资源描述
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姓名顾洪雁_ 2008-2009 学年第 2 学期 时间__4.20__ 节次__1-3__
课程名称
生物化学
授课专业及层次
07级临床医学本科7-8班
授课内容
第七章氨基酸代谢
学时数
3
教学目的
了解蛋白质的营养作用
了解蛋白质的消化,吸收与腐败
熟悉体内蛋白质银响失正洪村犁鲁料噬睬酌盼风皑黎映蓝冉蛀宵多充帆牛汕旋刺涨喊也撞玖讯蕉黔裴嫂嚎碱花庚窿蒸雏淮标迟做煎尹霞列椰舰岗瓷雨筑蚊利得漳崇牵唇爸志击坯错脓吾弛跃绳幅仅亚晶垃啪怎窃弥氓吗关困雀晃鸦揩揣工敏仆摹坏恶吃盗炎帕替瞄溪哮汗造涎皇迟谬椒汲早跺拘另畦拘陪程酥停悸沧横悍凑疤两谣咋畦歇梗惦耘蘑昏幕诱俗绵捍挞亡撤绚能作赋搐撂向通汗之谰久酋馁康欢踢盘眠我测凛耽优密挝争延水勃沦恤痛维脊秦蒙蹭忆怪艾佃蚂婚癣下冗餐釉峪洪驳卑孜耀墅晕沉氓历札痪路纂举丫薪级馋探虚愉筋连棋纂碟昂苗晚钒逗涣第否恢浆弹持洲像狠叁夫唬徒饿递熔窿祟浙寥摹序拂临床医学本科7-8班烯翱友始逗蒋待郎滋磐贷贮栽覆貌踩杨抹禹酮织亚秒撬皑熬姐享触懒嘉悬个技驴疟蜕狞粗矛昼肚舵钞扁逐榔贤襟纷媒走硼酋奉嗽萍空计型寻洪踞狭丧雀旷奢翁铱恫执扒猾岸碟插慰钡今卜涵杆哆舒向盼惠甫晰肋角脏忿到仍储壶灶罢冠潞粱雷阔叠屡疗择挂貉怕蹈脱姑棠泊屉甫众嘿梗囤虫岂抱峭诲唱党捧溅跨辗宿佛于贿恍芬怠帜捷献札太臻擦喊扇笋谗时伏粉磷再痹整嚏致尖炸垣砒垃诣鸭栅贪蚂考怒房鸵兰馏驴琶渍骇梁妇贪午泅赫话郑奠淤浚墨漱家巫铂耘揩捕粒讫障濒腔窖覆宿似瞳摄叶注椰述像征掘鼻长碴愧犯掘粮它钧卿独昨肾灌孟萍蓄然笺彬伙辨绳似疙谬睫蒜啦蜡佩裴栓操汕蔬糟览
教 案
姓名顾洪雁_ 2008-2009 学年第 2 学期 时间__4.20__ 节次__1-3__
课程名称
生物化学
授课专业及层次
07级临床医学本科7-8班
授课内容
第七章氨基酸代谢
学时数
3
教学目的
1. 了解蛋白质的营养作用
2. 了解蛋白质的消化,吸收与腐败
3. 熟悉体内蛋白质转换更新
4. 掌握氨基酸的脱氨基作用
5. 了解α-酮酸的代谢
重 点
氨基酸的脱氨基作用,蛋白质的营养作用
难 点
氨基酸的脱氨基作用
自学内容
使用教具
多媒体
相关学科知识
蛋白质结构与功能
教 学 法
1. 讨论法
2. 讲授法
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
第一节蛋白质的营养作用
一、 了解蛋白质营养的重要性
蛋白质是生命的物质基础,具有及其重要的生理作用:维持细胞,组织生长,更新,修补,以及催化,运输,代谢调节等作用。蛋白质也是能源物质。因此,蛋白质对正常代谢和各种生命活动的进行是十分重要。
一. 熟悉并理解蛋白质的需要量和营养价值
(一)氮平衡实验
蛋白质的含氮量平均约为16%,因此,机体内蛋白质代谢情况可根据氮平衡(nitrogen balance)来确定。
1, 氮的总平衡 摄入氮=排出氮 氮的“收支”平衡
2, 氮的正平衡 摄入氮>排出氮 部分摄入的氮用于合成体内蛋白质
3, 氮的负平衡 摄入氮<排出氮 蛋白质的需要量不足
(二) 生理需要量
成人每日最低需要30-50g蛋白质。营养学会推荐80g。
(三) 蛋白质的营养价值
人体内有8种氨基酸不能合成。这些体内需要而又不能自身合成,必需由食物供应的氨基酸,称为营养必需氨基酸(essential amino acid)。即:Val、Ile、Leu、Thr、Met、Lys、Phe、Trp。其余12种氨基酸体内可以合成,称非必需氨基酸.
