15-第十五章--常用医学统计软件简介.ppt

,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,第十五章,常用医学统计软件简介,预防医学,第一节,EpiData 3.02,软件简介,一、,EpiData,的基础知识,EpiData,由三种基本文件组成：,QES,文件（调查表文件），它的作用是定义调查表（问卷）的结构。,REC,文件（数据文件），它包括数据以及已经定义好的编码。,CHK,文件（数据录入核查文件），数据输入字段的有效性规则。,字段：每个字段就是我们临床观察表中的一个小项目。,它包括：,1.,字段的名称；,2.,字段的文本描述；,3.,字段的数据变量。,二、,EpiData,运行界面介绍,运行,EpiData.exe,会出现程序运行界面（图,15-1,）,图,15-1 EpiData3.02,软件主界面,二、,EpiData,运行界面介绍,第一行：,EpiData,菜单栏,1.,文件；,2.,数据核对；,3.,数据输入,/,输出；,4.,其他功能；,5.,工具；,6.,窗口设置；,7.,帮助。,第二行：,EpiData,工作过程工具栏,1.,建立调查表文件；,2.,生成数据文件；,3.,添加核对命令；,4.,数据录入；,5.,其他功能；,6.,数据输出。,第三行：,EpiData,常用的几个快捷工具按钮,三、使用,EpiData,建立临床数据录入表,图,15-2,需要建立数据库的原调查表示意图,1.,打开原始的调查表（见图,15-2,）。,（一）建立调查表文件,点击“建立调查表文件”按钮，选择“建立新调查表文件”。,图,15-3,选择字段类型,2.,根据原始表格在,EpiData,输入相关内容。在“姓名”之后，点击“选择字段类型”按钮，在选项卡片之中选择“文本”，设置为文本，长度,8,个字节（注意一个汉字的长度需要,2,个字节），点击“插入”按钮（图,15-3,）。,三、使用,EpiData,建立临床数据录入表,图,15-4,产生,qes,调查表,3.,依此类推将其他观察指标进行输入并保存（图,15-4,）。,三、使用,EpiData,建立临床数据录入表,图,15-7,自动提醒自动保存数据库对话框,点击“输入数据”按钮，打开“脑血管病人血脂调查表,.REC”,文件，将数据输入表格，录入完整后，软件会自动提醒进行保存（图,15-7,），确认保存之后就可以输入下一张表格的数据了。,（三）数据录入,三、使用,EpiData,建立临床数据录入表,图,15-8,输出的文本类型数据库,点击“数据输出”按钮，选择“脑血管病人血脂调查表,.REC”,文件。,（四）数据输出,三、使用,EpiData,建立临床数据录入表,图,15-9,输出的,Excel,数据库,三、使用,EpiData,建立临床数据录入表,Epidata,提供了对字段的进一步设置功能。点击工作过程工具条中“添加核对命令”按钮，仍旧选择“脑血管病人血脂调查表,.REC”,这个数据文件，同样会出现我们作好的电子表格，这时软件也会自动生成同名的,.CHK,文件，同时会有一个数据核对窗口（如图,15-10,）。,（五）优化数据表,三、使用,EpiData,建立临床数据录入表,图,15-10,数据核对数据库窗口,三、使用,EpiData,建立临床数据录入表,图,15-11,逻辑值设置窗口,1.Rang,，,Legal,：是定义一个字段的数字范围及合理数。,例如，我们对“年龄”字段进行设置，输入“,50-85”,（图,15-11),。,三、使用,EpiData,建立临床数据录入表,Jump,：跳转命令。,Must enter,：如果当前字段必须输入数据，则需要使用这个规则，选择,Yes,。,Epidata,的默认选择为,No,。,Repeat,：如果在编辑表中,Repeat,选择项中选择“,Yes”,则前一个记录中的该字段值将自动出现在下一个记录的该字段中。,Value label,：是将一组具有解释数值意义的文本与数值结合。,三、使用,EpiData,建立临床数据录入表,图,15-13,编辑数据标签窗口,例如，我们对“职业”这个,字段进行设置,(,图,15-13,）。,图,15-14,选择数值窗口,当录入职业时，按,F9,键，这时会,弹出一张转换表，如下（图,15-14,）。,三、使用,EpiData,建立临床数据录入表,图,15-15,数据核查结果,为了保证数据录入的可靠性，我们可以让两个人分别输入同样的一,组调查表数据，,Epidata,提供了对两个相同数据文件的检查功能。,三、使用,EpiData,建立临床数据录入表,（六）如何核查数据文件,第二节,SPSS10.01,社会医学统计软件包,一、,SPSS10.01,主要的功能窗口,SPSS10.01,主要有,3,大窗口：,数据编辑窗口（,Data Editor,）,结果输出窗口（,Viewer,）,语句编辑窗口（,Syntax Editor,）,一、,SPSS10.01,主要的功能窗口,图,15-16 SPSS,主界面窗口,整个数据编辑窗口分为标题栏、菜单栏、工具栏、编辑栏、内容区和,状态栏。,SPSS,程序很大，命令和功能也很多，我们主要介绍菜单栏上,的,10,个菜单命令。（见图,15-16,）,（一）,SPSS,数据编辑窗口,一、,SPSS10.01,主要的功能窗口,SPSS,输出窗口是用于展示,SPSS,的统计分析结果。其菜单命令与数据编辑窗口相似，只是减少了几个菜单项，而另加了一个,Insert,菜单项，在图形编辑窗口中，可以作图形转换,可存为,.spo,为后缀的文件。,（二）,SPSS,输出窗口,一、,SPSS10.01,主要的功能窗口,在语句编辑窗口，,SPSS,过程以命令语句形式出现。该窗口还可以编辑对话框操作不能实现的特殊过程的命令语句。窗口中所有的命令语句最终形成一个命令语句文件，可存为,.sps,为后缀的文件。,（三）,SPSS,语句编辑窗口,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,1.,统计描述：,Analyze Descriptive Statistics Frequencies,Descriptives,Explore,Analyze Compare Means Means,这里只简单介绍,Frequencies,过程和,Descriptives,过程。