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基于桑黄对肺炎的治疗作用及其机制的网络药理学分析.pdf

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资源描述

1、第 49 卷 第 4 期2023年 7 月吉林大学学报(医学版)Journal of Jilin University(Medicine Edition)Vol.49 No.4Jul.2023DOI:10.13481/j.1671587X.20230413基于桑黄对肺炎的治疗作用及其机制的网络药理学分析刘雨萌1,冷嵩2,萨仁高娃1,林黛洁1,谢林盛1,李梦睿3,许肖3,李婉南3(1.珠海科技学院药品与食品科学学院食品质量与安全教研室,广东 珠海 519041;2.珠海科技学院计算机学院计算机科学与技术教研室,广东 珠海 519041;3.吉林大学生命科学学院 Edmond Fischer细胞信

2、号传导实验室,吉林 长春 130012)摘要 目的目的:基于网络药理学筛选中药桑黄治疗肺炎的活性成分,分析桑黄治疗肺炎的有效成分和靶点。方法方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)软件搜索中药桑黄的成分和作用靶点;通过 Uniprot数据库得到基因名称(Gene Name);通过 GeneCards找出肺炎对应的靶点,将桑黄和肺炎的靶点进行比对,得到关键靶点。利用 Cytoscape 3.9.1软件绘制出桑黄化学成分-肺炎-靶点网络图;通过 String 平台构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络图,采用 Cytoscape软件中 ClueGo 插件对桑黄关键基因进行基因本体论(GO)

3、生物功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果结果:桑黄主要活性成分有 21种,(E)-4-(3,4-dihydroxyphenyl)but-3-en-2-one成分所含靶点最多,包括细胞色素 P450家族(CYP450)、人表皮生长因子受体(EGFR)和基质金属蛋白酶(MMP)等。筛选出桑黄的化合物靶点 358 个,其中 217 个基因为桑黄-肺炎共同靶点,与肺炎有关的关键基因包括含铜胺氧化酶 3(AOC3)、DNA 连接酶 1(LIG1)、谷氨酰胺肽酶(ENPEP)、乙醛脱氢酶 2(ALDH2)、组蛋白甲基化酶 8(PHF8)、基因-溶质载体家族 11成员 2

4、(SLC11A2)和CYP50等。GO 和 KEGG 富集分析,桑黄主要通过 17条代谢途径发挥作用,包括磷脂酰肌醇 3-激酶/蛋白激酶 B(PI3K/Akt)信号通路、癌症中的微小 RNA(miRNA)、化学致癌-受体激活、前列腺癌、癌 症 中 蛋 白 多 糖 和 脂 质、动 脉 粥 样 硬 化 及 化 学 致 癌 物-活 性 氧(ROS)等相关途径。结论结论:(E)-4-(3,4-dihydroxyphenyl)but-3-en-2-one是桑黄成分中对肺炎治疗最有效的化学物质,其作用机制主要与 CYP450家族有关。关键词 桑黄;肺炎;网络药理学;信号通路;靶点中图分类号 R285.5;

5、R563.1;R318.04文献标志码 ANetwork pharmacology analysis based on therapeutic effect of Sanghuang on pneumonia and its mechanismLIU Yumeng1,LENG Song2,SARENGAOWA 1,LIN Daijie1,XIE Linsheng1,LI Mengrui3,XU Xiao3,LI Wannan3(1.Department of Food Quality and Safety,School of Pharmaceutical and Food Science,Zh

6、uhai University of Science and Technology,Zhuhai 519041,China;2.Department of Computer Science and Technology,School of Computer Science,Zhuhai University of Science and Technology,Zhuhai 519041,China;3.Laboratory of Edmond Fischer Cell Signaling,School of Life Sciences,Jilin University,Changchun 13

7、0012,China)文章编号 1671587X(2023)04092308收稿日期 20221026基金项目 广东省教育厅创新强校工程科研项目青年创新人才项目(2019KQNCX197);吉林省科技厅科研项目(20200201386JC);珠海科技学院大学生创新创业训练计划项目(DC2022102,DC2022079)作者简介 刘雨萌(1986),女,吉林省四平市人,实验师,理学硕士,主要从事功能性食品方面的研究。通信作者 李婉南,副教授,博士研究生导师(E-mail:)923第 49 卷 第 4 期 2023 年 7 月吉林大学学报(医学版)ABSTRACT Objective:To sc

