医学文献检索复习笔记.docx

医药文件检索与利用（zll）
一、检索总论
1.1 信息及信息素养
信息：是普遍存在，是物质一个基本属性，是物质存在方式及其运动规律、特点外在表现。
信息定义：事物运动状态和状态改变方式。
信息与知识区分：信息是大家，独立于行为和决议，独立于环境存在，轻易转让，可复制。
情报：传递有特定效用知识（知识性，传递性，效用性）。
文件：以文字、图形、符号、声频、视频等伎俩统计和传输知识载体。
（知识内容、信息符号、载体材料、统计方式）

文件按加工层次划分：
一次文件（原始论文——期刊论文、学位论文、研究汇报、专利说明书）；
二次文件（目录、索引、文摘，pubmed、web of science、sinomed）；
三次文件（综述、年度总结、年鉴、指南、百科全书、annual reviews）；
零次文件（未被正式发表，书信、手稿、笔记、口头交流）
文件按载体形式划分：印刷型、电子数字型、缩微型、声像/视听型
文件按出版类型划分：图书（ISBN号 10位，4段——地域号、出版社号、书号、校验号；本馆订购电子图书：apabi，超星、读秀、elsevier、karger、Springer）、期刊（ISSN号 8位，前七位是刊名代号，末位是计算机校验号）、特种文件
整个信息行为：信息需要、信息检索、信息选择、信息利用
信息素养定义：人们在工作中利用信息、学习信息技术、利用信息处理问题能力。
信息素养组成要素：信息意识；信息能力；信息道德。
ACRL信息素养能力评价标准：（5个一级指标，24个二级指标）。
1.2医学文件检索相关概念
指从文件信息集合中查找所需文件或文件中包含信息内容过程
1.3计算机检索原理概述
检索提问字符串 匹 配 数据库中特征标识字符串
数据库组成：文档、统计、字段
常见字段：TI（题目） 、AB（文摘）、AU（作者）、MESH（主题词）、 SO（期刊名称）、 AD（作者单位）、DT（文件类型）、PY（出版年）
1.4检索语言
文件外部特征检索语言：题名、著者、文件序号、引用序号
文件内容特征检索语言：分类检索、主题检索、代码检索
（1）分类检索：美国国立图书馆图书分类法，杜威十进制、国际十进制、中国图书馆分类、国际疾病分类。
（2）主题检索：是以规范化词汇来表示文件内容主题；主题词（叙词）、副主题词（限定词）、关键词。
（3）代码检索：化合物分子式索引等
1.5计算机检策略与步骤
（1）布尔逻辑检索：NOT >AND> OR，括号优先
} （2）截词检索：？代表一个字母，必须以半角状态输入 %或*代替任意个字符
} （3）位置运算检索：（W）、（nW）、（N）、（nN）、（F）、（S）、（L）
} （4）字段限定检索：“=”或 “in”
（5）计算机检索通常步骤：（大题）
分析检索课题（课题所属学科范围、要求文件类型、年限、语种、需要文件量等）
选择检索工具（数据库选择）
确定检索路径（首先选择基本检索方式全字段检索）
依照检索结果调整检索策略（考虑关键词重述与转换，拆分）
依照文件线索，获取全文
（6）检索结果评价（收录范围、查全率、查准率、对应时间、用户负担、输出形式）
查全率：R=检索出相关信息量/信息系统中相关信息总量
用or组配，用上位词（扩展下位词），用截词，少用副主题词匹配
查准率: P=检索出相关信息量/检索出信息总量
1.6 本馆电子资源介绍
（1）汉字
sinomed :二次文件库
CNKI、万方、VIP:期刊全文数据库
超星、先生之家：电子图书
读秀、发觉：一站式资源整合平台
（2）外文
pubmed和web of science：:二次文件库
二、惯用汉字数据库
2.1 SinoMed
本馆订购：中国生物医学文件数据库（CBM）（1978年以来《医学主题词表》；《中医药学主题词表》；《中国图书馆分类法·医学专业分类表》）、中国医学科普文件数据库（以来）、北京协和医学院博硕学问论文库（1981年以来）。
数据库特点：
（1）检索入口多，检索策略制订灵活
多个检索路径：快速检索、高级检索、主题检索、期刊检索、作者检索
多个限定条件：年代、文件类型、年纪组、性别、对象类型、其它
（2）词表辅助检索功效
主题导航
（3）多角度文件分析功效（能够，txt，excle格式导出）
（4）定题检索（定时跟踪某一个课题最新文件）
我空间—>我检索策略
能够将检索策略保留到我空间，保留检索策略能够定时发送到邮箱或RSS订阅
（5）能获取详细书目信息及全文链接

