ApoE基因的检测方法.pptx

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,*,*,ApoE检测方法,ApoE基因的检测方法,第1页,112,158,cys,cys,cys,arg,arg,2,3,4,T,GC，cys,C,GC，arg,codon：112/158,T,GC,T,GC,T,GC,C,GC,C,GC,arg,C,GC,E2,(T/T),E3,(T/C),E4,(C/C),E2(T/T),E2/E2,(TT/TT),E2/E3,(TT/TC),E2/E4,(TC/TC),E3(T/C),E3/E3,(TT/CC),E3/E4,(TC/CC),E4(C/C),E4/E4,(CC/CC),ApoE基因的检测方法,第2页,测序,ARMS-PCR,PCR-SSCP,PCR-RFLP,Q-PCR,ApoE基因的检测方法,第3页,T/C,T/C,112,158,T,C,C,T,P1,P2,P3,P4,5,3,上游引物,P5,下游引物,A管：P1、P3、P5 B管：P2、P4、P5,1 2 3 4 5 6,1 2 3 4 5 6,11、22、33、44、55、66分别代表基因型,E2/E2、E2/E3、E2/E4、E3/E3、E3/E4、E4/E4,ARMS-PCR,ApoE基因的检测方法,第4页,PCR-SSCP,单链构象多态性,(,SSCP)是在非变性聚丙烯酰胺凝胶上，依据短单链DNA 或RNA 分子碱基序列不一样形成不一样构象；一个碱基改变将影响其构象而造成其在凝胶上移动速度改变,形成多态性,。,E2/E2：A,A1,E2/E3：A,A1,B,B1,E2/E4：A,A1,C,C1,E3/E3：B,B1,E3/E4：B,B1,C,C1,E4/E4：C,C1,ApoE基因的检测方法,第5页,PCR-RFLP,GCGC,CGCG,A,B,C,D,E,E2：,TT,片段A,E3：,TC,片段E、D,E4：,CC,片段B、C、D,112位：G,T/C,GC,158位：G,C/T,GC,E2/E2：A,E2/E3：A,D,E,E2/E4：A,B,C,D,E3/E3：E,D,E3/E4：B,C,D,E,E4/E4：B,C,D,ApoE基因的检测方法,第6页,Q-PCR,F,R,probe,probe,TT,TC,CC,TT,E2/E2,(TT/TT),E2/E3,(TT/TC),E2/E4,(TC/TC),TC,-,E3/E3,(TT/CC),E3/E4,(TC/CC),CC,-,-,E4/E4,(CC/CC),ApoE基因的检测方法,第7页,ApoE基因的检测方法,第8页,ApoE基因的检测方法,第9页,Roche SNP Genotyping Introduction,ApoE基因的检测方法,第10页,融解曲线分析原理,ApoE基因的检测方法,第11页,融解曲线分析结果判读,ApoE基因的检测方法,第12页,单色荧光对ApoE分型,ApoE基因的检测方法,第13页,双色荧光对ApoE分型,codon：112,codon：158,ApoE基因的检测方法,第14页,ApoE基因的检测方法,第15页,