,（一）数值变量资料的统计分析,图,15-17,描述统计量结果,1,）结果如下：,（,1,）频数分析（,Frequencies,）,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-18,直方图,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,2,）对资料进行分组：,Transform Recode Into same Variables,3,）对已分组资料进行频数分析步骤：,输入各组组中值,x,和频数,f,；对变量值进行加权，进行,Weight cases,过程；进行,Frequency,过程，此步同原始数据资料的操作。,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,Descriptives,对话框（图,15-19,）,Options,对话框（图,15-20,）,（,2,）描述统计（,Descriptives,）,图,15-21,描述性统计量显示,结果如下：显示描述统计量（见图,15-21,）。,（,2,）描述统计（,Descriptives,）,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,Analyze Compare Means One-samples T Test,Independent-samples T Test,Paired-samples T Test,One-way ANOVA,Analyze General Linear Model Univariate,2.,统计推断,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,例：有,83,例患者的血小板资料，问患者的血小板与正常人的平均值,150(10,9,/L),有无统计学意义，同时估计患者血小板的可信区间。,步骤：,1,）,Analyze Compare Means One-samples T Test,，打开对话框；,2,）把变量血小板转到右边的“,Test Variables”,栏中（见图,15-22,、,15-23,）；,（,1,）单样本,t,检验（,One-Samples T Test,）,2.,统计推断,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,t,检验对话框（图,15-22,）,Options,对话框（图,15-23,）,图,15-24,单样本,t,检验结果,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,例如有一个,189,例患者的临床资料，问不同性别之间的收缩压,(bp1),、舒张压,(bp2),分别是否相同？,步骤：,1,）,Analyze Compare Means Independent-samples T Test,；把变量,bp1,、,bp2,转到“,Test Variables”,栏中；,2,）把变量,sex,转到“,Grouping Variable”,栏中，激活“,Define Groups”,对话框，定义两组的两个值，然后单击,ok,按钮,返回；（见图,15-27,）,2.,统计推断,(2),成组设计两样本,t,检验（,Independent-samples T Test,）,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-27,两独立样本,t,检验对话框,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-28,两独立样本,t,检验描述性统计量,3,）检验；单击“,OK”,按钮即可。结果如下：,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-29,两独立样本,t,检验结果,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,结果显示：收缩压和舒张压的方差齐性检验的,F,值分别为,0.092,和,1.118,，说明方差齐，收缩压,P,=0.015,0.05,，不同性别间差异有显著性；但不同性别的舒张压差异无显著性，,P,=0.057,0.05,。,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,例如有,20,名患者，按性别和年龄配成,10,对，随机分到两组，一组服用新药，另一组服用安慰剂，然后观察某实验指标，问新药和安慰剂的疗效有无差别？,2.,统计推断,（,3,）配对,t,检验（,Paired-samples T Test,）,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-30,配对比较,t,检验,分析步骤如下：,Analyze Compare Means Paired-samples T Test,，打开对话框；,从左侧同时选中两个成对变量，转到“,Paired Variables”,栏中；,t,检验对话框结果类似单样本,t,检验，,P,=0.158,0.05,，尚不能说明新药和安慰剂的疗效不同。结果见图,15-30,。,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,例如有一个,189,例患者的临床资料，问不同意识程度之间的收缩压,(bp1),、舒张压,(bp2),分别是否相同？