检索方法与技巧：（夸库检索仅支持标黄）
（1）快速检索：在文章标题、摘要、作者、关键词、主题词等字段检索，检索出之间能够用逻辑运算符not，and，or链接，默认为and
（2）高级检索：能够限定在某一特定字段检索，智能检索（自动转化为主题词），精准检索（关键词、主题词、特征词、分类号、作者、刊名、ISSN）,限定检索，灵活组配检索式。
（3）限定检索：惯用限定条件如年代、文件类型、研究对象等加以整合，可使已检出文件数量有针正确降低，防止二次检检索操作。限定内容能够多项选择，同组内限定为“or”关系，不一样组之间限定为“and”关系，限定完成后能够在检索前设定，也能够在检索后设定。
（4）主题检索：用规范化主题词进行检索，有利于提升查全率和查准率
主题词“加权”表示主题词主要程度，反应文章阐述主要内容。加权主题词用“*”表示。
主题词扩展检索是指对当前主题词及其下位主题词进行检索，系统默认状态为扩展检索
能够使用主题导航
（5）分类检索
类名，类号
能够使用分类导航
（6）期刊检索
依照刊名、出版地、出版单位、及期刊主题词、ISSN相关信息进行检索
能够使用期刊分类导航和首字母导航进行检索
（7）作者检索
比较有效地处理“同名著者”，“同构异名”问题
（8）定题检索
可定制和跟踪某一课题最新文件。首次使用该项功效则需要注册，注册是无偿。
（9）引文检索

检索结果处理:
显示：题录格式、文摘格式、详细格式
输出：单次打印和保留（最大统计数500），单次e-mail（最大统计数50）

2.2 CNKI（最早能够追溯到19）
资源范围：中国学术文件总库（学术期刊、博士论文、优异硕士论文、工具书、会议论文、年鉴、报纸、专利、标准等）、我馆已购置数据库及专辑
检索方法：跨库检索、单库检索（默认为跨库检索，能够选择单库检索）
（1）跨库检索：一次性在全部类型资源中检索，但检索入口少
（2）单库检索：选择在某一特定数据类型库中检索，检索入口多
支持检索方法
（1）基本检索：
检索字段（主题、 篇名、关键词、作者、单位、基金、参考文件、 中图分类）多角度分组浏览（学科、发表年度、基金、研究层次、作者、机构）
多角度检索结果排序（主题、发表时间、被引、下载）
（2）高级检索
多个检索入口组配
多个限定条件（年限、起源期刊、起源类别支持基金、作者及单位）
（3）专业检索（需要自己设计检索式）
（4）作者检索
（5）起源期刊检索
（6）句子检索（全文检索+位置检索）
句子中包含了大量事实信息，能够为用户提供相关事实问题答案。
知网节（文件网络图）：
是中国知网特有技术概念，清楚地反应文件继承与发展。
共引文件：与本文有相同参考文件文件。
同被引文件：与本文同时作为参考文件文件。
引证文件：引用本文文件。
二级引证文件：本文参考文件参考文件。

2.3万方数据库 1998年
独家收录中华医学会杂志
跨库检索：
（1）能够对检索结果按相关度、时间、被引次数、经典论文等角度显示。
（2）支持检索结果以标准参考文件格式或参考文件管理软件格式导出。
（3）能够对检索结果从学科分类、论文类型、年份、发表期刊等角度分析。
高级检索：
经典高级检索：
专业检索：能够依照系统提醒字段输入检索出逻辑运算符
知识网络分析：从时间维度揭示知识点关注度，了解学科发展规律，有利于发觉新研究方向、研究趋势和热点研究。

