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原位杂交操作流程PPT课件.ppt

上传人:可**** 文档编号:765603 上传时间:2024-03-07 格式:PPT 页数:24 大小:100KB
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资源描述

1、原位杂交操作流程1.冰冻切片的(DIG-labeledRNAprobe)原位杂交操作程序一、切片制备用新鲜组织制作6m厚冰冻切片,37干燥14小时,进行下一步操作。二、预杂交前处理预固定:4%PFA(inDEPC-PBSPh7.4)RT3060min4%PFA:多聚甲醛20g1PBS450ml加热(60、20min)溶解冷却后调pH至7.41PBS500mlPBSRT5min210PBS:500mlNaCl40gKCl1gKH2PO41gNa2HPO47.7gDEPC水450ml调Ph至7.5DEPC水加至500mlPBS(含0.3%v/vTritonX-100)RT15min临用前配制10%

2、TritonX-10015ml1PBS500mlPBSRT5min22.消化:2g/mlProteinaseKinTEbuffer3710minTE:pH8.0Tris-HCl1M5mlpH8.0EDTA0.5M1mlDEPC水500ml0.2%GlycininPBSRT5min2(50 xDenharts;Ficoll400聚蔗糖1g后固定:4%PFAinPBSRT15minPVP聚乙烯基吡咯烷酮1gBSA牛血清白蛋白1g DEPC水100ml)PBSRT3min20.1M三乙醇胺(TEA)/0.25%乙酸酐RT5min20.1M三乙醇胺:三乙醇胺2.64mlDEPC水200ml用前加入乙酸

3、酐500lPBSRT5min23.三、预杂交 预杂交502h预杂交液:50%去离子甲酰胺5SSC5Denhardts0.02%SDS0.1mg/mltRNA四、杂交杂交5012h以上4.五、杂交后处理2SSC脱去盖膜(片)502SSC清洗3710min220g/mlRNaseAinRnsaebuffer3730minRnsaebuffer;2MTris5ml0.25MEDTA4ml3MnaCl167mlpH8.0DW1000mlRnasebuffer3730min2SSC5015min21SSC(含0.02%SDS)3715min25%SDS2ml1SSC500ml0.1SSC3715min2

4、5.Buffer3710min2Buffer:2MTris-HClPh7.625ml3MNaCl25mlD.W.500ml封闭;0.5%抗体阻断液inBuffer(含0.2%Tween20)3720min抗体阻断液:(1:500抗地高辛抗体in阻断液372h)阻断剂1gTween-200.4mlBuffer3710min2Buffer200mlBuffer3710min26.显色;Buffer:2MTris10ml(1:50NBT/BCIPStockSolutioninBuffer224h)3MNaCl6.67mlMgCl22.033g(湿合、避光)D.W.180ml 浓HCl调pH至9.5D

5、.W.200ml终止反应:BufferRT5min2流水冲洗5-10min1%甲基绿复染3-10min,水洗,晾干,封固7.DNA探针检测石蜡切片中DNA8.组织标本肝穿刺组织,常规石蜡包埋,4m连续石蜡切片,贴在涂有切片粘合剂的干净载玻片上,58烤18h。9.试剂1 120SSC20SSC2 2HBV cDNA-DigHBV cDNA-Dig探针 5 5 g g3 34 4多聚甲醛4 40.1mol/L PBS0.1mol/L PBS,pH7.4pH7.45 50.2mmol/L HCl 0.2mmol/L HCl 和0.1mol/L0.1mol/L甘氨酸 PBS pH7.4 PBS pH7

6、.46 60.4 0.4 Tritor X-100 PBS pH7.4Tritor X-100 PBS pH7.47 7蛋白酶 20 20 g/mlg/ml8 80.250.25乙酸酐,用0.1mol/L0.1mol/L三乙醇胺配制9 9预杂交缓冲液和杂交缓冲液10.AKP10.AKP标记抗Dig FabDig Fab段二抗,可1:5001:500稀释11.TSM11.TSM、TSM2TSM2(配制参阅附录4 4)12.NBT12.NBT和BCIPBCIP显色液或用AKPAKP显色KitKit 10.操作流程杂交前处理预杂交杂交杂交后漂洗杂交后检测结果判断11.杂交前处理1.石蜡切片常规脱蜡至

