1、 四川动物 Sichuan Journal of Zoology 2023,42(5):481-489基于线粒体 CO基因的河南省境内锯齿新米虾种群遗传多样性研究马志刚1,冯梦霞1,汤永涛1,刘如垚1,闫雪朦1,胡博1,聂国兴1,周传江1,2*(1.河南师范大学水产学院,河南省水产动物养殖工程技术研究中心,水产动物疾病控制河南省工程实验室,河南新乡453007;2.河南师范大学生命科学学院,河南新乡453007)摘要:为系统评估河南省锯齿新米虾Neocaridina denticulata的遗传多样性现状,本研究基于线粒体CO基因对河南省境内 19个群体 149尾样本进行了遗传多样性分析。结果
2、显示,河南省境内锯齿新米虾群体包含 35个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)为0.922,平均核苷酸多样性()为0.006 32;长江水系群体有最高的遗传多样性(Hd=0.924,=0.006 37),淮河水系群体最低(Hd=0.773,=0.002 28),各水系均显示出单倍型多样性高、核苷酸多样性低的特点。AMOVA分析显示,锯齿新米虾群体遗传变异仅26.19%,源自不同水系之间,各水系内不同群体间及群体内个体间的变异各占35.71%和38.10%。基于CO基因的最大似然树显示,不同水系群体互相嵌套在一起,但单倍型网络图显示海河水系与其他水系存在一定程度的分化。中性检验、错配分布及贝叶斯天际
3、线分析表明,锯齿新米虾群体近期没有发生种群扩张,群体相对稳定。本研究完善了河南省境内淡水虾类的物种名录,为后续境内淡水虾类的相关研究提供参考。关键词:锯齿新米虾;COI基因;河南境内;遗传多样性;资源保护中图分类号:Q959.223 文献标志码:A 文章编号:1000-7083(2023)05-0481-09Genetic Diversity of Neocaridina denticulata in Henan ProvinceBased on Mitochondrial CO GeneMA Zhigang1,FENG Mengxia1,TANG Yongtao1,LIU Ruyao1,YA
4、N Xuemeng1,HU Bo1,NIE Guoxing1,ZHOU Chuanjiang1,2*(1.College of Fisheries,Henan Normal University,Engineering Technology Research Center of Henan Province for Aquatic Animal Cultivation,Engineering Lab of Henan Province for Aquatic Animal Disease Control,Xinxiang,Henan Province 453007,China;2.Colleg
5、e of Life Sciences,Henan Normal University,Xinxiang,Henan Province 453007,China)Abstract:To study the genetic diversity of 19 populations of Neocaridina denticulata in Henan Province,149 samples were analyzed based on the mitochondrial CO gene.The results of genetic diversity analysis showed that th
6、e 19 geographic populations of N.denticulata in Henan contained a total of 35 haplotypes,and the average haplotype diversity(Hd)value is 0.922.The average nucleotide diversity()value is 0.006 32,indicative of high genetic diversity of N.denticulata DOI:10.11984/j.issn.1000-7083.20220422收稿日期:2022-12-
7、01 接受日期:2023-06-21基金项目:国家自然科学基金项目(U2004146);河南省科技攻关重点项目(182102110046;182102110237);河南省创新型科技团队支持计划项目(CXTD2016043);2019年度河南省高等学校青年骨干教师培养计划项目(2019GGJS063)作者简介:马志刚(1995),男,硕士研究生,研究方向为鱼类资源保护与利用,E-mail:*通信作者Corresponding author,E-mail:481四川动物 2023 年 第 42 卷 第 5 期Sichuan Journal of Zoology Vol.42 No.5 2023p
