静息态处理.ppt

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,静息态处理,fMRI 数据预处理,用spm做预处理：,slice timing,realign(Est&Res),Normalise(Est&Wri),Smooth,无需去协变量 全脑均值,ICA使用的是smooth之后的数据。,使用GIFT软件做独立成分分割,软件包如同SPM 只需添加到matlab搜索路径中保存然后在matlab中输入：gift 即可调用。,其使用说明书和相关文档：,主界面,Is your data stored in one folder？,选择 All*即可。,这说明第一个被试有一个run，200个时间点，点击一下右边呈蓝色，则Files Selected：200 表示选中了第一个被试的这200个时间的数据。,无需去协变量 全脑均值,其他的选项选择默认不变就可以了。,（如要做全脑尺度的网络，选的IC比较多，简单的办法是使用功率谱分析，排除非功能网络IC）,Is your data stored in one folder？,第一行：选择输入文件前缀（按个人习惯）,（如要做全脑尺度的网络，选的IC比较多，简单的办法是使用功率谱分析，排除非功能网络IC）,Subject Session 1，变蓝,软件包如同SPM 只需添加到matlab搜索路径中保存然后在matlab中输入：gift 即可调用。,第一步：对要考察的各个成分的时间序列进行滤波0.,Run Analysis，出现右边的选框,下面点击Subject1Session1,选则好数据后一般是要估计成分数的。,选择好后 Directories selected：1,选择好后 Directories selected：1,导入数据以及参数选择,setup ICA Analysis 选择输出路径,注意：,（每个被试的数据有一个文件夹，然后将所有文件夹放在同一个路径下）就是选择这个路径。,选择好后 Directories selected：1,第一行：选择输入文件前缀（按个人习惯）,第二行：选择要处理的数据，点入：,Is your data stored in one folder？,选择No（因为你的每一个被试都有一个文件夹）,被试数目选择,：（即所有被试数目总数）,Session处选择1，这里每个被试只有一个数据集（即我们说的一个run）,点ok,左边一栏为所有被试的数据输入的入口，从第一个起逐一选择每一个被试：点击,Subject Session 1，变蓝,下面点击Subject1Session1,选择第一个被试的数据,在左栏找到第一个被试的文件夹点入，右边即显示了：,1:200swrasub01_run1_*img,1,这说明第一个被试有一个run，200个时间点，点击一下右边呈蓝色，则Files Selected：200 表示选中了第一个被试的这200个时间的数据。,其他被试操作相同直到所有被试的数据都选中好。,选则好数据后一般是要估计成分数的。,这里虽然给出了一个默认的20个IC 但是在上面一个选项中要选择yes，来估计IC数目。,这就是估计出来的IC数目：,平均数目为36，最小的为27，最大的为54；,第二行：选择要处理的数据，点入：,平均数目为36，最小的为27，最大的为54；,点击Done 下一栏的所有选项也保持默认不变 直接点击Done。,左边一栏为所有被试的数据输入的入口，从第一个起逐一选择每一个被试：点击,先选中Component变绿，然后选择右下方的Display 即可以看到我们前面选择的27个成分的空间解剖分布及其对应的时间序列：,左边一栏为所有被试的数据输入的入口，从第一个起逐一选择每一个被试：点击,Subject Session 1，变蓝,其他的选项选择默认不变就可以了。,先选中Component变绿，然后选择右下方的Display 即可以看到我们前面选择的27个成分的空间解剖分布及其对应的时间序列：,选择好后 Directories selected：1,Is your data stored in one folder？,（如要做全脑尺度的网络，选的IC比较多，简单的办法是使用功率谱分析，排除非功能网络IC）,被试数目选择：（即所有被试数目总数）,当然取的成分数过多就会将这些网络细分开。,选则好数据后一般是要估计成分数的。,Number of IC，这里的选择是不确定的，具体填多少要看最后分出来的效果，即，要与研究的问题相结合。,一般来讲；要求分出：,DMN（默认模式网络）、感觉网络、自参考网络、视觉网络、听觉网络、运动网络当然还必须包括你要研究的ICs；当然取的成分数过多就会将这些网络细分开。,一般IC可以从最小的选择起，如这里选择27，最后看分出的效果，不好再改变。,其他的选项选择默认不变就可以了。,点击Done 下一栏的所有选项也保持默认不变 直接点击Done。,在主菜单栏中选择：,Run Analysis，出现右边的选框,然后选择刚才生成的.mat参数文件，如蓝色 点击ok即可。,选择 All*即可。,至此，已经完成了，数据的导入和输出。耐心等待它的处理。,先选中Component变绿，然后选择右下方的Display 即可以看到我们前面选择的27个成分的空间解剖分布及其对应的时间序列：,按解剖细节区分各个成分,ICA后处理,选择和确定好要研究的IC,这里IC相当于大脑之中的功能子网络，当然，作为更大尺度的网络来看，各个功能子网络之间也是相关的，根据这种相关程度可以构建更大尺度的网络并进一步进行分析：,第一步：对要考察的各个成分的时间序列进行滤波0.01到0.8Hz；,（如要做全脑尺度的网络，选的IC比较多，简单的办法是使用功率谱分析，排除非功能网络IC）,网络一般的构建方法与常用的分析：,谢谢观看,