基因工程制胰岛素(生工版)讲课教案.ppt

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,1,*,基因工程制胰岛素(生工版),基因工程制胰岛素三种方法,一、,A,链和,B,链分别表达法,化学合成,A,链和,B,链的编码序列,2025/5/14 周三,2,基因工程制胰岛素三种方法,一、,A,链和,B,链分别表达法,表达产物的后期处理路线：,2025/5/14 周三,3,基因工程制胰岛素三种方法,二、人胰岛素原表达法,基因工程菌的构建战略：,2025/5/14 周三,4,基因工程制胰岛素三种方法,二、人胰岛素原表达法,表达产物的后期处理路线：,2025/5/14 周三,5,基因工程制胰岛素三种方法,三、,A,链和,B,链同时表达法,2025/5/14 周三,6,方法一：,由于,A,链和,B,链上共存在六个半胱氨酸残基，体外二硫键的正确配对率较低，通常只有10%-20%，因此成本高。,方法二：,胰岛素原能形成良好的空间构象，三对二硫键的正确配对率提高，折叠率高。工艺路线依然繁琐。,方法三：,需体外折叠。,基因工程制胰岛素三种方法,三种方法比较：,2025/5/14 周三,7,基因工程获取胰岛素的步骤,一、获取外源目的基因片段,二、选择与获取表达载体,三、重组目的,DNA,片段与表达载体,四、选择与获取表达细胞,五、重组体导入表达细胞,六、对重组体细胞进行筛选纯化鉴定,七、工程菌产物鉴定和保存,八、发酵培养,2025/5/14 周三,8,一、获取外源目的基因片段,1,选择实验材料,2,提取,RNA,，分离,RNA,3,逆转录,mRNA,得,cDNA,第一链,4,得双链,DNA,5,DNA,序列纠错,6.,目的基因通过细胞克隆扩增,7.,目的基因回收及,DNA,测序，最终目的基因获取,2025/5/14 周三,9,一、获取外源目的基因片段,1,选择实验材料,胰岛素是一种蛋白质类激素，体内胰岛素是胰岛,B,细胞（即胰岛,细胞）受内源性或外源性物质如葡萄糖、乳糖、核糖、精氨酸、胰高血糖素等的刺激而分泌的。胰岛素基因只有在胰岛,B,细胞中才能转录出信使,RNA,，所以用基因工程方法生产胰岛素时，选用胰岛,B,细胞为获取目的基因的实验材料。,2025/5/14 周三,10,一、获取外源目的基因片段,2,提取,RNA,，分离,RNA,2,1,总,RNA,的提取,2,2,mRNA,的纯化,2,3,mRNA,的保存,2025/5/14 周三,11,一、获取外源目的基因片段,2,1,总,RNA,的提取,总,RNA,的抽提方法有多种，,TRIzol,试剂是使用组广泛的,RNA,抽提试剂，主要由苯酚和异硫氰酸胍组成，可以迅速破坏细胞结构，使存在于细胞质及核内的,RNA,释放出来，并使核糖体蛋白与,RNA,分子分离。苯酚虽可有效地变性蛋白质，但不能完全抑制,RNA,酶活性，因此,TRIzol,中还加入了,8,羟基喹啉、异硫氰酸胍、,-,巯基乙醇等来抑制内源和外源,RNase,（,RNA,酶）。,TRIzol,是从细胞和组织中提取总,RNA,的即用型试剂，在样品裂解或匀浆过程中，,TRIzol,能保持,RNA,完整性。提取,RNA,时，首先用液氮研磨材料，匀浆，加入,TRIzol,试剂，进一步破碎细胞并溶解细胞成分。然后加入氯仿抽提，离心，分离水相和有机相，收集含有,RNA,的水相，通过异丙醇沉淀，可获得比较纯的总,RNA,，用于下一步,mRNA,的纯化。,2025/5/14 周三,12,一、获取外源目的基因片段,2,1,1 TRIzol,法提取流程,（,1,）样品处理 培养细胞：收获细胞,1-5*107,，移入,1.5ml,离心管中，加入,1ml TRIzol,，混匀，室温静置,5min,。组织：取,50-100mg,组织（新鲜或,-70,及液氮中保存的组织均可）置,1.5ml,离心管中，加入,1ml TRIzol,充分匀浆，室温静置,5min,。,（,2,）加入,0.2ml,氯仿，振荡,15s,，静置,2min,。,（,3,）,4,离心，,12000g*15min,，取上清液。,（,4,）加入,0.5ml,异丙醇，将管中液体轻轻混匀，室温静置,10min,。,（,5,）,4,离心，,12000g*10min,，弃上清液。,（,6,）加入,1ml 75%,乙醇，轻轻洗涤沉淀。,4,，,7500g*5min,，弃上清液。,（,7,）晾干，加入适量的,DEPCH2O,溶解（,65,促溶,10-15min,）。