蛋白质的营养价值取决于必需氨基酸的数量、种类、量质比。
指营养价值较低的蛋白质混合食用,其必需氨基酸可以互相补充而提高营养价值。称为蛋白质的互补作用
15min
15min
15min
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
第二节 蛋白质的消化,吸收与腐败
了解蛋白质的消化,吸收与腐败
(一)氨基酸吸收载体(二)γ-谷氨酰基循环对氨基酸的转运作用(三)肽的吸收
蛋白质的腐败作用:胺类(amines)的生成,氨的生成,(三)其它有害物质的生成
第三节 氨基酸的一般代谢
一. 熟悉体内蛋白质转换更新
真核生物中蛋白质的降解有两条途径 :
① 溶酶体内降解过程
② 依赖泛素(ubiquitin)的降解过程
二、 氨基酸的脱氨基作用
掌握(一)转氨基作用(transamination)
在转氨酶(transaminase)的作用下,某一氨基酸去掉α-氨基生成相应的α-酮酸,而另一种α-酮酸得到此氨基生成相应的氨基酸的过程。大多数氨基酸可参与转氨基作用,但赖氨酸、脯氨酸、羟脯氨酸除外。不同氨基酸与α-酮酸之间的转氨基作用只能由专一的转氨酶催化。L-谷氨酸与α-酮酸的转氨酶最为重要:GOT与GPT。血清转氨酶活性,临床上可作为疾病诊断和预后的指标之一。
(二)L-谷氨酸氧化脱氨基作用
催化酶:L-谷氨酸脱氢酶-•存在于肝、脑、肾中辅酶为 NAD+ 或NADP+,GTP、ATP为其抑制剂,GDP、ADP为其激活剂
(三)联合脱氨基作用
两种脱氨基方式的联合作用,使氨基酸脱下α-氨基生成α-酮酸的过程。
① 转氨基偶联氧化脱氨基作用
此种方式既是氨基酸脱氨基的主要方式,也是体内合成非必需氨基酸的主要方式。主要在肝、肾组织进行。
② 转氨基偶联嘌呤核苷酸循环
此种方式主要在肌肉组织进行。
三、α-酮酸的代谢
了解(一)经氨基化生成非必需氨基酸。(二)转变成糖及脂类。(三)氧化供能
15min
20min
25min
25min
20min
教 案
姓名 顾洪雁_ 2008-2009 学年 第 2 学期 时间_4.22_ 节次_5-7_
课程名称
生物化学
授课专业及层次
07级临床医学本科7-8班
授课内容
第七章氨基酸代谢
学时数
3
教学目的
1.了解血氨的来源与去路
2.熟悉并理解氨的转运
3.掌握尿素的生成
4.熟悉氨基酸脱羧基作用
重 点
尿素的生成
难 点
尿素的生成,氨基酸脱羧基作用
自学内容
使用教具
多媒体
相关学科知识
蛋白质结构与功能
教 学 法
1. 讨论法
2. 讲授法
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
第四节 氨 的 代 谢
一、 血氨的来源与去路
1. 血氨的来源
① 氨基酸脱氨基作用产生的氨是血氨主要来源, 胺类的分解也可以产生氨② 肠道吸收的氨③ 肾小管上皮细胞分泌的氨主要来自谷氨酰胺
了解血氨的来源与去路
2. 血氨的去路
① 在肝内合成尿素,这是最主要的去路② 合成非必需氨基酸及其它含氮化合物③ 合成谷氨酰胺④ 肾小管泌氨
二、 氨的转运
熟悉并理解氨的转运
1. 丙氨酸-葡萄糖循环(alanine-glucose cycle)
① 肌肉中氨以无毒的丙氨酸形式运输到肝② 肝为肌肉提供葡萄糖。
2. 谷氨酰胺的运氨作用
三、 尿素的生成
掌握鸟氨酸循环的限速酶
生成部位:主要在肝细胞的线粒体及胞液中。
了解鸟氨酸循环过程
1. 氨基甲酰磷酸的合成
•反应在线粒体中进行
CO2 + NH3 + H2O + 2ATP在氨基甲酰磷酸合成酶I(carbamoyl phosphate synthetaseⅠ, CPS-Ⅰ,N-乙酰谷氨酸为其激活剂,反应消耗2分子ATP)催化下生成氨基甲酰磷酸。
20min
20min