8、reen the active ingredients of traditional Chinese medicine Sanghuang in the treatment of pneumonia based on network pharmacology,and to analyze the active ingredients and targets of Sanghuang in the treatment of pneumonia.Methods:The Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and An

9、alysis Platform(TCMSP)software was used to search for the ingredients and targets of Sanghuang;the Gene Name was obtained from the Uniprot database;the targets corresponding to pneumonia were found through GeneCards,and the targets of Sanghuang and pneumonia were compared to obtain the key targets;C

10、ytoscape 3.9.1 was used to draw the chemical ingredients of Sanghuang-pneumonia-target network diagram;the protein-protein interaction(PPI)network diagram was constructed by String platform;Gene Ontology(GO)biological function analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)signaling pathw

11、ay enrichment analysis on key genes of Sanghuang were performed by using the ClueGo plugin in Cytoscape software.Results:There were 21 kinds of active ingredients in the traditional Chinese medicine Sanghuang,and(E)-4-(3,4-dihydroxyphenyl)but-3-en-2-one contained the most targets,including cytochrom

12、e P450 family(CYP450),human epidermal growth factor receptor(EGFR),and matrix metalloproteinase(MMP)and so on.A total of 358 targets were screened as the compound targets of Sanghuang,among them 217 genes were regarded as common targets for Sanghuang and pneumonia,and 69 key genes related to pneumon

13、ia were amine oxidase copper containing 3 gene(AOC3),DNA ligase 1 gene(LIG1),glutamyl aminopeptidase gene(ENPEP),aldehyde dehydrogenase 2 family member gene(ALDH2),PHD finger protein 8 gene(PHF8),solute carrier family 11 member 2 gene(SLC11A2),CYP50 and so on.The KEGG and GO analysis results showed

14、that Sanghuang mainly produced a marked effect through 17 metabolic pathways,including the phosphatidylinositol-3 kinase/protein kinase B(PI3K/Akt)signaling pathway,microRNAs(miRNA)in cancer,chemical carcinogenesis-receptor activation,prostate cancer,proteoglycans and lipids in cancer,atherosclerosi

15、s,chemical carcinogenesis-reactive oxygen species(ROS)and other related pathways.Conclusion:(E)-4-(3,4-dihydroxyphenyl)but-3-en-2-one is the most effective chemical substance in the treatment of pneumonia among the ingredients of Sanghuang,and its mechanism is mainly related to the CYP450 family.KEY

16、WORDS Sanghuang;Pneumonia;Network pharmacology;Signaling pathway;Target桑黄为多孔菌科真菌火木层孔菌的子实体,主要分布于华北、西北、黑龙江、吉林、台湾、广东、四川、云南和西藏等地。桑黄的化学成分包括萜类、多糖类和黄酮类等。萜类在桑黄子实体中有多种存在形式,最主要的是三萜。三萜类成分可通过微波法1和超声波耦合技术2等方法提取。桑黄多糖类成分包括胞内多糖3、子实体多糖4和胞外多糖5,对桑黄进行液体发酵可获得浓度高于90%的多糖提取物 6。通过超临界 CO2萃取法7和硝酸钠-硝酸铝-氢氧化钠 NaNO2-Al(NO3)3-NaOH

17、 体系吸光度法8均检测到桑黄中的黄酮类成分含量较高。不同种类桑黄中所含黄酮类成分种类有很大不同,杨树桑黄含 3种黄酮类成分9,宝马桑黄含 15 种黄酮类成分10。除上述成分,桑黄中还含有纤维素酶、多酚类成分、麦角甾醇11和孔齿酸12。桑黄多糖具有抑制肿瘤的效果,可通过调节人类的免疫系统间接杀死肿瘤细胞,诱导肿瘤细胞凋亡抑制其增殖13,同时还可增强体液免疫和细胞免疫效应14-15。肺炎是由细菌、病毒等病原体和理化原因导致的肺泡、终末细支气管、肺泡管、肺泡囊和肺实质的炎症反应16,其中细菌性和病毒性感染源较为常见,目前国内外对于肺炎尚无最佳的治疗方案17。网络药理学采用多个数据库检索相关症候的靶点