8、opulation in the Yangtze River system.The values of its two average genetic diversity indices(Hd=0.924,=0.006 37)are much higher than those of the other three river systems.The Huaihe River system has the lowest average genetic diversity(Hd=0.773,=0.002 28),and the populations of N.denticulata in ea
9、ch river system show the characteristics of high Hd and low.The AMOVA analysis of the four river systems showed that only 26.19%of the population genetic variation came from different river systems,and the variation between different populations and individuals within each river system accounted for
10、 35.71%and 38.10%,respectively.The maximum likelihood tree based on CO gene showed that different river systems were nested together,while the haplotype network map showed that the populations of Haihe River system were differentiated from those of other river systems to a certain extent.The demogra
11、phic history analysis showed that the population of N.denticulata did not expand recently,and the population was relatively stable.This study improves the species list of freshwater shrimps in Henan Province,and provides a reference for further research on freshwater shrimp in China.Keywords:Neocari
12、dina denticulata;CO gene;Henan Province;genetic diversity;resource protection锯齿新米虾 Neocaridina denticulata 是一种体型偏小的淡水虾类,对水域环境适应能力较强,但分布范围较狭窄,据记载,其在国内仅分布于太湖区、福建等特定区域,后被移养至新疆、巴楚等地的部分区域(梁象秋,2004),在新米虾属 Neocaridina的修订中首次系统、详细地描述了新米虾属的分类地位及其形态特征,为相关研究提供了理论依据。随着更多物种的发现和分类学研究的深入(蔡奕雄,1996;梁象秋等,1999;梁象秋,2004
13、),锯齿新米虾、大卫米虾Caridina davidi和异足新米虾 N.heteropoda的分类命名存在一定冲突和争议,Klotz等(2013)的研究认为,大卫米虾、锯齿新米虾大卫亚种N.denticula davidi、锯齿新米虾中华亚种N.denticula sinensis是异足新米虾的同物异名,其有效物种名为N.davidii。锯齿新米虾作为一种形态体色多变的常见小型淡水虾,常被用作观赏虾类进行交易和养殖。为了培育更多体色增加其观赏价值,米虾属Caridina和新米虾属中许多种被人工杂交和选育(林师,2017)。此外,锯齿新米虾的环境适应性较强,有学者对其低溶解氧胁迫的耐受能力、水体
14、污染的生态响应进行研究报道(李典宝,2015;薛毓才等,2022),为后续锯齿新米虾环境适应相关研究奠定了基础。河南省地处中原腹地,地跨长江、淮河、黄河、海河4大流域,境内有1 500多条主干河流纵横交错,水系资源丰富,地形复杂。对河南省境内的虾类资源调查结果显示,相较于其他淡水虾类而言,锯齿新米虾在河南境内4大水系均有分布,且数量较大,但缺乏遗传多样性的研究报道。目前,DNA分子标记是进行群体遗传多样性研究的主要手段之一,线粒体CO基因已被广泛应用于鱼类、虾类种群遗传多样性的研究(冯建彬等,2008;公月月,2017)。本研究基于线粒体 CO基因对河南境内 19个野生锯齿新米虾群体的149尾
15、样本进行遗传多样性分析,评估河南境内锯齿新米虾种质资源现状,为其种质资源保护、可持续发展等提供理论参考。1材料与方法1.1实验材料20122020年于河南省4大水系的干流及其部分支流中采集锯齿新米虾,标本浸泡于95%乙醇中带回实验室保存。选取其中 19 个地理群体149尾样本作为研究对象(表1)。1.2CO基因的获取取适量样本肌肉组织(约0.01 g),采取酚-氯仿法提取DNA(Sambrook et al.,1989)。用1%琼脂糖482马志刚等:基于线粒体CO基因的河南省境内锯齿新米虾种群遗传多样性研究凝胶电泳和Nanodrop微量紫外分光光度计分别检测基因组DNA的质量与浓度,20 保存
