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ABCA3作为非小细胞肺癌的预后生物标志物及其与免疫细胞浸润的相关性.pdf

上传人:自信****多点 文档编号:2191486 上传时间:2024-05-22 格式:PDF 页数:10 大小:13.92MB
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资源描述

1、论著D O I:1 0.1 2 0 3 7/Y X Q Y.2 0 2 4.0 1-0 8A B C A3作为非小细胞肺癌的预后生物标志物及其与免疫细胞浸润的相关性张萌萌1,邵松2,曹冰3,潘蕾4(1.解放军总医院京南医疗区 内科,北京 1 0 0 8 4 3;2.解放军总医院京南医疗区 医学影像科,北京 1 0 0 8 4 3;3.解放军总医院京南医疗区 检验科,北京 1 0 0 8 4 3;4.空军军医大学唐都医院 呼吸与危重症医学科,陕西 西安 7 1 0 0 3 8)【摘要】目的 本研究旨在基于生物信息学分析探讨A B C A3在非小细胞肺癌 肺腺癌(l u n g a d e n o

2、 c a r c i n o m a,L U A D)中的临床意义和生物学功能。方法 基于癌症基因组图谱(t h e C a n c e r G e n o m e A t l a s,T C G A),提取L U A D中A B C A3表达和相应的临床信息。使用R 4.2.2软件进行统计分析。采用W i l c o x o n符号秩和检验比较T C G A L UA D队列中肿瘤组织与对照组之间A B C A3的表达,以及临床病理参数与A B C A3表达水平之间的关系。根据A B C A3表达的中位数,将T C G A L UA D患者分为高表达组和低表达组。使用s u r v i v

3、a l包和s u r v m i n e r包分析A B C A3与L U A D患者总生存(o v e r a l l s u r v i v a l,O S)期和无进展生存(p r o g r e s s i o n f r e e s u r v i v a l,P F S)期的关系,并进行单因素和多因素C o x回归分析确定与L UA D预后相关的危险因素。使用r m s包构建预测L UA D患者1年、2年和3年O S率的列线图模型。使用D E S e q 2包对高表达组和低表达组患者进行差异表达基因(d i f f e r e n t i a l e x p r e s s e d

4、g e n e s,D E G s)分析,并使用c l u s t e r P r o f i l e r包对D E G s进行基因本体(G e n e O n t o l o g y,G O)数据库和基因组京都百科全书(K y o t o E n c y c l o p e d i a o f G e n e s a n d G e n o m e s,K E G G)富集分析。利用C I B E R S O R T算法预测L U-A D肿瘤样本和正常样本中2 2种浸润性免疫细胞的丰度,并分析A B C A3表达与免疫浸润细胞和免疫检查点之间的相关性。结果 A B C A3基因在L U A

5、D肿瘤组织中的表达均低于配对和非配对样本正常组织(P 0.0 5)。A B C A3高表达L U A D患者的O S(P=0.0 3 1)和P F S(P=0.0 4 4)明显高于低表达患者。T2分期(P=0.0 0 4)和T3分期(P=0.0 4 4)患者A B C A3的表达显著低于T1分期患者。多因素C o x回归分析显示,T分期、N分期和A B C A3表达是影响L UA D预后的独立影响因素(P0.0 5)。基于A B C A3表达、T分期和N分期构建的列线图预测模型的C-i n d e x为0.8 6,提示模型与实际结果较为一致。校准曲线中的偏差修正线接近理想曲线,提示列线图模型的

6、预测结果与观测结果较吻合。基因集富集分析显示A B C A3高表达组主要与花生四烯酸代谢、补体和凝血级联、肠道免疫网络免疫球蛋白A产生等有关。A B C A3的表达与N R P 1、T R F R S F 1 4、T N F S F 1 5、C D 4 0 L G、HH L A 2、C D 2 8呈明显正相关,而与I D O 1、C D 7 0、T N F S F 4、C D 2 7 6和V T C N 1呈明显负相关(P0.0 5)。1 2种免疫浸润细胞在高表达组和低表达组存在明显差异(P0.0 5)。此外,1 4种免疫浸润细胞与A B C A3表达呈现明显相关性(P 0.0 5),包括巨噬