18、和中药复方中有效成分的靶点,并进行映射,通过计算机模拟,构建出药物-靶点-疾病网络18,进一步通过网络分析,预测其作用机制19,为成分复杂、分子间作用机制不清晰、关键基因和作用靶点较多的中药提供了新的研究方法 20-21。桑黄成分复杂,其相关研究多以单个蛋白或单条通路为切入点探讨桑黄有效成分对肺炎的作用机制,缺乏整体性,而相关靶点的研究较少22-25。本文作者采用网络药理学方法构建药物-靶点-疾病的复杂网络关系,联合桑黄的多种有效成分、靶点和关键基924刘雨萌,等.基于桑黄对肺炎的治疗作用及其机制的网络药理学分析因,全面分析并阐明桑黄对肺炎的药理作用,为进一步研究肺炎的治疗药物奠定理论基础。1

19、 材料与方法 1.1桑黄小分子化合物信息桑黄小分子化合物信息通过中药系统药理学 数 据 库 和 分 析 平 台(Traditional Chinese Medicine Systems Phaimacology Database and Analysis Platform,TCMSP)及文献资料查询收集桑黄成分,共收集到 21种成分信息26-27。1.2 桑 黄 潜 在 作 用 靶 标桑 黄 潜 在 作 用 靶 标 采 用 TCMSP 中CancerHSP 软件对桑黄 21种化合物进行靶点检索,采用小分子药物靶点预测数据库预测桑黄 21 种重要成分所关联的靶点信息。进入 Uniprot 数据库

20、,通过 Retrieve/ID mapping 软件,将靶点的 Uniprot ID 转化为基因名称(Gene Name),得到标准化基因名以便后续操作。1.3检索肺炎相关靶点检索肺炎相关靶点利用 GeneCards 数据库搜索关键词肺炎(pneumonia),获得与之相关的全部疾病靶点。将桑黄所筛选出的化学成分作用靶点与肺炎的疾病靶点通过 Venny数据库进行对照,得到相应的韦恩图,并检索得到交集中的关键靶点进行下一步分析。1.4构建桑黄化学成分构建桑黄化学成分-肺炎肺炎-靶点网络图靶点网络图采用Excel软件对桑黄-肺炎交集的关键作用靶点基因进行数据比对,利用 Cytoscape 3.9.

21、1 软件绘制桑黄化学成分-肺炎-靶点网络图。图中圆心红点代表疾病,周围的绿色圆点表示桑黄的化学成分,最外侧的蓝色小点代表靶点,其相互作用关系通过连接的“线”表示。关键的作用靶点可与代表肺炎的红点直接相连,与化学成分相连的“线”的数量与其作用的靶点数量成正比。1.5蛋白蛋白-蛋白互作蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网 络 构 建网 络 构 建 在 网 页 上 打 开 String 数 据 库(https:/string-db.org/),点击 String 数据库右侧的“Multiple Proteins”,将桑黄-肺炎交集的所有靶点录入,选择下方的“H

22、omo sapiens”可获取相关的 PPI网络图,将数据导入到 Cytoscape 3.9.1软件即可建立 PPI网络,蛋白之间的相关性可以通过节点之间的连接线进行分析,连线的不同颜色代表不同的作用类型:浅蓝色表示数据库中数据,粉色表示实验数据,绿色表示基因邻接,红色表示基因共融合,深蓝色表示基因共线,黄色表示文本数据挖掘,黑色表示基因共表达,灰色表示蛋白同源性。PPI网络图中以“degree”表示此节点的连线数目,degree值代表该种蛋白参与的生物过程数量。蛋白节点中的螺旋表示该蛋白的结构已知,节点为空圆圈表示结构未知。1.6桑黄化学成分的基因本体论桑黄化学成分的基因本体论(Gene O

