1、第八章第八章 微生物的分类与鉴定微生物的分类与鉴定第一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位第二节第二节 微生物的分类与命名微生物的分类与命名第三节第三节 微生物分类鉴定的方法微生物分类鉴定的方法第八章第八章 微生物的类与鉴定微生物的类与鉴定 一、生物分类学的发展概况一、生物分类学的发展概况 二、三域学说及其发展二、三域学说及其发展 第一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位图图8-1 8-1 生物界级的学说发展(阴影部分表示微生物)生物界级的学说发展(阴影部分表示微生物)第一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位一、生物分类学的发展概况一、生物分类学的发展
2、概况 植物界植物界动物界动物界原生生物界原生生物界真菌界真菌界原核生物界原核生物界真细菌界真细菌界古细菌界古细菌界细菌域细菌域古生菌域古生菌域真核生物域真核生物域病毒界?病毒界?2020世纪世纪7070年代以前年代以前,生物类群间的亲缘关系,生物类群间的亲缘关系判断的主要根据:判断的主要根据:形态结构形态结构形体微小、结构简单形体微小、结构简单生理生化生理生化缺少有性繁殖过程缺少有性繁殖过程行为习性,等等行为习性,等等少量的化石资料少量的化石资料化石资料凤毛麟角化石资料凤毛麟角表型特征:表型特征:第一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位二、三域学说及其发展二、三域学说及其发展 b
3、 b)形态特征在不同类群中进化速度差异很大,仅)形态特征在不同类群中进化速度差异很大,仅 根据形态推断进化关系往往不准确;根据形态推断进化关系往往不准确;根据形态学特征推断微生物之间的亲缘关系的缺点:根据形态学特征推断微生物之间的亲缘关系的缺点:a a)由于微生物可利用的形态特征少,很难把所有)由于微生物可利用的形态特征少,很难把所有 生物放在同一水平上进行比较;生物放在同一水平上进行比较;虽然根据少量表型特征来推测各类微生物的亲缘虽然根据少量表型特征来推测各类微生物的亲缘关系而提出的许多分类系统,都随着时间的推移关系而提出的许多分类系统,都随着时间的推移而不断地被否定了。而不断地被否定了。第
4、一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位2020世纪世纪7070年代以后,年代以后,分析和比较生物大分子的结构特分析和比较生物大分子的结构特征,特别是征,特别是蛋白质、蛋白质、RNARNA和和DNADNA这些反映生物基因组特这些反映生物基因组特征的分子序列,作为判断各类微生物乃至所有生物进征的分子序列,作为判断各类微生物乃至所有生物进化关系的主要指征。化关系的主要指征。分子计时器分子计时器(molecular chronometers)(molecular chronometers)进化钟进化钟(evolutionary clock)(evolutionary clock)二、三域
5、学说及其发展二、三域学说及其发展 第一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位蛋白质、蛋白质、RNARNA和和DNADNA序列进化变化的显著特点是进化序列进化变化的显著特点是进化速率相对恒定,也就是说,分子序列进化的改变量速率相对恒定,也就是说,分子序列进化的改变量(氨基酸或核苷酸替换数或替换百分率氨基酸或核苷酸替换数或替换百分率)与分子进化与分子进化的时间成正比。的时间成正比。生物大分子为什么可以作为进化标尺依据?生物大分子为什么可以作为进化标尺依据?a)a)在两群生物中,如果同一种分子的序列差异很大时,在两群生物中,如果同一种分子的序列差异很大时,-进化距离远,进化过程中很早就分
