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基于网络药理学和分子对接技术探究珍珠烧伤膏辅助缓解疼痛的作用机制.pdf

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资源描述

1、106DOl:10.16720/ki.tcyj.2022.152Special Wild Economic Animal and Plant Research特产研究基于网络药理学和分子对接技术探究珍珠烧伤膏辅助缓解疼痛的作用机制宋欣宏1,尚禹东2,初孟瑶1,程立业1,艾长山2,陈长宝1,王恩鹏1(1.长春中医药大学吉林省人参科学研究院,吉林长春130 117;2.长春科技学院鹿茸科学与产品技术研究所,吉林长春130 0 0 0)摘要:本研究利用网络药理学结合分子对接技术,研究珍珠烧伤膏辅助缓解疼痛作用机制。利用中药系统网络药理学数据库和分析平台(TCMSP)挖掘烧伤膏中金银花、紫草、甘草、当

2、归、黄芩和白芷的成分及作用靶点。通过UniProt等数据库查询靶点对应的基因,进一步通过Cytoscape3.8.2构建化合物一靶点(基因)网络。利用DrugBank数据库和GeneCards数据库检索疼痛的潜在靶点;采用蛋白质相互作用网络数据库(String)进行蛋白相互作用分析,通过Cytoscape3.8.2软件构建蛋白相互作用网络;运用Metascape数据库对关键靶点进行基因本体GO富集分析和KEGG通路富集分析,探究珍珠烧伤膏辅助缓解疼痛的作用机制;采用AutoDock分子对接软件对活性成分与关键辅助缓解疼痛靶点进行验证。通过筛选得到珍珠烧伤膏复方中药的156 种活性成分和2 45

3、个潜在作用靶点;GO功能富集分析得到生物过程(BP)条目2 38 个、细胞组成(CC)条目36 个和分子功能(MF)条目57 个;KEGG通路富集分析筛选得到2 0 0 条信号通路,主要涉及癌症相关通路、PI3K-Akt信号通路、HepatitisC信号通路、MAPK信号通路和TNF信号通路等;分子对接结果表明,主要活性成分与IL6、A K T 1、T NF和TP53均有较强的结合能力,其中皮素、木犀草素、汉黄芩素和山奈酚为最强的有效成分。珍珠烧伤膏主要通过调节皮肤细胞的无机物质反应、对异种刺激的反应及对细胞氮化合物反应等来辅助缓解疼痛,该研究进一步证明了烧伤膏可通过多靶点、多通路发挥缓解疼痛

4、的作用,初步阐明了珍珠烧伤膏辅助缓解疼痛的作用机制。关键词:网络药理学;分子对接;烧伤;缓解疼痛;分子机制中图分类号:R285Exploration on the Mechanism of Zhenzhu Burn Ointment in AssistingPain Relief Based on the Network Pharmacology and Molecular文献标识码:ADocking Technology文章编号:10 0 1-47 2 1(2 0 2 3)0 5-0 10 6-10SONG Xinhongl,SHANG Yudong,CHU Mengyaol,CHENG L

5、iyel,AI Changshan?,CHEN Changbaol*,WANG Enpengl*(1.Jilin Ginseng Academy,Changchun University of Chinese Medicine,Changchun 130117,China;2.Institute of AntlerScience and Product Technology,Changchun Sci-Tec University,Changchun 130000,China)Abstract:The study to determine the mechanism of Zhenzhu Bu

6、rn Ointment in pain relief.The composition and action targets of honeysu-ckle,herb,licorice,Angelica,baicalensis and angelica in burn ointment were excavated using the TCM network pharmacology database andanalysis platform(TCMSP).Query the genes corresponding to the target sites through UniProt and

7、other databases,and then the Cyto-scape3.8.2 was used to build a compound-target site(gene)network.Using the DrugBank database and GeneCards database,protein inter-action network database(String),protein interaction network constructed by Cytoscape 3.8.2 software;Metascape database to perform geneon

