生物分类总表.doc

窗体顶端窗体底端窗体顶端生物分类总表1 古菌域（Archaea） 2 细菌域（Bacteria) 3 真核生物域(Eukarya) 3。1 植物界(Plantae） 3。2 真菌/后生动物组 3.2.1 动物界(Metazoa） 3.2.2 真菌界(Fungi） 3。3 其余真核生物（原生生物和真核藻类） 4 病毒和类病毒 古菌域(Archaea）包含嗜盐菌、一些超嗜热菌、嗜酸菌等。参见古菌分类表.细菌域（Bacteria)包含蓝藻、放线菌、衣原体、支原体、立克次体等。参见细菌分类表。真核生物域(Eukarya)植物界（Plantae)包含绿藻、轮藻、苔藓植物、蕨类植物、种子植物等。参见植物分类表.真菌/后生动物组真菌/后生动物组除动物界和真菌外,还包含领鞭毛虫、鱼醉菌等。动物界(Metazoa)即“后生动物。参见动物分类表。真菌界(Fungi)参见真菌分类表，包括子囊菌、担子菌、接合菌、壶菌、Glomeromycota和微孢子虫.金藻纲（Chrysophyceae） 硅鞭藻纲（Dictyochophyceae） 针胞藻纲(Raphidophyceae) 前毛壶菌纲（Hyphochytriomycetes) 卵菌纲（Oomycetes) 褐藻门（Phaeophyceae）,如海带、巨藻、马尾藻、墨角藻。 硅藻门(Bacillariophyta） 黄藻门(Xanthophyceae) 囊泡虫类（Alveolata） 顶复门(Apicomplexa)，如疟原虫。 纤毛虫类（Ciliophora），如喇叭虫、中缢虫、榴弹虫、草履虫、四膜虫。 甲藻门（Dinophyceae) 单孢子虫门（Haplosporidia) 丝足虫类（Cercozoa) 根肿菌类(Plasmodiophorida） 粒网足虫类（Granuloreticulosea),如有孔虫. 叶足纲（Lobosea）,如变形虫（阿米巴）. 黏菌门（Mycetozoa） 灰胞藻纲(Glaucocystophyceae） 红藻门(Rhodophyta)，如石花菜、紫菜. 注：以上真核生物列表不完全，尚包括有其它一些未归类原生生物。古菌分类表目錄1 初古菌門(Korarchaeota) 2 納古菌門(Nanoarchaeota) 3 泉古菌門(Crenarchaeota) 3.1 熱變形菌綱(Thermoprotei） 4 廣古菌門（Euryarchaeota) 4.1 甲烷桿菌綱(Methanobacteria） 4。2 甲烷球菌綱(Methanococci) 4。3 甲烷微菌綱(Methanomicrobia） 4。4 鹽桿菌綱(Halobacteria） 4.5 熱原體綱（Thermoplasmata) 4。6 熱球菌綱(Thermococci) 4。7 古球狀菌綱(Archaeoglobi) 4。8 甲烷火菌綱（Methanopyri) 初古菌門(Korarchaeota）納古菌門（Nanoarchaeota）*納古菌屬（Nanoarchaeum) 泉古菌門(Crenarchaeota）熱變形菌綱（Thermoprotei)熱變形菌目(Thermoproteales) 熱變形菌科（Thermoproteaceae) 熱變形菌屬(Thermoproteus） 暖枝菌屬(Caldivirga) 火棒菌屬（Pyrobaculum） 熱分支菌屬(Thermocladium) 火山鬃菌屬(Vulcanisaeta） 熱絲菌科（Thermofilaceae) 熱絲菌屬（Thermofilium) 暖球形菌目(Caldisphaerales） 暖球形菌科(Caldisphaeraceae) 暖球形菌屬(Caldisphaera) 除硫球菌目(Desulfurococcales） 除硫球菌科(Desulfurococcaceae） 除硫球菌屬(Desulfurococcus) 酸葉菌屬（Acidilobus) 氣火菌屬（Aeropyrum) 燃球菌屬（Ignicoccus) 葡萄熱菌屬（Staphylothermus) （Stetteria) 厭硫球菌屬(Sulfophobococcus) 熱盤菌屬（Thermodiscus） 熱球形菌屬（Thermosphaera） 熱網菌科(Pyrodictiaceae) 熱網菌屬(Pyrodictium) 超熱菌屬（Hyperthermus) 火葉菌屬(Pyrolobus） 