6、支了进化距离远,进化过程中很早就分支了。b)b)如果两群生物同一来源的大分子的序列基本相同,如果两群生物同一来源的大分子的序列基本相同,-处在同一进化水平上。处在同一进化水平上。第一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位作为进化标尺的生物大分子的选择原则作为进化标尺的生物大分子的选择原则1 1)在所需研究的种群范围内,它必须是普遍存在的。)在所需研究的种群范围内,它必须是普遍存在的。2)在所有物种中该分子的功能是相同的。)在所有物种中该分子的功能是相同的。3 3)为了鉴定大分子序列的同源位置或同源区,要求所)为了鉴定大分子序列的同源位置或同源区,要求所 选择的分子序列必须能严格线性
7、排列,以便进行进选择的分子序列必须能严格线性排列,以便进行进 一步的分析比较。一步的分析比较。4 4)分子上序列的改变(突变)频率应与进化的测量尺)分子上序列的改变(突变)频率应与进化的测量尺 度相适应。度相适应。大量的资料表明:功能重要的大分子、或者大分子中功能重要大量的资料表明:功能重要的大分子、或者大分子中功能重要的区域,比功能不重要的分子或分子区域进化变化速度低。的区域,比功能不重要的分子或分子区域进化变化速度低。第一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位RNARNA作为进化的指征的优点:作为进化的指征的优点:16S rRNA16S rRNA被公认为是一把好的谱系分析的被公
8、认为是一把好的谱系分析的“分子尺分子尺”1 1)rRNArRNA具有重要且恒定的生理功能;具有重要且恒定的生理功能;2 2)在)在16SrRNA16SrRNA分子中,既含有高度保守的序列区域,又有中度保守分子中,既含有高度保守的序列区域,又有中度保守 和高度变化的序列区域,因而它适用于进化距离不同的各类生和高度变化的序列区域,因而它适用于进化距离不同的各类生 物亲缘关系的研究;物亲缘关系的研究;3 3)16SrRNA16SrRNA分子量大小适中,便于序列分析分子量大小适中,便于序列分析;4 4)rRNArRNA在细胞中含量大在细胞中含量大(约占细胞中约占细胞中RNARNA的的90%)90%),
9、也易于提取;,也易于提取;5 5)16SrRNA16SrRNA普遍存在于真核生物和原核生物中普遍存在于真核生物和原核生物中(真核生物中其同源真核生物中其同源 分子是分子是18SrRNA)18SrRNA)。因此它可以作为测量各类生物进化的工具。因此它可以作为测量各类生物进化的工具。第一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位rRNArRNA和系统发育树和系统发育树培养微生物培养微生物提取并纯化提取并纯化rRNArRNArRNArRNA序列测定序列测定分析比较分析比较微生物之间的系统发育关系微生物之间的系统发育关系第一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位对对rRNArRNA
10、序列测定和分析方法序列测定和分析方法常用的有两种常用的有两种(P280P280):):寡核苷酸编目分析法寡核苷酸编目分析法 直接序列分析法直接序列分析法二、三域学说及其发展二、三域学说及其发展 20 20世纪世纪7070年代末,美国伊利诺斯大学的伍斯等年代末,美国伊利诺斯大学的伍斯等用用寡核苷酸序列编目分析法寡核苷酸序列编目分析法对大量微生物和其他生对大量微生物和其他生物的物的16S rRNA16S rRNA和和18S rRNA18S rRNA序列进行同源性比较序列进行同源性比较后,后,惊奇发现嗜极菌惊奇发现嗜极菌产甲烷细菌、嗜盐菌、嗜热菌、产甲烷细菌、嗜盐菌、嗜热菌、嗜压菌和嗜酸嗜热菌等具有