7、细胞、C D 4+T细胞和树突细胞。结论 A B C A3的表达与L UA D患者预后和免疫细胞浸润有关,可能是预测非小细胞肺癌预后的有价值生物标志物。【关键词】非小细胞肺癌;肺腺癌;三磷酸腺苷结合盒转运子A 3;免疫细胞浸润;预后A B C A3 a s a p r o g n o s t i c b i o m a r k e r i n n o n-s m a l l c e l l l u n g c a n c e r a n d i t s c o r r e l a t i o n w i t h i mm u n e c e l l i n f i l t r a t i o

8、nZ h a n g M e n g m e n g1,S h a o S o n g2,C a o B i n g3,P a n L e i4(1.D e p a r t m e n t o f I n t e r n a l,S o u t h e r n M e d i c a l B r a n c h o f P L A G e n e r a l H o s p i t a l,B e i j i n g 1 0 0 8 4 3,C h i n a;2.D e p a r t m e n t o f M e d i c a l I m a g i n g,S o u t h e r

9、 n M e d i c a l B r a n c h o f P L A G e n e r a l H o s p i t a l,B e i j i n g 1 0 0 8 4 3,C h i n a;3.D e p a r t m e n t o f C l i n i c a l L a b o r a t o r y,S o u t h e r n M e d i c a l B r a n c h o f P L A G e n e r a l H o s p i t a l,B e i j i n g 1 0 0 8 4 3,C h i n a;4.D e p a r t m

10、 e n t o f R e s p i r a t o r y a n d C r i t i c a l C a r e M e d i c i n e,A i r F o r c e M e d i c a l U n i v e r s i t y T a n g d u H o s p i t a l,X i a n 7 1 0 0 3 8,C h i n a)C o r r e s p o n d i n g a u t h o r:P a n L e i,E-m a i l:r e t a 5 6 8 7 42 1 c n.c o m【A b s t r a c t】O b j

11、e c t i v e T h e a i m o f t h i s s t u d y i s t o i n v e s t i g a t e t h e c l i n i c a l s i g n i f i c a n c e a n d b i o l o g i c a l f u n c t i o n s o f A B C A3 i n n o n-s m a l l c e l l l u n g c a n c e r-l u n g a d e n o c a r c i n o m a(L UA D)b a s e d o n b i o i n f o r

12、m a t i c s a n a l y s i s.M e t h o d s B a s e d o n t h e C a n c e r G e n o m e A t l a s(T C GA)d a t a b a s e,A B C A3 e x p r e s s i o n a n d c o r r e s p o n d i n g c l i n i c a l i n f o r m a t i o n i n L UA D w e r e 4 5 中国医学前沿杂志(电子版)2 0 2 4年第1 6卷第1期基金项目:陕西省重点研发计划项目(2 0 2 0 S F-1

13、 1 2)通信作者:潘蕾 E-m a i l:r e t a 5 6 8 7 42 1 c n.c o m论著e x t r a c t e d.S t a t i s t i c a l a n a l y s i s w a s p e r f o r m e d u s i n g R 4.2.2 s o f t w a r e.W i l c o x o n r a n k s u m a s s a y w a s u s e d t o c o m p a r e A B C A3 e x p r e s s i o n b e t w e e n t u m o r t i s

14、s u e s a n d c o n t r o l s i n t h e T C GA L UA D c o h o r t,a n d t h e r e l a t i o n s h i p b e t w e e n c l i n i c o p a t h o l o g i c a l p a r a m e t e r s a n d A B C A3 e x p r e s s i o n l e v e l s.T C G A L UA D p a t i e n t s w e r e d i v i d e d i n t o h i g h a n d l o

15、w e x p r e s s i o n g r o u p s b a s e d o n t h e m e d i a n A B C A3 e x p r e s s i o n.T h e r e l a t i o n s h i p b e t w e e n A B C A3 a n d o v e r a l l s u r v i v a l(O S)a n d p r o g r e s s i o n-f r e e s u r v i v a l(P F S)o f L UA D p a t i e n t s w a s a n a l y z e d b y u