16、备用。扩 增 线 粒 体 CO基 因 引 物 为 LCO1490:5-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3,HCO21 98:5-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3(Folmer et al.,1994),引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。PCR反应体系为30 L:2Es Taq Master Mix 15 L,正、反向引物各1.5 L,DNA模板1 L,无菌双蒸水11 L。PCR反应程序为:94 5 min;94 30 s,54 45 s,72 45 s,35个循环;72 7 min,4 保存(冯建彬等,2008)。PCR产物经 1%琼脂糖凝
17、胶电泳检测后送至生工生物工程(上海)股份有限公司进行测序。1.3数据分析测序获得的DNA序列采用Lasergene 7.1的SeqMan(Swindell&Plasterer,1997)进行人工核查、校正 及 组 装 拼 接。拼 接 完 成 的 序 列 用 BioEdit(Tippmann,2004)进行多重比对,获得一致序列备用。用 DnaSP 5.0(Librado&Rozas,2009)计算DNA序列的单倍型数、单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性()等遗传多样性参数。用 MEGA 7.0(Sudhir et al.,2016)计算序列碱基组成、变异位点、简约信息位点和组内、组间遗传距离等
18、参数。用 Arlequin 3.5(Excoffier et al.,2005)进 行AMOVA估算遗传变异在不同水系间的分布和遗传分化系数(FST),进而评估不同水系锯齿新米虾群体的遗传分化程度;为探究其种群历史动态,进行 Fu s Fs 和 Tajima s D 中性检验及错配分布分析,评估群体是否发生种群扩张。根据长臂虾科Palaemonidae 的系统发育关系,以细足米虾 C.nilotica gracilipes(GenBank 登录号:MK190025)为外群(李新正等,2003),Bootstrap设置为1 000检验置信度,构建锯齿新米虾 19个群体的 ML 系统发育树,以分析
19、各群体之间系统进化关系及地理分化情况。采用 Network 5.0(Bandelt et al.,2000)中的Median-Joining 法构建锯齿新米虾的单倍型网络表1锯齿新米虾采样信息Table 1Sampling information of Neocaridina denticulata水系River system长江黄河淮河海河种群PopulationC01C02C03C04H01H02H03H04A01A02A03A04A05A06E01E02E03E04E05采样点Sampling location驻马店市泌阳县马谷田镇南阳市淅川县荆紫关镇南阳市宛城区黄台岗镇南阳市蒲山镇洛阳
20、市洛宁县兴华乡洛阳市洛龙区李村镇洛阳市汝阳县三门峡市卢氏县横涧乡登封市告成镇洛阳市汝阳县平顶山市汝州市小屯镇驻马店市驿城区沙河店镇驻马店市确山县竹沟镇南阳市方城县四里店乡安阳市林州市浊漳河桥安阳市善应镇林州市姚村镇林州市东姚镇新乡市辉县拍石头乡样本数Sample size55456919124875166144659地理位置Geographic location113.329 010E,32.655 810N111.021 024E,33.243 679N112.569 990E,32.809 720N112.635 910E,33.079 550N111.439 780E,34.270 89
21、0N112.754 780E,34.650 920N112.424 290E,34.308 010N111.066 560E,34.050 010N113.133 390E,34.403 810N112.578 850E,34.153 370N112.943 820E,34.073 490N113.726 300E,33.013 440N113.680 370E,32.776 030N112.855 120E,33.398 150N113.816 330E,36.086 830N114.102 540E,36.030 910N113.813 510E,36.138 290N114.013 73
22、0E,35.848 120N113.857 650E,35.601 920N483四川动物 2023 年 第 42 卷 第 5 期Sichuan Journal of Zoology Vol.42 No.5 2023图,以分析其单倍型演化关系。用 BEAST 1.7.4(Heled&Drummond,2010)进行贝叶斯天际线点(Bayesian skyline plot,BSP)分析估算锯齿新米虾种群历史动态的变化,采用1.4%CO基因进化速率(Knowlton&Weigt,1998),由 Tracer 1.5(Rambaut&Drummond,2009)生成BSP图。2结果与分析2.1CO