11、既不同于其他细菌,也嗜压菌和嗜酸嗜热菌等具有既不同于其他细菌,也不同于真核生物的序列特征,这些嗜极菌都是能在不同于真核生物的序列特征,这些嗜极菌都是能在地球早期严酷自然环境的极端条件下生存的微生物。地球早期严酷自然环境的极端条件下生存的微生物。提出提出三域三域即:即:细菌域细菌域(Bacteria)(Bacteria)古生菌域古生菌域(Archaea)(Archaea)真核生物域真核生物域(Eukarya)(Eukarya)第一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位图图8-2 8-2 三域学说及其三域学说及其生物进化谱系树生物进化谱系树比较生物大分子序列差异的数值构建了比较生物大分
12、子序列差异的数值构建了系统树系统树(分子系统树分子系统树)。特点特点:用一种树状分枝的图型来概括各种用一种树状分枝的图型来概括各种(类类)生物之间的生物之间的亲缘关亲缘关系系。细菌域细菌域古生菌域古生菌域真核生物域真核生物域第一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位利用利用16S rRNA16S rRNA建立分子进化树的美国科学家建立分子进化树的美国科学家伍伍斯斯 (C.R Woese)(C.R Woese)二、三域学说及其发展二、三域学说及其发展 发展中新的挑战:发展中新的挑战:认为认为16S rRNA16S rRNA和和18S rRNA18S rRNA分子的进化难以代表整个基因
13、分子的进化难以代表整个基因组的分子进化;组的分子进化;许多真核生物的基因组和它们所表达的功能蛋白与细菌许多真核生物的基因组和它们所表达的功能蛋白与细菌更为接近,而不是古生菌。更为接近,而不是古生菌。三域学说观点:三域学说观点:现在的一切生物均由一个共同的原始祖先,一种小细胞慢慢现在的一切生物均由一个共同的原始祖先,一种小细胞慢慢进化而来。首先分化出细菌和古生菌两个分枝,而后在古生进化而来。首先分化出细菌和古生菌两个分枝,而后在古生菌的基础上吞噬了一些其他生物如蓝细菌、菌的基础上吞噬了一些其他生物如蓝细菌、朊细菌朊细菌(相当于相当于G G细菌细菌)等,经过长期的内共生后,两者逐渐进化形成一种等,
14、经过长期的内共生后,两者逐渐进化形成一种新的生物新的生物真核生物。真核生物。第一节第一节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位 第二节第二节 微生物的分类与命名微生物的分类与命名 一、微生物的分类与命名法则一、微生物的分类与命名法则 二、微生物的分类系统二、微生物的分类系统第八章第八章 微生物的类与鉴定微生物的类与鉴定揭示微生物的多样性及其亲缘关系,建立自然分类系统。揭示微生物的多样性及其亲缘关系,建立自然分类系统。目的:目的:根据微生物的相似性和亲缘关系,将微生物归入不同的类:根据微生物的相似性和亲缘关系,将微生物归入不同的类 群群(分类单元分类单元);:根据国际生物命名法规给微生物分类
15、单元以科学的名称;:根据国际生物命名法规给微生物分类单元以科学的名称;:确定一个新的分类微生物属于已经命名的分类单元的过程。:确定一个新的分类微生物属于已经命名的分类单元的过程。分类分类命名命名:鉴定鉴定第二节第二节 微生物的分类与命名微生物的分类与命名微生物分类学:微生物分类学:研究微生物分类理论和方法的学科研究微生物分类理论和方法的学科。包括:包括:分类、命名和鉴定分类、命名和鉴定三个独立和相关的分类学领域。三个独立和相关的分类学领域。生物分类的原则:生物分类的原则:根据根据表型特征表型特征(形态学、生理生化学、生态学等形态学、生理生化学、生态学等)的相似程的相似程 度分群归类。度分群归类