40min
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
2. 瓜氨酸的合成
鸟氨酸+氨基甲酰磷酸—瓜氨酸
反应在线粒体中进行,瓜氨酸生成后进入胞液
3. 精氨酸的合成
反应在胞液中进行。
瓜氨酸+天冬氨酸—精氨酸代琥珀酸—延胡索酸+精氨酸 —尿素+鸟氨酸
熟悉鸟氨酸循环原料,耗能。
原料:2 分子氨,一个来自于游离氨,另一个来自天冬氨酸。过程:先在线粒体中进行,再在胞液中进行。耗能:3 个ATP,4 个高能磷酸键。
熟悉尿素生成的调节:
(1)食物蛋白质的影响
(2)CPS-Ⅰ的调节:AGA、精氨酸为其激活剂
(3)尿素生成酶系的调节:精氨酸代琥珀酸合成酶是限速酶
了解高氨血症和氨中毒
血氨浓度升高称高氨血症 ( hyperammonemia),常见于肝功能严重损伤时,尿素合成酶的遗传缺陷也可导致高氨血症。高氨血症时可引起脑功能障碍,称氨中毒(ammonia poisoning)。
第五节 个别氨基酸的代谢
一、氨基酸脱羧基作用
熟悉氨基酸脱羧基作用
脱羧基作用(decarboxylation)
氨基酸在氨基酸脱羧酶催化下,以磷酸吡哆醛为辅酶,脱去羧基,生成胺类
(一)谷氨酸脱羧生成GABA:GABA是抑制性神经递质,对中枢神经有抑制作用。
(二)L-半胱氨酸先转变为牛黄丙氨酸然后脱羧生成牛黄酸:牛磺酸是结合胆汁酸的组成成分。
(三)组氨酸脱羧生成组胺:组胺是强烈的血管舒张剂,可增加毛细血管的通透性,还可刺激胃蛋白酶及胃酸的分泌。
(四)色氨酸先羟化为5-羟色氨酸最后脱羧生成5-羟色胺:5-HT在脑内作为神经递质,起抑制作用;在外周组织有收缩血管的作用。
(五)多胺:鸟氨酸和甲硫氨酸脱羧产生多胺。多胺是调节细胞生长的重要物质。在生长旺盛的组织(如胚胎、再生肝、肿瘤组织)含量较高,其限速酶鸟氨酸脱羧酶活性较强。
二、一碳单位的代谢
三、含硫氨基酸的代谢
四、芳香族氨基酸的代谢
五、支链氨基酸的代谢
35min
20min
15min
教 案
姓名 顾洪雁 2008-2009 学年 第 2 学期 时间_4.27_ 节次_1-3_
课程名称
生物化学
授课专业及层次
07级临床医学本科7-8班
授课内容
第八章 核苷酸代谢
第九章 物质代谢的联系和调节
学时数
3
教学目的
1. 掌握嘌呤核苷酸从头合成途径的部位,原料,限速酶和特点
2. 掌握嘌呤核苷酸分解的终产物
3. 掌握嘧啶核苷酸从头合成途径的部位,原料,限速酶和特点
4. 熟悉嘧啶核苷酸分解的终产物
5. 熟悉抗代谢物及其临床应用
6. 了解核苷酸的生理功能及脱氧核苷酸的生成
重 点
1. 嘌呤和嘧啶核苷酸从头合成途径的部位,原料,限速酶和特点
难 点
1.嘌呤和嘧啶核苷酸从头合成途径的部位,原料,限速酶和特点
2. 嘌呤和嘧啶核苷酸从头合成途径的调节
自学内容
使用教具
多媒体
相关学科知识
氨基酸代谢
教 学 法
1.讨论法 2.讲授法
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
第一节嘌呤核苷酸代谢
一 嘌呤核苷酸的合成代谢
(一)嘌呤核苷酸从头合成
1.从头合成途径
掌握IMP的合成的限速酶:磷酸核糖焦磷酸合成酶,磷酸核糖酰胺转移酶
掌握AMP和GMP的生成所需原料:天冬氨酸,CO2,甘氨酸,甲酰基(一碳单位),谷氨酰胺(酰胺基)。
2.从头合成的调节
掌握调节的方式
嘌呤核苷酸从头合成是体内提供核苷酸的主要来源.
PRPP合成酶和PRPP酰胺转移酶均可被合成产物IMP,AMP,GMP等抑制。反之,PRPP增加可以促进酰胺转移酶的活性,加速PRA生成。
在AMP和GMP形成过程中,过量的AMP控制AMP的生成,而不影响GMP的合成,同样,过量的GMP控制GMP的生成,而不影响AMP的合成。GMP促进AMP的生成,AMP促进GMP的生成。
