GaussView基础教程.doc_咨信网zixin.com.cn

资源描述

1、GaussView教程【1】界面介绍Gview就是一个专门设计于高斯配套使用得软件,其主要用途有两个:构建高斯得输入文件;以图得形式显示高斯计算得结果。除了可以自己构建输入文件外,Gview还可读入Chem3D,HyperChem与晶体数据等诸多格式得文件。从而使其可以于诸多图形软件连用,大大拓宽了使用范围。开启GaussView会瞧到一大一小两个窗口,后面灰色背景得窗口为选择窗口,在里面选择要输入得分子或基团;前面紫色得窗口为绘图窗口,使用鼠标绘制想要绘制得图形。菜单栏【File】主要功能就是建立,打开,保存与打印当前得文件【Edit】完成对分子得剪贴、拷贝、删除、抓图等【View】与

2、显示分子相关得都在这个菜单下,如显示氢原子、键、元素符号、坐标等【Calculate】直接向Gaussian提交计算【Results】接收并显示Gaussian计算后得结果【Windows】控制窗体,如关闭、恢复等【Help】帮助快速工具栏【左面第一个】选择元素与价键,单击打开会瞧到一个元素周期表,通过它可以选择需要绘制得元素以及价态。【左面第二个】环工具,作用与上一个差不多,只就是这里提供得都就是环状化合物残基;【左面第三个】提供常用得R基团模板,其中包括乙基、丙基、异丙基、异丁基等【左面第四个】氨基酸残基,使用它可以迅速绘制氨基酸【左面第五个】用户自定义基团,您可以将常用得基团存

4、到工作窗口;按上下左右键,或者左键单击不放移动鼠标,可以调节分子得角度;滚动鼠标滚轮,可以放大缩小分子;按住shift键,左键单击不放移动鼠标,可以移动分子;当工作窗口内有多个分子时(在构建大得分子时,这种情况很容易出现)用Shift+Alt+鼠标左键组合,移动想要移动得分子;用Ctrl+Alt+鼠标左键组合调节其中一个分子得角度;双击图标(或者左键不放),在元素周期表中选择【F】元素,回到工作窗口在苯得任意一个【H】上单击,使之变成【F】双击图标,从链烃库中选择【乙基】(第一个),然后点击间位上得【H】即可至此,分子式已经构建完成,Gview存储个人常用分子得功能,双击view上得图标,在下

5、面得对话框中键入相关项目,保存即可。(注:我得程序此项功能不行,用户自定义基团)查瞧分子坐标:单击Gview界面得图标,查瞧分子得坐标。至此,我们保存一下我们构建好得间氟苯乙烷分子,在绘图界面右键单击【File】【Save】然后选择保存路径即可。GaussView教程【3】向Gaussian提交计算上一讲我们已经构建好了一个间氟苯乙烷分子,现在打开间氟苯乙烷分子。点击Gview界面上得【Calculate】【Gaussian Calculate Setup】从对话框中我们可以选择许多参数,下面依次选择一下【Job Type】工作类型:【Energy能量】|【Optimization优化】|【F

6、requency频率】|【Opt+Freq优化频率】|【Scan扫描】|【Stability稳定性】|【NMR核磁】,这里我们选择【NMR】核磁【Method】方法:每种计算模式都提供了若干种方法,这里选择默认值即可【Title】题目:这项可以根据自己得项目自行命名【Link 0】给检查点文件命名其它选择默认即可选好后点击【Submit】提交至Gaussian,并保存。(最好存到安装文件所在磁盘)系统会询问就是否提交至Gaussian,选择【OK】,Gaussian会自动开启并计算,计算时间因硬件配置而异计算完毕后系统会提示关闭Gaussian,点击【就是】计算完毕后会生成两个文件,

7、、log得就是系统日志,便于查瞧计算结果。这里我们选择、chk文件【Ok】接下来我们又一次瞧到了刚才绘制得那个分子,表面上没什么不同,但这次我们可以预言它得许多性质了,在GView得主界面点击【Results】【Summary】可以瞧到刚才得计算总结,点击【View File】可以瞧到日志文件。因为我们刚才选择计算模式就是【NMR】核磁,所以我们点击【Results】【NMR】,随即我们瞧到了很熟悉得核磁图谱,但似乎很乱,因为这就是所有元素得核磁谱图,在左下方【Element】右方选择【H】,即H谱,旁边【Reference】选择【TMS HF/6-31G(d)】,这次我们就可以瞧到间氟苯乙烷分子理论计算得核磁谱图了。在绘图界面右击【View】【Labels】可以瞧到每个H原子对应场中得位置。

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