20111127-中文数据库检索.ppt

中文生物医学数据库的信息检索与利用（一）杜永莉杜永莉2011年年11月月解放军医学图书馆解放军医学图书馆Medical Library of Chinese PLA一个研究人员的全部工作时间中一个研究人员的全部工作时间中q思考计划思考计划 7.7%7.7%q查阅文献查阅文献 50.950.9%q科学实验科学实验 32.1%32.1%q编写报告编写报告 9.3%9.3%-美国科学基金会凯斯工学院基金委员会美国科学基金会凯斯工学院基金委员会 近年来，全世界每年出版图书近年来，全世界每年出版图书8080万种万种,期刊期刊4040万种万种,其他文献信息资料其他文献信息资料400400万种；万种；发表科学论发表科学论文大约文大约13000130001400014000万篇左右；每年登记的新万篇左右；每年登记的新专利达专利达7070万项；网上信息更是以几何级数迅速万项；网上信息更是以几何级数迅速增长。近增长。近3030年来，人类生产的信息已超过过去年来，人类生产的信息已超过过去50005000年信息生产的总和。年信息生产的总和。-信息爆炸信息爆炸 对于进行专业学习和即将从事对于进行专业学习和即将从事科研工作的现代人来说，掌握最科研工作的现代人来说，掌握最适合自己、最经济、最有效的信适合自己、最经济、最有效的信息获取手段是至关重要的息获取手段是至关重要的图书馆图书馆 是知识信息收集、存储、传播、应用是知识信息收集、存储、传播、应用 的专门机构的专门机构一、如何查找医学文献信息线索一、如何查找医学文献信息线索?二、如何查找和获取全文信息二、如何查找和获取全文信息?三、如何查找文献被引情况？三、如何查找文献被引情况？四、如何查找特殊类型文献四、如何查找特殊类型文献?五、如何查找因特网上的学术信息五、如何查找因特网上的学术信息?一、如何查找医学文献信息线索一、如何查找医学文献信息线索 一般方法一般方法：先中文，后外文 先文摘，后全文 我馆可供检索的中文文摘型数据库我馆可供检索的中文文摘型数据库 中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBMCBM）中文生物医学期刊数据库（CMCC)中国生物医学引文数据库（CMCI)中国科学引文数据库（CSCD)解放军医学图书馆网址：http:/中国生物医学文献数据库介绍中国生物医学文献数据库介绍q研制单位：研制单位：中国医学科学院医学信息研究所中国医学科学院医学信息研究所q时间范围：时间范围：1978年年q收录内容：收录内容：1600 多种中国生物医学期刊，多种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文献题录以及汇编、会议论文的文献题录 540余余 万篇。万篇。年增长量约年增长量约 40 万条。万条。q学科范围：学科范围：基础医学、临床医学、预防医学、基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学的药学、中医学及中药学等生物医学的 各个领域。各个领域。中国生物医学文献数据库介绍中国生物医学文献数据库介绍特点特点q注重数据的规范化处理和知识管理注重数据的规范化处理和知识管理 全部题录由医学主题词表、中国中医研究院中医药信息研究所中国中医药学主题词表及中国图书馆分类法 医学专业分类表进行主题标引和分类标引。q具有多种词表辅助检索具有多种词表辅助检索 主题词表 中英文主题轮排表 分类表 期刊表 作者表 等 丰富的注释信息中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）介绍）介绍q兼容性好：CBM 与 PubMed 检索系统兼容良好q检索入口多：30多个。有特色：主题词、分类、第一著者、文献类型、基金检索等。q检索功能全：定题、限定、截词、通配符、逻辑组配检索。q全文获取：与维普全文实现链接版本发展更新版本发展更新q1994年 CBMdosq2000年 CBMwinq2004年 CBMwebq2009年 SinoMed 中国生物医学文献服务系统中国生物医学文献服务系统CBM 主页主页SinoMed 帮助帮助主要检索途径主要检索途径检索途径检索途径基本检索基本检索主题检索主题检索分类检索分类检索期刊检索期刊检索作者检索作者检索q基本检索基本检索 题目、英文标题、摘要、作者、地址、关键词、主题词、特征词、基金、参考文献、刊名、出版年、分类号等。主要检索规则和逻辑算符主要检索规则和逻辑算符q基本检索：基本检索：主要包括：题目、英文题目、作者、地址、关键词、文摘、基金、参考文献、刊名、出版年、期、分类号、主题词、特征词等。q逻辑算符逻辑算符：AND，OR，NOTq通配符：通配符：“?”