1、1.微生物分类的目的2.微生物的鉴定方法3.微生物的分类方法4.微生物的分类系统5.微生物的命名法则一一、微生物分类的目的:微生物分类的目的:1.按其亲缘关系分类后,了解其系统发生。2.按照分类系统编制检索表,在实际工作中检索表是鉴定具有某一菌种的依据。微生物的分类单位微生物的分类单位 界界门门纲纲目目科科属属种种变种变种亚种亚种型型菌株或品系菌株或品系群群通常认为种是一个通常认为种是一个分类分类基基本本单位单位,它是一大群表型,它是一大群表型特征高度相似、亲缘关系特征高度相似、亲缘关系极其相近、与同属内其他极其相近、与同属内其他有着明显差异的菌株的总有着明显差异的菌株的总称。称。1.细菌分类
2、系统细菌分类系统2.放线菌分类系统放线菌分类系统3.霉菌分类系统霉菌分类系统分类系统分类系统鸡枞白色双歧放线菌白色双歧放线菌大肠杆菌大肠杆菌早期微生物的鉴定步骤:现代的鉴定结合了红外光谱、气相色谱、分子生物学及计算机技术的应用。获得该微生物的纯培养物测定一系列鉴定指标查找权威性鉴定手册1.形态特征2.生理和生化特征3.血清学反应4.生态特性6.对噬菌体的敏感性5.生活史传统微生物的分类方法的依据:传统微生物的分类方法的依据:形状、大小、颜色、表面特征等营养来源、代谢产物、温度和氧气的关系根据它是否与待鉴定对象发生特异性血清反应来鉴别未知菌生长、发育和产生子代的全部经历寄生/共生,致病性,嗜盐性
3、等现代微生物分类方法1.核酸分析 2.DNA杂交试验 3.细胞壁成分分析 4.红外光谱 5.数值分类法 分类学上,用分类学上,用G+C占全部碱基的摩尔分数来表示各占全部碱基的摩尔分数来表示各类生物的类生物的DNA碱基因组成特征碱基因组成特征。微生物的。微生物的G+C的含的含量变化幅度在量变化幅度在27%-75%之间,任何两种微生物的之间,任何两种微生物的G+C含量相差含量相差10%以上,这两种微生物就肯定不属以上,这两种微生物就肯定不属于同一个种。于同一个种。不同生物不同生物DNA碱基排列顺序的异同直接反映生物之间碱基排列顺序的异同直接反映生物之间亲缘关系的远近,碱基排列顺序差异越小,它们之间
4、亲缘关系的远近,碱基排列顺序差异越小,它们之间的亲缘关系就越近,反之亦然。的亲缘关系就越近,反之亦然。将将DNA进行杂交,看其杂合率,若杂合率越高,进行杂交,看其杂合率,若杂合率越高,DNA碱基排列顺序相似性越高,则亲缘关系越近。碱基排列顺序相似性越高,则亲缘关系越近。数值分类法 数值分类法是根据数值分析,借助计算机将拟分类的微生物按其性状的相似程度归类的方法。书P(28)微生物的名字微生物的名字微生物往往都有他们的微生物往往都有他们的俗名俗名和学名。和学名。有时某些常见的细菌也可用习惯通用的俗名,如有时某些常见的细菌也可用习惯通用的俗名,如Tubercle bacillus(结核杆菌)可表示
5、(结核杆菌)可表示Mycobacteriumtuberculosis(结核分枝杆菌);(结核分枝杆菌);Typhoid bacillus(伤寒杆菌)可表示(伤寒杆菌)可表示Salmonella typhi(伤寒沙门(伤寒沙门菌)等。菌)等。指普通的、通俗的、地区指普通的、通俗的、地区性的名字,具有简明和大性的名字,具有简明和大众化的优点,但往往含义众化的优点,但往往含义不够明确,易于重复,使不够明确,易于重复,使用范围有限。用范围有限。微生物的命名法则微生物的命名法则 学名学名是每种微生物公认的科学用名。一个种的学名由两个拉丁或希腊词或拉丁化的其他文字组成。通常:=+属名种名学名首字母小写小写
6、,用来描述微生物的次要特征次要特征如颜色、形状和用途等。首字母大写大写,用来描述微生物的主要特征主要特征如形态、生理等。两种命名方法两种命名方法1.林奈双名法林奈双名法 学名学名=属名属名+种名加词种名加词+(首次定名人)(首次定名人)+现名定名人现名定名人+定名年份定名年份 例如例如:Saccharomyces cerevisiae(啤酒酵母)啤酒酵母)书书P(33)2.在少数情况下,当该种是亚种或变种时,用三名法在少数情况下,当该种是亚种或变种时,用三名法 学名学名=属名属名+种名加词种名加词+(subsp.或或var.)+亚种(或变种)的加词亚种(或变种)的加词 例如例如:Bacillu
7、s thuringiensis subsp.galleria(苏云金芽孢杆菌蜡螟苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种)书亚种)书P(33)斜体斜体斜体斜体总结 现代:现代:核酸分析、核酸分析、DNA杂交试验、细胞壁成分杂交试验、细胞壁成分 1.微生物的分类方法微生物的分类方法 析、红外光谱、数值分类法析、红外光谱、数值分类法 传统传统2.微生物的分类系统:微生物的分类系统:细菌分类系统、放线菌分类细菌分类系统、放线菌分类 系统、真菌分系统、真菌分类系统。类系统。3.种的概念(种的概念(P31):):它是一大群表型特征高度相似、亲缘关系及其它是一大群表型特征高度相似、亲缘关系及其接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。接近、与同属内其他种有着明显差异的菌株的总称。4.菌种的概念(菌种的概念(P32):):表示任何由一个独立分离的单细胞(或病表示任何由一个独立分离的单细胞(或病毒粒子)繁殖而成的纯种群体及其一切后代。毒粒子)繁殖而成的纯种群体及其一切后代。林奈双名法林奈双名法5.微生物的命名法则微生物的命名法则 三名法三名法