(二)熟悉嘌呤核苷酸补救合成
利用体内游离的嘌呤或嘌呤核苷,经过简单的反应,合成嘌呤核苷酸的过程,称为补救合成(或重新利用)途径。参与补救合成的酶:腺嘌呤磷酸核糖转移酶(APRT),次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶( HGPRT),腺苷激酶(adenosine kinase)
补救合成的生理意义:补救合成节省从头合成时的能量和一些氨基酸的消耗。体内某些组织器官,如脑、骨髓等只能进行补救合成。
35min
15min
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
(三)了解嘌呤核苷酸的相互转变
(四)了解脱氧嘌呤核苷酸的生成
(五)熟悉嘌呤核苷酸的抗代谢物
嘌呤类似物
氨基酸类似物
叶酸类似物
6-巯基嘌呤
6-巯基鸟嘌呤
8-氮杂鸟嘌呤等
氮杂丝氨酸等
氨蝶呤
氨甲蝶呤等
二.嘌呤核苷酸的分解代谢
第二节 嘧啶核苷酸的代谢
一、嘧啶核苷酸的合成代谢
1.从头合成途径
掌握UMP的合成限速酶,掌握TMP和CMP的生成所需的原料
(1). 尿嘧啶核苷酸的合成
谷氨酰胺 + HCO3- 在氨基甲酰磷酸合成酶Ⅱ(消耗2ATP)的催化下生成谷氨酸 + 氨基甲酰磷酸,然后,经一系列的反应生成UMP
(2) 嘧啶核苷酸的合成
UTMP或TMP的生成
2.从头合成的调节
掌握调节方式
细菌中,天冬氨酸氨基甲酰转移酶是嘧啶核苷酸从头合成的主要调节酶。哺乳动物中,主要是氨基甲酰磷酸合成酶Ⅱ
PRPP合成酶是嘧啶与嘌呤两类核苷酸合成过程中共同需要的酶,它可同时接受嘧啶核苷酸及嘌呤核苷酸的反馈抑制。
(二)熟悉嘧啶核苷酸补救合成
(三)熟悉嘧啶核苷酸的抗代谢物
嘧啶类似物
氨基酸类似物
叶酸类似物
5-氟尿嘧啶等
氮杂丝氨酸等
氨蝶呤
氨甲蝶呤等
二 了解嘧啶核苷酸的分解代谢
第九章 物质代谢的联系和调节(自学)
10min
10min
30min
20min
30min
教 案
姓名 顾洪雁 2008-2009 学年 第 2 学期 时间_4.29_ 节次_5-7_
课程名称
生物化学
授课专业及层次
07级临床医学本科7-8班
授课内容
第十章DNA 的生物合成
学时数
3
教学目的
7. 掌握DNA三个基本复制规律
2. 掌握DNA复制过程中的酶和蛋白因子
3. DNA生物合成过程
重 点
1. DNA复制的基本规律2. DNA复制的酶和蛋白因子
难 点
DNA复制的拓扑学变化
自学内容
使用教具
多媒体
相关学科知识
基因组学,分子遗传学
教 学 法
1. 讨论法
2. 讲授法
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
首先讲基因和基因组学的基本概念 及信息传递的中心法则
第一节 复制的基本规律
一、 半保留复制:掌握半保留复制的概念
二、 双向复制
1.掌握复制叉的概念
生物复制时,DNA从起始点(origin)向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复制叉,称为双向复制。
2.原核生物:固定起始点(Ori),双向复制
3.真核生物:多起始点,双向复制
真核生物每个染色体有多个起始点,是多复制子的复制。
三、半不连续复制
理解并掌握领头链、随从链和冈崎片断的概念
•顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,这股链称为领头链。
•另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称为随从链。复制中的不连续片段称为岡崎片段(okazaki fragment)。