代表单字；“*”代表任意中国生物医学文献数据库的检索中国生物医学文献数据库的检索q检索举例检索举例 例1：“先天性心脏病的手术治疗”步骤1：先用自由词（关键词)检索。步骤2：再用主题词进行检索。步骤3：将二者检索结果进行对比。目的：了解主题词和自由词检索的作用与区别目的：了解主题词和自由词检索的作用与区别 心脏缺损例：先天性心脏病的手术治疗例：先天性心脏病的手术治疗自由词检索自由词检索（803篇）篇）主题词检索主题词检索（5725篇）篇）CBM 检索检索q 例2：“阿司匹林诱发哮喘”步骤1：用主题词“阿司匹林”检索。步骤2：再用主题词“哮喘”进行检索。步骤3：将二者检索结果进行合并。目的：1、了解主题词之间的组合检索 2、了解主题词和副主题词的组配检索 CBM 检索检索q 例3：“急性心肌梗死的治疗”步骤1：用主题词“心肌梗塞”检索。步骤2：再用自由词“急性”进行检索。步骤3：将二者检索结果进行合并。目的：了解主题词和自由词（关键词）之间的组配检索 CBM 检索检索q例4：查找主要主要研究“IL-2”的文献 步骤1：用主题词扩展检索。步骤2：选择主题词“加权”进行检索。q目的：了解主题词加权的概念和作用 了解中英文主题词的转换 加权：加权：6871篇篇不加权：不加权：9759篇篇q主题词是规范化检索语言，可检索出语言表达主题词是规范化检索语言，可检索出语言表达不同不同 但概念相同的文献但概念相同的文献 CBM主题检索特点总结主题检索特点总结q主题词有扩展功能，主题词有扩展功能，能迅速检索出主题树型结构中所有下位主题的文献 CBM主题检索特点总结主题检索特点总结q单选某一主题词树型的下位主题词，单选某一主题词树型的下位主题词，可以使检索结果更加专指 CBM主题检索特点总结主题检索特点总结 CBM主题检索特点总结主题检索特点总结v主题词的加权功能，主题词的加权功能，可检索出主要论述该主题的文献 CBM主题检索特点总结主题检索特点总结v主题词的加权功能，主题词的加权功能，可检索出主要论述该主题的文献CBM数据库主题检索特点总结数据库主题检索特点总结q命命中中的的文文献献较较自自由由词词准准确确，如如查查全全可可用用“OR”例如：食管癌的化疗q主题词设有英文主题词对照，主题词设有英文主题词对照，与MeSH词表一致，可进一步查询相关外文数据库 CBM主题检索特点总结主题检索特点总结q主题词和主题词进行组配，主题词和主题词进行组配，能表达较复杂概念，而且关系明确 CBM主题检索特点总结主题检索特点总结q主题词和副主题词进行组配主题词和副主题词进行组配，可以使检索结果更加准确；其副主题词的扩展可以扩大检索范围。q主题词和自由词进行组配主题词和自由词进行组配，可以使检索结果更加专指。CBM主题检索特点总结主题检索特点总结 CBM主题检索特点总结主题检索特点总结v主题词栏目中提供的相关参见，主题词栏目中提供的相关参见，可扩大检索思路和范围q主题词中有概念定义及概念范围，主题词中有概念定义及概念范围，可以避免检索时的概念混淆和误用 CBM主题检索特点总结主题检索特点总结一、如何查找文献信息线索一、如何查找文献信息线索如何查找系统的主题词如何查找系统的主题词 主题词和其他检索词的转换主题词和其他检索词的转换主题词检索一般原则主题词检索一般原则关键词和主题词检索比较关键词和主题词检索比较中文生物医学文献数据库（中文生物医学文献数据库（CBM）q主题检索总结：主题检索总结：1、如何寻找主题词如何寻找主题词 可以在基本检索窗口找出标题包含某个检索词的文献，浏览检索结果，看其对应的标引用词是什么，这就是要找的主题词。再用这个规范主题词去“主题”里检索。仔细阅读主题词的注释信息，特别注意相关词、上位词及专指词。中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q主题检索：主题检索：可用中文主题词、英文主题词及同义词进行查找，还可浏览主题注释信息及树形结构。通过是否加权、是否扩展、选择合适的副主题词，使检索结果更加符合要求。中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）主题词和其他检索词的转换主题词和其他检索词的转换：q从轮排表中的用代关系，树状结构表和索从轮排表中的用代关系，树状结构表和索引词的转换。引词的转换。