,2025/5/14 周三,13,一、获取外源目的基因片段,2,1,1 TRIzol,法提取流程图,2025/5/14 周三,14,一、获取外源目的基因片段,2,2,mRNA,的纯化,该方法利用,mRNA3,端含有,PolyA,（多聚腺苷酸）的特点，当,RNA,流经寡聚,dT,纤维素柱时，在高盐缓冲液的作用下，,mRNA,被特异性的结合在柱上，再用低盐溶液或蒸馏水洗脱,mRNA,。经过两次寡聚纤维柱后可得到较高纯度的,mRNA,。,2025/5/14 周三,15,一、获取外源目的基因片段,2,2,1,寡聚（,dT,）纤维素柱纯化,mRNA,（,1,）试剂准备：,3M,醋酸钠（,pH5.2,）；,0.1M NaOH,；,上样缓冲液：,20mM Tris-HCl,（,pH7.6,）,0.5M NaCl,1M EDTA(pH8.0),0.1%SLS(,十二烷基氨酸钠,),。配制时可先配制,Tris-HCl,（,pH7.6,）、,NaCl,、,EDTA,（,pH8.0,）的母液，经高压消毒后按各成分确切含量，经混合后再高压消毒，冷却至,65,，加入经,65,温育（,30min,）的,10%SLS,至终浓度为,0.1%,；,洗脱缓冲液：,10mM Tris-HCl,（,pH7.6,），,1mM EDTA,（,pH8.0,），,0.05%SDS,；,无水乙醇、,70%,乙醇；,DEPC,（,0.1%,焦炭酸二乙酯）,2025/5/14 周三,16,一、获取外源目的基因片段,2,2,1,寡聚（,dT,）纤维素柱纯化,mRNA,（,2,）操作步骤：,将,0.5-1.0g,寡聚（,dT,）纤维悬浮于,0.1M,的,NaOH,溶液中。,用,DEPC,处理的,1ml,注射器或适当的细管，将寡聚（,dT,）纤维素装柱,0.5-1ml,，用,3,倍柱床体积的,DEPCH2O,洗柱。,使用,1*,上样缓冲液洗柱，直至洗出液,pH,值小于,8.0,。,将,RNA,溶解于,DEPCH2O,中，在,65,中温育,10min,左右，冷却至室温后加入等体,2*,上样缓冲液，混匀后上柱，立即收集流出液。当,RNA,上样液全部进入柱床后，再用,1*,上样缓冲液洗柱，继续收集流出液。,将所有流出液于,65,加热,5min,，冷却至室温后再次上柱，收集流出液。,用,5-10,倍柱床体积的,1*,上样缓冲液洗柱，每管,1ml,分步收集，,OD260,测定,RNA,含量。前部分收集管中流出液的,OD260,值很高，其内含物为无,polyA,尾的,RNA,。后部分收集管中流出液的,OD260,值很低或无吸收。,用,2-3,倍柱容积的洗脱缓冲液洗脱,poly,（,A+,）,RNA,，分步收集，每部分为,1/3-1/2,柱体积。,OD260,测定,poly,（,A+,）,RNA,分布，合并含,poly,（,A+,）,RNA,的收集管，加入,1/10,体积,3M NaAc,（,pH5.2,）、,2.5,倍体积的预冷无水乙醇，混匀，,-20,放置,30min,。,4,离心，,10000g*15min,，小心吸弃上清。用,70%,乙醇洗涤沉淀。,4,离心，,10000g*5min,，弃上清，室温晾干。,用适量的,DEPCH2O,溶解,RNA,。,2025/5/14 周三,17,一、获取外源目的基因片段,2,2,1,寡聚（,dT,）纤维素柱纯化,mRNA,（,3,）注意事项,整个实验过程必须防止,Rnase,的污染。,步骤中将,RNA,溶液置,65,中温育然后冷却至室温再上样的目的有两个，一个是破坏,RNA,的二级结构，尤其是,mRNA poly,（,A+,）尾处的二级结构，使,poly,（,A+,）尾充分暴露，从而提高,poly,（,A+,）,RNA,的回收率；另一个目的是能解离,mRNA,与,rRNA,的结合，否则会导致,rRNA,的污染。所以此步骤不能省略。,十二烷基肌氨酸钠盐在,18,以下溶解度下降，会阻碍柱内液体流动，若室温低于,18,最好用,LiCl,替代,NaCl,。,寡聚（,dT,）纤维素柱可在,4,贮存，反复使用。每次使用前应该依次用,NaOH,、灭菌,ddH2O,、上样缓冲液洗柱。,一般而言，,107,哺乳动物培养细胞能提取,1-5g poly,（,A+,）,RNA,，约相当于上柱总,RNA,量的,1%-2%,。,2025/5/14 周三,18,一、获取外源目的基因片段,2,3,mRNA,的保存,用少量水溶解,mRNA,，即可用于,cDNA,合成或保存在,70%,乙醇中并于,-70,下贮存。