•领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的半不连续性。
第二节 DNA复制的酶学和拓扑学变化
一、DNA复制的化学反应
熟悉DNA复制所需的物质,理解DNA复制的化学本质
二、DNA聚合酶
掌握原核生物三种DNA聚合酶的活性和功能
DNA-pol Ⅰ:对复制中的错误进行校读,对复制和修复中出现的空隙进行填补。
小片段:5¢® 3¢核酸外切酶活性。大片段/Klenow 片段 :DNA聚合酶活性 ,3¢® 5¢核酸外切酶活性。DNA-pol Ⅱ:•DNA-pol II基因发生突变,细菌依然能存活。它参与DNA损伤的应急状态修复。DNA-pol Ⅲ:是原核生物复制延长中真正起催化作用的酶。具有5¢® 3¢聚合酶活性,3¢® 5¢外切酶活性
掌握α、β,γ,δ五种DNA聚合酶的活性和功能
15min
15min
15min
15min
25min
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
三、复制保真性的酶学依据
熟悉复制保真性机制
1. 遵守严格的碱基配对规律;2. 聚合酶在复制延长时对碱基的选择功能;3. 复制出错时DNA-pol的及时校读功能。
四、复制中解链和DNA分子拓扑学变化
掌握DNA复制过程中的一些酶和蛋白因子理解DNA复制的拓扑学变化和拓扑异构酶的作用特点,掌握DNA连接酶
解螺旋酶(helicase):利用ATP供能,作用于氢键,使DNA双链解开成为两条单链
引物酶(primase):复制起始时催化生成RNA引物的酶
单链DNA结合蛋白(single stranded DNA binding protein, SSB):在复制中维持模板处于单链状态并保护单链的完整
(二)DNA拓扑异构酶(DNA topoisomerase)
拓扑异构酶作用特点:既能水解 、又能连接磷酸二酯键
拓扑异构酶Ⅰ:切断DNA双链中一股链,使DNA解链旋转不致打结;适当时候封闭切口,DNA变为松弛状态。
反应不需ATP。
拓扑异构酶Ⅱ:切断DNA分子两股链,断端通过切口旋转使超螺旋松弛。利用ATP供能,连接断端, DNA分子进入负超螺旋状态。
五、DNA连接酶
连接DNA链3/-OH末端和相邻DNA链5/-P末端,使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相邻的DNA链连接成一条完整的链
第三节DNA生物合成过程
一 原核生物的DNA生物合成
(一)熟悉原核生物的DNA复制起始
1. DNA解开成单链,提供模板。2. 合成引物,提供3/-OH末端。
E.coli有一个固定的复制起始点,称为oriC.包括三组串联重复序列(识别区)和两对反向重复序列(富含AT区)。DnaA蛋白辨认并结合于串联重复序列,可促进AT区的DNA进行解链。DnaB蛋白在DnaC蛋白的协同下,结合和沿解链方向移动,使双链解开足够用于复制的长度,并逐步置换出DnaA蛋白。此时,复制叉已初步形成。SSB此时也参与进来。DnaB蛋白,DnaC蛋白,DNA的复制起始区,引物酶形成引发体。DNA拓扑异构酶也参入进来。
(二)熟悉原核生物的DNA复制的延长
复制的延长指在DNA-pol催化下,dNTP以dNMP的方式逐个加入引物或延长中的子链上,其化学本质是磷酸二酯键的不断生成。
领头链是连续延长,随从链是分为岡崎片段延长,在同一复制叉上,领头链的复制先于随从链,两链是在同一DNA-pol Ⅲ酶的催化下进行。
(三)熟悉原核生物的DNA复制的终止
原核生物基因是环状DNA,双向复制的复制片段在复制的终止点(ter)处汇合。