16、。按照生物按照生物系统发育系统发育相关性水平来分群归类。相关性水平来分群归类。其目标是探寻各种生物之间的进化关系,建立反映生物其目标是探寻各种生物之间的进化关系,建立反映生物系统发育的分类系统。系统发育的分类系统。现代微生物分类学现代微生物分类学:已从传统的微生物分类方法已从传统的微生物分类方法(根据根据表型特征表型特征来推断微生物的系来推断微生物的系统发育统发育)发展到按其亲缘关系和进化规律进行分类。发展到按其亲缘关系和进化规律进行分类。第二节第二节 微生物的分类与命名微生物的分类与命名界界门门纲纲目目科科属属种种一、微生物的分类与命名法则一、微生物的分类与命名法则1、分类单元及其等级、分类
17、单元及其等级 种是最基本分类单元种是最基本分类单元第二节第二节 微生物的分类与命名微生物的分类与命名根据根据C.R WoeseC.R Woese的的理论,现在还在理论,现在还在 界之上使用域界之上使用域 把全部生物先分为把全部生物先分为古生菌域古生菌域 细菌域细菌域真核生物域真核生物域域下面再分界域下面再分界一、微生物的分类与命名法则一、微生物的分类与命名法则1、分类单元及其等级、分类单元及其等级(1)(1)属属(Genus)通常将具有某些共同特征或密切相关的种归为一个属。通常将具有某些共同特征或密切相关的种归为一个属。一般而言,微生物属间的差异比较明显。一般而言,微生物属间的差异比较明显。(
18、2)(2)种种(Species)种种(物种物种)是生物分类中最基本的分类单元和分类等级。是生物分类中最基本的分类单元和分类等级。在种以下分亚种、变种、型、菌株。在种以下分亚种、变种、型、菌株。种是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与种是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与 同属内的其它物种又有明显差异的一大群菌株的总称。同属内的其它物种又有明显差异的一大群菌株的总称。伯杰氏伯杰氏(Bengey)给种下的定义是:凡是与典型培养菌非给种下的定义是:凡是与典型培养菌非 常相同的其他培养菌统一起来区分成为一个常相同的其他培养菌统一起来区分成为一个“种种”。第二节第二节 微生物的分类与命
19、名微生物的分类与命名一、微生物的分类与命名法则一、微生物的分类与命名法则1、分类单元及其等级、分类单元及其等级(3)(3)亚种亚种(subspecies)或变种(或变种(variety)正式分类单元中地位最低的分类等级,指其某一明显而稳定正式分类单元中地位最低的分类等级,指其某一明显而稳定 的特征与模式种不同的菌株。的特征与模式种不同的菌株。(4)(4)培养物培养物培养物是指一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。培养物是指一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。微生物的纯培养物。(5)(5)菌株菌株(strain)(品系)(品系)(病毒称毒株或株病毒称