23、ntology,GO)生 物 功 能 及 京 都 基 因 和 基 因 组 百 科 全 书生 物 功 能 及 京 都 基 因 和 基 因 组 百 科 全 书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析通路富集分析采用在线工具 DAVID数据库+R 语言的方式进行分析。GO 包括分子功能(molecular function,MF)、生 物 过 程(biological process,BP)和 细 胞 组 成(cellular component,CC)3个部分。KEGG 数据库是系统分析基因表达过程中形成的 RNA 或蛋白质功能和代谢

24、途径。进入 DAVID 数据库,点击左侧功能菜单,进入分析页面后通过如下 4 步即可完成分析:在“Enter Gene List”中上传基因列表,格式是每行 1 个基因。在“Select Identifier”中选择上传的基因类型,因上传的是基因符号(Gene Symbol),所以在下拉菜单中选择“OFFICIAL_GENE_SYMBOL”。在“List Type”中选择“Gene List”。点击“Submit List”。结 果 显 示 多 个 折 叠 栏,其 中Gene_Ontology 折叠栏中有 3 个栏目:GOTERM_BP_FAT、GOTERM_CC_FAT和GOTERM_MF_

25、FAT,即 GO功能富集分析结果。Pathways折叠栏中 KEGG_PATHWAY 是 KEGG 通路富集分析结果。点击每个栏目后面的“Chart”即可出现一 个 表 格,数 据 分 别 为 Category、Term、RT、Genes、Count、%、P-Value 和 Benjamini,点 击Download File,可将结果的文本文件下载或者导入作图软件中进行后续 R语言可视化分析。2 结 果 2.1 桑 黄 的 化 学 成 分桑 黄 的 化 学 成 分 通 过 TCMSP 中CancerHSP软件获得与桑黄有关的化合物,由于桑黄所含化学成分种类较少,因此忽略化合物口服生物利用度,

26、共有 9种化合物通过筛选。查阅相关文献,总 结 桑 黄 其 他 12 种 成 分:樱 花 汀(sakuranetin)、-乳香酸(beta-boswellic acid)、软木三烯酮(3-friedelanone)、熊果酸(ursolic acid)、甲 基 苯 鲲(p-toluquinone)、4-乙 烯 基 苯 酚(4-ethenylphenol)、齿孔酸(eburicoic acid)、麦角甾 醇(ergostero)、托 鲁 西 酸(torulosic acid)、natalic、3,14-二希斯皮啶(3,14-bihispidinyl)和羟噻吩咯 B(hypholomine B)。共

27、计总结出桑黄所含化合物 21种,用于查询桑黄主要成分所含靶点。925第 49 卷 第 4 期 2023 年 7 月吉林大学学报(医学版)(E)-4-(3,4-dihydroxyphenyl)but-3-en-2-one 成分 所 含 靶 点 最 多,包 括 细 胞 色 素 P450 家 族(cytochrome P450 enzyme system,CYP450)、人表 皮 生 长 因 子 受 体(epidermal growth factor receptor,EGFR)和 基 质 金 属 蛋 白 酶(matrix metalloproteinases,MMP)等。2.2桑黄桑黄-肺炎作用靶

28、点肺炎作用靶点通过 TCMSP 数据库中CancerHSP 软 件 得 到 桑 黄 9 种 化 学 成 分 靶 点 的Uniprot ID,利 用 Uniprot 数 据 库 将 桑 黄 靶 点 的Uniprot ID 转化成对应的 Gene Name。将其余文献中搜索到的 12种成分用 SwissTargetPrediction 数据库预测出靶点,去掉其中可能性为 0的靶点,结合之前 CancerHSP 软件搜索的靶点,共计 833 个靶点,用 Excel 软件去掉重复项,筛选出 358 个靶点可以作为桑黄化合物靶点。通过 GeneCards数据库搜索得到 5 543个肺炎靶点。与肺炎有关的

29、 69种关键 基 因 分 别 为 含 铜 胺 氧 化 酶 3(amine oxidase,copper containing 3,AOC3)、DNA 连 接 酶 1(DNA ligase 1,LIG1)、谷 氨 酰 氨 基 肽 酶(glutamyl aminopeptidase,ENPEP)、乙 醛 脱 氢酶2(aldehyde dehydrogenase 2,ALDH2)、组蛋白去甲基化酶 8(plant homeo domain finger protein 8,PHF8)、溶 质 载 体 家 族 11 成 员 2(solute carrier family 11 member 2,SLC