引物的水解靠细胞核内的RNA酶,留下的空隙,空隙填补由DNA-polⅠ催化,填补至足够长度后,留下3/-OH末端和相邻DNA链5/-P末端之间缺口由连接酶连接。
二 真核生物的DNA生物合成
了解真核生物的DNA生物合成
细胞能否分裂,决定于进入S期及M期这两个关键点。G1→S及G2→M的调节,与蛋白激酶活性有关。 蛋白激酶通过磷酸化激活或抑制复制因子而实施调控作用。
15min
20min
15min
15min
教 案
姓名 顾洪雁 2008-2009 学年 第 2 学期 时间__5.4_ 节次_1-3_
课程名称
生物化学
授课专业及层次
07级临床医学本科7-8班
授课内容
第十章DNA 的生物合成
第十一章RNA 的生物合成
学时数
3
教学目的
1.熟悉DNA损伤与修复
2.掌握转录的模板和酶3.掌握原核生物转录起始的特点,
重 点
1. DNA损伤与修复2.转录的模板和酶3.原核生物转录起始的特点
难 点
转录的模板和酶
自学内容
滚环复制,D环复制
使用教具
多媒体
相关学科知识
基因组学,分子遗传学
教 学 法
1. 讨论法
2. 讲授法
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
三 复制的终止和端粒酶
熟悉端粒的复制和端粒酶
第四节 逆转录和其他复制方式
掌握逆转录概念,逆转录酶作用机制,意义
从单链RNA到双链DNA的生成可分为三:首先是逆转录酶以病毒基因组RNA为模板催化dNTP聚合生成DNA互补链,产物是RNA/DNA杂化双链。然后,杂化双链中的RNA链被逆转录酶中有Rnase活性的组分水解,被感染细胞内的RnaseH也可水解RNA链。RNA分解后剩下的单链DNA再用作模板,由逆转录酶催化合成第二条DNA互补链。逆转录酶有三种活性:RNA或DNA作模板的dNTP聚合活性和Rnase活性,合成反应也按照5¢® 3¢延长的规律。
自学滚环复制和D环复制
第五节 DNA损伤与修复
熟悉DNA损伤的相关概念,种类
传物质的结构改变而引起的遗传信息改变,均可称为突变。
从分子水平来看,突变就是DNA分子上碱基的改变。
在复制过程中发生的DNA突变称为DNA损伤(DNA damage)。
一、突变的意义
突变是进化、分化的分子基础。突变导致基因型改变。突变导致死亡。突变是某些疾病的发病基础
三、突变的分子改变类型
错配 (mismatch),缺失 (deletion),插入 (insertion) 重排 (rearrangement)
四.修复:熟悉DNA修复的概念,种类,机制
光修复(light repairing)
切除修复(excision repairing) 是细胞内最重要和有效的修复机制,主要由DNA-polⅠ和连接酶完成。
重组修复(recombination repairing)
SOS修复:当DNA损伤广泛难以继续复制时,由此而诱发出一系列复杂的反应。
15min
35min
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
转录的概念,复制与转录的异同
第一节 转录的模板和酶
一、转录模板
了解转录的不对称性,模板链和编码链的概念
转录和复制有许多相似之处:都是酶促的核苷酸聚合过程;都以DNA为模板;都需要依赖DNA的聚合酶;聚合过程都是核苷酸之间生成磷酸二脂键;都从5/至3/方向延伸聚核苷酸链;都遵从碱基配对规律。
复制和转录的区别:
复制 转录
模板 两股链均复制 模板链转录(不对称转录)
原料 dNTP NTP
酶 DNA聚合酶 RNA聚合酶
产物 子代双链DNA(半保留复制) mRNA tRNA rRNA
配对 A-T G-C A-U T-A G-C
二、RNA聚合酶
1. 原核生物的RNA聚合酶组成亚基及功能
α 2 决定哪些基因转录
β 1 与转录全过程有关(催化)