如：如：同义词和准同义词之间的转换同义词和准同义词之间的转换 癌癌 见见 肿瘤肿瘤 Cancer see NEOPLASMS 化学疗法化学疗法 见见 药物疗法药物疗法 Chemotherapy see DURG THERAPY中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）又如：又如：主题词中有些词与我们在文献中常主题词中有些词与我们在文献中常见的形式和习惯不同见的形式和习惯不同 如：如：维生素维生素C 见见 抗坏血酸抗坏血酸 Vitamin C see ASCORBIC ACID 艾滋病艾滋病 见见 获得性免疫缺陷综合征获得性免疫缺陷综合征 AIDS see ACQUIRED IMMUNODEFICINECY SYNDROME 肺结核肺结核 见见 结核，肺结核，肺 （倒装）（倒装）中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q有些词没有完全对应的主题词或副主题有些词没有完全对应的主题词或副主题时，可以用其他相关词互相转换时，可以用其他相关词互相转换.例如：例如：血清、血浆血清、血浆 和和 血液血液 转换转换 举例：肺炎的血清学检测举例：肺炎的血清学检测 肺炎（主题词）肺炎（主题词）/代谢、血液代谢、血液中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q有的文献对主题概念提法不准确，应转有的文献对主题概念提法不准确，应转换为准确的主题词换为准确的主题词 如：如：子宫纤维瘤子宫纤维瘤 Uterine Uterine fibromafibroma 应为：应为：子宫平滑肌瘤子宫平滑肌瘤(主题词）主题词）Uterine Uterine leiomyomaleiomyoma中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q一些病名及诊断技术简称一些病名及诊断技术简称 如：如：艾滋病、甲亢、乙肝、艾滋病、甲亢、乙肝、B B超、超、CT CT 等应转等应转换为全称主题词换为全称主题词q组织类型肿瘤一般为倒装，部位肿瘤用顺装组织类型肿瘤一般为倒装，部位肿瘤用顺装 如：如：胃肿瘤胃肿瘤 肺肿瘤肺肿瘤 肿瘤，结缔组织肿瘤，结缔组织 肿瘤，神经组织肿瘤，神经组织中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q化学物质和药物名称的转换化学物质和药物名称的转换 化学物质和药品的主题按药典名称命名。化学物质和药品的主题按药典名称命名。如：阿司匹林如：阿司匹林 AspirinAspirin 药物的商品名一般不做为主题词药物的商品名一般不做为主题词 如：如：寿比山寿比山 用用 吲达帕胺吲达帕胺 灭滴灵灭滴灵 用用 甲硝唑甲硝唑 中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q有些自然语言可以转换为副主题词有些自然语言可以转换为副主题词 如：如：某个器官发育不全、异位、闭锁可以转某个器官发育不全、异位、闭锁可以转换为换为/畸形畸形(abnomalitiesabnomalities）q一些物质活性（酶）结合、降解、传输、吸收、一些物质活性（酶）结合、降解、传输、吸收、摄取可以转换为摄取可以转换为 /代谢代谢(metabolism(metabolism）器官、组织、细胞等功能器官、组织、细胞等功能 /生理学生理学q疾病的普查、流行、发病率、调查疾病的普查、流行、发病率、调查 /流行流行病学病学q细胞、亚细胞形态的电镜观察细胞、亚细胞形态的电镜观察 /超微结构超微结构中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q主题词检索一般原则（1）有先组的主题词用先组有先组的主题词用先组 如：血糖 是血液和葡萄糖的先组词 一氧化碳中毒 用 一氧化碳中毒 （先组的主题词）不用 一氧化碳/中毒 （中毒可用在化学物质后）也不用 一氧化碳+中毒 （这里的中毒是主题词）中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q主题词检索一般原则（1）有先组的主题词用先组有先组的主题词用先组 如：血糖 是血液和葡萄糖的先组词 一氧化碳中毒 用 一氧化碳中毒 （先组的主题词）不用 一氧化碳/中毒 （中毒可用在化学物质后）也不用 一氧化碳+中毒 （这里的中毒是主题词）中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q主题词检索一般原则（2 2）无先组的用组配检索）无先组的用组配检索组配分两种：一种是概念组配，一种是方面组配；即有两个以上并列概念的主题，例如：肝胆疾病 肝疾病 +胆道疾病LIVER DISEASE +DILIARYTRACT DISEASE中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）（3 3）组配检索）组配检索:有外延或限定概念，要选用有外延或限定概念，要选用适合的主题词或自由词组配。适合的主题词或自由词组配。