23、基因序列基本特征19个地理群体149条锯齿新米虾的CO基因序列长632 bp,其中包括变异位点43个(6.8%),简约信息位点32个,单变异位点11个,转颠换位点数的比值为2.628 1;T、C、A和G的平均含量分别为 33.4%、20.7%、27.2%和 18.7%,表现出显著的AT偏倚性。2.2种群遗传多样性锯齿新米虾样品共包含 35 个单倍型,其中,24 个为独享单倍型,11 个为群体间共享,Hap6被长江、黄河、淮河 10 个群体 33 尾个体共享。各水系的 Hd为 0.7730.924,平均 0.922,其中,淮河水系的最低(Hd=0.773),长江水系的最高(Hd=0.924);各
24、水系的为0.002 280.006 37,平均为0.006 32,其中,淮河水系的最低(=0.002 28),长江水系的最高(=0.006 37)。整体上,长江水系群体显示出更高的遗传多样性(Hd=0.924,=0.006 37),远高于其他3个水系(表2)。2.3种群遗传结构4 大 水 系 群 体 内 遗 传 距 离 为 0.002 290.006 45,其中,淮河水系的最小(0.002 29),长江水系的最大(0.006 45);两两水系间的遗传距离为0.004 710.008 87,其中,长江水系与淮河水系的最小(0.004 71),海河水系与长江水系的最大(0.008 87)。4 大
25、水 系 间 的 FST为 0.104 680.586 00,4大水系之间均存在显著的遗传差异:黄河水系和长江水系的最高(0.586 00),且存在极显著 遗 传 差 异;黄 河 水 系 与 海 河 水 系 的 最 低(0.104 68),且存在显著差异(表3)。海河水系中,E02与C02、E05,E04与C02的遗传分化较低(FST0.25),且分化程度均达到显著或极显著水平;海河水系的5个群体之间也存在一定遗传差异,除E02与E04、E05之间的遗传分化程度没有达到显著差异水平外,其他几个群体之间的遗传分化程度均达到了显著或极显著水平。FST分析与成对遗传距离分析结果一致,均表明C02、E0
26、1、E02和E04群体与其他各锯齿新米虾表2河南省4大水系锯齿新米虾群体的遗传多样性信息Table 2Genetic diversity of Neocaridina denticulata populations from four river systems in Henan Province水系Riversystem长江黄河淮河海河合计样本数Samplesize19464638149单倍型数Numberof haplotypes108121035单倍型Haplotype(样本数Sample size)Hap1(2),Hap2(3),Hap3(2),Hap4(1),Hap5(2),Hap6
27、(4),Hap7(2),Hap8(1),Hap9(1),Hap10(1)Hap1(1),Hap4(16),Hap6(7),Hap11(1),Hap12(6),Hap13(3),Hap14(9),Hap15(3)Hap1(1),Hap6(22),Hap16(2),Hap17(2),Hap18(1),Hap19(1),Hap20(9),Hap21(4),Hap22(1),Hap23(1),Hap24(1),Hap25(1)Hap26(1),Hap27(9),Hap28(1),Hap29(15),Hap30(1),Hap31(2),Hap32(4),Hap33(2),Hap34(2),Hap35(1
28、)单倍型多样性Haplotypediversity(Hd)0.9240.8090.7730.7870.922核苷酸多样性Nucleotidediversity()0.006 370.005 930.002 280.002 460.006 32Tajima s D0.929 292.594 46*1.871 25*1.035 111.692 13Fu s Fs0.147 130.341 442.853 50*0.054 401.167 07 注Notes:*P0.05,*P0.01;下同the same below484马志刚等:基于线粒体CO基因的河南省境内锯齿新米虾种群遗传多样性研究群体间存
29、在较大遗传分化(表4)。AMOVA结果显示,锯齿新米虾的遗传变异主要源自其群体内的个体间,且群体内锯齿新米虾个体间的变异占总变异的38.10%,群体间的变异则占35.71%(表5)。锯齿新米虾19个群体的ML系统发育树(图1:a)显示,各水系不同群体间系统进化关系成交叉式嵌套,无明显水系和地理分化。单倍型网络图显示,锯齿新米虾群体各水系35个单倍型之间总体上并未呈现出明显的水系交叉,除 Hap1、Hap4、Hap6存在不同水系锯齿新米虾样品之间单倍型共享的情况外,其他各个锯齿新米虾群体形成了比较明显的地理结构,不同水系的群体间多为特有单倍型;此外,35 个单倍型中,除 Hap1、Hap27 和