硫化葉菌目(Sulfolobales） 硫化葉菌科（Sulfolobaceae) 硫化葉菌屬（Sulfolobus） 喜酸菌屬(Acidiamus） 生金球形菌屬(Metallosphaera） 憎葉菌屬(Stygiolobus) 硫磺球形菌屬(Sulfurisphaera) 硫磺球菌屬（Sulfurococcus) 餐古菌目(Cenarchaeales）* 餐古菌科（Cenarchaeaceae）* 餐古菌屬（Cenarchaeum) 廣古菌門（Euryarchaeota)甲烷桿菌綱(Methanobacteria）甲烷桿菌目（Methanobacteriales) 甲烷桿菌科(Methanobacteriaceae） 甲烷桿菌屬（Methanobacterium) 甲烷短桿菌屬(Methanobrevibacter) 甲烷球形菌屬（Methanosphaera) 甲烷熱菌科（Methanothermaceae) 甲烷熱菌屬（Methanothermus） 甲烷球菌綱(Methanococci）甲烷球菌目（Methanococcales) 甲烷球菌科(Methanococcaceae) 甲烷球菌屬（Methanococcus) 甲烷熱球菌屬(Methanothermococcus） 甲烷暖球菌科(Methanocaldococcaceae) 甲烷暖球菌屬(Methanocaldococcus) 甲烷炎菌屬（Methanotorris) 甲烷微菌綱(Methanomicrobia）甲烷微菌目(Methanomirobiales） 甲烷微菌科(Methanomicrobiaceae) 甲烷微菌屬（Methanomicrobium) 甲烷囊菌屬（Methanoculleus) 甲烷泡菌屬（Methanofollis) 產甲烷菌屬(Methanogenium) 甲烷裂葉菌屬（Methanolacinia） 甲烷盤菌屬(Methanoplanus) 甲烷粒菌科（Methanocorpusculaceae) 甲烷粒菌屬(Methanocorpusculum) 甲烷螺菌科（Methanospirillaceae） 甲烷螺菌屬(Methanospirillum） 科未定 甲烷礫菌屬（Methanocalculus) 甲烷八疊球菌目(Methanosarcinales) 甲烷八疊球菌科（Methanosarcinaceae） 甲烷八疊球菌屬（Methanosarcina) 甲烷類球菌屬（Methanococcoides） 甲烷鹽菌屬(Methanohalobium） 甲烷嗜鹽菌屬(Methanohalophilus） 甲烷葉菌屬(Methanolobus) 甲烷食甲基菌屬（Methanomethylovorans) 甲烷微球菌屬(Methanimicrococcus) 甲烷鹹菌屬（Methanosalsum） 甲烷鬃菌科(Methanosaetaceae） 甲烷鬃菌屬(Methanosaeta） 鹽桿菌綱(Halobacteria)鹽桿菌目(Halobacteriales） 鹽桿菌科(Halobacteriaceae) 鹽桿菌屬(Halobacterium） 鹽盒菌屬（Haloarcula) 鹽棒菌屬（Halobaculum) 鹽二型菌屬(Halobiforma） 鹽球菌屬（Halococcus) 富鹽菌屬（Haloferax） 鹽幾何菌屬(Halogeometricum) 鹽微菌屬（Halomicrobium) 鹽棍菌屬(Halorhabdus） 鹽紅菌屬(Halorubrum) 鹽簡菌屬(Halosimplex） 鹽陸生菌屬（Haloterrigena） 鈉白菌屬(Natrialba） 鈉線菌屬(Natrinema） 鹽鹼桿菌屬（Natronobacterium) 鹽鹼球菌屬（Natronococcus） 鹽鹼單胞菌屬（Natronomonas） 鹽鹼紅菌屬(Natronorubrum) 熱原體綱(Thermoplasmata)熱原體目(Thermoplasmatales） 熱原體科(Thermoplasmataceae） 熱原體屬（Thermoplasma） 嗜苦菌科(Picrophilaceae） 嗜苦菌屬(Picrophilus) 鐵原體科（Ferroplasmataceae) 鐵原體屬(Ferroplasma） 熱球菌綱(Thermococci）熱球菌目（Thermococci) 熱球菌科(Thermococcaceae） 