8、tology GO enrichment analysis and KEGG pathway enrichment analysis to explore the mechanism of Zhenzhu Burn Ointment assistedpain relief,and AutoDock molecular docking software to verify the results of active components and key auxiliary pain relief targets.156active ingredients of Zhenzhu Burn Oint

9、ment were selected,245 potential action targets;The GO functional enrichment analysis yielded收稿日期:2 0 2 2-0 6-2 1基金项目:长春市科技创新“双十工程”项目(19SS017、2 1ZG Y10);吉林省科技发展计划项目(2 0 190 30 40 99YY、2 0 2 0 0 40 40 42 YY、20210401108YY)作者简介:宋欣宏(1995-),女,吉林临江人,在读硕士,从事药物分析研究。通讯作者:王恩鹏,男,吉林长春人,博士,副研究员,硕士研究生导师,从事中药化学研究。

10、第5期238 entries for the biological process(BP),cellcomposition(CC)with 36 entries,molecular function(MF)has 57 entries;KEGG pathwayenrichment analysis selected 200 signal pathways mainly involving cancer-related pathway,PI3K-Akt signaling pathway,hepatitis C signa-ling pathway,MAPK signaling pathway,

11、and TNF signaling pathway;The molecular docking results showed that the main active compon-ents all have a strong binding capacity with IL6,AKT1,TNF and TP53.Among them,quercetin,luteolin,baicalein and kaempferol werethe four strongest binding active components.Zhenzhu Burn Ointment mainly by regula

12、ting the inorganic material response of skin cells,response to different stimuli,response to cell nitrogen compounds to assist to relieve pain,the study further proved that Burn Ointment canplay the role of multiple targets,multiple ways to relieve pain,the results could help relieve the role mechan

13、ism of Zhenzhu Burn Ointmenresearch to provide ideas and references.Key words:network pharmacology;molecular docking;empyrosis;pain relief;molecular mechanism烧烫伤是一种临床上常见的疾病,一旦发生会给患者带来极大的身心伤害,严重的威胁着人类的健康1。烫伤的损伤一般发生在体表,但反应在全身,烫伤愈重,反应愈烈2 。烫伤会破坏皮肤天然屏障,导致血液循环障碍甚至丧失血液灌注,同时造成局部营养缺乏,全身免疫力下降,为细菌入侵提供便利条件3。创面感

14、染发病急、进展快,持续恶化可引起脓毒症(Sepsis)、脓毒性休克(Septic shock)、多器官功能障碍综合征(MODS),甚至死亡4。珍珠烧伤膏是一种治疗烧烫伤的医疗机构制剂,历经2 0 余年40 余万例患者的应用,具有良好的临床疗效和安全性,具备较好的开发价值和市场前景。珍珠烧伤膏具有祛腐排脓、修复组织、生肌敛口、增强免疫、清热解毒、活血祛瘀和消肿止痛的功效5,6 ,方中有黄芩、当归、紫草、白芷、甘草和金银花等药味,诸药相配,可以在烧烫伤治疗过程中,起到辅助缓解疼痛的作用7 。网络药理学(Network pharmacology)是基于大数据的分析平台,通过筛选中药中有效化合物成分,

15、结合相关数据库中疾病的相关信息,筛选出药物作用于疾病的靶点及机制网络,对药物作用及机制的相关数据进行挖掘,直观反映药物与疾病的关联程度8,9,随着生物信息学的快速发展,网络药理学已成为中医药探索的有力工具10,1。分子对接是一项可以利用Auto-Dock及PyMOL等软件来模拟配体和受体结合的技术,通过分析其结合能力的大小,从而对网络药理学结果进行初步验证12 。本研究主要通过网络药理学的方法预测出珍珠烧伤膏辅助缓解疼痛的有效成分、关键靶点及信号通路,然后利用分子对接的方法进行初步验证,为后续研究提供参考。1材料及方法1.1楼数据库及软件TCMSP(https:/old.tcmsp- Tool

