蛋白灰度分析软件使用.pptx

蛋白灰度分析软件使用蛋白灰度分析软件使用蛋白灰度分析软件使用第1页蛋白灰度分析软件蛋白灰度分析软件有：Image-Pro Plus，Quantity One，Image J 等（1）Image-Pro Plus 综合性能最好，操作简便结果可靠！因为它有强大IOD 算法，能准确反应蛋白灰度但需要靠魔棒或轨迹法选取目标蛋白区域，有一定主观性主观性，不过蛋白灰度测定本身就是半定量分析-测量值本身就没有一定标准，不一样软件测量值不一样，即使相同软件重复测量数值也不一定相同，所以只要测定数值能反应目标蛋白改变趋势，测量值相对偏差不大即可蛋白灰度分析软件使用第2页（2 2）Quantity Quantity One One：有泳道-轨迹测定法，等高线/手绘选取目标区域测定法等方法.泳道-轨迹测定法：先剔除一系列背景，再选择泳道（lane），然后分析条带（band）,最终使用高斯建模得出灰度分析值（Gauss Model trace）特点：感觉比较科学，重复性好，但十分繁琐，而且有时不能正确反应灰度。.等高线-手绘选取目标区域测定法：经过等高线或手绘选取目标蛋白区域，最简便，但重复性不太好。蛋白灰度分析软件使用第3页（3）Image J 最坑爹，它用魔棒选取区域测定灰度，可是有时极难选中所需区域，而且方法繁琐，不推荐！蛋白灰度分析软件使用第4页Image-Pro Plus Image-Pro Plus 分析蛋白灰度教程说明：目标蛋白灰度=目标蛋白IOD 值/对应内参IOD 值1.使用Photoshop 剪切出目标区域（只含western bolt 条带，如图），保留为TIFF 格式文件。蛋白灰度分析软件使用第5页2.Image-Pro Plus 2.Image-Pro Plus 打开文件，剔除背景：（1）放大镜放大目标区域蛋白灰度分析软件使用第6页（2 2）Measure-calibration-intensity-options-image,Measure-calibration-intensity-options-image,选择背景最大value value 值-ok-ok-system-close-ok-ok-system-close蛋白灰度分析软件使用第7页蛋白灰度分析软件使用第8页（3 3）Measure-count/size-measure-select measurementsMeasure-count/size-measure-select measurements，选择IOD IOD 为测量值，调整结果显示方式：Options-label style Options-label style 改为mesurementmesurement，选择IOD IOD 为显示值。蛋白灰度分析软件使用第9页（4）接下来有2 种方法选择目标蛋白区域（即找出AOI，area of interest,IPP 关键元件）：魔棒和手绘轨迹法。蛋白灰度分析软件使用第10页（5）count/size-edit-convert AOI to object-得出IOD 值蛋白灰度分析软件使用第11页（6）若测下一条带，则点NEW AOI 按钮，再按以上方法选择AOI（7）能够count/size-view-measurement data 显示或输出测量值蛋白灰度分析软件使用第12页Thank you 蛋白灰度分析软件使用第13页