,2025/5/14 周三,19,一、获取外源目的基因片段,胰岛素基因,mRNA,序列,2025/5/14 周三,20,一、获取外源目的基因片段,胰岛素基因,mRNA,序列,NCBI,中搜索得,2025/5/14 周三,21,一、获取外源目的基因片段,3,逆转录,mRNA,得,cDNA,第一链,mRNA,在反转录酶的作用下由引物引导合成,cDNA,。,加入高浓度的,Oligo,（,dT,）引物，,Oligo,（,dT,）引物与,mRNA,的,3,末端的,poly,（,A,）配对，引导反转录酶以,mRNA,为模板合成第一链,cDNA,。,这种,cDNA,合成的方法在,cDNA,文库构建中应用极为普遍，其缺点主要是由于,cDNA,末端存在较长的,poly,（,A,）而影响,cDNA,测序。（原因：,oligo,（,dT,）结合在,mRNA,的,3,端，因此合成全长的,cDNA,需要反转录酶从,mRNA,分子的一端移动到另一端，有时这种全合成难以达到）,2025/5/14 周三,22,一、获取外源目的基因片段,4,得双链,DNA,4.1,合成,cDNA,第二链得双链,DNA,4.2,将,DNA,双链通过,PCR,技术进行扩增,2025/5/14 周三,23,一、获取外源目的基因片段,4.1,合成,cDNA,第二链得双链,DNA,mRNA,cDNA,杂合双链中的,mRNA,链在,RNA,酶,H,作用下先形成很多切口，,mRNA,链就被切割成很多的小片段，这些小片段为大肠杆菌,DNA,聚合酶,提供了合成第二链的引物。大肠杆菌,DNA,聚合酶,以第一链,cDNA,为模板合成一段段互补的,cDNA,片段。这些,cDNA,片段进而在,DNA,连接酶的作用下连接成一条链，即,cDNA,的第二链。遗留在,5-,末端的一段很小的,mRNA,也被大肠杆菌,DNA,聚合酶,的,53,核酸外切酶和,RNA,酶,H,降解，暴露出与第一链,cDNA,对应的,3-,端部分序列。同时，大肠杆菌,DNA,聚合酶,的,3-5,核酸外切酶的活性可将暴露出的第一链,cDNA,的,3-,端部分消化掉，形成平端或差不多的平端,优点,:,a),合成,cDNA,的效率高,b),直接利用第一链的反应产物,不需纯化,c),避免使用,S1,核酸酶来切割双链,cDNA,2025/5/14 周三,24,一、获取外源目的基因片段,4.1,合成,cDNA,第二链得双链,DNA,2025/5/14 周三,25,一、获取外源目的基因片段,4.2,将,DNA,双链通过,PCR,技术进行扩增,4.2.1,模板,DNA,的变性,向离心管加入模板、引物、耐热的,DNA,聚合酶、,PCR,缓冲液（,500mm01,L KCl,；,100mmol,L Tris,一,HCl(pH8.4),，,150mmol,L MgCl2,，,lmg,m1,明胶）、,5mmo1,L dNTP,贮备液，然后加热至,93,左右一定时间后，使模板,DNA,双链或经,PCR,扩增形成的双链,DNA,解离，使之成为单链，以便它与引物结合，为下轮反应作准备,2025/5/14 周三,26,一、获取外源目的基因片段,4.2,将,DNA,双链通过,PCR,技术进行扩增,4.2.2,模板,DNA,与引物的退火,(,复性,),模板,DNA,经加热变性成单链后，温度降至,55,左右，引物与模板,DNA,单链的互补序列配对结合,；,2025/5/14 周三,27,一、获取外源目的基因片段,4.2,将,DNA,双链通过,PCR,技术进行扩增,4.2.3,引物的延伸,DNA,模板,-,引物结合 物在,TaqDNA,聚合酶的作用下，以,dNTP,为反应原料，靶序列为模板，按碱基配对与半保留复制原理，合成一条新的与模板,DNA,链互补的半保留复制链，重复循环变性,-,退火,-,延伸三过程，就可获得更多的“半保留复制链”，而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需,2,4,分钟，,2,3,小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。,2025/5/14 周三,28,一、获取外源目的基因片段,5.,目的基因回收纯化及,DNA,测序纠错,5.1,将目的基因进行回收纯化,5.2,对目的基因进行测序,5.3 DNA,序列纠错,2025/5/14 周三,29,一、获取外源目的基因片段,5.1,将目的基因进行回收纯化,1),在,PCR,试管中加入凝胶缓冲液进行琼脂糖凝胶电泳电泳到适当位置后在目的,DNA,条带的前端挖一长方形槽，向槽中加入融化的低熔点胶，待凝固后进行电泳。