7、水2.0.02M pH7.4 PBS洗33min3.0.2M HCI 20min 室温(除去蛋白)4.2SSC(内含5M EDTA)50 洗 30min5.蛋白酶 2g/ml 37 20min6.0.1M甘氨酸PBS洗 10min 室温,中止酶反应7.4多聚甲醛,20min 室温8.PBS洗 33min9.75,85,95和无水乙醇各2min12.预杂交和杂交加预杂交液 20l/每片,42 2h。加杂交液1020ul/每片(内含HBV-cDNA Dig标记探针4g/ml),加盖硅化玻片,将切片置于95 10min,使探针和靶病毒DNA双链打开(变性),然后迅速置于冰上5min,再将切片置于盛有

8、2SSC湿合内,42杂交过夜(1216h)。13.杂交后漂洗1.将切片置于2SSC液内振动移去盖片2.2SSC洗 210min,553.0.5SSC 25min,504.PBS洗33min5.10醋酸 20min 室温,阻断内源性碱性磷酸酶6.PBS洗33min14.信号放大和显示1.1:500稀释AKP标记抗Dig二抗,37 4h,或4过夜2.PBS洗 33min3.TSM1洗 25min4.TSM2洗 25min5.显色液 在1mlTSM2中加入4.5lNBT,3.5l,BCIP 混合后,显色30min12h,中间不断观察6.TSM2洗,PBS洗33min,核固红或甲基绿衬染7.蒸镏水洗,

9、系列乙醇脱水,二甲苯透明,树脂封片15.结果判断16.ISHISH流程探针合成组织细胞标本的准备ISHISH试剂的配制操作流程17.探针 1、根据文献报道合成PCR引物一对。2、PCR扩增:用高保真DNA聚合酶 进行PCR扩增。18.3、将PCR扩增产物亚克隆入pGEM2Z质粒(EcoRI和ACC I酶切位点),在大肠杆菌中扩增,纯化。原理:PGEM3质粒购于promega公司,含有位于pUc19 MCS侧面的SP6和T7 RNA聚合酶启动子,在将所需序列插入MCS后,一个简单的基于lac Z-肽灭活的颜色选择方案将促进重组体的筛选。在体外,将SP6或T7 RNA聚合酶加入到含有标记物的三磷酸

10、核苷前体的转录系统中,可允许从任何一方向产生多拷贝DNA插入序列的标记RNA探针。19.4、利用Roche生产的体外转录标记RNA kit(Cat.No 999644)操作流程参阅原位检测技术p132-133。20.组织细胞标本的准备 ISHISH试剂的配制(所有试剂和用具均用DEPCDEPC水处理)21.操作流程11、活细胞经4多聚甲醛固定20min,室温,PBS洗,系列乙醇脱水。2、组织标本:标准取材后,4多聚甲醛固定6h,用25遮糖或液氮速冻,切片贴在涂有APES胶的干净载玻片上。3、PBS洗33min,冰冻切用4%柠檬酸盐90保温20min,石蜡切片98 10min,细胞片不用。4、2

11、g/ml蛋白酶K 37 20min,PBS洗33min。5、0.1mol/L甘氨酸PBS洗10min.6、0.25%乙酸酐的0.1mol/L三乙醇胺(pH8.0)洗10min,PBS洗10min。22.7 7、预杂交 0.2SSC 0.2SSC5050甲酰胺 30min 37 30min 37。8 8、杂交:滴加杂交液(2g/ml2g/ml)加一层复盖膜,4848杂交8-12h8-12h。9 9、杂交后洗:2SSC 2SSC洗 25min 45 25min 45 1SSC 1SSC洗 25min 25min 室温 0.5SSC 0.5SSC洗 25min 25min 室温 0.1SSC 0.1SSC洗 25min 25min 室温 PBS PBS洗 33min 33min23.10、用10正常血清封闭 30min11、抗Dig IgG 1:500 37 1h12、PBS洗 33min13、0.02M TBS pH9.015min14、NBT/BCIP显色 1h-24h15、洗后,核固红衬染,蒸馏水洗,脱 水,透明,封片。16、结果观察:紫蓝色为阳性信号,红 色为背景。24.

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