16、s 1.5.7;PyMOL 2.3.2.1.2珍珠烧伤膏活性成分筛选通过TCMSP数据库以金银花、黄芩、白芷、紫草、当归和甘草等为关键词检索化学成分,以药代动力学参数(ADME)为依据13,由于珍珠烧伤膏为外用药,因此,不将口服生物利用度列为筛选条件,仅将类药性DL0.18设为筛选条件,过滤获得烧伤膏的止疼活性成分作为研究对象。1.3珍珠烧伤膏活性成分作用靶点获取通过TCMSP数据库得到1.2 中活性成分对应的靶标蛋白,将靶标蛋白通过UniProt数据库检索查询其对应的基因名称。1.4珍珠烧伤膏辅助缓解疼痛的潜在靶点预测在DrugBank 数据库、GeneCards 数据库输入“pain14检

17、索获得疼痛的作用靶点。使用Venny2.1.0(https:/b.csic.es/)云平台中的维恩图软件将药物预测的靶点与疾病的靶点进行映射,获得珍珠烧伤膏辅助缓解疼痛的潜在作用靶点。1.5构建“药物-活性成分一靶点基因-疾病 网络将中药材、活性成分及1.4项下所得的疼痛潜在作用靶点导入Cytoscape3.8.2软件,构建“药物一活性成分一靶点基因一疾病”网络图,分析网络拓扑性质,采用“Network analyzer插件进行数据处理。1.6蛋白相互作用网络构建将1.4项下潜在靶点导入STRING数据库,勾选multiple proteins,物种选择Homo sapines,构建蛋白相互作

18、用(PPI)关系图。另外将得到的数据用tsv的格式导入Cytoscape3.8.2软件,运用Cytoscape软件中Cy-toNVA插件的betweenness功能,计算网络的介数中心性。1.7生物通路富集分析利用Metascape数据库(https:/metascape.org)对1.4中获得的共同靶点进行基因本体(gene ontology,107STRING(https:/cn.string-db.org/);Metascape(https:/lmetascape.org/);Cytoscape 3.8.2;OpenBabel 3.1.1;108GO)功能富集分析,包括生物过程(Biol

19、ogical process,BP)、细胞组成(Cell composition,CC)、分子功能(Mol-ecularfunction,M F),各筛选前10 条重要通路,用微生信在线网站(http:/)绘制柱状图。同样在该数据库上进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,设置P-value0.01,筛选前2 0 条重要通路制作气泡图。最后将上述得到的靶点、通路导入Cytoscape3.8.2,得到靶点一通路网络图。1.8核心活性成分一关键作用靶点分子对接从PubChem数据库中获取1.5中筛选出来的

20、核心活性成分的三维结构并保存为SDF文件,用Open-Babel3.1.1将核心活性成分转化为PDB文件,再由AutoDockTools1.5.7转化为PDBQT文件;另从RCSBPDB数据库中获取从1.6 中筛选出来的关键靶蛋白的晶体结构并保存为PDB文件,用PyMOL2.3.2软件去除关键靶蛋白晶体中的水分子并加极性氢,去除活性中心的原配体,将处理后的关键靶蛋白保存为PDB文件,再通过AutoDockTools1.5.7软件转化为PDBQT文件,通过AutoDockTools1.5.7软件对处理完的核心活性成分和关键靶蛋白进行对接模拟,最后利用PyMOL2.3.2软件作出分子对接图,以直观

21、展示分子对接的结合模式。2结果2.1珍珠烧伤膏活性成分的筛选通过TCMSP数据库,设定DL0.18,筛选出符合条件的化合物,检索到黄芩有效成分36 个,当归2个,金银花2 3个,紫草12 个,白芷2 2 个,甘草92 个,筛选去除共有成分,共计156 个(表1)。表1珍珠烧伤膏化合物基本信息Table 1 Compounds basic information of Zhenzhu BurnOintment编号有效成分No.Active ingredientA1Beta-sitosterolA2StigmasterolB1MandenolBZ1AlloisoimperatorinBZ10Sen