16、 s i n g t h e s u r v i v a l p a c k a g e a n d s u r v m i n e r p a c k a g e,a n d u n i v a r i a t e a n d m u l t i f a c t o r i a l C o x r e g r e s s i o n a n a l y s e s w e r e p e r f o r m e d t o i d e n t i f y r i s k f a c t o r s a s s o c i a t e d w i t h L UA D p r o g n o

17、s i s.C o l u m n a r l i n e g r a p h m o d e l s p r e d i c t i n g t h e p r o b a b i l i t y o f 1-y e a r,2-y e a r a n d 3-y e a r O S i n L UA D p a t i e n t s w e r e c o n s t r u c t e d b y u s i n g t h e r m s p a c k a g e.D i f f e r e n t i a l l y e x p r e s s e d g e n e s(D E

18、 G s)a n a l y s i s w a s p e r f o r m e d f o r p a t i e n t s i n t h e h i g h a n d l o w e x p r e s s i o n g r o u p s b y u s i n g t h e D E S e q 2 p a c k a g e.T h e C I B E R S O R T a l g o r i t h m w a s u s e d t o p r e d i c t t h e a b u n d a n c e o f 2 2 i n f i l t r a t i

19、 n g i mm u n e c e l l s i n L UA D t u m o r s a m p l e s a n d n o r m a l s a m p l e s,a n d t o a n a l y z e t h e c o r r e l a t i o n b e t w e e n A B C A3 e x p r e s s i o n a n d i mm u n e i n f i l t r a t i n g c e l l s a n d i mm u n e c h e c k p o i n t s.R e s u l t s A B C A

20、1 g e n e e x p r e s s i o n w a s l o w e r i n L UA D t u m o r t i s s u e s t h a n i n n o r m a l t i s s u e s o f b o t h p a i r e d a n d u n p a i r e d s a m p l e s(P0.0 5).O S(P=0.0 3 1)a n d P F S(P=0.0 4 4)w e r e s i g n i f i c a n t l y h i g h e r i n p a t i e n t s w i t h h i

21、 g h A B C A3 e x p r e s s i o n L UA D t h a n i n p a t i e n t s w i t h l o w e x p r e s s i o n.A B C A3 e x p r e s s i o n w a s s i g n i f i c a n t l y l o w e r i n T2-s t a g e d(P=0.0 0 4)a n d T3-s t a g e d(P=0.0 4 4)p a t i e n t s t h a n i n T 1-s t a g e d p a t i e n t s.M u l

22、t i-f a c t o r C o x r e g r e s s i o n a n a l y s i s s h o w e d t h a t T-s t a g e,N-s t a g e a n d A B C A3 e x p r e s s i o n w e r e i n d e p e n d e n t f a c t o r s a f f e c t i n g t h e p r o g n o s i s o f L UA D(P0.0 5).T h e C-i n d e x o f t h e p r e d i c t i o n m o d e l

23、o f c o l u m n l i n e g r a p h c o n s t r u c t e d b a s e d o n A B C A3 e x p r e s s i o n,T s t a g e a n d N s t a g e w a s 0.8 6,w h i c h s u g g e s t i n g t h a t t h e m o d e l w a s m o r e c o n s i s t e n t w i t h t h e a c t u a l r e s u l t s.T h e d e v i a t i o n c o r r

24、 e c t i o n l i n e i n t h e c a l i b r a t i o n c u r v e w a s c l o s e t o t h e i d e a l c u r v e,w h i c h s u g g e s t i n g t h a t t h e p r e d i c t i o n r e s u l t s o f t h e c o l u m n l i n e g r a p h m o d e l w e r e i n b e t t e r a g r e e m e n t w i t h t h e o b s e

25、 r v e d r e s u l t s.G S E A a n a l y s i s s h o w e d t h a t t h e A B C A3 h i g h e x p r e s s i o n g r o u p w a s m a i n l y a s s o c i a t e d w i t h a r a c h i d o n i c a c i d m e t a b o l i s m,c o m p l e m e n t a n d c o a g u l a t i o n c a s c a d e s,a n d I g A p r o d