熱球菌屬(Thermococcus) 古老球菌屬(Palaeococcus) 火球菌屬(Pyrococcus) 古球狀菌綱(Archaeoglobi）古球狀菌目(Archaeoglobales） 古球狀菌科（Archaeoglobaceae) 古球狀菌屬（Archaeoglobus) 鐵球狀菌屬(Ferroglobus） 地球狀菌屬(Geoglobus） 甲烷火菌綱(Methanopyri)甲烷火菌目（Methanopyrales） 甲烷火菌科(Methanopyraceae) 甲烷火菌屬（Methanopyrus) 植物分类表（略）动物分类表（略)细菌分类表目录1 产水菌门(Aquificae) 1。1 产水菌纲(Aquificae) 2 热袍菌门(Thermotogae） 2。1 热袍菌纲（Thermotogae） 3 热脱硫杆菌门（Thermodesulfobacteria) 3.1 热脱硫杆菌纲（Thermodesulfobacteria） 4 恐球菌栖热菌门（Deinococcus-Thermus) 4.1 恐球菌纲(Deinococci) 5 产金菌门（Chrysiogenetes） 5.1 产金菌纲(Chrysiogenetes) 6 绿弯菌门（Chloroflexi） 6.1 绿弯菌纲(Chloroflexi) 6.2 厌氧绳菌纲(Anaerolineae） 7 热微菌门(Thermomicrobia) 7。1 热微菌纲（Thermomicrobia) 8 硝化螺旋菌门(Nitrospira) 8。1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira) 9 脱铁杆菌门（Deferribacteres） 9。1 脱铁杆菌纲（Deferribacteres) 10 蓝藻门(Cyanobacteria） 10.1 蓝藻纲（Cyanobacteria） 11 绿菌门(Chlorobi） 11.1 绿菌纲(Chlorobia） 12 变形菌门(Proteobacteria） 12.1 变形菌纲（Alphaproteobacteria） 12。2 -变形菌纲（Betaproteobacteria） 12.3 -变形菌纲（Gammaproteobacteria) 12。4 -变形菌纲（Deltaproteobacteria） 12.5 -变形菌纲(Epsilonproteobacteria) 13 厚壁菌门(Firmicutes）（低G+C革兰氏阳性菌) 13。1 梭菌纲（Clostridia) 13。2 柔膜菌纲(Mollicutes） 13。3 芽孢杆菌纲（Bacilli） 14 放线菌门（Actinobacteria）（高G+C革兰氏阳性菌） 14.1 放线菌纲(Actinobacteria） 15 浮霉菌门（Planctomycetes） 15。1 浮霉菌纲（Planctomycetacia） 16 衣原体门(Chlamydiae) 16.1 衣原体纲（Chlamydiae） 17 螺旋体门（Spirochaetes) 17.1 螺旋体纲（Spirochaetes） 18 纤维杆菌门（Fibrobacteres) 18。1 纤维杆菌纲（Fibrobacteres) 19 酸杆菌门（Acidobacteria) 19.1 酸杆菌纲(Acidobacteria） 20 拟杆菌门（Bacteroidetes） 20。1 拟杆菌纲(Bacteroidetes) 20.2 黄杆菌纲（Flavobacteria) 20。3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria） 21 梭杆菌门（Fusobacteria) 21。