22、-byakangelicolBZ11CLRBZ12ZINC03860434BZ13Phellopterin特产分子编号MOL IDMOL000358MOL000449MOL001494MOL001939MOL005807MOL000953MOL001749MOL002644研编号No.BZ14BZ15BZ16BZ17BZ2BZ3BZ4BZ5BZ6(5-2(R)-Hydroxy-3-methyl-3-butenyl-BZ7oxylfurocoumarin)BZ8Byakangelicol4-(2S)-2,3-dihydroxy-3-methylbutoxyBZ9furo3,2-glchromen

23、-7-oneC1Eriodyctiol(flavanone)D1KaempferolD2QuercetinE1SitosterolGC1InermineGC10FormononetinGC11CalycosinGC12Naringenin(2S)-2-4-hydroxy-3-(3-methylbut-2-enyl)GC13phenyl-8,8-dimethyl-2,3-dihydropyrano2,3-fchromen-4-oneGC14EuchrenoneGC15Glyasperin BGC16Glyasperin FGC17Glyasperin CGC18Isotrifoliol(E)-1

24、-(2,4-dihydroxyphenyl)-3-(2,2-dimet-GC19hylchromen-6-yl)prop-2-en-1-oneGC2GC20(2S)-6-(2,4-dihydroxyphenyl)-2-(2-hydro-GC21xypropan-2-yl)-4-methoxy-2,3-di-hydrofuro3,2-gchromen-7-oneGC22Semilicoisoflavone BGC23Glepidotin AGC24Glepidotin BGC25Phaseolinisoflavan究Active ingredientPrangenidinLinolein,2-m

25、ono-Methyl icosa-11,14-dienoatePrangeninAmmidinIsoimperatorinCnidilinEthyl oleate(NF)NeobyakangelicolDFVKanzonols w2023年第45卷第5期有效成分分子编号MOLIDMOL003588MOL003791MOL007514MOL013430MOL001941MOL001942MOL001956MOL002883MOL005789MOL005792MOL005800MOL005806MOL002914MOL000422MOL000098MOL000359MOL001484MOL0003

26、92MOL000417MOL004328MOL004805MOL004806MOL004808MOL004810MOL004811MOL004814MOL004815MOL001792MOL004820MOL004824MOL004827MOL004828MOL004829MOL004833第5期续表编号No.GC268-(6-hydroxy-2-benzofuranyl)-2,2-dimet-GC27GC28GC29GC33-(2,4-dihydroxypheny)-8-(1,1-dimethyl-GC30prop-2-enyl)-7-hydroxy-5-methoxy-cou-GC31GC

27、32GC333-(3,4-dihydroxyphenyl)-5,7-dihydroxy-8-GC34(3-methylbut-2-enyl)chromone5,7-dihydroxy-3-(4-methoxyphenyl)-8-(3-GC35methylbut-2-enyl)chromone2-(3,4-dihydroxyphenyl)-5,7-dihydroxy-6-GC36(3-methylbut-2-enyl)chromoneGC37GlycyrinGC38LicocoumaroneGC39LicoisoflavoneGC4GlycyrolGC40Licoisoflavone BGC41

28、LicoisoflavanoneGC42Shinpterocarpin(E)-3-3,4-dihydroxy-5-(3-methylbut-2-GC43enyl)phenyll-1-(2,4-dihydroxyphenyl)prop-2-en-1-oneGC44LiquiritinGC45LicopyranocoumarinGC46GlyzaglabrinGC47GlabridinGC48GlabraninGC49GlabreneGC5JaranolGC50Glabrone1,3-dihydroxy-9-methoxy-6-benzofuranoGC513,2-cchromenone1,3-d