,2,）当,DNA,进入低熔点胶中心时停止电泳。紫外灯下切下目的条带的低熔点胶。,3),将切下的胶放到离心管中，加入,200,的缓冲液，,65,温浴,3,分钟以融化低熔点胶。,4),然后分别用酚,/,氯仿，氯仿抽提一次。取上清，加入,2,倍体积的无水乙醇，,-20,沉淀,DNA 2h,以上，,12 000rpm,离心,15min,，弃上清，用,70%,乙醇洗涤，吹干后溶于,10l,无菌水中。,注意事项：在紫外灯下切出含有目的,DNA,片段的琼脂糖凝胶时应注意要快速操作，以免损伤。,2025/5/14 周三,30,一、获取外源目的基因片段,5.2,对目的基因进行测序,利用,DNA,聚合酶，以待测单链,DNA,为模板，以,dNTP,为底物，设立四种相互独立的测序反应体系，在每个反应体系中加入不同的,ddNTP,作为链延伸终止剂。在测序引物引导下，按照碱基配对原则，每个反应体系中合成一系列长短不一的引物延伸链，通过高分辨率的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，放射自显影检测后，从凝胶底部到顶部按,5,至,3,方向读出新合成链序列，由此推知待测模板链的序列。,2025/5/14 周三,31,一、获取外源目的基因片段,5.2,对目的基因进行测序,2025/5/14 周三,32,一、获取外源目的基因片段,5.3 DNA,序列纠错,1,、将待突变基因克隆到突变载体上；,2,、制备含突变基因的单链模板；,3,、人工合成一段改变了碱基顺序的寡核苷酸片段，以此作为引物，在体外合成互补链，获得含有错配碱基的完整双链,M13DNA,4,、转化和初步筛选异源双链,DNA,分子转化大肠杆菌后，产生野生型、突变型的同源双链,DNA,分子。,5,、用诱变的寡核苷酸引物作为探针，通过杂交即可鉴定出突变体,2025/5/14 周三,33,一、获取外源目的基因片段,6,、目的基因通过细胞克隆扩增,6.1,目的基因与运载体结合,6.2,将目的基因导入受体细胞并使之扩增,6.3,筛选获得了重组,DNA,分子的受体细胞克隆,2025/5/14 周三,34,一、获取外源目的基因片段,6.1,目的基因与运载体结合,用与提取目的基因相同的限制酶切割质粒使之出现一个切口；将目的基因插入切口处，让目的基因的黏性末端与切口上的黏性末端互补配对；在连接酶的作用下连接形成重组,DNA,分子。,2025/5/14 周三,35,一、获取外源目的基因片段,6.2,将目的基因导入受体细胞并使之扩增,要让目的基因表达，必须将它导入受体细胞并进行扩增。为获得目的基因的表达产物时，通常以大肠杆菌等无害易得的细菌为受体。,注意：,为改进某种生物时，将欲改进的生物细胞为受体。为使重组的,DNA,分子更容易进入受体细胞，通常还要用一些物质对受体细胞进行处理，使受体细胞具有更大的通透性，例如改变,PH,值，加入氯化钙等。,2025/5/14 周三,36,一、获取外源目的基因片段,6.3,筛选获得重组,DNA,分子的受体细胞克隆,前几步的处理十分繁锁，为保证目的基因得到有效利用，通常用大量的受体细胞来接受不多的目的基因。这样，处理的受体细胞中真正摄入了目的基因的很少，必须将它从中检测出来。细菌的检测，将每个受体细胞单独培养形成菌落，检测菌落中是否有目的基因的表达产物。淘汰无表达产物的菌落，保留有表达产物的进一步培养、研究。多细胞生物的检测，将每个受体细胞单独培养并诱导发育成完整个体，检测这些个体是否摄入目的基因，摄入的基因是否表达（是否表现出相应的性状）。,2025/5/14 周三,37,一、获取外源目的基因片段,7,、目的基因回收及,DNA,测序，最终目的基因获取,7.1,内容物释放,将培养物加入试管，加入,EDTA,及去污剂（），用碱处理细菌，使细菌的细胞壁破裂，释放出细胞内容物（在强碱环境下，宿主菌的线性双链,DNA,片段中的氢键断裂，双链解离变性，而质粒,DNA,共价闭合环状的双链并不完全分离）。,2025/5/14 周三,38,一、获取外源目的基因片段,7,、目的基因回收及,DNA,测序，最终目的基因获取,7.2,加酸、离心,然后加入高浓度酸性盐，,PH,恢复至中性（变性的染色体,DNA,与变性的蛋白质以及细胞碎片凝聚成网络状大分子不溶性沉淀物，而质粒,DNA,又恢复天然构型，能溶解在上清液中），通过离心把染色体,DNA,，蛋白质,-SDS,复合物等一起除去。