Xtile软件的操作作业流程.docx

Xtile 软件操作步骤 因为最近在做某基因表示和预后相关性分析，对怎样选择最好cutoff值很迷惑。搜了丁香园各大帖子，发觉对x-tile怎样使用并没有些人分享过。经过对照软件中操作说明，最终搞明白是怎么回事了，现分享给大家！ 首先，将你excel表格中“某基因表示值”“生存期”“删失情况”等等其它部分数据复制到文本文档中。注意：“删失情况”要写成“censored”, “uncensored”, or “unknown” 形式。 然后打开软件（软件下载见附件），图点击“Analyze进入下图：点击“file-open打开刚建“txt”文本，接着就能够进行设置了。以下图扩大来看！（下图）将“删失情况” 即图中DOD-censor,放入”censor”中， 然后将“inter type” 改为”DeadOfDiese”；将“生存期”即图中”Followup-months”放入“Survival Time”,j将“inter type” 改为你所用时间度量，如“天”或“年”；将“表示量”即图中”HER2”放入“Marker1”, Mark2假如没有能够不填。剩下也能够不填。然后点左上角“do”，选择”Kaplan-Meier”“Marker1”.即可。接着会出现下图所表示结果。鼠标左键点击“2Pop X-tile Plot”所指矩形图，软件会自动找到最好cutoff值，得到两条线（两组：高表示低表示）。鼠标左键点击“3Pop X-tile Plot”所指三角形，软件会自动找到最好cutoff值，得到三条线（三组：高表示中度表示低表示）。条形图下X轴所指数值即是最好cutoff值。其它能够参考软件里指南。写比较业余，期望能够给大家部分帮助。