2.4维普资讯 1989年
基本服务：期刊文件检索、文件引证追踪、科学指标分析、搜索引擎服务
基本检索：
传统检索：专辑导航、分类导航
高级检索：实现同义词索引功效预防漏检；同名作者功效缩小检索范围
检索执行从上到下次序，而不是逻辑优先次序
期刊导航：可经过期刊导航实现期刊逐期浏览，也能够定制自己关注 期刊
检索历史：

2.5三大全文数据库比较
从收录资源角度:知网最全；万方没有收录报纸、工具、学习；维普只有全文、报纸、学习和外文
从检索方式角度：
（1）中国知网单库检索方式比万方数据多，其中: 科研基金检索、句子检索、文件出版起源是其特有检索方式。
（2）万方数据学术期刊检索特有字段为: 被引用次数、DOI数字对象唯一标识符 、有没有全文。
（3）维普资讯特有检索字段：栏目信息
（4）单库检索字段而言，中国知网、维普检索字段多于万方数据
从收录学位论文角度：
（1）知网对硕士论文单位收录数量较多
（2）万方数据库收录了部分单位博士后论文
（3）维普没有收录学位论文

2.6 读秀学术搜索——以海量汉字资源为基础知识库，整合了多个资源，经过统一检索平台，实现一站式检索。
三、惯用外文数据库
3.1 Pubmed
Pubmed介绍：NCBI建立了生物医学文件数据库，使用是Entrez检索平台，每七天更新。约5%文件提供无偿全文，前身是medline光盘数据库。pubmed由medline（1946年以来，均进行过主题词标引）、premedline（暂时性医学数据库）、 publisher supplied citation（出版商递送电子文件）和old medline结构。
Entrez平台：是资源整合系统，可检索NCBI提供30多个数据库。
截词检索：截词符*，只有右截词，会自动关闭自动匹配与转换功效。
词汇自动转换：系统会自动将检索词语转换为对应mesh词和textword词。
精准检索：在短语上加半角双引号“”后，系统将不再进行自动转化，而进行精准检索。
基本检索：
能够输入任何字词，系统会自动识别并匹配进行检索；
能够输入逻辑表示式；
能够进行字段限制检索。
高级检索：
检索表示式生成器——提供字段进行字段限制检索，逻辑组配检索，依照检索需要，进行逻辑组配，生成复杂检索表示式
检索历史——显示检索过程，能够进行逻辑组配，可对检索历史进行保留和删除。
主题词检索：
有很好准确性与专指性，在新文件及新概念上存在缺失和时滞
期刊检索：能够查看期刊相关信息，也能够检索该刊上发表文章。
检索结果过滤：
文本过滤、出版时间过滤、试验对象过滤、文件类型过滤、语种过滤等。过滤设置对后续检索都有限制作用，能够经过clear all链接去除重新设置
单篇引文匹配器 single citation matcher：用于单篇文章查找
临床咨询 clinical queries：专门为临床医生设计
检索结果处理：
（1）检索结果显示
（2）课题追踪
（3）检索结果保留（send to）
File:将全部检索结果或选择数据保留到当地电脑中
Clipboard:其暂时保留作用，最多保留500条统计。从剪贴板中可进行保留到当地电脑、发送到邮箱等操作。
Collections:将文件添加到个人文件集中，需要登录my ncbi.
E_mail:将文件发送到个人邮箱，不需要登录my ncbi
Order:向NLM订购全文
My Bibliography：需要登录my ncbi，将检索结果添加到我书目数据库中。
（4）my nibi个性化服务
3.2 Web Of Science
介绍：web of science是大型综合性、多学科、关键期刊引文索引数据库，web of science关键集合是其中引文索引数据库（包含了SCI、SSCI、A&HCI）。
引文检索：是指对文章参考文件进行检索，是从学术论文中引证关系入手进行检索一个方法。（意义：揭示科学研究过去、现在、未来之间内在联络，揭示科学研究中所包括各个学科领域交叉联络，帮助研究人员快速地掌握科学研究历史、发展和动态。）
检索规则：
逻辑运算符：not、and、or
位置运算符：same、near/n（n默认是15,）
截词符：？表示单个字符、*表示多个字符
精准检索：“”
期刊引证汇报journal citation reports (JCR):
是对引用和被引用数据统计，数据每年更新。
JCR作用：
确定投稿期刊是否被SCI收录，期刊变更信息等。
了解期刊详细信息，包含影响因子及其改变趋势、出版国家与出版商等。
对期刊进行多角度比较。
按照学科、影响影子、期刊分区等方式选择适宜投稿期刊。