30、Hap29拓展出少量的单倍型外,Hap6的拓展单倍型最多(图1:b)。2.4种群历史动态河南省锯齿新米虾群体的Tajima s D检验值和Fu s FS检验值均为负数(Tajima s D=1.692 13,Fu s FS=1.167 07),均 未 达 到 显 著 差 异 水 平(表2);错配分布分析表明,群体的错配分布曲线呈现出多峰状态(图2),推测河南省锯齿新米虾种群相对稳定,近期未发生过种群扩张事件。BSP分析结果显示,锯齿新米虾群体整体保持稳定趋势,并未经历种群扩张或瓶颈效应(图3)。3讨论3.1河南境内锯齿新米虾的遗传多样性采集的河南境内149尾锯齿新米虾群体平均遗传多样性指数(H
31、d=0.922,=0.006 32)均低于河南境内日本沼虾M.nipponense群体(Hd=0.785 74,=0.010 59),但是略高于掌肢新米虾 N.palmata palmata群体(Hd=0.5570.025,=0.000 980.000 07)(郑小壮等,2019)。总体而言,河南境内锯齿新米虾与河南境内日本沼虾群体、掌肢新米虾(郑小壮等,2019)、4个海域口虾蛄Oratosqilla oratoria群体(董鑫等,2015)及紫贻贝Mytilus galloprovincialis群体(沈玉帮等,2011)均表现出单倍型多样性较高、核苷酸多样性较低的特点。遗传多样性分析结果
32、显示,长江水系锯齿新米虾群体显示出更高的遗传多样性(Hd=0.924,=0.006 37),均远高于其他3个水系,表明长江水系锯齿新米虾群体目前具有较高的遗传多样性,这与河南境内日本沼虾群体的遗传多样性现状(郑小壮等,2019)相一致。而淮河水系和黄河水系因采样点多为半封闭水体,群体间可能存在基因交流,导致结果偏低。3.2河南境内锯齿新米虾的遗传结构淮河水系的遗传距离最小,长江水系与其他水系之间的遗传距离均较大。其次是黄河水系和海河水系,海河遗传距离也相对较大。FST值差异显著性检验显示,海河水系与其他各水系的群体均存在显著或极显著的遗传差异(P0.05,P0.25),就海河水系内部来看,其5
33、个群体之间也存在一定遗传学差异。或因海河水系涉及 3 个采样点(E02、E04、E05)为水库,其他2个采样点则位于林州市太行山脉中,与其他几个地理群体存在一定地理隔离和基因交流障碍,从而导致了该水系锯齿新米虾群体与其他群体产生了差异。单倍型Hap6在10个种群中共享,且以其为中心直接拓展出10个单倍型,呈明显的星形辐射状,表3河南省4大水系锯齿新米虾群体遗传结构Table 3Genetic structure of Neocaridina denticulatapopulations from four river systems in Henan Province水系River syste
34、m长江黄河淮河海河长江Yangtze River0.006 450.007 040.004 710.008 87黄河Yellow River0.586 00*0.005 980.005 620.008 04淮河Huaihe River0.326 34*0.263 79*0.002 290.008 36海河Haihe River0.384 67*0.104 68*0.118 80*0.004 86注:对角线上方为遗传分化指数,粗体为群体内遗传距离,对角线下方为群体间遗传距离Notes:pairwise FST was above the diagonal,genetic distance wit
35、hin populations was in bold,genetic distance between populations was below the diagonal485四川动物 2023 年 第 42 卷 第 5 期Sichuan Journal of Zoology Vol.42 No.5 2023表4河南省4大水系锯齿新米虾群体遗传结构Table 4Genetic structure of Neocaridina denticulata populations from four river systems in Henan Province种群PopulationC01C02
36、C03C04H01H02H03H04A01A02A03A04A05A06E01E02E03E04E05长江Yangtze RiverC010.0020.321*0.362*0.1300.1940.722*0.711*0.1730.2110.223*0.339*0.1940.245*0.310*0.706*0.789*0.816*0.494*0.828*C020.0110.0120.3120.2460.294*0.470*0.508*0.420*0.2590.403*0.412*0.214*0.497*0.313*0.438*0.2380.425*0.1690.420*C030.0020.011
37、0.0010.0830.1430.852*0.740*0.1680.3330.1380.2220.1800.1360.278*0.734*0.905*0.879*0.508*0.903*C040.0030.0110.0020.0030.0580.642*0.677*0.0590.0630.0070.0380.0610.0760.180*0.667*0.652*0.735*0.454*0.737*黄河Yellow RiverH010.0040.0120.0030.0040.0040.596*0.686*0.0810.1390.132*0.157*0.0790.197*0.237*0.675*0.