例如：急性心肌梗塞 用 心肌梗塞/主题词（Infarction）+急性（自由词）（Acute）或者 急性病（主题词）但有先组的不需组配：如 慢性肾功能衰竭 有：肾功能衰竭，慢性（主题词)中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）（4 4）主题概念交叉要分开查）主题概念交叉要分开查如：食管鳞状细胞癌 查 食管肿瘤（Esophsgesl Neoplasms）AND 癌，鳞状细胞（Carcinoma，Squamous Cell）如：结肠贾第虫病 查 结肠疾病 （Colonic Disease）贾第虫病 （Giariasis）肠疾病，寄生虫性（Intestinal Disease，Parasitic）中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）（5 5）靠词检索，即查邻近的上位词：）靠词检索，即查邻近的上位词：如：贲门癌 查 贲门（Cardia）AND（Stomach Neoplasms）如：胃幽门螺杆菌感染 查：幽门螺杆菌 AND 螺杆菌感染 AND 胃疾病（6 6）上位词检索：）上位词检索：世界上的物种名称成千上万，仅化合物名称就超过600万种，主题词表不可能一一列出。检索时可用某种物种最密切的上位词。如：中华按蚊 查 按蚊属 （Anopheles）中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）（7）副主题词的使用能用专指的副主题词时，使用专指词能用专指的副主题词时，使用专指词 如：脑肿瘤的CT诊断 脑肿瘤放射摄影术 不用 诊断 断层摄影术，X线计算机能用限定组配用限定组配能用限定组配用限定组配如：普吗嗪对回肠平滑肌的作用 普吗嗪药理学 回肠药物作用 肌，平滑 药物作用中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）限定组配只能是单级组配，而不是多级组配限定组配只能是单级组配，而不是多级组配如：心脏病的外科手术治疗 用 心脏病/外科而不能用 心脏病/外科，治疗 一个主题词可能涉及到几个副主题词，可以多选一个主题词可能涉及到几个副主题词，可以多选如：爱滋病的流行病学、传播及防治 获得性免疫缺陷综合征/流行病学，预防和控制，治疗，药物治疗，膳食疗法，.关键词和主题词检索比较总结关键词（自由词）：q根据自己需要查找的关键词直接输入进行检索。只要文献中出现与检索词相同的实义词，系统一律检出。q检索途径：在基本检索“缺省”状态，对题目、摘要、主题词、关键词、特征词、期刊名称进行检索q关键词检索简捷，方便。q查出文章专指性不强，容易漏检q适用于：新出现的科技术语，新发现的物质及疾病名称。某些特定概念，如：体重、海拔、高度、剂量等。中医药名称关键词和主题词检索比较总结q主题词：主题词：从表示同一主题的不同形式的词（正式名称、缩写、俗称，商品名、化学名等）中归纳提炼出来的规范词规范词，不论作者使用何种名称，都被标引到这个主题词下。如：艾滋病、爱滋病、艾滋病、爱滋病、AIDSAIDS、获得性免疫缺陷综合症、获得性免疫缺陷综合症 获得性免疫缺陷综合征（主题词）获得性免疫缺陷综合征（主题词）中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）关键（自由）词 主题词必须是录入的文本词必须是录入的文本词 文献的主要概念，不一定出现文献的主要概念，不一定出现以词的拼写相同为查找目标以词的拼写相同为查找目标 以主题词相同为查找目标以主题词相同为查找目标要用全同义词要用全同义词 单个主题词可集中同义词单个主题词可集中同义词不需要查词表可直接键入不需要查词表可直接键入 需查词表需查词表不能直接与副主题词组配不能直接与副主题词组配 能与副主题词组配能与副主题词组配不能扩展检索不能扩展检索 可扩展检索可扩展检索不能加权不能加权 可加权可加权复杂关系表达不明确复杂关系表达不明确 复杂关系可明确表达复杂关系可明确表达常出现虚假命中常出现虚假命中 不会出现虚假命中不会出现虚假命中多自由词短语要逐一查找多自由词短语要逐一查找 主题词和副主题词可作为一词检出主题词和副主题词可作为一词检出不能提供相关提示不能提供相关提示 提供相关检索提供相关检索中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）其他检索q分类检索分类检索：以中国图书馆分类法医学专业分类表为分类标引和检索的依据。可通过分类号和分类名进行检索，通过选择是否扩展、是否复分，使检索结果更为贴切；单独使用可发挥族性检索的优势。q著者检索著者检索：可检索第一著者发表论文q期刊检索期刊检索：可查找期刊编辑部信息中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）其他辅助检索q限定检索限定检索：对年代范围、文献类型、年龄组、研究对象等整合成一个对话框，方便检索。