29、ihydroxy-8,9-dimethoxy-6-benzofur-GC52ano3,2-clchromenoneGC53Eurycarpin A宋欣宏,等:基于网络药理学和分子对接技术探究珍珠烧伤膏辅助缓解疼痛的作用机制有效成分Active ingredientGlypallichalconeHyl-5-chromenolLicochalcone BLicochalcone GMairinmarinLicoriconeGancaonin AGancaonin B109编号有效成分分子编号No.MOLIDGC54MOL004835GC55MOL004838(2R)-7-hydroxy-2-(4

30、-hydroxyphenyl)chro-GC56MOL004841(2S)-7-hydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)-8-MOL004848GC57MOL000211GC58GC59MOL004849GC6MOL004855GC60MOL004856GC61MOL004857GC62GC63MOL004863GC64GC65MOL0048642-(3R)-8,8-dimethyl-3,4-dihydro-2H-GC66pyrano6,5-flchromen-3-yll-5-methox-MOL004866MOL004879MOL004882MOL004883MOL002311

31、MOL004884MOL004885MOL004891MOL004898MOL004903MOL004904MOL004907MOL004908MOL004910MOL004911MOL000239MOL004912MOL004913MOL004914MOL004915分子编号Active ingredientMOLID(-)-MedicocarpinMOL004924Sigmoidin-BMOL004935MOL004941man-4-oneMOL004945(3-methylbut-2-enyl)chroman-4-oneIsoglycyrolIsolicoflavonolMedicarp

32、inHMO1-MethoxyphaseollidinQuercetin der.3-Hydroxy-4-O-MethylglabridinLicochalcone a3-MethoxyglabridinyphenolGC67Inflacoumarin AGC68Icos-5-enoic acidGC69Kanzonol FGC7IsorhamnetinGC706-prenylated eriodictyol7,2,4-trihydroxy-5-methoxy-3-ar-GC71GC72GC73GC74GC75GC76GC77GC78GC79GC8GC80GC81GC82GC83GC84GC85

33、GC9MOL004948MOL004949MOL002565MOL004957MOL004959MOL004961MOL004966MOL000497MOL004974MOL004978MOL004980MOL004985MOL004988MOL000354MOL004989MOL004990ylcoumarin7-Acetoxy-2-methylisoflavone8-prenylated eriodictyolGadelaidic acidVestitolGancaonin GGancaonin HLicoagrocarpinGlyasperins MLupiwighteoneGlycyr

34、rhiza flavonol ALicoagroisoflavoneOdoratinPhaseolXambioonaDehydroglyasperinsC7-Methoxy-2-methyl isoflavoneMOL004991MOL004993MOL004996MOL000500MOL005000MOL005001MOL005003MOL005007MOL003656MOL005008MOL005012MOL005016MOL005017MOL005018MOL005020MOL003896110续表编号No.HQ1HQ10HQ11HQ12HQ13HQ14HQ15HQ16HQ17HQ185

35、,2-Dihydroxy-6,7,8-trimethoxyflavoneHQ19HQ2HQ20Bis(2S)-2-ethylhexyll benzene-1,2-dicar-HQ21HQ22HQ23HQ24HQ2511,13-Eicosadienoic acid,methyl esterHQ265,7,4-trihydroxy-6-methoxyflavanoneHQ275,7,4-trihydroxy-8-methoxyflavanoneHQ28(2R)-7-hydroxy-5-methoxy-2-phenylchro-HQ3HQ45,7,2,5-tetrahydroxy-8,6-dimet

36、hoxyflav-HQ5HQ6HQ7HQ8HQ95,2,6-Trihydroxy-7,8-dimethoxyflavoneJYH1JYH10JYH11(beta-D-glucopyranosyloxy)-2,3,9,9a,JYH210,10a-hexahydro-5-oxo-5H,8H-pyrano4,3-doxazolo3,2-alpyridine-3-carboxy-JYH3Secologanic dibutylacetal_qtJYH4Beta-carotene特产有效成分分子编号Active ingredientMOL IDAcacetinMOL0016895,7,2,6-Tetrah