38、601*0.697*0.478*0.701*H020.0030.0100.0040.0040.00500.767*0.548*0.695*0.724*0.827*0.772*0.627*0.653*0.774*0.945*0.919*0.604*0.926*H030.0090.0120.0090.0090.0100.0080.0030.698*0.693*0.732*0.752*0.718*0.736*0.657*0.683*0.571*0.682*0.627*0.625*H040.0030.0110.0020.0030.0040.0040.0090.0030.1060.0820.127*0.
39、0250.162*0.291*0.701*0.642*0.727*0.575*0.701*淮河Huaihe RiverA010.0020.0110.0020.0030.0040.0030.0080.0030.0020.0880.3150.1260.210*0.2620.685*0.778*0.805*0.438*0.822*A020.0020.0110.0020.0020.0030.0030.0090.0020.0020.0020.0520.0670.0530.281*0.733*0.793*0.825*0.579*0.825*A030.0020.0100.0010.0020.0030.003
40、0.0090.0020.0020.0010.0010.0110.0590.313*0.754*0.886*0.880*0.595*0.890*A040.0020.0100.0010.0020.0030.0030.0080.0020.0020.0010.0010.0010.0500.1120.716*0.849*0.849*0.507*0.864*A050.0030.0110.0020.0030.0040.0040.0090.0030.0030.0020.0020.0020.0020.191*0.741*0.708*0.771*0.645*0.748*A060.0040.0120.0040.00
41、40.0060.0060.0090.0050.0040.0040.0040.0030.0040.0040.674*0.604*0.700*0.481*0.702*海河Haihe RiverE010.0090.0120.0100.0090.0110.0090.0090.0100.0090.0100.0100.0090.0100.0110.0020.502*0.638*0.266*0.575*E020.0050.0090.0050.0050.0060.0040.0050.0050.0050.0050.0050.0050.0060.0060.00400.758*0.3270.116E030.0070
42、.0110.0080.0070.0090.0070.0070.0070.0070.0070.0070.0070.0080.0080.0070.0020.0010.497*0.759*E040.0120.0140.0130.0120.0140.0110.0130.0130.0120.0120.0120.0120.0130.0140.0080.0080.0110.0090.498*E050.0050.0090.0060.0050.0070.0050.0050.0050.0050.0050.0050.0050.0060.0060.00500.0020.0090注:对角线上方为群体间遗传距离,粗体为群
43、体内遗传距离,对角线下方为遗传分化指数Notes:genetic distance between populations was above the diagonal,genetic distance within populations was in bold,pairwise FST was below the diagonal486马志刚等:基于线粒体CO基因的河南省境内锯齿新米虾种群遗传多样性研究表5河南省4大水系锯齿新米虾群体AMOVA分析Table 5Analysis of molecular variance among Neocaridina denticulata popu