IF（期刊影响因子）：
是国际上通用评价期刊影响力一个主要指标。通常来说影响因子高，期刊影响力就越大。对于一些综合类，或者大项研究领域来说，因为研究领域广所以引用率也比较高。
经过描述文章内容关键词选择适宜期刊投稿：
在WOS关键合集中检索相关文件；经过起源出版物分析功效， 寻求适宜投稿期刊
或分析功效能够找到一些内容比较集中期刊

四、外文全文数据库
定义：外文全文数据库是指提供了一次文件外文数据库
分类：
（1）出版商提供网络电子平台，通常只提供自己出版文件，Elsevier SD,Springer,Karger....
(2)数据库代理商，整合多家资源，Ebscohost，OVID....
(3)open access 开放获取期刊
本馆订阅外文全文数据库：
（1）图书期刊类：annual reviews,acs,ebscohost,karger,ovid,springer, pnas,nature,scinece, sciencedirect
（2）特征文件：pqdd
（3）循证医学库：cochrane library

详细介绍：
science direct:
（1）介绍：由世界上最大学术期刊出版商elsevier开发，全球最著名科技医学全文数据库之一，我馆现在可访问1997年以来多个电子期刊。
（2）检索规则：
位置算符： W/n （词次序任意）
Pre/n（两个词之间顺应是固定）
截词符： ？ *
宽松短语检索：“ ”（标点符号、连字符、停用字等会自动忽略）
精准短语检索： {}
（3）四个模块：
physical science and engineering（自然科学）
life sciences（生命科学）
health sciences （健康科学）
social science and humanities（社会科学）
（4）检索方法：
基本检索：
高级检索：
（5）检索结果处理：
检索结果个深入限定（refine filters）
检索结果保留，全文下载
订阅检索结果或期刊内容（save search alert）

Clinicalkey：
基于爱思唯尔全部医学内容开发，权威而全方面。包含期刊、参考书、视频、图片、影像、临床试验、诊疗指南、药品专论等等。

Wiley online library：
（1）介绍：18创建于美国，出版学术期刊、过刊集、图书、参考工具书、试验室指南、循证医学图书馆等
（2）检索路径：
期刊浏览方式（字序、学科）
基本检索
高级检索
（3）Lab protocals

Cochrane Library(Wiley) 循证临床证据数据库：
Cochrane协作网是1993年正式成立国际性协作组织，其目标是对临床医学各个领域所开展随机对照试验进行全方面、系统、定量综合分析和评价，以电子出版物形式发表结果，为临床医疗、科研及医疗卫生决议提供可靠科学依据。
OVID数据库：

Annual Reviews：
是一家致力于向全球科学家提供高度概括、实用信息非赢利性组织，专注于出版权威综述期刊；AR邀请各学科领域最权威、顶尖科学家撰写综述，回顾本学科最前沿进展，为科学研究提供方向性指导

springer：（德国）

PQDD：
是现在国内唯一能够查询国外大学（北美地域为主）优异博硕士论文全文数据库，数据库覆盖了大部分北美地域高等院校以及世界其余地域数千个高等院校每年取得经过博硕士论文。

五、文件管理软件
文件管理软件是适应科技文件快速增加开发工具，集参考文件检索、搜集、整理功效于一体，帮助用户高效管理和快速生成参考文件。这类软件提供附件、笔记、查找、分析等功效，能够帮助用户实现包含文件检索、文件阅读、文件引用全过程管理。
惯用文件管理软件:
NoteExpress 、EndNote、Biblioscape 、Reference Manager、ProCite 、RefWorks

