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常用实验方法和所需试剂的配制.doc

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资源描述
(一)Western-blot实验 1. Western blot主要实验试剂 溴酚蓝(Bromphenol Blue) 丽春红(Ponceau S) 考马斯亮蓝(Coomassie brilliant blue R-250) 吐温-20(Tween-20) β-巯基乙醇(β-Mercaptoethanol) 十二烷基硫酸钠(SDS ) 过硫酸铵(APS) TEMED 聚丙烯酰胺凝胶单体贮备溶液 4×浓缩胶缓冲液 4×浓缩胶缓冲液 甘氨酸 Tris碱 脱脂奶粉 牛血清白蛋白(BSA) 硝酸纤维素膜(NC膜) 蛋白质Marker和预染 Marker 通用蛋白裂解/提取试剂 BCA法蛋白定量试剂盒 Bradford法蛋白定量试剂盒 兔源性抗抗体 辣根过氧化物酶标记羊抗兔IgG ECL超敏发光液 定影液、显影液、X光胶片曝光盒 其他试剂(乙醇、甲醇、冰醋酸、二甲苯、戊二醛等) 2. Western-blot主要实验试剂的配制方法 (1)10%SDS溶液: SDS粉末1g,加双蒸水10mL使其溶解,室温保存。 (2)10%APS:APS 20mg,加双蒸水200μL,混匀,现配现用。 (3)10×电极缓冲液(PH8.3): SDS粉末10g、Tris碱30.4g、甘氨酸144g,双蒸水定溶至1000mL,4℃保存,用时10倍稀释。 (4)考马斯亮蓝固定液:乙醇500mL、冰醋酸10mL、双蒸水定溶至1000mL。 (5)考马斯亮蓝脱色溶液:95%乙醇250mL、冰醋酸80mL,双蒸水定溶至1000mL。 (6)考马斯亮蓝染色溶液:0.29g考马斯亮蓝,溶解于250mL脱色液中,过滤后室温保存。 (7)转移缓冲液:甘氨酸2.93g、Tris碱5.812g、甲醇200mL、去离子水定溶至1000mL,4℃保存。 (8)10×TBS溶液:Nacl87.75g、Tris碱12.1g,用双蒸水溶至1000mL,4℃保存,用时10倍稀释。 (9)TBST溶液: 1×TBS溶液1000mL、Tween-20溶液1mL,混匀。 (9)丽春红溶液:100g丽春红,5mL冰醋酸,双蒸水定溶至100mL,室温保存。 (11)5×上样缓冲液:1mol/LTris-HCl(pH6.8) 0.6mL、甘油2.5mL、10% SDS溶液2mL、β-巯基乙醇(使用前加)0.5mL、1%溴酚蓝溶液1mL,去离子水定溶至10mL,4℃保存。 (12)12%分离胶:聚丙烯酰胺单体贮备液3.2mL、4×分离胶缓冲液0.5mL、10%SDS溶液80μL、10%APS溶液25μL、TEMED原液10μL、双蒸水溶至8mL。 (13)5%浓缩胶:聚丙烯酰胺单体贮备液0.68mL、4×浓缩胶贮备液0.25mL、10%SDS溶液40μL、10%APS溶液15μL、TEMED原液5μL、双蒸水溶至4mL。 (14)NC膜封闭液:脱脂奶粉1g,TBST溶液20mL中溶解,4℃保存。 (15)抗体稀释液:TBST溶液20mL、小牛血清白蛋白1g,混匀,4℃保存。 (16)Striping Buffer:β-巯基乙醇 35μL、10%SDS 溶液1mL、0.5MTris溶液(pH6.7) 625μL,去离子水定溶至5mL,室温保存。 3. Western-blot实验步骤 (1)总蛋白的提取 (采用北京普利莱公司蛋白质抽提试剂盒抽提) ①电子天平精确称取组织50mg(±2mg),放入含有1mL细胞裂解液和适量的PMSF(终浓度为1mmoL/mL)的预冷玻璃匀浆器内,冰上匀浆。 ②取0.5mL匀浆液移入新的2mLEP管内,加1mL蛋白抽提试剂并混匀,静置10min后(偶有颠倒混匀),12000g 4℃离心10min。 ③弃去上清保留蛋白质膜,加2%SDS溶液500μL,100℃水浴10min,4℃放置2小时使蛋白质膜充分溶解。 (2)总蛋白浓度的测定(BCA法) ①配制统一的蛋白质标准品:以牛血清白蛋白(bovine serum albumin,BSA)的标准品溶液(浓度为1mg/mL)制作蛋白质标准曲线。分别吸取BSA标准品溶液0、100、200、400、800、1200、1600和2000μL,各自加入0.01MPBS溶液补足到2000μL,配成梯度浓度的标准品溶液,分装后-20℃备用。 ②配制BCA工作液:按50:1的比例将BCA试剂盒内的A试剂与B试剂进行混合,配成BCA工作液。室温保存,1d内使用。 ③样品处理:取各样品10μL,加0.01MPBS溶液490μL,配成待测样品。 ④加样:先于酶标板上样孔内加入200μL BCA工作液,再分别加入倍比稀释的标准品及待测样品各20μL,酶标仪上震荡3min,充分混匀。 ⑤测定:将酶标板置于恒温水浴箱中,37℃孵育30min。用MRK3型酶标仪测定562nm波长下各孔吸光度值(optical density,OD),采用Softmax5.2软件计算各样本蛋白质浓度。 (3)样品浓度的配平和制备 ①配平:按测定的各样品蛋白质浓度,用2%SDS溶液配平各样品总蛋白浓度。根据预实验结果,将组织的总蛋白浓度调为1mg/mL。 ②制备:将配平后的样品与5×上样缓冲液按4:1的比例混合。 100℃水浴10min,部分4℃保存用于电泳,部分-20℃保存备用。 (4)样品内蛋白含量的检测 ①凝胶的配制:配制12%分离胶和5%浓缩胶(配制方法见附录)。 ②上样:分别用Eppendorf微量移液器吸取蛋白质Marker或样品各10μL,将枪尖的插入加样孔的底部,缓慢地将样品或Marker加入加样孔,避免有气泡产生。 ③电泳:浓缩胶:电压100V、电流400mA,电泳20min;分离胶:120V,400mA,电泳50min,待溴酚蓝到达凝胶底部,关闭电源。 ④蛋白质转膜:恒压转移,转膜参数:电压100V,电流350mA,转移23min。结束后,将硝酸纤维素膜(nitrocellulose,NC膜)于丽春红染液中染色10 min,可见清晰的红色条带,表明转膜成功。去离子水冲洗,根据蛋白质Marker的位置将含有目的蛋白的膜条带上下各0.5cm)裁下。 ⑤封闭:把NC膜置于封闭液内室温封闭4h(摇床上进行),TBST液洗膜2min×3次。 ⑥免疫反应:将封闭好的膜置于一抗溶液中4℃孵育过夜,TBST溶液洗3min×5次后,NC膜再于辣根过氧化物酶标记羊抗兔IgG溶液中孵4℃育1h,用TBST溶液洗膜3min×5次。以上步骤均在摇床上进行。 ⑦曝光:将ECL超敏发光液中的A液和B液按1:1比例混合后滴于NC膜上,暗室内曝光30s,X-光片在显影液中显影2min,定影液中定影5min。 ⑧分析结果:将NC膜上肌动蛋白染色条带结果扫描后输入电脑,IPP5.0图像分析系统分析结果。 (二)免疫组化(荧光)染色实验 1. 免疫组化(荧光)染色主要实验试剂 防脱片剂 一抗抗体 免疫组化试剂盒(SP或SABC) DAB试剂盒 罗丹明标记的羊抗兔IgG 组织自身荧光淬灭剂 其他试剂(乙醇、甲醇、冰醋酸、二甲苯、戊二醛等)均为国产分析纯 2. 常用试剂的配制 (1)0.01MPBS溶液:中衫公司的PBS粉末一包,加蒸馏水2000mL,混匀,室温保存。 (2)4%多聚甲醛溶液:500ml 0.01MPBS液加40g多聚甲醛在2000 ml的烧杯内加热至60℃,边搅拌边加热,至溶液呈澄清,另加500 ml 0.01MPBS液至1000 ml。冷却后过滤, 4℃冰箱保存备用。 (3) 苏木素: (4) 伊红: 3. HE染色方法 (1)二甲苯I脱蜡10min (2)二甲苯II、III脱蜡各5min (3)无水乙醇洗1min×2次 (4)95%酒精1min (5)90%酒精1min (6)85%酒精1min (7)自来水洗2min (8)苏木素染色1~5min (9)自来水洗1min (10)1%盐酸酒精分化20s (11)自来水洗1min (12)稀氨水(1%)反蓝30s (13)自来水洗或蒸馏水洗1min (14)伊红染色20s~5min (15)自来水洗30s (16)85%酒精脱水20s (17)90%酒精30s (18)95%酒精1min (19)95%酒精1min (20)无水乙醇2min (21)无水乙醇2min (22)二甲苯I、II、III透明各5min (23)中性树胶封片 4.