44、lationsfrom four river systems in Henan Province变异来源Source of variation组间组内群体间群体内合计自由度df315130149平方和Variance component88.265102.522111.388302.174变异组成Percentage of variation0.588 800.802 930.856 833.111 13变异百分比Percentage of variation/%26.1935.7138.10固定系数Fixation indexFCT=0.261 87FSC=0.483 76*FST=0.61
45、8 95*图1基于CO基因构建的河南境内4大水系锯齿新米虾的ML系统进化树(a)及单倍型网络图(b)Fig.1ML phylogenetic tree(a)and network of haplotypes(b)of Neocaridina denticulata from four river systemsin Henan Province based on CO gene sequences487四川动物 2023 年 第 42 卷 第 5 期Sichuan Journal of Zoology Vol.42 No.5 2023占据除海河以外的其他3个水系,为分布最广泛的单倍型,推断Ha
46、p6是一个存在时间较为久远的主要单倍型。3.3河南境内锯齿新米虾的种群历史动态中性检测结果显示,河南境内锯齿新米虾群体的平均Fu Fs值和Tajima s D值均为负值但未达显著差异水平;错配分布分析显示其群体错配分布图为多峰泊松分布;BSP分析结果显示锯齿新米虾群体整体上保持稳定趋势。推测河南境内锯齿新米虾种群整体比较稳定,未经历过种群扩张及瓶颈效应。锯齿新米虾作为一类古老的小型淡水虾类,在我国除了分布于几个已知的区域(梁象秋,2004)外,在贵州(邓一德,吴本寿,1997)、江西(李文浩等,2016)、湖北三峡(杨振冰等,2018)等多个地方记录有分布。锯齿新米虾不同地理群体间的遗传距离虽
47、然较小,但多存在单独的遗传结构和一定的地理格局,推测其原因可能有以下几点:首先,采集样点的设置和采样方法的不同均会对分析结果产生一定的影响,如水库等静水与溪流等流水的群体可能存在因为生存环境的不同和基因交流的阻碍而产生遗传分化现象;其次,由于锯齿新米虾个体较小,且大多生活在静水或水体流动性较小的水体,迁移能力相对较弱,因此,不同水系锯齿新米虾群体之间可能因为地理、水系上的隔离而存在一定的交流障碍,从而造成群体之间的分化;最后,气候和环境等不同也会引起其局部适应性的改变,捕捞、放流等人为因素造成锯齿新米虾不同地理群体及其栖息环境之间存在一定的差异。为了适应不同的水域环境,不同群体之间可能会发生一
48、定程度的进化或变异(易啸等,2018;郑小壮等,2019)。本研究对河南省境内锯齿新米虾遗传多样性进行了系统研究,对进一步评价河南省淡水虾类物种多样性和淡水虾类广布种的遗传多样性现状,丰富河南省境内关于淡水虾类的相关研究,完善境内淡水虾类的物种名录和后续相关研究提供了理论依据和参考。参考文献:蔡奕雄.1996.新米虾属的修订(甲壳亚门:十足目:匙指虾科)J.动物分类学报,21(2):129-160.邓一德,吴本寿.1997.贵州省的淡水虾类 J.动物学杂志,32(1):5-8.董鑫,邢坤,隋宥珍,等.2015.基于线粒体CO基因序列的4个海域口虾蛄群体的遗传多样性研究 J.海洋科学,39(7)
49、:29-36.冯建彬,孙悦娜,程熙,等.2008.我国五大淡水湖日本沼虾线粒体 CO基因部分片段序列比较 J.水产学报,32(4):517-525.公月月.2017.CO基因在鱼类物种鉴定与分类中的应用图2河南境内4大水系锯齿新米虾群体错配分布分析Fig.2Mismatch distribution analysis ofNeocaridina denticulata populationsfrom four river systems in Henan Province图3河南境内4大水系锯齿新米虾群体总贝叶斯天际线点图Fig.3Bayesian skyline plots of Neoca
50、ridina denticulatapopulations from four river systems in Henan Province488马志刚等:基于线粒体CO基因的河南省境内锯齿新米虾种群遗传多样性研究D.浙江:浙江海洋大学.李典宝.2015.锯齿新米虾对水体污染状况的生态响应研究 D.上海:上海海洋大学.李文浩,张萌,门吉帅,等.2016.江西仙女湖流域大型底栖动物群落结构及水质评价 J.长江流域资源与环境,25(8):1218-1227.李新正,刘瑞玉,梁象秋.2003.中国长臂虾总科的动物地理学特点 J.生物多样性,11(5):393-406.梁象秋,郭照良,唐凯娥,等.1