q定题检索：用于定期跟踪某一课题的最新文献。q被引著者检索：可通过参考文献字段查某著者或某篇文章被其他著者或期刊引用情况。分类检索分类检索著者检索著者检索期刊检索期刊检索刊名、出版地、出版单位刊名、出版地、出版单位期刊主题词、期刊主题词、ISSNCBM几种检索方式几种检索方式q二次检索：二次检索：在已有检索结果基础上再检索，逐步缩小检索范围。与上一个检索词之间的关系为“AND”。如再输入“年代”q命令检索：命令检索：PY=1999-2006 AND 高血压 in TIq链接检索：链接检索：如作者链接，刊名链接，主题链接q限定检索：限定检索：可对检索结果实现年代范围、是否带文摘、核心期刊、文献类型、年龄组、性别、特征、以及其他内容的限定检索限定检索限定检索 注意：应在完注意：应在完成基本检索后，成基本检索后，再进行限定检索；再进行限定检索；如需进行下一如需进行下一个检索式，应先个检索式，应先去除设定的限定去除设定的限定检索。检索。中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q我的空间我的空间 我的检索策略：我的检索策略：用于定期跟踪某一课题的最新文献。我的数据库：我的数据库：检索步骤：初次使用需注册。制订检索策略并保存。定期调用检索策略，获取最新信息。中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）被引著者检索被引著者检索中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）吴孟超共有吴孟超共有17951795篇篇被引文献被引文献CBMCBM 检索结果处理检索结果处理年代年代著者著者期刊期刊相关度相关度CBMCBM 检索结果处理检索结果处理题录题录文摘文摘详细详细题录格式题录格式CBM 检索结果处理检索结果处理文摘格式文摘格式详细格式详细格式CBM 检索结果处理检索结果处理q检索结果标记显示标记文献显示标记文献CBM 检索结果处理检索结果处理q文献输出文本显示格式文本显示格式CBM 检索结果处理检索结果处理CBM 检索结果处理检索结果处理q全文链接CBM 检索结果分析检索结果分析结果分析可以了解某一结果分析可以了解某一学科作者及单位分布、学科作者及单位分布、时间分布、期刊分布时间分布、期刊分布中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q检索结果的检验和调整检索结果的检验和调整q多数据库检索多数据库检索 Medline/PubMed 和 CBM 是国内外重要的生物医学数据库。但对于某些中医药学方面的文献，没有CMCC收录的全；生化、药物化学、药理学等方面没有化学文摘数据库和药学数据库全，可以相互补充。中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q检索结果的检验和调整检索结果的检验和调整q从主题途径检出的文献也可以从分类途从主题途径检出的文献也可以从分类途径进行检索。径进行检索。CBM 设有分类检索途径 例如：肺结核的流行病学 分类号=R521/扩展/011 1192 主题词=结核,肺/EP/全部树 1149中国生物医学文献数据库（中国生物医学文献数据库（CBM）q检索结果的检验和调整检索结果的检验和调整q扩大检索范围扩大检索范围（查全）（查全）用扩展检索、用OR运算扩大范围、用截词符、用通配符、去掉主题词或词组之间的“”连字符、减少自由词的语句和字数、副主题词扩展等q缩小检索范围缩小检索范围（查准）（查准）用AND NOT 缩小检索范围 用限定字段（Fields)包括著者、题名、语种、文献类型等缩小检索范围 用概念加权缩小检索范围一、如何查找文献信息线索一、如何查找文献信息线索文献检索技巧文献检索技巧q尽量选用主题词检索，以保证将概念相同而字面表达不同的文献，保证查全保证查全。q选择主题词加权可检索出主要文献，缩小检索范围，保证查准保证查准。q注意主题词与副主题词的组配，避免漏检避免漏检。q灵活运用逻辑算符（AND OR NOT）一、如何查找文献信息线索一、如何查找文献信息线索如何利用检索工具提供的功能选择最有价值的文献如何利用检索工具提供的功能选择最有价值的文献q选择核心期刊选择核心期刊（EMBASE、国内数据库有此功能；或选择中华系列、中国系列、学报系列期刊,）q选择综述性文献选择综述性文献（一般数据库中“文献类型”选项）q通过年代限定选择最新出版的文献通过年代限定选择最新出版的文献q通过各种限定检索选择所需文献通过各种限定检索选择所需文献（如：语种、年龄、对象、随机对照、临床实验等等）