26、u c t i o n i n t h e i n t e s t i n a l i mm u n e n e t w o r k.A B C A3 e x p r e s s i o n s h o w e d a s i g n i f i c a n t p o s i t i v e c o r r e l a t i o n w i t h N R P 1,T R F R S F 1 4,T N F S F 1 5,C D 4 0 L G,HH L A 2,a n d C D 2 8,a n d a s i g n i f i c a n t n e g a t i v e c o

27、 r r e l a t i o n w i t h I D O 1,C D 7 0,T N F S F 4,C D 2 7 6,a n d V T C N 1(P0.0 5).T w e l v e i mm u n e i n f i l t r a t i n g c e l l s w e r e s i g n i f i c a n t l y d i f f e r e n t b e t w e e n t h e h i g h a n d l o w e x p r e s s i o n g r o u p s(P0.0 5).I n a d d i t i o n,1

28、4 i mm u n e i n f i l t r a t i n g c e l l s s h o w e d s i g n i f i c a n t c o r r e l a t i o n(P0.0 5)w i t h A B C A3 e x p r e s s i o n,i n c l u d i n g m a c r o p h a g e s,C D 4+T c e l l s a n d d e n d r i t i c c e l l s.C o n c l u s i o n s A B C A3 e x p r e s s i o n w a s a s

29、s o c i a t e d w i t h p r o g n o s i s a n d i mm u n e c e l l i n f i l t r a t i o n i n p a t i e n t s w i t h L U A D a n d m a y b e a v a l u a b l e b i o m a r k e r f o r p r e d i c t i n g t h e p r o g n o s i s o f n o n-s m a l l c e l l l u n g c a n c e r.【K e y w o r d s】N o n-

30、s m a l l c e l l l u n g c a n c e r;L u n g a d e n o c a r c i n o m a;A d e n o s i n e t r i p h o s p h a t e b i n d i n g c a s s e t t e t r a n s p o r t e r;I mm u n e c e l l i n f i l t r a t i o n;P r o g n o s i sF u n d P r o g r a m:S h a a n x i P r o v i n c e K e y R e s e a r c

31、h a n d D e v e l o p m e n t P r o g r a m(2 0 2 0 S F-1 1 2)肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因,主要分为小细胞肺癌和非小细胞肺癌(n o n-s m a l l c e l l l u n g c a n c e r,N S C L C)1。其中N S C L C占肺癌的8 0%,而肺腺癌(l u n g a d e n o c a r c i n o m a,L UA D)是N S C L C中最普遍的亚型,其发病率和病死率高,严重威胁人类健康2。尽管L UA D的5年生存率已有明显提高,但目前中国L UA D的发病率和死亡率仍呈

32、上长趋势,且有年轻化倾向。由于早期没有特异性症状,7 0%8 0%的L UA D患者在确诊时已处于中晚期,存在淋巴结转移和远处转移3。基于体液的检测在包括肿瘤在内的多种人类疾病预测中的价值受到关注。然而,目前用于肺癌筛查的血清肿瘤标志物,如癌胚抗原和神经元特异性烯醇化酶,存在敏感度和特异度低的缺点4。糖类抗原1 2 5常用于卵巢癌的筛查,在包括肺癌在内的其他癌症类型中特异度较低5。探讨L U A D有价值的预后标志物和治疗靶点是至关重要的。肿瘤免 疫 微 环 境 在 肿 瘤 发 生 中 起 着 重 要 作用6。渗入的免疫细胞可作为抗癌或促癌因素。癌细胞获得抑制免疫细胞拮抗肿瘤功能的能力,可逃避

33、免疫监视、导致癌症的发生。近年来,针对免疫微环境调节和免疫检查点调控的免疫疗法在癌症治疗中显示出良好的疗效7。利用生物信息学和机器学习方法发现多种类型的免疫相关标志物与肿瘤的预后相关8。然而,目前仍然缺乏免疫相关的有效生物标志物来预测L U A D患者的生存情况。三磷酸腺苷结合盒转运子A 3(a d e n o s i n e t r i p h o s-p h a t e b i n d i n g c a s s e t t e t r a n s p o r t e r,A B C A3)是A T P-结合盒转运体家族成员之一,在肺组织中高度表达9。既往已证实A B C A3与包括肺癌在

