生组织发育影响其产量性状。

42、玉米 CLV3 同源小肽 ZmCLE7 和ZmFCP1 同样会与 WUS 形成反馈调控信号通路,精准调控花序分生组织发育。利用 CRISPR/Cas9 基因编辑技术编辑 ZmCLE7 和 ZmFCP1 基因的启动子区产生弱等位基因,可以调节基因表达量,影响玉米花序分生组织发育,从而产生玉米产量性状的数量变异,显著提升玉米的单穗产量。此外,对玉米中功能冗余的 ZmCLE1E5 进行基因编辑,能够显著增强 Zmcle7 的突变表型,创制高产等位基因80。同样,番茄中 CLV3 是果实从小到大驯化选择的关键基因,番茄 CLV3 完全突变会导致茎尖干细胞的过度增殖,花器官簇化,果实心室增多,果实增大8

43、1。通过CRISPR/Cas9 技术编辑 CLV3 基因启动子区域可以获得不同程度果实增大的番茄且几乎不影响植株发育81,82。之后的研究表明,番茄 CLV3 基因启动子存在 4 个保守序列区域,对每个区域及其组合进行突变,结果发现,单个保守区域的突变产生微弱的 820 Hereditas(Beijing)2023 第 45 卷 表型,而不同的区域存在相加性、协同作用及冗余性,使得不同的区域突变组合导致果实大小急剧增加83。上述研究表明 CLV3 小肽在水稻花器官数目,玉米果穗大小、穗行数和单穗粒数以及番茄果实大小等产量性状调控中的重要作用。环境胁迫导致的花器官非正常脱落对作物的产量造成严重影

44、响。番茄中干旱诱导的花器官脱落是由类枯草杆菌蛋白激酶 SlPhyt2(phytaspase2)和 PSK小肽调控的,SlPhyt2 能够促进成熟的 PSK 产生和积累,使其在离层区域发挥功能,诱导细胞壁水解酶的表达,从而加速器官脱落。干旱条件下在番茄中过表达 SlPhyt2,转基因植株的落花率显著高于WT 植株;而 SlPhyt2 的敲低突变体落花率显著降低,坐果率显著提升。外源 PSK 可以消除 SlPhyt2 的表达量对落花的影响,并诱导离层标记基因的表达84,85。弱光胁迫也会引起植物花和果实的过早脱落。研究发现番茄中 SlCLV3 能够响应弱光胁迫,在花梗脱落区高量表达。SlCLV3

45、通过抑制 SlWUS 基因的表达解 除 SlWUS 对 下 游 基 因 SlKD1(KNOX-LIKE HOMEDOMAIN PROTEIN1)和 SlFUL2(FRUITFULL 2)的抑制作用,影响了离层区生长素的响应和乙烯释放,从而调控器官脱落86。对 SlCLV3 基因进行RNAi 和 CRISPR/Cas9 基因敲除,番茄在弱光条件下均表现出花器官脱落延迟现象,而用成熟的SlCLV3 小肽能够诱导番茄花器官脱落。进一步研究发现 SlCLE2 在 slclv3 突变体中的表达量上升,缓解突变体的花器官脱落现象,弱光条件下 slclv3 slcle2的花器官脱落率只有 9%,显著低于 s

46、lclv3 单突变体中 21%的落花率86。以上研究表明,小肽能够通过调控作物花器官脱落从而影响作物产量。2.2 小肽信号调控作物品质形成 水稻的芒在漫长的驯化过程发生了明显的变化。野生稻的长芒有助于水稻种子的传播,阻止了鸟兽食用,而现代栽培稻的短芒或无芒性状便于水稻种子的收获、贮藏和加工。在水稻的驯化过程中,水稻EPF/EPFL 家族小肽成员随着芒的缺失受到选择75,87。将非洲栽培稻(Oryza glaberrima)的 OsEPFL1 等位基因导入到日本晴中,转基因植株表现出有芒的表型。对 OsEPFL1 的序列分析发现,亚洲栽培稻(Oryza sativa)中存在一个高度可变的富含 G

47、C 区域,该区域的突变可能导致 OsEPFL1 的功能变异造成无芒现象87。通过 CRISPR/Cas9 技术将水稻品种 Kasalath中的 OsEPFL2 基因敲除,水稻出现短芒或者无芒的表型并减小了稻粒的大小,表明水稻 EPFL2 小肽同样参与调控水稻芒的发育17。此外,研究发现水稻OsEPFL1(GAD1)和 OsEPFL2 不仅促进芒的发育,还能够通过抑制 ABA 的合成和信号通路,提高 淀粉酶活性和释放可溶性糖,促进种子萌发。同时,由于芒可以协助种子进入土壤,OsEPFL1 和 OsEPFL2通过调控芒的发育可以间接提高种子在自然环境中的萌发效率17,88。棉花纤维是一种优良的天然

48、纤维,提高棉花纤维品质具有重要意义。研究发现陆地棉中 PSK 小肽的前体基因在伸长的纤维细胞中优先表达,外源施加PSK-小肽和过表达GhPSK都能够促进棉花纤维细胞的伸长,改良棉花纤维的长度和细度89。此外,棉花中 GhRALF1 基因在纤维伸长发育早期优势表达,外源施加 GhRALF1 后的棉花纤维细胞生长受到抑制。进一步研究表明,GhRALF1 小肽可以作为纤维细胞生长过程中的变阻器,通过昼夜节律波动表达控制植物激素信号来控制纤维细胞生长90。这些研究表明小肽在棉花纤维品质调控中发挥重要作用。2.3 小肽信号调控作物抗虫、抗病及耐旱性 褐飞虱(Nilaparvata lugens)是危害水

49、稻生产最严重的刺吸式害虫之一。在褐飞虱取食水稻数小时内能够诱导水稻叶鞘中多种 PEP 小肽前体基因PROPEP(PRECURSOR OF PEP)和受体 PEPR(PEP RECEPTOR)基因的表达。利用 CRISPR/Cas9 技术敲除水稻 OsPEPR1/2 基因能显著削弱水稻对褐飞虱的抗性,而外源施加人工合成的具有较强诱抗力的OsPep3 小肽能明显增强水稻对褐飞虱的抗性。此外,OsPep3的使用还能提高水稻对稻瘟病和白叶枯病原菌的抗性,增强其他禾本科作物如小麦(Triticum aestivum)的免疫反应19。根结线虫是一种遍布全球范围的农业害虫。在马铃薯中用 StPep1 小肽预

50、处理根系能减少根结线虫(Meloidogyne chitwoodi)造成的擦伤以及线虫卵量且不影响根系及地上部生物量。抗性相关基因表达检测发现 StPep1 显著诱导了马铃薯叶片中抗性基因表达,这表明 StPep1 处理马铃薯根系可以引起基因表达的系统性响应,从而提高其 第9期 吕倩雯等:植物小肽信号生物学功能及其在作物改良中研究进展 821 对根结线虫感染的抗性91。马铃薯 Y 病毒(potato virus Y,PVY)属于最大的植物病毒属Potyvirus,它的寄主范围广,在农业生产上给作物造成了严重的经济损失92。马铃薯植株被 PVY 侵染后,PIP(PAMP-INDUCED PEPT

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