37、ydroxyflavoneMOL002925Skullcapflavone IIMOL002927Oroxylin aMOL002928PanicolinMOL0029325,7,4-Trihydroxy-8-methoxyflavoneMOL002933NEOBAICALEINMOL002934DIHYDROOROXYLINMOL002937NorwogoninMOL000525MOL000552Ent-EpicatechinMOL000073WogoninMOL000173CoptisineMOL001458MOL001490boxylateDiopEpiberberineMoslosoo

38、flavoneRivularinman-4-oneBaicaleinoneCarthamidinDihydrobaicalin_qtSalvigeninEthyl linolenateDinethylsecologanosideLuteolin(-)-(3R,8S,9R,9aS,10aS)-9-ethenyl-8-lic acid_qt研编号No.JYH5JYH6JYH7JYH8JYH9ZC1ZC2(1R)-1-(5,8-dihydroxy-1,4-dioxo-2-nap-ZC3hthyl)-4-methyl-pent-3-enyll propanoateZC4ZC5ZC6ZC7ZC8MOL0

39、02879MOL002897MOL008206MOL010415MOL012245MOL012246MOL012266MOL000228MOL002714MOL002909MOL002910MOL002913MOL002915MOL002917MOL001495MOL003128MOL000006MOL003006MOL003014MOL002773究Active ingredientZINC03978781Chryseriol5-hydroxy-7-methoxy-2-(3,4,5-trimet-hoxyphenyl)chromoneCentauroside_qtIoniceracetali

40、des B_qtEthyl oleate(NF)1-methoxyacetylshikoninAcetylshikoninIsoarnebin 4Lithospermidin A5-(E)-5-(3-furyl)-2-methyl-pent-2-enyl-2,3-dimethoxy-p-benzoquinoneLithospermidin B2.2珍珠烧伤膏活性成分作用靶点通过UniProt数据库检索到黄芩潜在作用靶点92个,当归潜在作用靶点40 个,金银花潜在作用靶点17 4个,紫草潜在作用靶点13个,白芷潜在作用靶点44个,甘草潜在作用靶点191个,去除重复靶点,共计2 45个。2.3珍珠

41、烧伤膏辅助缓解疼痛的潜在靶点通过DrugBank数据库、GeneCards数据库输入“pain检索、筛查并整合后获得疼痛的作用靶点16 6 7个。使用 Venny 2.1.0(https:/b.csic.es/)云平台中的维恩图软件将珍珠烧伤膏预测的靶点与疼痛的靶点进行映射,获得珍珠烧伤膏辅助缓解疼痛的潜在作用靶点149个(图1)。compound96(5.4%)图1珍珠烧伤膏缓解疼痛潜在靶点维恩图Fig.1 Venn diagram of a potential target for pain relief fromZhenzhu Burn Ointment2023年第45卷第5期有效成分分

42、子编号MOL IDMOL003036MOL003044MOL003095MOL003111MOL003117MOL002883MOL007714MOL007715MOL007716MOL007722MOL007728MOL007734MOL007736pain1491518(8.5%)(86.1%)第5期2.4“药物一活性成分一靶点”网络模型及分析采用Cytoscape3.8.2软件构建“药物一活性成分一靶点 网络模型(图2)。该网络共有40 7 个节点(包括245个靶点节点,16 2 个活性化合物节点(包括中药名称),共有2 143条边(每条边代表活性化合物与靶点基因之间的相互作用关系)。“

43、正六边形”表示药物的活性宋欣宏,等:基于网络药理学和分子对接技术探究珍珠烧伤膏辅助缓解疼痛的作用机制111化合物节点,“菱形”为靶点节点,“正方形”表示中药材名称,由图2 可见,珍珠烧伤膏中各药物之间存在各种相互作用关系,同一成分对应不同的靶点,不同成分也可对应同一靶点,形成复杂的作用网络,也充分体现了珍珠烧伤膏缓解疼痛的多成分、多靶点治疗机制。GCJYHYHEHTD241A2DG共有成分注:GC.甘草;HQ.黄芩;BZ.白芷;JYH.金银花;DG.当归;ZC.紫草。Note:GC.licorice;HQ.baicalensis;BZ.angelica;JYH.honeysuckle;DG.l