30、11A2)和肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)等。利用 Venny2.1工具软件将桑黄作用靶点与肺炎靶点相互筛选得到交集靶点和对应的韦恩图,桑黄-肺炎共同靶点共计 217个基因。见图 1。2.3桑黄化学成分桑黄化学成分-肺炎肺炎-靶点网络图靶点网络图肺炎靶点和桑黄所含的化合物同时录入 Cytoscape 3.9.1 软件,经过作图处理后,得到桑黄化学成分-肺炎-靶点网络图(图 2)。图中绿色的节点为桑黄的化学成分,与绿色节点连接的为桑黄成分的靶点。与中心红色的肺炎节点直接相连的即为取交集所得的关键靶点。(E)-4-(3,4-dihydroxyphenyl)but

31、-3-en-2-one、natalic、sakuranetin、ursolic acid、torulosic acid、beta-boswellic acid 和 eburicoic acid 7 种化学成分周围的放射线较密集,degree值大于等于其所有数据均值,密集程度与靶点数量成正比,说明桑黄中上述 7种化学成分对桑黄治疗肺炎的效果具有重要影响。2.4桑黄桑黄-肺炎肺炎 PPI 网络网络将 217 个关键的交集靶点导入 String 数据库中的 Multiple Proteins 构建桑黄-肺炎 PPI 网络图(图 3)。每一个靶点蛋白由网络图中的蓝色圆点表示,2 个靶点之间的相互作用由

32、蓝色节点之间的连线表示,蓝色节点大小表示与其相互作用靶点数的多少。通过 Cytoscape3.9.1软件中的 Network Analyzer工具进行拓扑分析。接近中心性代表一个节点在整个三维网络图中的位置,其数值大小与该节点到图中其他节点的直线距离呈负相关关系。集聚系数代表一个节点与相邻节点间连 接 的 密 集 程 度。PPI 网 络 靶 点 共 计 175 个,degree值30的靶点名称和信息见表 1,其中 TNF图图 1桑黄桑黄-肺炎靶点交集图肺炎靶点交集图Fig.1 Intersection diagrams of Sanghuang-pneumonia targets图图 2桑黄化

33、学成分桑黄化学成分-肺炎肺炎-靶点网络图靶点网络图Fig.2Network diagram of chemical ingredients-pneumonia-targets926刘雨萌,等.基于桑黄对肺炎的治疗作用及其机制的网络药理学分析的 degree 值远大于其他节点,degree 值80 的 4 个靶 点 分 别 为 EGFR、丝 裂 原 活 化 蛋 白 激 酶 3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)、血管 内 皮 生 长 因 子(vascular endothelial growth factor,VEGF)和 雌 激 素 受 体 1(

34、estrogen receptor 1,ESR1)。degree 值 30 的 靶 点 中CYP450家族成员占比最高,包括细胞色素 P450家族 2 亚 科 C 成 员 9(cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9,CYP2C9)、细胞色素 P450家 族 2 亚 科 C 成 员 19(cytochrome P450 family 2 subfamily C member 19,CYP2C19)和 细 胞 色 素 P450 家 族 1 亚 科 B 成 员 1(cytochrome P450 family 1 subfamily B membe

35、r 1,CYP1B1),其 中CYP2C9 和 CYP2C19 靶点 degree 值排名前 15,表明 CYP450家族在肺炎治疗中发挥重要作用。2.5 GO 生 物 功 能 和生 物 功 能 和 KEGG 信 号 通 路 富 集 分 析信 号 通 路 富 集 分 析 通过 Cytoscape3.9.1 中的 ClueGO 软件在阈值P0.05的条件下对桑黄-肺炎的 217个关键靶点进行 GO 生物功能分析,得出桑黄治疗肺炎关键靶点GO 生物功能气泡图(图 4),横坐标为基因比例,纵坐标为基因名称,圆点面积大小表示相关基因数,不同颜色表示通过 P值校正方法得到的校正后的 P 值;其中氧化反应