20、毒株或株)把同种微生物的不同来源的纯培养物或纯分离物均可称为某菌把同种微生物的不同来源的纯培养物或纯分离物均可称为某菌种的一个品系或菌株。种的一个品系或菌株。它表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代。从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养物都可以称为一个菌株或品系。实验诱变菌株。第二节第二节 微生物的分类与命名微生物的分类与命名Bacillus subtilisASI.398Bacillus subtilisBF7658生产蛋白酶生产蛋白酶生产生产淀粉酶淀粉酶一、微生物的分类与命名法则一、微生物的分类与命名法则1、分类单元及其等级、分类单元及其等级(7 7)群)群
21、指一组具有某些共同性状的生物。指一组具有某些共同性状的生物。一个种变成另外一个种时产生一系列过渡类型一个种变成另外一个种时产生一系列过渡类型“群群”。如大肠杆菌和产气肠杆菌两个种有明显区别,但自然界中还存在许多介于此两种细菌之间的中间类型,因此就将这两种菌和介于它们之间的中间类型统称为大肠菌群。第二节第二节 微生物的分类与命名微生物的分类与命名一、微生物的分类与命名法则一、微生物的分类与命名法则2、分类单元的命名、分类单元的命名微生物的种名采用林奈微生物的种名采用林奈(1753(1753年年)所创立的双名法命名。所创立的双名法命名。双名法:双名法:就是用属名和种名两个部分作为一种生物的学名。就
22、是用属名和种名两个部分作为一种生物的学名。命名规则:命名规则:属名在前,一般用拉丁字名词表示,字首字母大写属名在前,一般用拉丁字名词表示,字首字母大写 种名在后,常用拉丁文形容词表示,全部小写种名在后,常用拉丁文形容词表示,全部小写若所分离的菌株只鉴定到属,而未鉴定到种,若所分离的菌株只鉴定到属,而未鉴定到种,学名学名=属名属名+种名加词种名加词+(+(首次定名人首次定名人)+)+现名定名人现名定名人+现名定名年份现名定名年份 斜体字斜体字可可省省略略正正体体字字第二节第二节 微生物的分类与命名微生物的分类与命名例如:例如:Staphylococcus aureus 或泛指某一属的微生物,而不
23、特指某一具体的种时,或泛指某一属的微生物,而不特指某一具体的种时,可用可用sp.sp.或或spp.spp.来表示,来表示,例如:例如:Bacillus sp.或或Bacillus spp.二、微生物的分类系统二、微生物的分类系统1 1、细菌的分类系统、细菌的分类系统(1 1)伯杰氏手册伯杰氏手册 伯杰氏鉴定细菌学手册伯杰氏鉴定细菌学手册目前细菌分类鉴定的主要参考书。目前细菌分类鉴定的主要参考书。(2 2)伯杰氏系统细菌学手册伯杰氏系统细菌学手册第二版的分类第二版的分类 将原核生物分为古生菌界和细菌界。将原核生物分为古生菌界和细菌界。第一卷:第一卷:1 11414组,包括古生菌、蓝细菌、光合细菌
24、和最早分组,包括古生菌、蓝细菌、光合细菌和最早分 支的属。支的属。第二卷:第二卷:15151919组,包括变形杆菌组,包括变形杆菌(属属G G 真细菌类真细菌类)。第三卷:第三卷:20202222组,包括低组,包括低(G+C)(G+C)含量的含量的G G+细菌。细菌。第四卷:第四卷:2323组,包括高组,包括高(G+C)(G+C)含量的含量的G G+细菌细菌(放线菌类放线菌类)。第五卷:第五卷:24243030组,包括浮组,包括浮霉霉状菌、螺旋体、丝杆菌、拟杆菌状菌、螺旋体、丝杆菌、拟杆菌 、梭杆菌、梭杆菌(属属G G细菌类细菌类)。第二节第二节 微生物的分类与命名微生物的分类与命名二、微生物
25、的分类系统二、微生物的分类系统2 2、真菌的分类系统、真菌的分类系统采用采用AinsworthAinsworth的分类系统的分类系统(1983(1983年第七版年第七版)。它将真菌界分成粘菌门和真菌门,它将真菌界分成粘菌门和真菌门,真菌门又分成真菌门又分成5 5个亚门:个亚门:鞭毛菌亚门鞭毛菌亚门 接合菌亚门接合菌亚门 子囊菌亚门子囊菌亚门 半知菌亚门半知菌亚门 担子菌亚门担子菌亚门菌物界是广义的真菌。菌物界是广义的真菌。包括粘菌门、假菌门和真菌门包括粘菌门、假菌门和真菌门(即狭义的真菌即狭义的真菌)。第二节第二节 微生物的分类与命名微生物的分类与命名二、微生物的分类系统二、微生物的分类系统2
