靶向上调ID4基因表达药物的生物信息学预测、分析和验证.ppt

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,靶向上调ID4基因表达药物的生物信息学预测、分析和验证,解放军总医院南楼血液科,卢学春 杨波 朱宏丽等,生物信息学在全球迅猛发展,基因基因组学,蛋白质蛋白质组学,表观遗传学表观基因组学,疾病状态的,如何利用数据库为我们服务？,生物信息学！,表观遗传学的贡献,抗癌基因的丢失与肿瘤的发生密切相关,ID4,基因的表达缺失而非突变与白血病和淋巴瘤的发生密切相关,ID4丢失对白血病治疗前景的启示,重新表达！,转染,-,基因治疗,药物诱导,哪些药物能够诱导ID4基因的表达？,生物信息学可以预测！,实验室证实,ID4基因5侧翼区顺式作用元件的预测结果,调控区,顺式元件,位置,正向调控,c-Myb,-903,-621,-441,-374,-149,-136,-606 NR,Sp1,-901N,-872NR,-867,-559,-369,-283,-187,-118,-91,-58,+14,+17,+45,+47,+48,+78,+81,+91,+94,+1004,+1006,+1007,+1011+124,+130,+132,+133,+134,+173,+191,+193,+194,+231,+233,+235,+236,+259,+260,abaA,-794NR,-498,-424,-419,-350,-157,-4,C/EBPalpha,-705,-369,-572,-253,-108,GR,-355NR,-148,-106,Zeste,-291,-249,-80,-32,+34,+53,+61,CRE/half,-301，-267,ERE,-244，-214，-181，-155，-129，-68，-28,负向调控,GCF,+44,+133,+160,+177,WT1-KTS,+46,+102,+105,+131,+124,HiNF-C,+105,+131,+46,EGR2,+107,+127,+133,+194,CACC-binding factor,-873,-871 NR,-283,ID4基因表达谱的生物信息学预测,雌激素对ID4基因表达的影响,a.C57BL/6小鼠卵巢切除后的胸腺用17-雌二醇（E2）或E2的类似物三羟基异黄酮处理.b.卵巢切除14天后，小鼠皮下注射黄体酮，在不同时间点切除子宫检测,对ID4基因表达具有抑制作用的因素,a.肺组织取自100氧损伤的野生型Nrf2敲除小鼠.b.用100uM ZVAD处理REtsAF-Bcl-2细胞，并在39.5条件下培养使caspases失活.REtsAF-Bcl-2细胞带有温度敏感的LT抗原突变体，能够在33而非39.5条件下抑制p53基因的活性.c.脊髓组织，200ng的二羟维生素D3对多发脊髓硬化B10PL小鼠基因表达的影响.d.比较对Sindbis病毒具有抗性和敏感性293细胞的基因表达,对ID4基因表达具有促进作用的因素,a.3日龄小鼠用ATRA处理.在第4天给一半小鼠以地塞米松（DEX）.b.额叶皮质的基因表达，取自过表达人类乙酰胆碱酯酶（AchE）的雌性小鼠和雌性FVB/N小鼠.C.巨噬细胞和脐静脉内皮细胞用100nM白三烯处理1小时后的基因表达.d.来自骨髓的巨噬细胞PIAS1用500U/ml的IFN-或10ng/ml IFN-处理2h或4h.,有关ID4基因表达调控的文献,No.,paper,Author,Experiment materials,ID4 expression,1,Nat-Genet,Yu L,2005,mice,Methylation(-),2,Oncogene,Umetani N,2005,breast cancer tissues,Methylation(-),3,Oncogene,Chan AS，2003,breast cancer cell lines,Methylation(-),4,Anal-Biochem,Semov A，2002,WI-38 fibroblast,E-box binding factor and c-Myc-binding protein(-),5,Endocrinology,Chaudhary J，2001,Sertoli cell line,FSH and cAMP(+)*,6,Exp-Cell-Res,Andres BPJ,1999,mouse forebrain astrocytes,cAMP(-)*,7,J-Biol-Chem,Pagliuca A,1998,DNA sequence,E-box(+),GA(-),*不同研究结果间存在矛盾,.(-)抑制表达;(+)促进表达,二丁酰环磷腺苷钙对MOLT4白血病细胞系表达ID4基因的影响,DL2000为DNA分子量标准；M4为不做任何处理的MOLT4细胞系，M4-DC浓度为0.1mmol/L的二丁酰环磷腺苷钙处理48h。ID4基因的PCR产物长度为364bp。内参hHPRT的产物长度为231bp。,结 论,生物信息学可用于筛选靶向调控功能基因表达的药物,二丁酰环磷腺苷具有诱导,ID4,基因在白血病细胞中表达的作用，对,ID4,基因表达缺失的白血病细胞可能具有杀伤作用,ID4,基因的表达可能还受糖皮质激素、雌激素、甲状腺素和卵泡刺激素等多种活性物质调控,谢 谢,