,2025/5/14 周三,39,一、获取外源目的基因片段,7,、目的基因回收及,DNA,测序，最终目的基因获取,7.3,切割、电泳,利用限制性内切酶特异的识别,DNA,特异的核苷酸序列，并切割,DNA,，产生一定长度的,DNA,片段，通过电泳对酶切前后产物分析可以鉴别目的基因,2025/5/14 周三,40,一、获取外源目的基因片段,7,、目的基因回收及,DNA,测序，最终目的基因获取,7.4,回收纯化、测序,对目的基因进行回收纯化，再测序,2025/5/14 周三,41,二,.表达载体的构建,pET28a,（含有T7噬菌体启动子、乳糖操纵子、核糖体结合位点、His6标签序列、凝血酶切割位点、多克隆位点、T7噬菌体终止子、乳糖阻遏序列、pBR322复制子ori、fl噬菌体复制子、卡那霉素筛选标记序列等。）,2025/5/14 周三,42,二,.表达载体的构建,2025/5/14 周三,43,原因,：,1,.,T7噬菌体启动子、核糖体结合位点等引导目的基因高效转录和翻译。,2,.,乳糖操纵子和乳糖阻遏序列存在的意义主要在于，当目的蛋白对大肠杆菌有毒性的时候，可以通过添加阻遏物，控制目的蛋白以较低水平表达。,3,.,His6标签序列、凝血酶切割位点存在的意义主要在于方便利用针对His6的整合层析分离纯化蛋白、然后利用凝血酶去除切割标签蛋白。,4.,卡那霉素抗性基因编码的氨基糖苷磷酸转移酶，对卡那霉素进行修饰，阻断其与核糖体结合作用。,二,.表达载体的构建,2025/5/14 周三,44,三,.,重组目的DNA片段和表达载体,用,T7噬菌体DNA连接酶将质粒载体pET28a经EcoR,和,BamH,酶切的片段与目的基因经EcoR,和,BamH,酶切的片段连接起来，构成重组DNA分子。,使用双酶切：,DNA,分子重组时为了保证目的片段以正确的方向连接进入载体，往往尽可能选择两种具有不同黏性末端的酶分别酶切目的,DNA,分子和载体，这种双酶切虽然使载体和目的,DNA,都产生两种不同的黏性末端，但是连接酶会选择把相同的黏性末端连接起来，从而保证目的基因只以一个方向连接入载体。,2025/5/14 周三,45,四、选择与获取表达细胞,1、选择大肠杆菌,2、培养大肠杆菌,2025/5/14 周三,46,四、选择与获取表达细胞,1、选择大肠杆菌原因：,1）繁殖迅速、培养简单、操作方便、遗传稳定,2）基因克隆及表达系统成熟完善,3）全基因组测序完成，共有4405个开放性阅读框架,4）被美国FDA批准为安全的基因工程受体生物,2025/5/14 周三,47,四、选择与获取表达细胞,开放阅读框（ORF）是生物个体的基因组中，可能是蛋白质编码序列的部分。基因中的ORF包含并位于开始编码与终止编码之间。由于一段DNA或RNA序列有多种不同读取方式，因此可能同时存在许多不同的开放阅读框架。开放阅读框包含一段可以编码蛋白的碱基序列，不能被终止子打断。,2025/5/14 周三,48,2、大肠杆菌的培养,（1）,LB,（,Luria-Bertain),液体培养基配制,精解蛋白胨,(bacto-tryptone)1.0%,酵母浸出粉,(bacto-extract)0.5%,氯化钠,1.0%,搅拌使之完全溶解，用,5molNaOH(about0.2ml/1000ml,培养基）调,pH,至,7.0,，如用进口试剂可不必调，高压灭菌,20min(120 0.1Mpa),四、选择与获取表达细胞,2025/5/14 周三,49,四、选择与获取表达细胞,（,2,）牛肉膏蛋白胨培养基,组成成分：牛肉膏,3g,蛋白胨,10g,Nacl 5g,琼脂,15,20g,水,1000mL,PH7.4,7.6,。,具体配置步骤：,1.,称药品 按实际用量计算后,按配方称取各种药品放入大烧杯中,.,牛肉膏可放在小烧杯或表面皿中称量,用热水溶解后倒入大烧杯,;,也可放在称量纸上称量,随后放入热水中,牛肉膏使与称量纸分离,立即取出纸片,.,蛋白胨极易吸潮,故称量时要迅速。,2025/5/14 周三,50,四、选择与获取表达细胞,具体配置步骤：,2.,加热溶解 在烧杯中加入少于所需要的水量,然后放在石棉网上,小火加热,并用玻棒搅拌,待药品完全溶解后再补充水分至所需量,.,若配制固体培养基,则将称好的琼脂放入己溶解的药品中,再加热融化,此过程中,需不断搅拌,以防琼脂糊底或溢出,最后补足所失的水分。