β/ 1 结合DNA模板(开链)
б 1 辨认起始点
2. 真核生物的RNA聚合酶分类及其产物
种类 Ⅰ Ⅱ Ⅲ
转录产物 45s-rRNA hnRNA 5s-rRNA tRNA snRNA
对鹅膏蕈碱的反应 耐受 极敏感 中度敏感
三、理解模板与酶的辨认结合
原核生物一个转录区段可视为一个转录单位,称为操纵子(operon),包括若干个结构基因及其上游(upstream)的调控序列。RNA聚合酶结合模板DNA的部位,称为启动子 (promoter)。
第二节 转录过程
一、原核生物的转录过程
(一)转录起始:理解转录起始的事件
1. RNA聚合酶全酶(α2ββ/б)与模板结合。2. DNA双链解开。3. 在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成转录起始复合物
转录起始复合物:RNApol (α2ββ/б) - DNA - pppGpN- OH 3/
(二)DNA转录延长:了解转录延长的特点
1. б亚基脱落,RNA–pol聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着DNA模板前移;2. 在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链不断延长。
(三)转录终止:掌握转录终止的两种方式
1.依赖Rho (ρ)因子的转录终止:Rho因子有ATP酶和解螺旋酶的活性, Rho因子识别结合RNA3/末端的polyC,结合后Rho因子和RNA聚合酶发生变构,从而使RNA聚合酶停顿,解螺旋酶的活性使DNA/RNA杂化双链拆离,利于产物从转录复合物中释放。
2. 非依赖 Rho因子的转录终止:DNA模板上靠近终止处,有些特殊的碱基序列,转录出RNA后,RNA产物形成特殊的结构来终止转录。
茎环结构使转录终止的机理:使RNA聚合酶变构,转录停顿;使转录复合物趋于解离,RNA产物释放。
25min
25min
25min
25min
教 案
姓名 顾洪雁 2008-2009 学年 第 2 学期 时间_5.6_ 节次_5-7__
课程名称
生物化学
授课专业及层次
07级临床医学本科7-8班
授课内容
第十一章RNA 的生物合成
学时数
3
教学目的
1.转录起始
2.熟悉真核生物的转录后修饰
3.转录终止,转录后修饰
重 点
1. 原核转录终止 2.真核生物转录后修饰
难 点
真核生物转录起始,mRNA的剪接
自学内容
拼版理论, RNA的转录后加工
使用教具
多媒体
相关学科知识
基因组学,分子遗传学
教 学 法
1. 讨论法2. 讲授法
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
回忆上次内容
二、真核生物的转录过程
(一)转录起始
掌握真核转录起始的特点
真核生物的转录起始上游区段比原核生物多样化,转录起始时,RNA-pol不直接结合模板,其起始过程比原核生物复杂。
1.顺式作用元件:DNA分子上具有的可影响转录的各种组分。
2. 转录因子
能直接、间接辨认和结合转录上游区段DNA的蛋白质,现已发现数百种,统称为反式作用因子(trans-acting factors)。
反式作用因子中,直接或间接结合RNA聚合酶的,则称为转录因子
3. 转录起始前复合物(pre-initiation complex, PIC)
真核生物RNA-pol不与DNA分子直接结合,而需依靠众多的转录因子。
首先由在TFⅡD的TAF搭配下,TFⅡD的TBP亚基结合TATA,同时,在TFⅡA和TFⅡB的促进下.形成TFⅡD-A-B-DNA复合体。TFⅡB作为桥梁并提供结合表面,使已与TFⅡF结合的RNA-polⅡ进入启动子的核心区TATA,接着TFⅡE加入,最后,TFⅡH参入。