34、内的多种癌症的发生进展有关1 0。然而,目前尚未见A B C A3参与L U A D免疫浸润并指示其预后价值的相关报道。因此,本研究通过对A B C A3基因进行数据挖掘,分析其在L U A D中的表达及其预后价值,并通过C I B E R-S O R T算法分析其与L U A D免疫浸润细胞的关系,以期为L U A D的免疫治疗提供有价值的新靶标。4 6 中国医学前沿杂志(电子版)2 0 2 4年第1 6卷第1期论著1 资料与方法1.1 数据源和预处理 利用T I M E R 2.0数 据 库(h t t p:/t i m e r.c o m p-g e n o m i c s.o r g/

35、t i m e r/),进入“C a n c e r E x p l o r a t i o n”下的“G e n e_D E”模块来检索A B C A3在多种癌症中的表达情况。2 0 2 3年5月从癌症基因组图谱(t h e C a n c-e r G e n o m e A t l a s,T C G A)网站(h t t p s:/c a n c e r g e-n o m e.n i h.g o v/)下载了4 9 7例L U A D和5 7例癌旁正常组织的转录组测序数据和相应的临床数据。R 4.2.1软件用于规范化、处理和分析数据。使用P e r l(h t-t p s:/w w w

36、.p e r l.o r g/)将每个样本的R N A s e q值整合成一个矩阵文件。1.2 A B C A3在T C GA队列中的差异表达分析及生存分析 使用R 4.2.2软件进行统计分析。采用W i l c-o x o n符号秩和检验比较T C GA L UA D队列中肿瘤组织与对照组之间A B C A3的表达,以及临床病理参数与A B C A3表达水平之间的关系。以总生存(o v e r a l l s u r v i v a l,O S)期和无进展生存(p r o g r e s-s i o n f r e e s u r v i v a l,P F S)期作为主要的预后终点,使用R

37、软件s u r v i v a l包和s u r v m i n e r包创建K a p-l a n-M e i e r生存曲线。亚组间的比较采用对数秩检验,P2校正P1、名义P值0.0 5和错误发现率(F D R)0.2 5作为阈值筛选阳性基因集。1.6 免疫细胞浸润的差异分析及相关性分析 C I B E R S O R T算法是一种反卷积算法,利用特定标记基因的特征对每个免疫细胞亚型进行评分,并根据评分计算免疫细胞亚型的比例。本研究利用C I B E R S O R T算法预测L UA D肿瘤样本和正常样本中2 2种浸润性免疫细胞的丰度,包括B细胞、树突状细胞、嗜酸性粒细胞、巨噬细胞、肥大

38、 细 胞、单 核 细 胞、中 性 粒 细 胞、自 然 杀 伤(n a t u r a l k i l l e r,NK)细胞、浆细胞、T细胞及其不同亚型。以A B C A3基因分组分别得出各免疫细胞与A B C A3基因的相关性。采用W i l c o x o n符号秩和检验比较高、低A B C A3表达组中2 2种浸润性免疫细胞的比例,并评价A B C A3表达与免疫浸润细胞比例和免疫检查点之间的P e a r s o n相关性。使用“v i o p l o t”“g g p l o t 2 2”和“g g p u b r”R软件包绘制小提琴图、散点图和相关性热图。2 结果2.1 A B C

39、 A3基因表达水平 T I ME R数据库分析3 3种不同类型的肿瘤组织及癌旁正常组织中A B C A3的表达水平,结果显4 7 中国医学前沿杂志(电子版)2 0 2 4年第1 6卷第1期论著示A B C A3在B R C A(乳腺浸润癌)、CHO L(胆管癌)、K I R C(肾透明细胞癌)、K I R P(肾乳头状细胞癌)、L I HC(肝细胞癌)、P C P G(嗜铬细胞瘤和副神经节瘤)、P R A D(前列腺癌)中高表达,而在B L C A(膀 胱 尿 路 上 皮 癌)、C OA D(结 肠癌)、HN S C(头 颈 鳞 状 细 胞 癌)、L UA D(肺 腺癌)、L U S C(肺鳞