,3.,调,pH,检测培养基的,pH,若,pH,偏酸,可滴加,lmol/L NaOH,边加边搅拌,并随时用,pH,试纸检测,直至达到所需,pH,范围,.,若偏碱,则用,lmol/L HCl,进行调节,.pH,的调节通常放在加琼脂之前,.,应注意,pH,值不要调过头,以免回调而影响培养基内各离子的浓度。,2025/5/14 周三,51,四、选择与获取表达细胞,具体配置步骤：,4.,过滤 液体培养基可用滤纸过滤,固体培养基可用,4,层纱布趁热过滤,以利培养的观察,.,但是供一般使用的培养基,这步可省略。,5.,分装 按实验要求,可将配制的培养基分装入试管或三角瓶内,.,分装时可用漏斗以免使培养基沾在管口或瓶口上而造成污染,.,分装量,:,固体培养基约为试管高度的,l/5,灭菌后制成斜面,.,分装入三角瓶内以不超过其容积的一半为宜,.,半固体培养基以试管高度的,1/3,为宜,灭菌后垂直待凝。,2025/5/14 周三,52,四、选择与获取表达细胞,具体配置步骤：,6.,加棉塞 试管口和三角瓶口塞上用普通棉花,(,非脱脂棉,),制作的棉塞,.,棉塞的形状,大小和松紧度要合适,四周紧贴管壁,不留缝隙,才能起到防止杂菌侵入和有利通气的作用,.,要使棉塞总长约,3/5,塞入试管口或瓶口内,以防棉塞脱落,.,有些微生物需要更好的通气,则可用,8,层纱布制成通气塞,.,有时也可用试管帽或塑料塞代替棉塞。,7.,包扎 加塞后,将三角瓶的棉塞外包一层牛皮纸或双层报纸,以防灭菌时冷凝水沾湿棉塞,.,若培养基分装于试管中,则应以,5,支或,7,支在一起,再于棉塞外包一层牛皮纸,用绳扎好,.,然后用记号笔注明,培养基名称,组别,日期。,2025/5/14 周三,53,四、选择与获取表达细胞,具体配置步骤：,8.,灭菌 将上述培养基于,121.3,湿热灭菌,20min.,如因特殊情况不能及时灭菌,则应故人冰箱内暂存。,9.,无菌检查 将灭菌的培养基放入,37,温箱中培养,24,48h,无菌生长即可使用,或贮存于冰箱或清洁的橱内,备用。,2025/5/14 周三,54,四、选择与获取表达细胞,大肠杆菌培养：,采用划痕接种法。用接种环从菌种中沾取少量菌液，划线。,37,摄氏度，恒温培养,48,到,72,小时，因为接种时和具体培养条件的不同，其生长一般都在,2,天外才能长出明显的菌落。,菌落特征：乳白色，圆形，菌落边缘整齐，表面光滑，表面和背面颜色一致。,2025/5/14 周三,55,五、重组,DNA,导入表达细胞,氯化钙转化法,对数生长期的大肠杆菌经冰浴的氯化钙低渗溶液处理，其细胞膜通透性增加，成为感受态细胞（,感受态是指受体细胞处于容易吸收外源,DNA,的一种生理状态,），加入重组质粒，重组质粒与钙离子形成复合物并粘附于细菌细胞膜表面，经42热休克处理，细胞膜通透性增加，重组质粒DNA进入感受态细胞（,导入重组体,）。细菌在不含抗生素的培养基中培养一定时间，使含有重组质粒的细胞复原并表达抗生素抗性基因，涂布于含有抗生素的培养板上，生长得到转化子。,2025/5/14 周三,56,氯化钙法转化的原理机制：,在,0,的,CaCl2,低渗溶液中，细菌细胞发生膨胀，,Ca,2+,使细胞膜磷脂层形成液晶结构，促使细胞外膜与内膜间隙中部分核酸酶解离，诱导形成感受态。,此外，,Ca,2+,能与加入的,DNA,分子结合，形成抗脱氧核糖核酸酶的羟基磷酸钙复合物，黏附在胞膜的外表面；,42,热激处理，细胞膜的液晶结构发生扰动，出现间隙。,五、重组,DNA,导入表达细胞,2025/5/14 周三,57,氯化钙转化法要点：,1.,氯化钙（二价钙离子）的作用：提高细胞壁（膜）的通透性；,2.,热激后迅速转移到冰上：促使质粒,DNA,转移进入胞内；,3.,这种转化方法适用于双链环状,DNA,（质粒），线型,DNA,不能采用此法。（在自然界自然发生的转化过程中，进入细菌细胞中的为单链,DNA,。）,五、重组,DNA,导入表达细胞,2025/5/14 周三,58,标准质粒,DNA,、重组质粒,DNA,、大肠杆菌,JM109,、离心机、,0.1mol/L CaCl,2,、,LB,培养基、微量移液器、微量离心管、抗生素、,20mmol/L MgSO4,、微孔滤膜及滤器、培养皿、三角瓶、恒温水浴箱、恒温摇床、超净工作台、玻璃涂布棒、,95%,乙醇,实验材料：,五、重组,DNA,导入表达细胞,2025/5/14 周三,59,注意事项：,质粒的质量和浓度。