免疫组化染色 (1)制作切片:组织切片的制作、切片脱蜡、脱水过程按HE染色步骤进行; (2)抗原修复:0.01M的枸橼酸缓冲液内、中火微波修复15min,冷却至室温后,PBS溶液洗3min×3次; (3)封闭:封闭液室温封闭30min,弃去封闭液,不洗; (4)免疫反应:滴加一抗抗体,4℃孵育过夜(保湿盒内进行),PBS溶液洗切片3min×5次后,滴加二抗,室温4℃孵育30min,PBS溶液洗切片3min×5次;滴加DAB试剂、显色。显微镜观察切片,蒸馏水终止显色反应。脱水、透明、封片。 (5)观察:每张切片随机选5个视野,扫描记录,并采用IPP5.0图像分析软件分析图像。 5.免疫荧光染色 (1)制作切片:组织切片的制作、切片脱蜡、脱水过程按HE染色步骤进行; (2)抗原修复:0.01M的枸橼酸缓冲液内、中火微波修复15min,冷却至室温后,PBS溶液洗3min×3次; (3)封闭:封闭液室温封闭30min,弃去封闭液,不洗; (4)免疫反应:滴加一抗抗体,4℃孵育过夜(保湿盒内进行),PBS溶液洗切片3min×5次后,滴加罗丹明标记IgG,室温避光4℃孵育30min,PBS溶液洗切片3min×5次;滴加组织自发荧光淬灭剂,室温孵育30min,PBS溶液洗3min×3次;滴加抗荧光淬灭封片剂封片,4℃避光保存。 (5)观察:荧光显微镜观察切片,每张切片随机选5个视野,扫描记录,并采用IPP5.0图像分析软件分析图像。 (三)RT-PCR实验 1. RT-PCR主要实验试剂 TRIzol Reagent DEPC One Step RNA PCR Kit (AMV) DNA Marker 琼脂糖 Tris MOPS MGP试剂 去离子甲酞胺 去离子甲醛 其他试剂(乙醇、甲醇、冰醋酸、二甲苯、戊二醛等)均为国产分析纯 2. 常用试剂的配制 (1)DEPC水(v/v):在1000 ml去离子水中加入DEPC 1ml,37℃充分振荡过夜,高压灭菌。浸泡实验器具的DEPC水:在1000 m去离子水中加入DEPC 1ml,充分振荡后即可使用。 (2)75%乙醇(DEPC水配制):无水乙醉375ml,加入DEPC水定容至500ml。 (3)0.5M EDAT (pH8.0): EDAT-2Na 186.1g,加DEPC水至800ml,充分搅拌。用NaOH约20g调pH至8.0,用DEPC水定容至1000ml。高温高压灭菌后分装,室温保存。 (4)1×Tri-HCl(pH8.0):Tris 121.1g,加DEPC水800ml搅拌溶解后,用浓HCl约42ml调pH至8.0,用DEPC水定容至1000ml。高温高压灭菌后分装,室温保存" (5)10×TE(pH8.0): 100mM Tris-HCI(pH8.0), 1mM EDAT(pH8.0), 加800mlDEPC 水混合均匀后定容至IL。高温高压灭菌后分装,室温保存。 (6)EB染液(200μg/μl)I:澳化乙锭2.0mg,,加DEPC水至10ml,充分搅拌数小时完全溶解后室温避光保存。 (7)1MM乙酸钠: 68g乙酸钠, 加DEPC水400ml,搅拌,用DEPC水定容至500ml。(8)10×MOPS电泳缓冲液:41.8gMOPS溶解于700ml灭菌的DEPC水中,用2M的NaOH调整到pH7.0, 加20ml乙酸钠和20 ml MEDAT(pH8.0), 用DEPC水调整到1L, 避光保存。 (9)10×甲醛变性琼脂糖凝胶:加1.5g琼脂糖到72ml灭菌去离子水中,煮沸溶解琼脂糖,将溶液冷却到55℃同时加入10ml 10xMOPS电泳缓冲液和18ml去离子甲醛后灌胶。 (10)10×甲醛凝胶缓冲液:甘油5ml, 25mg固体澳酚蓝, 25mg二甲苯青FF, 10mM EDAT(PH8.0) 5ml定容至10m。 (11)1.5%琼脂糖凝胶:琼脂糖1.5g,加入100ml l×TBE电泳缓冲液P(H8.3)后在微波炉内加热溶解,冷却至55℃左右加入EB染液(终浓度0.5μg/μl)充分混匀后灌胶。 (12)5×TBE电泳缓冲液(pH8.3): 54gTris碱,27.59硼酸,20ml 0.5M EDAT(pH8.0),定容至1L。 (13)6×凝胶载样缓冲液:0.25%嗅酚蓝(m/v)、0.25%二甲苯青(m/V), 30%甘油水溶液,4℃保存。 3. RNA提取方法 (1)组织取出后立刻至于液氮中。 (2)脑组织称取后在液氮存在下研磨3次成粉末状(需要磨成非常细的粉末,否则抽提效率会降低)。 (3)待液氮挥发干,立即加入TRIzol,每100mg组织加1ml TRIzol,用加样枪吹吸,使样品充分裂解,移入1.5 ml EP管中,静止5min,以使核酸蛋白复合体完全分离。 (4)在EP管中加200μL氯仿,剧烈振荡15秒,静置5min。 (5)将EP管在4℃ 12000g,离心15min,离心后混合物分离成一个较低的红色苯酚-氯仿的有机相,一个中间相和一个无色的上层的水相。 (6)用移液器小心吸出上层水相(不要吸取中间白色的中间层)300ml,加入另一EP管中。 (7)加入500 μL预冷过的异丙醇,振荡混匀。-20℃沉淀过夜。 (8)4℃ 12000g,离心15min,此时在EP管中常常能看到白色沉淀,小自移出 上清。 (9)沉淀中加入lml预冷过的75%乙醇,振荡混匀后4℃ 7500g,离心5min。 (10)重复用75%乙醇洗涤RNA沉淀一次。 (11)去上清,RNA沉淀于空气干燥5-10min,,加入DEPC水充分济解(难溶时可在55-60℃孵育10min助溶。 4. RNA定量检测 (1)提取适量总RNA用1×xTE稀释200倍,以1xTE作为空白对照。 (2)分别测定在260nm和280nm处的吸光值,纯RNA的OD260/OD280比值应接近2.0(比值最好在1.7-2.0之间)。 (3)在260nm处的吸光度,1OD=40μg/ml NRA。浓度计算公式如下:A260光密度值×40×稀释倍数/1000=μg/μl RNA。 5、琼脂糖变性凝胶电泳质检RNA (1)在EP管内建立变性反应: 对照组总RNA(约5μg)2.0 μl 10×MOPS电泳缓冲液 2.0 μl 去离子甲醛 4.0 μl 去离子甲酰胺 10.0μl 澳化乙锭(200μg/μl) 1.0 μl (2) 将EP管置于水浴恒温器中65℃ 温育5min,取出立刻置丁冰上10min,然后离心5s,将所有液体沉淀到EP管内底部。 (3)加2.0 μl 10×甲醛凝胶缓冲液并重新置于冰上。 (4)将1.5%甲醛变性琼脂糖凝胶放入水平电泳槽内,加入足量1×MOPS电泳缓冲液覆盖凝胶约lmm,加RNA样品到凝胶加样孔中。 (5)5V/cm电压下电泳,直到溴酚蓝移出约8厘米,由于电泳过程中电泳缓冲液的pH值会发生变化,需每小时人工转变缓冲液。 (6)紫外线下观察,拍照。提取质量较好RNA电泳结果为5s、18s和28s三条带清晰,没有明显的降解,28s RNA条带是18s RNA条带亮度的两倍。 6、RT-PCR反应 (1)按照试剂盒说明书加入试剂。 (2)RT-PCR反应。 (3)反应结束后,取PCR反应液各5μl进行1.5%琼脂糖凝胶(含EB)电泳。 (4)5V/em电压下电泳40min。 (5)紫外线下观察,拍照。 (四)ElISA实验 1. RT-PCR主要实验试剂 2.ElISA操作步骤 (1)取右心血液,在4℃下2000r/min离心10min,取上层血清。 (2)取出ELISA试剂盒平衡至室温。 (3)取出反应板每孔分别加入20μl标准品、20μl血清于反应板孔中。 (4)每孔加入100μl Zero Buffer,轻轻混匀30秒,室温温育30min。 (5)洗板:甩尽板内液体,用蒸馏水或者洗涤液洗涤反应板,并去除水滴(在厚叠吸水纸上拍干),这样反复洗涤5次。 (6)每孔加入150ul酶联物(Reagent),轻轻混匀10秒,室温温育30min。 (7)洗板:与步骤5相同。 (8)每孔加入IO0μl TMB显色液,轻轻混匀10秒钟,置暗处室温温育20 min。 (9)每孔加入50μl终止液(stop solution),轻轻混匀30s;确定兰色变为黄色(重要),30min内在45Onm处读OD值。 (10)以OD值为纵坐标,以标准品浓度为横坐标,绘制标准曲线。根据豚鼠血清样品的OD值可在标准曲线上查出其浓度。 (五) 原位杂交实验 1. 原位杂交实验所需试剂 TriS 曲拉通X-100 吐温-20 DEPC mRNA原位杂交试剂盒及专用盖玻片 原位杂交寡核昔酸探针 2. 原位杂交所需试剂的配制方法 (1) DEPC水:在1000ml去离子水中加入DEPC 1ml,37℃下充分振荡过夜,高温高压灭菌,浸泡实验器具的DEPC水:在1000ml去离子水中加入DEPC1ml而,充分振荡后即可使用。 (2) 组织细胞打孔液:DEPC处理的构椽酸缓冲液(0.01mol)99.5ml,加入曲拉通X-100 0.5ml,混匀即可。 (3)DEPC处理的PBS缓冲液:1000 ml PBS缓冲液(0.01mol)中加入DEPC 1ml, 荡过夜,高温高压灭菌。 (4)0.1 mol TBS: 8.5g NaCI、l.2g Tris用DEPC处理的去离子水定容至I000ml,混匀, 用乙酸调pH至7.5。 (5)过氧化氢封闭液: 市售30%的过氧化氢10ml,加DEPC处理的PBS缓冲液定容至100ml, 此液现用现配。 (6)4%多聚甲醛: 4g多聚甲醛溶于DEPC处理的双蒸水100ml中, 50℃加热搅拌,滴加IN氢氧化钠直至白色的多聚甲醛完全溶解,3号定性滤纸过滤备用。 (7)20×SSC 缓冲液的配制:氯化钠 175.3g、柠檬酸三钠 88.2g 加 DEPC 处理的去离子水混合均匀后定容至 1L。2×SSC、0.2×SSC 依次稀释 10 倍。 3. 原位杂交实验步骤 (1)取组织,于DEPC处理的4%多聚甲醛中固定2h,15%蔗糖(4℃)脱水1天,冰冻切片12μm。 (2)原位杂交合成探针(8μg/ml, 地高辛标记) (3)切片丙酮中浸泡10min,DEPC处理的PBS(0.01M, pH7.4)冲洗3min。 (4)置打孔液中室温10分钟,以改变组织细胞的通透性使探针快速顺利地穿透细胞膜,0.01 M PBS冲洗3次, 每次3min。 (5)加过氧化氢封闭液室温20分钟,以封闭内源性过氧化氢酶,0.01 M PBS冲洗3min。 (6)滴加复合消化工作液覆盖组织表面,4℃ 20min,0.01M PBS冲洗3次,0.2× SSC冲洗一次(室温3min)。 (7) 滴加预杂交工作液(25μl/张)覆盖组织,37℃孵育盒孵育过夜。 (8)预杂交后,揭去盖玻片,以0.2×SSC 37℃洗3次,每次5min。以上步骤所 用洗液均经DEPC处理。 (9) 滴加杂交工作液(25μl/张)覆盖组织,37℃孵育盒孵育6h。 (10) 揭去盖玻片以2×SSC 37℃洗3次,每次5min;0.2×SSC 37℃洗3次,每次5min;0.l mol TBS 37℃洗4次, 每次5分钟。 (11) 滴加小鼠抗地高辛生物素标记的抗体工作液,37℃孵育30 min,0.0l M PBS 冲洗3次,每次5min。 (12) 滴加高敏过氧化物酶链亲和素复合工作液,37℃孵育30 min,0.0l M PBS 冲洗3次,每次5min。 (13) DAB显色,光镜下观察,当细胞浆内阳性颜色与细胞外背景色对比度反差明显时,蒸馏水洗终止反应。胞浆显棕黄色颗粒为阳性反应。80%酒精-90%酒精-无水乙醇-二甲苯脱水,每步4分钟,中性树胶封片,4℃保存。 或(13) 滴加高敏荧光链亲和素复合物(FITC)工作液,4℃湿盒孵育 2h。 0.01M PBS 冲洗,5min×3 次。甘油封片。
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