1 梭杆菌纲（Fusobacteria) 22 疣微菌门（Verrucomicrobia） 22.1 疣微菌纲（Verrucomicrobiae) 23 网团菌门（Dictyoglomi） 23.1 网团菌纲(Dictyoglomi） 24 芽单胞菌门（Gemmatimonadetes) 24.1 芽单胞菌纲（Gemmatimonadetes） 产水菌门（Aquificae）产水菌纲(Aquificae)产水菌目(Aquificales) 产水菌科（Aquificaceae） 产水菌属（Aquifex) （Calderobacterium） (Hydrogenobaculum） (Hydrogenobacter) （Hydrogenothermus） (Persephonella) （Sulfurihydrogenibium） (Thermocrinis) 科未定 （Balnearium） （Desulfurobacterium) （Thermovibrio） 热袍菌门(Thermotogae)热袍菌纲（Thermotogae）热袍菌目(Thermotogales） 热袍菌科（Thermotogaceae） 热袍菌属(Thermotoga） （Fervidobacterium) （Geotoga） （Marinitoga) (Petrotoga) (Thermosipho) 热脱硫杆菌门（Thermodesulfobacteria）热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria)热脱硫杆菌目(Thermodesulfobacteriales） 热脱硫杆菌科(Thermodesulfobacteriaceae) 热脱硫杆菌属(Thermodesulfobacterium） （Thermodesulfatator） 恐球菌-栖热菌门（DeinococcusThermus）恐球菌纲（Deinococci）恐球菌目（Deinococcales) 恐球菌科(Deinococcaceae) 恐球菌属(Deinococcus) （注：依据希腊语 / deinos，与“恐龙”的dino同源) 栖热菌目(Thermales) 栖热菌科(Thermaceae) 栖热菌属（Thermus) 海栖热菌属(Marinithermus) 亚栖热菌属（Meiothermus） 海洋栖热菌属(Oceanithermus) 火山栖热菌属(Vulcanithermus） 产金菌门（Chrysiogenetes）产金菌纲（Chrysiogenetes)产金菌目（Chrysiogenales） 产金菌科(Chrysiogenaceae) 产金菌属（Chrysiogenes) 绿弯菌门(Chloroflexi）绿弯菌纲（Chloroflexi）绿弯菌目（Chloroflexales） 绿弯菌科（Chloroflexaceae) 绿弯菌属（Chloroflexus） 绿线菌属（Chloronema） 太阳发菌属（Heliothrix) 玫瑰弯菌属(Roseiflexus） 颤绿菌科(Oscillochloridaceae） 颤绿菌属(Oscilochloris) 爬管菌目(Herpetosiphonales) 爬管菌科（Herpetosiphonaceae） 爬管菌属(Herpetosiphon) 厌氧绳菌纲（Anaerolineae)厌氧绳菌目（Anaerolineales） 厌氧绳菌科（Anaerolineaceae） 厌氧绳菌属（Anaerolinea) 暖绳菌属(Caldilinea) 热微菌门(Thermomicrobia）热微菌纲(Thermomicrobia）热微菌目（Thermomicrobiales） 热微菌科(Thermomicrobiaceae） 热微菌属(Thermomicrobium) 硝化螺旋菌门（Nitrospira)硝化螺旋菌纲（Nitrospira)硝化螺旋菌目（Nitrospirales） 硝化螺旋菌科(Nitrospiraceae) 硝化螺旋菌属（Nitrospira） 钩端螺菌属(Leptospirillum) 磁杆菌属（Magnetobacterium） 热脱硫弧菌属（Thermodesulfovibrio） 脱铁杆菌门(Deferribacteres)脱铁杆菌纲（Deferribacteres）脱铁杆菌目(Deferribacterales) 脱铁杆菌科(Deferribacteraceae) 脱铁杆菌属(Deferribacter) (Denitrovibrio) （Flexistipes) (Geovibrio） 科未定 (Synergistes） (Caldithrix） 蓝藻门(Cyanobacteria）蓝藻纲（Cyanobacteria)注：本文采用的Bergeys手册中蓝藻内的分类,不论目科属,均为形态分类，其中目在手册中为“Subsection”而非“Order，目、科均未列名称,此处目名称为习习用法，科不列名称；属除Halospirulina和Trichodesmium之外均标为“形态属”（Form Genus)而非“属”（Genus)。