40、癌)、R E A D(直肠腺癌)、TH-C A(甲状腺癌)、U C E C(子宫内膜癌)中低 表达,差异具有统计学意义(P0.0 5,图1 A)。此外,在T C G A样本中发现,无论是L U A D配对样本还是非配对样本,A B C A1基因表达均低于正常组织,差异具有统计学意义(P 0.0 5,图1 B和1 C)。2.2 A B C A3与L U A D患者预后的关系 根据A B C A3表达的中位值将T C G A L U A D患者分为A B C A3高表达组和A B C A3低表达组。采用K a p l a n-M e i e r生存分析和L o g-r a n k检验分析A B C

41、 A3图1 T I ME R数据库内A B C A3在不同组织中基因表达水平注:A.T I ME R数据库分析A B C A3在不同组织中基因表达水平;B.R语言分析A B C A3在T C GA L UA D非配对样本中的表达水平;C.R语言分析A B C A3在T C GA L UA D配对样本中的表达水平。*P0.0 5,*P0.0 1,*P0.0 0 1。图2 A B C A3与L U A D患者预后的关系注:A.L UA D表达与L UA D患者总生存的关系;B.L UA D表达与L UA D患者无进展生存的关系。4 8 中国医学前沿杂志(电子版)2 0 2 4年第1 6卷第1期论著

42、表达与L UA D患者预后指标O S和P F S的相关性。结果显示,A B C A3高表达L UA D患者的O S和P F S明显高于低表达患者,差异具有统计学意义(P0.0 5)(图2)。2.3 A B C A3与L UA D患者临床病理特征的关系A B C A3表达与L U A D患者年龄、性别、M分期和N分期均无明显关系(图3 A 3 D)。T2期(P=0.0 0 4)和T3期(P=0.0 4 4)患者A B C A3的表达显著低于T1期患者,差异有统计学意义(P 0.0 5,图4 E)。图3 A B C A3与L U A D患者临床病理特征的关系注:A.年龄;B.性别;C.M分期;D.

43、N分期;E.T分期。图4 L U A D预后影响因素分析及预后模型构建注:A、B、C用于预测L UA D患者1年、2年和3年O S率的列线图模型。D.预测L UA D患者3年O S概率的列线图校准曲线。4 9 中国医学前沿杂志(电子版)2 0 2 4年第1 6卷第1期论著2.4 L U A D预后影响因素分析及预后模型构建 通过将临床数据和A B C A3表达等资料构建单因素和多因素C o x回归模型来分析L U A D预后的影响因素。单因素C o x回归分析显示,T分期、N分期、M分 期 和A B C A3表 达 与L U A D预 后 有 关(P 0.0 5,图4 A)。多因素C o x回

44、归分析显示,T分期、N分期和A B C A3表达是影响L U A D预后的独立影响因素(P0.0 5,图4 B)。基于多因素C o x回归分析的独立临床危险因素,构建了预测预后列线图模型(图4 C)。结果显示,A B C A3表达、T分期和N分期构建的列线图预测模型的C-i n d e x为0.8 6,提示模型与实际结果较为一致。校准曲线中的偏差修正线接近理想曲线(4 5 线),提示列线图模型的预测结果与观测结果较吻合(图4 D)。2.5 A B C A3差异表达基因分析和功能富集分析 A B C A3高 表 达 组 和 低 表 达 组 之 间 共 有7 9个D E G s,包括1 8个上调的

45、基因和6 1个下调的基因(图5 A)。G O分析结果表明(图5 B),D E G s主要参与胚胎器官形态发生、模式规范过程、胚胎骨骼系统等生物学过程;主要定位于片状体、顶端质膜、细胞的顶端部分等细胞成分;主要参与内肽酶抑制剂活性、肽酶抑制剂活性、钠离子跨膜转运体活性等分子功能。K E G G分析显示(图5 C),D E G s主要富集于神经活性配体-受体相互作用、补体和凝血级联、蛋白质的消化和吸收等相关信号通路。2.6 A B C A3高表达组和低表达组的G S E A 本研究分别对A B C A3高表达组和低表达组进行了G S E A。G S E A结果显示(图6 A),A B C A3高表