26、 2、真菌的分类系统、真菌的分类系统真核生物域真核生物域(Domain Eukaryota)原生动物界原生动物界(Kingdom Protozoa)集胞粘菌门集胞粘菌门(Acrasiomycota)网柱粘菌门网柱粘菌门(Dictyosteliomycota)粘菌门粘菌门(Myxomycota)肿根菌门肿根菌门(Plamodiophoromycota)假菌界假菌界(Kingdom Chromista)丝壶菌门丝壶菌门(Hyphochitriomycota)网粘菌门网粘菌门(Labyrinthulomycota)卵菌门卵菌门(Oomycota)真菌界真菌界(Kingdom Fungi)子囊菌门子囊
27、菌门(Ascomycota)担子菌门担子菌门(Basidiomycota)壶菌门壶菌门(Chytridiomycota)接合菌门接合菌门(Zygomycota)有丝孢真菌类有丝孢真菌类(Mitosporic Fungi)第二节第二节 微生物的分类与命名微生物的分类与命名二、微生物的分类系统二、微生物的分类系统2 2、真菌的分类系统、真菌的分类系统(1 1)霉菌的分类系统)霉菌的分类系统 霉霉菌菌:是是在在固固体体营营养养基基质质上上,形形成成绒绒毛毛状状、蜘蜘蛛蛛网网状状或或棉棉絮状菌丝体的真菌。絮状菌丝体的真菌。霉菌在真菌分类中分属于真菌门的霉菌在真菌分类中分属于真菌门的4 4个亚门:个亚门
28、:即即鞭毛菌亚门、接合菌亚门、子囊菌亚门和半知菌亚门鞭毛菌亚门、接合菌亚门、子囊菌亚门和半知菌亚门(2)2)酵母菌的分类系统酵母菌的分类系统 酵母菌:酵母菌:是以出芽繁殖为主要特征的单细胞真菌的统称。是以出芽繁殖为主要特征的单细胞真菌的统称。酵母菌在真菌分类中分属于真菌门的酵母菌在真菌分类中分属于真菌门的3 3个亚门:个亚门:即即子囊菌亚门、担子菌亚门和半知菌亚门子囊菌亚门、担子菌亚门和半知菌亚门但由于研究酵母的分类方法较研究一般丝状真菌特殊,但由于研究酵母的分类方法较研究一般丝状真菌特殊,荷兰科学家罗德荷兰科学家罗德(Lodder)(Lodder)的分类系统比较全面和实用的分类系统比较全面和
29、实用。第二节第二节 微生物的分类与命名微生物的分类与命名第八章第八章 微生物的分类与鉴定微生物的分类与鉴定第三节第三节 微生物分类鉴定的方法微生物分类鉴定的方法一、经典分类鉴定方法一、经典分类鉴定方法 二、现代分类鉴定方法二、现代分类鉴定方法 微生物的鉴定方法微生物的鉴定方法细胞的形态和习性水平细胞的形态和习性水平细胞组分水平细胞组分水平蛋白质水平蛋白质水平核酸水平核酸水平经典经典现代现代第三节第三节 微生物分类鉴定的方法微生物分类鉴定的方法一、经典分类鉴定方法一、经典分类鉴定方法鉴定步骤:鉴定步骤:获得该微生物的纯培养物获得该微生物的纯培养物测定一系列必要的鉴定指标测定一系列必要的鉴定指标查
30、找权威性的菌种鉴定手册查找权威性的菌种鉴定手册 经典分类鉴定中,分类鉴定的依据经典分类鉴定中,分类鉴定的依据(鉴定指标鉴定指标):1 1、形态学特征、形态学特征 2 2、生理生化特征、生理生化特征 3 3、生态学特征、生态学特征 4 4、血清学反应、血清学反应 5 5、噬菌体分型、噬菌体分型(宿主宿主对噬菌体的敏感性分型对噬菌体的敏感性分型)第三节第三节 微生物分类鉴定的方法微生物分类鉴定的方法一、经典分类鉴定方法一、经典分类鉴定方法个体形态特征:个体形态特征:细菌细胞的大小、形状、排列方细菌细胞的大小、形状、排列方 式、分枝、有无鞭毛、芽孢和荚式、分枝、有无鞭毛、芽孢和荚 膜及其形状和着膜及