表中在形态分类后面加注”.预料不久的将来整个蓝藻分类系统将会大调，与其它细菌统一为系统发育分类系统。此外，因汉语“藻”字可指多种水生光合产氧生物，包括多支互不相关的原生生物甚至高等水生植物,此处仍用按照“藻”翻译蓝藻门（Cyanobacteria）细菌。但也可依据个人理念将名称定为“某菌”或“某蓝菌”，但应注意避免与其余细菌重名。色球藻目（Chroococcales) 第一科 管孢藻属(Chamaesiphon） 色球藻属（Chroococcus) （Cyanobacterium） (Cyanobium) (Cyanothece) 蓝纤维藻属（Dactylococcopsis） （Gloeobacter） 黏球藻属（Gloeocapsa） 黏杆藻属(Gloeothece) 微囊藻属（Microcystis） 原绿球藻属(Prochlorococcus） 原绿藻属(Prochloron) 聚球藻属（Synechococcus） 集胞藻属（Synechocystis） 宽球藻目（Pleurocapsales） 第一科 (Cyanocystis) (Borzia） (Crinalium) （Geitlerinema) 盐螺旋藻属（Halospirulina） （Leptolyngbya) (Limnothrix） 鞘丝藻属（Lyngbya） 微鞘藻属（Microcoleus） 颤藻属(Oscillatoria） （Planktothrix) 原绿发藻属（Prochlorothrix） (Pseudanabaena） 螺旋藻属(Spirulina） (Starria） 束藻属(Symploca) 束毛藻属（Trichodesmium) （Tychonema） 念珠藻目(Nostocales） 第一科 鱼腥藻属（Anabaena） 项圈藻属(Anabaenopsis） 束丝藻属(Aphanizomenon) (Cyanospira） （Cylindrospermopsis) 筒孢藻属（Cylindrospermum) 节球藻属(Nodularia) 念珠藻属(Nostoc) 伪枝藻属(Scytonema) 第二科 眉藻属（Calothrix） 胶须藻属（Rivularia） 单歧藻属（Tolypothrix) 真枝藻目（Stigonematales) 第一科 (Chlorogloeopsis) 费氏藻属(Fischerella) (Geitleria） （Iyengariella) 拟念珠藻属(Nostochopsis) 真枝藻属(Stigonema) 绿菌门(Chlorobi)绿菌纲（Chlorobia)绿菌目（Chlorobiales） 绿菌科（Chlorobiaceae) 绿菌属(Chlorobium) 臂绿菌属（Ancalochloris） 绿棒菌属（Chlorobaculum） 绿爬菌属(Chloroherpeton) 暗网菌属（Pelodictyon) 突柄绿菌属(Prosthecochloris) 变形菌门（Proteobacteria）-变形菌纲(Alphaproteobacteria）红螺菌目(Rhodospirillales） 红螺菌科(Rhodospirillaceae) 红螺菌属(Rhodospirillum) 固氮螺菌属(Azospirillum） (Inquilinus） 磁螺菌属（Magnetospirillum) （Phaeospirillum) (Rhodocista) 红螺旋菌属(Rhodospira) （Rhodovibrio） (Roseospira) (Skermanella） (Thalassospira) (Tistrella） 醋杆菌科(Acetobacteraceae) 醋杆菌属(Acetobacter） 嗜酸菌属（Acidiphilium） （Acidisphaera) （Acidocella） (Acidomonas) （Asaia） (Craurococcus) 葡糖醋杆菌属(Gluconacetobacter） 葡糖杆菌属(Gluconobacter） (Kozakia） （Muricoccus） （Paracraurococcus) (Rhodopila） (Roseococcus) (Rubritepida） （Stella) （Teichococcus) (Zavarzinia) 