详细介绍:
NoteExpress
是现在流行参考文件管理工具软件之一，其关键功效是帮助读者在整个科研流程中高效利用电子资源，检索并管理得到文件摘要、全文；在撰写学术论文、学位论文、专著或汇报时，可在正文中指定位置方便地添加文中注释，然后按照不一样期刊，学位论文格式要求自动生成参考文件索引。
其关键功效包含：检索、管理、分析、发觉和写作。
EndNote
是一个专门用于科技文章中管理参考文件数据库软件，是SCI（Thomson Scientific 企业）官方软件，支持国际期刊参考文件格式有三千多个，写作模板几百种，涵盖各个领域杂志。

TS= 主题
TI= 标题
AU= 作者 [索引]
AI= 作者识别号
GP= 团体作者 [索引]
ED= 编者
DO= DOI
SO=出版物名称 [索引]
IS=ISSN号[索引]
PY= 出版年
AD= 地址
OO= 机构
OG= 机构扩展 [索引]
CU= 国家/地域
FO= 基金资助机构
FG= 授权号
FT= 基金资助信息
SU= 研究方向
WC= Web of Science 分类
IS= ISSN/ISBN
UT= 入藏号

分析检索课题：课题主题分析，主要概念有：视盘脉管炎、中医药治疗或中医药疗法。学科范围属于自然科学医学领域。用户是希望了解汉字医学期刊发表此方面文件情况，并希望发表相关方面论文，所以文件信息检索对象主要是期刊论文。检索要求，应该是查全查准。
数据库选择：鉴于汉字医学期刊文件调研需求，sinomed、cnki、万方和维普平台符合检索要求。
确定检索路径：
（1）sinomed
默认检索方式一框式全字段检索：视盘脉管炎and 中医药治疗
考虑关键词重述与转换：在sinomed主题词表检索入口输入“视盘脉管炎”没有对应词汇，说明没有这么表示形式主题词，输入“视盘”显示为主题词，对应款目词有“视神经乳头”“脉管炎”对应主题词“血管炎”，考虑副主题词。“视盘”[不加权：扩展]and“血管炎/按摩疗法/气功疗法/中医病机/中药疗法/中医疗法”[不加权：扩展]。
评价检索结果，修正检索策略：结合sinomed主题词标引实际情况，一框式全字段检索，再次编写检索表示式（视盘 or 视神经头 or 视神经乳头） and（脉管炎 or 血管炎）and （中医 or 中药 or 中成药 or 中西医 or 中草药 or 辨证）

分析检索课题：课题主题分析，主要概念有：B超（B Type ultrasound）、钼靶x射线摄影术（mo-target-x-ray radiography）、乳腺疾病诊疗（breast diseases diagnosing）；次要概念对照分析（contrast evaluation ）。学科范围属于自然科学医学领域；用户是希望了解国外医学期刊发表此方面文件情况，并发表相关文件论文，所以文件信息检索对象主要是期刊论文。检索要求，应该是追求查全和查准。
数据库选择，鉴于国外医学期刊文件调研需求，pubmed数据库符合要求。
确定检索路径：
首先选择pubmed基本检索方式全字段查找。依照现有信息编写主要概念检索式 B Type ultrasound and mo-target-x-ray radiography and breast diseases diagnosing and breast diseases diagnosing 试检，结果为0篇。
此情况需要考虑关键词重述和转换。能够借助pubmed主题词表树状结构表来实现关键词重述与转换。在pubmed主题词表输入B Type ultrasound没有对应词汇出现说明没有这么形式主题词，能够采取概念归纳和概念划分方法来确定主题词。选择上位词ultrasound，词表相关首位词为ultrasonography 阅读定义符合上位概念，点击该词进入树状结构表，其下位词ultrasonography mammary 最符合该课题检索用词。在主题词表输入mo-target-x-ray radiography没有对应词汇出现说明没有这么形式主题词，能够采取概念归纳和概念划分方法来确定主题词。选择上位词radiography点击该词进入树状结构表，其下位词mammography 最符合该课题检索用词。