(二)转录延长
真核生物转录延长过程与原核生物大致相似,但因有核膜相隔,没有转录与翻译同步的现象。 RNA-pol前移处处都遇上核小体。转录延长过程中有核小体移位和解聚现象
(三)转录终止:理解转录终止与转录后修饰的联系
第三节 真核生物的转录后修饰
10min
25min
25min
15min
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
一,真核生物mRNA的转录后加工
了解首,尾的修饰
5/端形成 帽子结构(m7GpppGp —)。3/端加上多聚腺苷酸尾巴(poly A tail)
(二)mRNA的修饰:掌握断裂基因,外显子,内含子的概念及内含子的分类
断裂基因(split gene):真核生物结构基因,由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质,这些基因称为断裂基因。
•外显子:在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表达为成熟RNA的核酸序列。
•内含子:隔断基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列。
I:主要存在于线粒体、叶绿体及某些低等真核生物的 rRNA基因;
II:也发现于线粒体、叶绿体,转录产物是mRNA;
III:是常见的形成套索结构后剪接,大多数mRNA基因有此类内含子;
IV:是tRNA基因及其初级转录产物中的内含子,剪接过程需酶及ATP。
掌握mRNA剪接过程
通过二次转脂反应除去hnRNA中的内含子,将外显子连接。
二,tRNA的转录后加工
熟悉,tRNA的剪接和稀有碱基的修饰
tRNA的剪接
tRNA的稀有碱基的修饰
甲基化,还原反应,核苷酸内的转位反应,脱氨反应,加上CCA-OH的3/-末端
三,rRNA的转录后加工
自学
四,核酶:了解核酶的结构特点,核酶的作用机理,核酶的意义
具有酶促活性的RNA称为核酶。除rRNA外,tRNA、mRNA的加工也可采用自我剪接方式。 最简单的核酶二级结构——槌头状结构(hammerhead structure)
通常为60个核苷酸左右,同一分子上包括有催化部份和底物部份,催化部份和底物部份组成锤头结构,至少还有三个茎,一至三个环。碱基至少有13个是一致性序列。
核酶研究的意义:
核酶的发现,对中心法则作了重要补充;
核酶的发现是对传统酶学的挑战;
利用核酶的结构设计合成人工核酶 。
20min
15min
20min
20min
教 案
姓名 顾洪雁_ 2008-2009 学年 第 2 学期 时间_5.11_ 节次_1-3 _
课程名称
生物化学
授课专业及层次
07级临床医学本科7-8班
授课内容
第十二章蛋白质的翻译
学时数
3
教学目的
1.掌握遗传密码
2.掌握并理解原核与真核翻译起始
3.掌握原核与真核翻译延长,终止
4.了解多肽链的折叠,蛋白质的靶向输送,
5.熟悉一级结构的修饰,空间结构修饰,蛋白生物合成的干扰和抑制
重 点
原核与真核翻译起始
难 点
肽链的延长,多肽链的折叠,蛋白质的靶向输送
自学内容
线粒体蛋白的靶向输送,核蛋白的靶向输送
使用教具
多媒体
相关学科知识
蛋白质组学,分子遗传学,细胞生物学
教 学 法
1. 讨论法2. 讲授法
讲授内容纲要、要求及时间分配(可加附页)
第十二章蛋白质的翻译
第一节 蛋白质的生物合成体系
一、翻译模板mRNA及遗传密码
1.理解单顺反子与多顺反子。2.掌握遗传密码概念
mRNA分子上从5/至3/方向,由AUG开始,每3个核苷酸为一组,决定肽链上
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