用于转化的质粒,DNA,应主要是超螺旋,DNA,。转化效率与外源,DNA,的浓度在一定范围内成正比，但当加入的外源,DNA,的量过多或体积过大时，转化效率就会降低。,试剂的质量。所用试剂均需要最高纯度的，并用超纯水新鲜配制，灭菌备用。,防止杂菌和杂,DNA,的污染。,五、重组,DNA,导入表达细胞,2025/5/14 周三,60,二价钙离子对转化效率的影响,热激温度对转化效率的影响,五、重组,DNA,导入表达细胞,2025/5/14 周三,61,感受态细胞的制备,：,1,、从新活化的,E.coli,DH5,平板上挑取一单菌落，接种于,3,5ml LB,液体培养中，,37,振荡培养至对数生长期,(12h,左右,),；,2,、将该菌悬液以,1:100,1:50,转接于,100ml LB,液体培养基中，,37,振荡扩大培养，当培养液开始出现混浊后，每隔,20,30min,测一次,OD,600,，至,OD,600,为,0.3,0.5,时停止培养，并转装到,1.5 mL,离心管中；,3,、培养物于冰上放置,20min,；,4,、,0,4,，,4000g,离心,10min,，弃去上清液，加入,1 mL,冰冷的,0.1mo1,L CaCl,2,溶液，小心悬浮细胞,冰浴,20,分钟；,五、重组,DNA,导入表达细胞,2025/5/14 周三,62,5,、,0,4,，,4000g,离心,10min,，倒净上清培养液，再用,1.0 mL,冰冷的,0.1mo1,L CaCl2,溶液轻轻悬浮细胞，冰浴,20min,；,6,、,0,4,，,4000g,离心,10min,，弃去上清液，加入,100 L,冰冷的,0.1mo1,L CaCl2,溶液，小心悬浮细胞，冰上放置片刻后，即制成了感受态细胞悬液；,制备好的感受态细胞悬液可直接用于转化实验，如果在,4,放置,12,24h,，其转化效率可以增高,4,6,倍；也可加入占总体积,15,左右高压灭菌过的甘油，混匀后分装于,1.5ml,离心管中，置于,-70,条件下，可保存半年至一年。,五、重组,DNA,导入表达细胞,2025/5/14 周三,63,六、,重组体细胞,的,筛选纯化鉴定,在重组,DNA导入受体细胞的实验中，由于重组率,很低，因此需要从这些细胞中筛选出期望重组子，将转化后的细胞涂布于特定的固体培养板，生长出的单菌落或噬菌斑进一步筛选和鉴定。,2025/5/14 周三,64,1、,载体遗传标记法,（抗生素抗性筛选法、营养缺陷型筛选法、噬菌斑筛选法、互补筛选法）,2、,核酸分子杂交法,菌落原位杂交：制备与目的基因某一区域同源的探针序列，根据核酸杂交原理，探针序列特异性的杂交目的基因，并通过放射性同位素或荧光基团进行定位检测。,六、,重组体细胞,的,筛选纯化鉴定,2025/5/14 周三,65,3、,目的基因表达产物测定法,如果重组DNA的目的基因能在宿主细胞中编码蛋白质，且宿主细胞本身不含该蛋白质，那么可以通过检测蛋白质的生物功能或结构来筛选和鉴定重组子。,六、,重组体细胞,的,筛选纯化鉴定,2025/5/14 周三,66,用荧光原位标记筛选重组体,1、制备核酸探针，通过数据库查询所需的寡核苷酸探针的资料，用合成仪合成，然后用荧光素进行标记。,、将样品进行打碎、离心、清洗等步骤，使微生物细胞与杂质进行分离，同时增大细胞壁的通透性，保证探针算例进入与杂交。,、配置杂交液，其中杂交液中的甲酰胺的浓度直接影响杂交的特异性，将杂交液与样品之一杂交炉（避光、密封），杂交完成后用洗脱液（或）将多余的探针除去。,、加少量的苯二胺甘油溶液覆盖样品，防止荧光淬灭，再封片，用荧光显微镜观察、照相进行分析。,六、,重组体细胞,的,筛选纯化鉴定,2025/5/14 周三,67,荧光原位杂交技术,荧光原位杂交是一种非放射性原位杂交方法，将荧光标记的探针与待测序列进行杂交，根据杂交信号的有无及类型达到诊断的目的。,原理：基于碱基互补配对的原则，用荧光素标记的已知外源DNA或RNA作探针，与载玻片上的组织切片等杂交，与待测核酸的靶序列专一性结合，通过检测杂交位点荧光来显示特定核苷酸序列的存在、数目和定位。,六、,重组体细胞,的,筛选纯化鉴定,2025/5/14 周三,68,产物,1,.菌种,RRhPIZpQE,-,40 Ecoli M15菌株,七、工程菌产物鉴定和保存,2025/5/14 周三,69,2,.