,分析步骤如下：,Analyze Compare Means One-way ANOVA,，打开对话框；,把变量,bp1,、,bp2,转到“,Dependent List”,栏；,2.,统计推断,（,4,）单因素方差分析（,One-way ANOVA,）,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,把变量意识程度转到“,Factor”,栏中；,单击“,Contrasts”,按钮，激活对话框，选择“,Polynomial”,，单击“,Continue”,按钮返回；,单击“,Post Hoc”,按钮，激活对话框，若方差齐时选择,Bonferroni,两两比较方法，方差不齐时选择,Tamhanes T2,方法，单击“,Continue”,按钮返回；,单击“,Options”,按钮，激活对话框，选择,Descriptive,和,Homogeneity-of-variance,选项，单击“,Continue”,按钮返回；,单击“,OK”,即可。（具体见图,15-31,、,15-32,、,15-33,）,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-31,单因素方差分析对话框 图,15-32 Contrasts,对话框,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,结果如下：包括各组变量值的描述统计（图,15-34,）；方差齐性检验（图,15-35,）；,从方差分析表中可知，不同意识程度之间的收缩压、舒张压相等，,P,分别为,0.922,、,0.108,，均,0.05,；两两比较表省略。,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-34,一般描述性统计量,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-35,方差齐性检验结果,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,例如,16,只家兔按种属分成,4,个区组，每个区组中的,4,只家兔分别在不同室温下（,5,、,10,、,15,、,20,度）测血糖浓度，问不同室温下家兔的血糖浓度是否相同？,步骤：,Analyze General Linear Model Univariate,，打开对话框；,从左侧选中变量“血糖浓度”转到“,Dependent Variable”,栏中，处理因素选入“,Fixed Factor”,栏中，区组因素选入“,Random Factor”,栏中；单击“,OK”,即可。见图,15-36,2.,统计推断,（,5,）随机区组设计的方差分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-36 Univariate,对话框,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-37,（双因素设计方差分析结果）,结果表明不同室温下家兔的血糖浓度不相同。,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,1.,统计描述：,Analyze Descriptive Statistics Frequencies,Crosstables,频数分析（,Frequencies,）,可产生频数表，计算构成比；也可以绘出条图或圆图。,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,例：有一组临床病人的资料，观察性别和意识程度情况。,步骤：,（,1,）,Analyze Descriptive Statistics Frequencies,，打开对话框；,（,2,）从左侧选中性别和意识程度两变量，转到“,Variables”,栏中；,（,3,）单击“,Charts”,按钮，打开对话框，选中,Bar Charts,或,Pie Charts,选项，单击“,Continue”,返回后，单击“,OK”,即可（见图,15-38,、图,15-39,和图,15-40,）。,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-38 Frequencies,对话框,（二）分类资料的统计分析,图,15-40 Charts,对话框,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-39 format,对话框,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-41,分类资料描述统计量,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-42,分类变量直条图,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,列联表分析（,Crosstables,）,可产生四格表、,RC,表，计算率或构成比；同时进行,2,检验。,2,检验在,SPSS,中的过程：,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-43,分类频数表资料数据库结构,在数据编辑窗口中确定行变量、列变量、频数变量（图,15-43,）；,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,必须指定频数变量，,Data Weight Cases,，前面已阐述过；,Analyze Descriptive Statistics Crosstables,，打开对话框，把行变量和列变量分别从左侧转到右侧的,Rows,和,Columns,栏中；,单击“,Statistics”,按钮，激活对话框，根据不同资料、不同的研究目的，在对话框中选入不同的分析指标，然后单击“,Continue”,返回后，单击“,OK”,即可。,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-44,卡方检验主要对话框,如何在,Statistics,对话框中选入不同的分析指标（图,15-44,）：,（二）分类资料的统计分析,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,下面结果里,2,=26.066,，,P,=0.000,，表明不同喂养方式的婴儿腹泻发生率不同。