44、icorice;ZC.herb.图2“药物一活性成分一靶点网络图Fig.2“Drugs-lngredients-Targets”network2.5蛋白相互作用(PPI)网络将珍珠烧伤膏缓解疼痛的149个作用靶点导入STRING数据库,物种限定为“Homo sapiens得到潜在作用靶点的PPI网络(图3)保存其TSV格式文件。将文件中的nodel,n o d e 2,c o m b i n e d s c o r e 信息导入Cytoscape3.8.2软件,绘制PPI网络,并进行NetworkAnalyze分析,网络中共包含148 个节点(节点代表靶点),30 7 5条边(边代表靶点之间的

45、相互作用),一个有更高介数中心性的节点在网络中有更强的控制能力。运用Cytoscape软件中的CytoNVA插件的bet-weenness功能计算网络的介数中心性,图中节点越大,颜色越深,则表明度值越大,依次排序为IL6、AKT1、T NF、ESR1、C A V 1、SLC 6 A 4、M M P9、I L1B、TP53和 CTNNB1 等。112特产RSS研究2023年第45卷第5期GSTM1FASLORATCHRUMPLAUL1AFATOMT-NDGCHRM4FKKICIA5PACHEMYC0000000CTINB1TP53RMMP9SLGA4CAV1ESR1TNFAKTTABCC1CAC

46、NA2D1OLRIAOO1G8ONPTENRFFRS81PCHACHRMSA2DCA2OPRD1图3珍珠烧伤膏蛋白一蛋白互作网络图Fig.3 PPI network of Zhenzhu Burn Ointment 2.6GO功能富集和KEGG通路分析将以上靶点导入Metascape数据库,共得到GO富集条目331个,其中生物过程(BP)238个,分子功能(MF)57个,细胞组分(CC)36个。BP方面与疼痛相关的生物过程有2 2 条,选取BP与疼痛相关的10 个条目、MF与CC排名A前10 位的条目,分别绘制条形图(图4)。BP主要富集在无机物质反应、细胞对氮response to inor

47、ganic substancecellular response to nitrogen compoundresponsetoxenobioticstimuluspositive regulation ofcellmigrationegativeregulation ofcell population proliferationcellularresponsetoorganiccycliccompoundregulationofcelladhesionresponseto extracellular stimulusresponsetolipopolysaccharideresponsetor

48、adiationmembranerafttranscription regulator complexreceptorcomplexperinuclearregionofcytoplasmvesicleiumenextracellularmatrixsideofmembraneendoplasmicreticulumlumenlyticvacuolepostsynaptic membranekinase bindingproteindomain specificbindingoxidoreductaseactivityprotein homodimerizationactivityprotei

49、nkinaseactivityenzymeactivatoractivitycytokineactivityphosphatase bindingprotein heterodimerization activitytranscriptioncoregulatorbindingFig.4 GO analysis of the biological process,molecular function and cellular composition化合物反应和对异种刺激的反应等;MF主要富集在激酶结合、蛋白质结构域特异性结合、氧化还原酶活性和蛋白质同源二聚活性等;CC主要涉及膜筏、囊泡腔、转录

50、调节因子复合物、受体复合物和内质网腔等。KEGG通路分析结果,共得到信号通路2 0 0 条,其中,与疼痛密切相关的通路有2 0 条(图5)。CCMF010图4GO分析生物过程、分子功能和细胞组成情况BP203040第5期2.7“活性成分一重要靶点一关键通路 网络模型构建基于以上结果,获得药物的活性成分、重要靶点和关键通路,导入Cytoscape3.8.2软件,构建“活性成分一重要靶点-关键通路 网络模型,进行NetworkAnalyze分析,见图6。该网络共有2 7 4个节点,150 9条边,平均度值是11.0 1。图6 中节点越大表明度值越大,大于宋欣宏,等:基于网络药理学和分子对接技术探究

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