31、其形状和着 生位置、染色反生位置、染色反 应等方面。应等方面。群体形态特征:群体形态特征:在固体培养基上的菌落形态和在在固体培养基上的菌落形态和在 液体培养基中的生长情况等。液体培养基中的生长情况等。第三节第三节 微生物分类鉴定的方法微生物分类鉴定的方法1 1、形态学特征、形态学特征一、经典分类鉴定方法一、经典分类鉴定方法2 2、生理生化特征、生理生化特征(1 1)营养特征)营养特征 碳源、氮源和能源的利用能力不同。碳源、氮源和能源的利用能力不同。(2 2)代谢产物)代谢产物 根据各种特征性的代谢产物鉴别菌种。根据各种特征性的代谢产物鉴别菌种。(3 3)酶活性)酶活性 淀粉水解、油脂水解、酪素
32、水解、明胶液化淀粉水解、油脂水解、酪素水解、明胶液化(4 4)在牛乳培养基中生长的反应)在牛乳培养基中生长的反应 牛乳中是凝固还是胨化,是产酸还是产碱。牛乳中是凝固还是胨化,是产酸还是产碱。第三节第三节 微生物分类鉴定的方法微生物分类鉴定的方法一、经典分类鉴定方法一、经典分类鉴定方法3 3、生态学特征、生态学特征 主要包括:主要包括:生长温度生长温度(最适、最低和最高温度最适、最低和最高温度)pH pH值值 水分水分 渗透压渗透压(是否耐高渗,是否有嗜盐性等是否耐高渗,是否有嗜盐性等)的适应性的适应性 需氧性需氧性(好氧、微好氧、厌氧及兼性厌氧好氧、微好氧、厌氧及兼性厌氧)宿主的种类及其与宿主
33、的关系宿主的种类及其与宿主的关系(共生、互生、寄生共生、互生、寄生)第三节第三节 微生物分类鉴定的方法微生物分类鉴定的方法一、经典分类鉴定方法一、经典分类鉴定方法4 4、血清学反应、血清学反应(又称抗原抗体反应又称抗原抗体反应)优点:特异性强、灵敏度高、简便快速。优点:特异性强、灵敏度高、简便快速。在在微微生生物物分分类类鉴鉴定定中中,常常用用已已知知菌菌种种、型型或或菌菌株株制制成成抗抗血血清清(抗抗体体),根根据据它它是是否否与与待待鉴鉴定定的的对对象象发发生生特特异异性结合反应性结合反应来鉴定未知菌种、型或菌株来鉴定未知菌种、型或菌株(抗原抗原)。常用血清学试验常用血清学试验(参见第七章
34、第二节参见第七章第二节P267)P267):凝凝集集反反应应、沉沉淀淀反反应应、补补体体结结合合反反应应、免免疫疫荧荧光光抗抗体体技术、酶联免疫吸附试验、免疫组织化学等方法。技术、酶联免疫吸附试验、免疫组织化学等方法。第三节第三节 微生物分类鉴定的方法微生物分类鉴定的方法一、经典分类鉴定方法一、经典分类鉴定方法5 5、噬菌体分型、噬菌体分型噬菌体有严格的寄主范围。噬菌体有严格的寄主范围。它它不不仅仅对对种种有有特特异异性性,而而且且对对同同种种细细菌菌的的不不同同型也有特异型也有特异性。性。可可利利用用这这些些特特性性,用用已已知知的的专专一一性性噬噬菌菌体体对对未未知的相应细菌进行种的鉴定。
35、知的相应细菌进行种的鉴定。参见第一章第六节参见第一章第六节P80-P80-噬菌体的应用噬菌体的应用第三节第三节 微生物分类鉴定的方法微生物分类鉴定的方法二、现代分类鉴定方法二、现代分类鉴定方法1 1、氨基酸顺序和蛋白质分析、氨基酸顺序和蛋白质分析(P291)(P291)2 2、通过核酸分析鉴定微生物遗传型、通过核酸分析鉴定微生物遗传型(P292)(P292)(1 1)DNADNA的碱基组成的碱基组成(G+C)mol(G+C)mol (2 2)核酸的分子杂交)核酸的分子杂交 DNA-DNADNA-DNA杂交杂交 DNA-rRNADNA-rRNA杂交杂交 核酸探针核酸探针 第三节第三节 微生物分类鉴定的方法微生物分类鉴定的方法