立克次体目（Rickettsiales) 立克次体科(Rickettsiaceae) 立克次体属（Rickettsia） （Orientia) 无形体科(Anaplasmataceae） 无形体属(Anaplasma) (Aegyptianella） (Cowdria） 埃里希体属（Ehrlichia) 新立克次体属（Neorickettsia) 沃巴赫体属（Wolbachia) (Xenohaliotis） 全孢菌科（Holosporaceae) 全孢菌属(Holospora） 科未定 (Caedibacter) （Lyticum) （Odyssella) （Pseudocaedibacter) (Symbiotes） (Tectibacter) 红细菌目(Rhodobacterales） 红细菌科(Rhodobacteraceae） 红细菌属（Rhodobacter) (Ahrensia） (Albidovulum) (Amaricoccus) (Antarctobacter） （Gemmobacter) （Hirschia) 生丝单胞菌属（Hyphomonas) (Jannaschia) (Ketogulonicigenium） （Leisingera) (Maricaulis) （Methylarcula) (Oceanicaulis) (Octadecabacter） (Pannonibacter) 副球菌属(Paracoccus) (Pseudorhodobacter） (Rhodobaca） (Rhodothalassium) 小红卵菌属（Rhodovulum) （Roseibium） (Roseinatronobacter） (Roseivivax） 玫瑰杆菌属(Roseobacter) （Roseovarius） (Rubrimonas) （Ruegeria） （Satittula） （Silicibacter) （Staleya) (Stappia） （Sulfitobacter） 鞘脂单胞菌目（Sphingomonadales) 鞘脂单胞菌科(Sphingomonadaceae) 鞘脂单胞菌属（Sphingomonas) （Blastomonas) 赤杆菌属（Erythrobacter） (Erythromicrobium) （Erythromonas) (Novosphingobium） 紫杆菌属(Porphyrobacter） （Rhizomonas) （Sandaracinobacter） （Sphingobium） （Sphingopyxis） 发酵单胞菌属（Zymomonas) 柄杆菌目(Caulobacterales） 柄杆菌科（Caulobacteraceae） 柄杆菌属(Caulobacter） （Asticcacaulis） （Brevundimonas） (Phenylobacterium) 根瘤菌目(Rhizobiales) 根瘤菌科（Rhizobiaceae) 根瘤菌属(Rhizobium) 土壤杆菌属（Agrobacterium） (Allorhizobium) (Carbophilus) （Chelatobacter) 剑菌属（Ensifer) 中华根瘤菌属（Sinorhizobium） 橙单胞菌科(Aurantimonadaceae) 橙单胞菌属(Aurantimonas） （Fulvimarina） 巴通体科（Bartonellaceae） 巴通体属(Bartonella) 布鲁氏菌科（Brucellaceae) 布鲁氏菌属(Brucella) 支动菌属(Mycoplana） 苍白杆菌属(Ochrobactrum) 叶杆菌科(Phyllobacteriaceae） 叶杆菌属(Phyllobacterium) （Aminobacter) (Aquamicrobium) （Defluvibacter) （Liberibacter) 中慢生根瘤菌属（Mesorhizobium） （Nitratireductor） （Pseudaminobacter) 甲基孢囊菌科（Methylocystaceae） 甲基孢囊菌属（Methylocystis） (Albibacter) (Methylopila） （Methylosinus） （Terasakiella） 拜叶林克氏菌科（Beijerinckiaceae) 拜叶林克氏菌属（Beijerinc