36、位于首位,而 CYP450主要参与药物生物转化中的氧化反应,是主要的药物代谢酶系。KEGG 信号通路富集结果柱状图见图 5,以基因数为横坐标,通过 P值校正方法得到的校正后的 P值由不同颜色表示。桑黄治疗肺炎涉及到磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K/protein kinase B,Akt)信号通路、癌症中的微小 RNA(microRNAs,miRNA)、化学致癌-受体激活、前列腺癌、癌症中的蛋白多糖和脂 质、动 脉 粥 样 硬 化 及 化 学 致 癌 物-活 性 氧(reactive oxygen species,ROS)等相

37、关途径。3 讨 论 随着基因、蛋白和代谢组学的发展,许多学者尝试用现代医学解释中药的作用机制28。但由于中药多成分、多途径和多靶点的特点,很难明确其发挥药效的物质基础。基于数据库的共享和系统生物学的理论,HOPKINS 提出了网络药理学概念和研究方法,通过搜集数据库信息,构建系统网络,图图 3桑黄桑黄-肺炎肺炎 PPI网络图网络图Fig.3PPI network diagram of Sanghuang-pneumonia927第 49 卷 第 4 期 2023 年 7 月吉林大学学报(医学版)预测多分子协同作用机制29-31。桑黄素可通过抑制高迁移率族蛋白 B1(high mobility

38、group protein B1,HMGB1/Toll 样受体 4(Toll-like receptor 4,TLR4)/核因子 B(nuclear factor kappa-B,NF-B)通路改善重症肺炎大鼠肺损伤,桑黄泻肺汤可用于支原体肺炎痰热闭肺证的治疗32。本研究通过网络药理学,采用 TCMSP数 据 库、Uniport 数 据 库、DAVID 数 据 库、GeneCards数据库、ClueGo软件和 Cytoscape 3.9.1软件,并联合桑黄多种化学成分、靶点和关键基因,分析桑黄在肺炎治疗中的有效成分和作用靶点,结果显示:桑黄在 TCMSP 数据库中的录入信息较少,仅能查到 9种

39、成分,因此忽略生物口服利用度和类药性的影响,并从其他文献搜索补充 12 种其 他 成分,其中(E)-4-(3,4-dihydroxyphenyl)but-3-en-2-one 的 作 用 靶 点 最 多,包 括 CYP450、EGFR 和 MMP 等,说明其参与的生物过程种类最多。degree值30的靶点中 CYP450家族成员占比最高,包含 CYP2C9 和 CYP2C19,而 CYP2C9 和CYP2C19 的 degree 值排名前 15,表明 CYP450 家族在桑黄治疗肺炎过程中发挥重要作用。CYP450是存在于动植物、微生物和人体中的完整膜保守蛋白的超家族33,参与药物合成、类固醇

40、代谢和致癌物代谢等许多重要反应34。生物体内的防御系统以 CYP450为核心,保护生物体免受有毒化合物的侵害。人类 CYP450 家族至少包含 57 个基因和58 个假基因,上述基因被分成了 18 个家族和 43 个亚家族,主要分布于人体的肾脏、小肠和肝脏组织中35。本研究中 GO 生物过程富集分析和 KEGG 信号表表 1PPI网络靶点及其拓扑参数网络靶点及其拓扑参数TabTab.1 1PPI network targets and their topological parametersPPI network targets and their topological parameters

41、Gene nameTNFEGFRMAPK3VEGFAESR1HSP90AA1PPARGSTAT3PTGS2SIRT1ERBB2CYP2C9EP300CYP2C19TLR4PPARAGSK3BBCL2L1ARPIK3CARELAMDM2HDAC1HPGDSAPPACECYP3A4Closeness centrality0.701 639 3440.638 805 9700.625 730 9940.614 942 5290.609 686 6100.606 232 2950.602 816 9010.599 439 7760.599 439 7760.592 797 7840.572 192 5

42、130.572 192 5130.570 666 6670.558 746 7360.555 844 1560.555 844 1560.558 746 7360.554 404 1450.544 529 2620.528 395 0620.550 128 5350.547 314 5780.540 404 0400.547 314 5780.545 918 3670.547 314 5780.539 042 821Clustering coefficient0.187 647 5220.245 240 7610.267 665 4180.308 683 4730.288 862 7680.3