材料与试剂,DEAE,-,Sepharose FF(琼脂糖快流速阴离子交换剂)为杭州争光树脂有限公司产品,SephadexG,-,25为Sigma公司产品，Superdex75为GE公司产品,溶菌酶、脱氧核糖核酸酶、胰蛋白酶和羧肽酶,B均为Sigma公司产品,谷胱甘肽,氧化型(GSSG)和还原型(GSH)为上海博奥生物科技有限公司产品，二硫苏糖醇(DTY)为Organics Inc产品,13,-巯基乙醇和异丙基-,13,-,D,-巯基吡喃半乳糖苷,(IPTG)为BB1分装,胰蛋白胨、酵母粉（英国,Oxiod,公司）,氨苄青霉素（美国,Sigma,公司）,其余试剂均为国产分析纯产品,。,七、工程菌产物鉴定和保存,2025/5/14 周三,70,培养基：,（）,LB培养基(g/L):胰蛋白胨10.0,酵母提取物5.0,NaCl 10.0,pH 7.0;,（）发酵培养基,(g/L):葡萄糖4,甘油15,酵母粉30,蛋白胨30,Na,2,HPO,4,12,KH,2,PO,4,6,NH,4,C l1,NaCl 2,MgSO,4,0.48,pH 7.0;,（）甘油补料培养基,(g/L):甘油300,酵母汁150,MgSO,4,10,pH 7.0,。所有培养基使用前均加入氨苄青霉素至终浓度,50mg/L。水平恒温摇床,（德国,Therma公司）,；,BiostatB发酵系统（德国Braun公司）,；蛋白质电泳凝胶自动成像系统（英国,Syngene公司）,。,七、工程菌产物鉴定和保存,2025/5/14 周三,71,3,.,细菌培养和RRhPI的表达,采用二级发酵的方式，用正交法优化培养条件，并将优化条件用于发酵罐进行发酵，收获湿菌体。RRhPIZpQE,-,40 Ecoli M15的发酵罐培养：将lO lId经过活化的RRhPIpQE,-,40 Ecoli M15转移至100 ml培养基中进行培养，培养一段时间后，将其转移至含有,1.5,L培养基的发酵罐中，培养一段时间(转速为,300,r,/,min，通气量为1,:1.5-1:1.8,)，过程中加人一定量新鲜的培养基并用NaOH调节pH，之后加入IPTG并升温诱导RRhPI的表达，转速随即调为,400-500,rmin，增大通气量至1,:1.8-1,：,2.0,，继续培养一段时间后，收集菌体。,七、工程菌产物鉴定和保存,2025/5/14 周三,72,4,.,包涵体的收集和洗涤,将收集的湿菌体冻存于,-,2O，然后悬浮于缓冲液A(,50,mmol,/,L rifs,-,HC1，,0.5,mmol,/,L EDTA，,50,mmol,/,L NaC1，5 甘油，,0.1-0.5,mmol,/,LDTY，pH,7.9,)(,5-6,ml,/,g湿菌)中，加入溶菌酶(,5,mg,/,g湿菌体)，室温或37振荡,2,h。冰浴超声10S30次，其间每次间隔20S，功率为200W。10条件下1000g离心5min去除细胞碎片。上清液中的包涵体(Inclusion body,IB)在4条件下27000g离心15min收集，然后用含2mol,/,L尿素的缓冲液A充分悬浮，室温静置30min后4条件下17000g离心15min，收集沉淀。沉淀再用含2脱氧胆酸钠的缓冲液A充分悬浮，4条件下17000g离心l5min，收集沉淀。最后沉淀用10,mm,ol,/,L rifs,-,HC1,pH7,.,3洗涤两次(4,17000g离心15min)。,七、工程菌产物鉴定和保存,2025/5/14 周三,73,注意事项：细胞内表达的最大问题就是容易形成不溶性的包涵体,它的形成对表达产物的活性不利。,七、工程菌产物鉴定和保存,2025/5/14 周三,74,包涵体(inclusionbody)是细菌表达的蛋白质在胞内互相凝集而形成的无活性固体颗粒。具有很强的折光性。正常的大肠杆菌基因以重组方法使其在大肠杆菌内表达也会形成包涵体。说明不仅仅是外源蛋白才能形成包涵体,同时也发现有表达量较低的基因产物也是以不可溶形式存在的。包涵体的形成不仅仅与宿主细胞、表达基因有关,还与培养外环境有关系。其形成的原因多数认为:目的基因的过度表达使蛋白质无足够时间进行肽链折叠,产生凝集。重组蛋白所处的环境条件对包涵体也有较大影响,如当温度超过某一种蛋白质的变性温度时,随着温度的增加凝集量也增加。当环境PH接近某一种蛋白的等电点时,蛋白的凝集增加,包涵体的形成也增多,此外,离子组成和强度、辅助因子、氧化还原电位等均可影响包涵体的形成。,七、工程菌产物鉴定和保存,2025/5/14 周三,75,应对方案：,改变发酵条件,如发酵温度