46、达组主要与花生四烯酸代谢、补体和凝血级联、肠道免疫网络免疫球蛋白A产生、亚油酸代谢、近端小管碳酸氢盐回收等有关。同时,A B-C A3低表达队列主要与细胞周期、碱基切除修复、D NA复制、范科尼贫血途径、同源重组、错配修复等有关(图6 A)。图5 A B C A3差异表达基因分析和功能富集分析注:A.A B C A3高表达组和低表达组之间前5 0个差异表达基因的热图;B.差异表达基因的GO分析条形图;C.差异表达基因的K E G G分析条形图。2.7 A B C A3表达与免疫浸润的关系 我们首先分析了L UA D患者中A B C A3表达与常见免疫检查点的相关性。结果发现,A B C A3的

47、 表 达 与N R P 1、T R F R S F 1 4、T N F S F 1 5、C D 4 0 L G、HHL A 2、C D 2 8呈 明 显 正 相 关,而 与I D O 1、C D 7 0、T N F S F 4、C D 2 7 6和VT C N 1呈明显负 相 关(表1,图7 A)。随 后,应 用C I B E R-S O R T算法评估L UA D中2 2种免疫细胞谱。比较5 0 中国医学前沿杂志(电子版)2 0 2 4年第1 6卷第1期论著图6 A B C A3高表达组和低表达组的基因集富集分析A B C A3高和低表达组之间2 2种免疫细胞的比例(图7 B),结果发现,记

48、忆B细胞、静息C D 4+T细胞、单核细胞、树突状细胞、静息肥大细胞在A B C A3高表达组中的浸润丰度明显高于低表达组(P0.0 5),而浆细胞、活化C D 4+T细胞、T细胞、M 0型巨噬细胞、M 1型巨噬细胞、活化肥大细胞和嗜酸性粒细胞在高表达组中的浸润丰度明显低于低表达组(P0.0 5)。此外,2 2种免疫浸润细胞中有7种与A B C A3表达呈正相关(P0.0 5),包括静息肥大细胞、静息C D 4+T细胞、记忆B细胞、单核细胞、静息树突细胞、活化树突细胞、M 2型巨噬细胞;有7种与A B C A3的表达呈负相关(P0.0 5),包括活化C D 4+T细胞、M 1型巨噬细胞、嗜酸性

49、粒细胞、活化肥大细胞、M 0型 巨 噬 细 胞、浆 细 胞 和T细 胞(表2,图8)。3 讨论N S C L C的早期诊断困难,治疗效果及预后均不理想,且详细的分子生物学机制尚未完全阐明。探究 新 的 分 子 标 志 物 和 分 子 治 疗 靶 点 对 研 究N S C L C预后评估和靶向治疗具有重要意义。A B-C A3是与肺表面活性剂稳态相关的磷脂转运蛋白,肺组织中的A B C A3能够将胆固醇和磷脂转运至肺泡腔形成肺表面活性物质1 1。肺表面活性物质在表1 T C G A L U A D患者中A B C A3表达与常见免疫检查点的相关性分析免疫检查点rP值神经纤毛蛋白0.1 80.0

50、0 1肿瘤坏死因子配体受体0.1 60.0 0 1吲哚胺-2,3-双加氧酶1-0.1 70.0 0 1分化群7 0-0.1 90.0 0 1肿瘤坏死因子配体1 50.3 00.0 0 1分化群4 0配体0.3 10.0 0 1H长末端重复关联蛋白20.1 70.0 0 1分化群2 80.1 70.0 0 1肿瘤坏死因子配体4-0.3 30.0 0 1分化群2 7 6-0.2 60.0 0 1含V-s e t域T细胞激活抑制因子1-0.1 80.0 0 1表2 T C G A L U A D患者中A B C A3表达与2 2种免疫浸润细胞的相关性免疫浸润细胞rP值初始B细胞-0.0 50.3 3

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