43、02 174 6190.246 673 1580.340 326 3400.311 004 7850.318 712 2740.371 223 7580.369 175 6270.353 781 0680.385 359 9520.331 168 8310.280 841 8000.378 809 8690.484 917 0440.408 748 1150.452 380 9520.483 156 0280.474 290 7800.421 985 8160.308 080 8080.341 414 1410.346 723 0440.249 169 435Degree124 95 90 8

44、5 83 79 79 78 77 71 63 63 62 58 56 53 53 52 52 49 48 48 48 45 45 44 43Gene nameMMP2NR3C1SERPINE1KDRPGRGRB2HNF4APLGF2KITRAF1CDK4CDK2MCL1PTPN11METHDAC2SNCARPS6KB1IGF1RNFE2L2ABCB1MMP9CXCL8RXRACYP1A2IGFBP3Closeness centrality0.536 340 8520.533 665 8350.524 509 8040.531 017 3700.527 093 5960.515 662 6510

45、.529 702 9700.516 908 2130.520 681 2650.514 423 0770.513 189 4480.510 739 8570.515 662 6510.509 523 8100.502 347 4180.514 423 0770.510 739 8570.509 523 8100.521 951 2200.516 908 2130.519 417 4760.521 951 2200.495 370 3700.481 981 9820.511 961 7220.489 702 5170.516 908 213Clustering coefficient0.540

46、069 6860.432 926 8290.482 051 2820.476 383 2660.476 383 2660.438 122 3330.364 864 8650.534 534 5350.276 190 4760.459 893 0480.411 764 7060.565 062 3890.518 716 5780.593 582 8880.558 712 1210.606 060 6060.494 318 1820.292 338 7100.584 677 4190.699 596 7740.586 693 5480.406 451 6130.329 032 2580.307 5

47、26 8820.356 989 2470.278 160 9200.586 206 897Degree424140393938373736343434343433333332323232313131313030928刘雨萌,等.基于桑黄对肺炎的治疗作用及其机制的网络药理学分析通路富集分析结果显示:桑黄治疗肺炎涉及的途径包括 PI3K/Akt信号通路、癌症中的 miRNA、化学致癌-受体激活、前列腺癌、癌症中的蛋白多糖和脂质、动脉粥样硬化和化学致癌物-ROS 等相关途径,CYP450靶点均存在于上述相关途径中,参与桑黄治疗肺炎的过程。综上所述,本研究基于网络药理学理论分析了桑黄的化学成分及其作用

48、靶点、与肺炎有关的靶点、相 关 的 生 物 过 程 和 信 号 通 路,结 果 表明:(E)-4-(3,4-dihydroxyphenyl)but-3-en-2-one 是桑黄中对肺炎治疗最有效的化学成分,其作用机制主要与 CYP450家族有关。参考文献1 梁 佳,孙梦伊,张 腾,等.响应曲面法优化桑黄菌丝体中三萜的微波提取工艺 J.中国农学通报,2011,27(10):235-238.2 刘爽爽,王昀睿,李德海.粗毛纤孔菌三萜的提取及胆酸盐结合 研 究J.中 南 林 业 科 技 大 学 学 报,2019,39(10):132-138.3 WAN X L,JIN X,WU X M,et al.

49、Structural characterisation and antitumor activity against non-small cell lung cancer of polysaccharides from Sanghuang porus vaninii J.Carbohydr Polym,2022,276:118798.4 WU Y,LIU H,LI Z H,et al.Purification of polysaccharides from Phellinus linteus by using an aqueous two-phase system and evaluation

50、 of the physicochemical and antioxidant properties of polysaccharides in vitroJ.Prep Biochem Biotechnol,2022,52(1):89-98.5 张维博,王家国,李正阔,等.药 用 真 菌 桑 黄 的 研 究进展 J.中国中药杂志,2014,39(15):2838-2845.6 刘 鑫.粗毛纤孔菌胞外多糖对酒精肝损伤保护作用及其液体发酵条件优化 D.福州:福建农林大学.7 张 倩,孙瑞祥,王 妍,等.桑黄、蛹虫草超临界CO2萃取物的抗氧化活性及其黄酮和三萜含量 J.食用菌,2020,42(5):

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