具体结果见图,15-45,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-45,卡方检验结果,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,Analyze,菜单,Nonparametric Tests,Two-Independent-Samples Tests,Tests for Several Independent Samples,Two-Related-Samples Tests,Tests for Several Related Samples,（三）非参数检验,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,1.,成组设计两样本均数比较的非参数检验（,Two-Independent-Samples Tests,）,如比较两种手术方案患者的生存日数间的比较，假设生存日数呈偏态分布。在“,Test type”,复选框组中选中最常用的“,Mann-Whitney U”,复选框（图,15-46,）。,（三）非参数检验,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-46,成组比较秩和检验对话框,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-47,两组比较秩和检验结果,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,2.,配对设计两样本均数比较的非参数检验（,Two-Related-Samples Tests,）,在“,Test type”,复选框组中选中最常用的“,Wilcoxon”,复选框，即配对设计两样本均数比较的秩和检验。结果如下：,Wilcoxon Signed Ranks Test,（图,15-48,）结果中,P,=0.154,，说明两种方法相同。,（三）非参数检验,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-48,配对设计秩和检验结果,（三）非参数检验,2.,配对设计两样本均数比较的非参数检验,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,3.,成组设计多样本均数比较的非参数检验（,Tests for Several Independent Samples,）和区组设计多样本均数比较的非参数检验（,Tests for Several Related Samples,）,它们的基本对话框分别如下，与方差分析中不同的是：它们不提供多重比较。（主要对话框见图,15-49,、,15-50,）,（三）非参数检验,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-49,成组设计多样本秩和检验图,15-50,随机区组设计多样本秩和检验,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-51,完全随机设计秩和检验主要结果,NPar Tests,主要结果见图,15-51,Kruskal-Wallis Test,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,Analyze Correlate Bivariate,（双变量相关）、,Partial,（偏相关分析）,Analyze Regression Linear,例：随机抽取,10,名女中学生，测得体重和肺活量情况，问女中学生的体重与肺活量之间有无直线关系？,（四）直线回归和相关,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-53,直线回归的主要对话框,（四）直线回归和相关,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-54,回归模型拟合指标选择对话框,（四）直线回归和相关,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-55,描述性统计量结果 图,15-56,模型优劣评价指标,Regression,结果,（四）直线回归和相关,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-57,两个变量的相关分析结果,（四）直线回归和相关,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-58,回归系数显著性检验结果,（四）直线回归和相关,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,图,15-59,线性回归分析主要结果,（四）直线回归和相关,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,从结果中可知方程的决定系数、调整决定系数、剩余标准差分别等于,0.482,、,0.418,、,331.19,；女中学生的体重与肺活量之间有直线关系，因为对回归系数,b,做,t,检验，,P,=0.026,0.05,；直线回归方程为：肺活量,=,-1375.228,+,91.117,体重。,（四）直线回归和相关,二、主要统计方法的软件实现及结果解释,思考题,1.,建立数据库在,Epidata3.02,中关键的步骤有哪些？应该注意哪些问题？,2.SPSS,软件有哪几个主要的窗口，各自有和功能？,3.,如何在,SPSS,软件中对于一个定量变量进行适当的分组？,4.,列出,SPSS,软件对于分类变量统计学方法的主要步骤及注意事项。,（潘发明,）,