医药文献方法学第一部分文献利用.ppt

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,1.,药学文献信息资源的利用,2.NoteExpress,参考文献管理,3.,应用文献计量分析法深度挖掘药学信息,4.,学术期刊在线投稿,内容提纲,一、医药学文献,信息资源的利用,CNKI、,维普、,万方,Thieme,、,Adis,、,Scopus,、,Pubmed,、,Google Scholar,WebofScience,、,Scifinder scholar,、,Elsevier,、,springer,、,EBSCO,、,ACS,、,Thomson Integrity,专利、,工具书等,主题词的选取,1.,找到合适的检索词,a.,在检索过程中进行修正,b.,外文名称可以通过专业词典或从中文文献的英文摘要中提取,2.,检索中文文献，了解该课题的大致进展,维普的特点是收录范围广,CNKI,的特点是专业性强,3.,检索外文文献，进一步了解该课题的国际研究水平。,(,如何选取主题词,),对检索结果进行分析,创建引文报告,创建引文报告,创建引证关系图,1.2,其它检索方法,2.1,概述,美国化学文摘,(Chemical Abstracts,，,CA),，创刊于,1907,年，是由美国化学文摘社,(Chemical Abstracts Service,，,CAS),编辑出版的、检索化学化工、生命科学领域文献的最具权威的检索工具。,它收录了,150,个国家、,56,种文字、,16000,多种期刊和,50,个国家和两个地区的专利文献。,检索药理学文献可选择世界公认的最具权威性和代表性的医学文献数据库,MEDLINE,。,而,SciFinder Scholar,拥有包括,MEDLINE,在内的共,6,个数据库。,2.SciFinder Scholar,数据库,2.2 Scifinder Scholar,含有,6,个数据库,Scifinder,CAplus,Medline,Registry,CASReact,Chemcats,Chemlist,物质数据库,反应数据库,管制品物质数据库,商品来源数据库,2.SciFinder Scholar,数据库,2.3,检索方法,信息检索,信息定位检索,期刊目次浏览,2.SciFinder Scholar,数据库,2.3.1 explore literature,有三种检索方法供选，即研究主题途径、作者途径和机构组织名称途径,。,2.SciFinder Scholar,数据库,2.3.2 explore substances,化学结构：如检索杨梅素药理学文献，可用画图工具画杨梅素结构式再进行检索操作。,分子式：输入杨梅素的分子式,C,15,H,10,O,8,检索得到,60,种该分子式的同分异构体，椭圆形曲线所圈结构式即为杨梅素的结构式。,2.SciFinder Scholar,数据库,2.SciFinder Scholar,数据库,2.3.3 locate substances,输入杨梅素标准化学名称：,4H-1-Benzopyran-4-one,3,5,7-trihydroxy-2-(3,4,5-trihydroxyphenyl)-,，同样检索到,2187,篇相关文献，与通过,物质登记号,检索结果相一致。,下面有很多副主题词供我们选择，包括副作用及毒性、分析研究、生物学研究、现象、制备、过程、理化性质、应用等。,(,无药理学副主题词,),2.SciFinder Scholar,数据库,2.4,后处理工具,Analyze,通过选择各种索引条目 对大量的初始检索结果进行趋势分析，以柱状图形象表达出来，逐步接近检索目标；,Refine,明确检索目标、缩小检索范围、提高检索准确性和命中率，象漏斗一样过滤掉不准确的结果；,Categorize,通过索引条目和,CAS RN,来更深入分析检索结果（更高级的分析工具）。,2.SciFinder Scholar,数据库,CA,分类分析图,共检索到,2187,篇以,MYR,为主题词的文献,2.SciFinder Scholar,数据库,出版时间分析,2.SciFinder Scholar,数据库,输入用户名和密码,Http:/scifinder.cas.org,SciFinder,Web,检索主界面,保存过的结果集,邮件提醒,文献检索途径,a KMP,定题查询,设置提醒文件名和失效时间,设定,Email,提醒，一旦有新的记录，会发邮件通知。,可以允许使用者对多个已保存的文献结果集进行,AND,，,OR,，,NOT,等操作。,在,Save Answer Sets,中选择两个或者多个文件。,Combine,进行布尔逻辑运算符,OR,操作。,Intersect,进行布尔逻辑运算符,AND,操作。,Exclude,进行布尔逻辑发,NOT,操作,b,组合功能（,Combine,）,c Markush,检索,28,直接检索和结构有关的专利，用于做初步的专利评估,29,d SciPlanner,SciPlanner,是一个特定的工作区域，可以让用户用一种更加直接的方式去组织、管理检索结果。文献、物质、反应信息都可以传送到,SciPlanner,，并在其中进行自由组织，增强可视化效果。,勾选感兴趣的反应，点击,Send to SciPlanner,，,可以看到有,1,条反应推送到,SciPlanner,3.1,概述,美国化学会,(AmericanChemicalSociety,，,ACS,）成立于,1876,年，现已成为世界上最大的科技学会。,ACS,一直致力于为全球化学研究机构、企业及个人提供高品质的文献资讯及服务,是享誉全球的科技出版机构。,其期刊被,ISI,的,JournalCitationReport(JCR),评为“化学领域中被引用次数最多的化学期刊”。,3.ACS,电子数据库,3.2,检索方法,3.2.1,按期刊名称浏览检索,以检索期刊论文为例：如欲检索期刊,Journal of the american chemical society,中的某一篇论文，先点击,Journal A-Z,，显示当前所有收录期刊名称，再选择该刊，依据已知的卷期号即可检索到该论文。,3.ACS,电子数据库,3.ACS,电子数据库,3.ACS,电子数据库,3.2.2,按学科领域检索,3.ACS,电子数据库,3.2.3,快速检索,3.ACS,电子数据库,3.ACS,电子数据库,3.2.4,文献出处检索,3.ACS,电子数据库,3.2.5 DOI(,数字对象标识符,),检索,3.ACS,电子数据库,DOI(digital object identifier),数字对象唯一标识,被誉为互联网上的条形码,是国际出版界的事实标准,可兼容包含其它编码方案,如,ISBN ISSN,甚至身份证号,.,由两部分组成,前缀和后缀,中间一条斜线分开,.,90%,以上的西文科技刊物已通过注册,DOI.,国内大型数字期刊都不同程度使用了唯一标识符,并对期刊、报纸等各种数字资源进行了标识，但在应用,DOI,方面仍处于初级阶段。,2007,年以前，国内英文期刊，通过,CrossRef,加入,DOI,，,2007,年,3,月，,IDF,正式授权中国科技信息研究所和万方数据公司，成立中文,DOI,注册机构，推动,DOI,在国内的规模化、标准化、公益化应用发展。,3.ACS,电子数据库,3.ACS,电子数据库,4.1,概述,Adis,国际组织提供药理学、治疗学和疾病控制方面的医学信息已有,40,年的传统。,Adis,的出版物所有原稿都被国际评论专家视为上品，所以可以确认那些用来帮助你做决定或研究的信息是独立的、客观的，质量很高的。,Ovid,将这些出色的刊物与,JournalsOvid,界面的高级搜索功能相结合时，,Adis,期刊的价值被发挥到最大。,4.Adis,核心药学电子期刊,4.2,检索方法,4.Adis,核心药学电子期刊,4.2.1,基本检索,4.Adis,核心药学电子期刊,4.2.2,引文检索,4.Adis,核心药学电子期刊,4.2.3,字段检索,4.Adis,核心药学电子期刊,4.2.4 Ovid,高级检索,4.Adis,核心药学电子期刊,4.2.5,多个字段检索,4.Adis,核心药学电子期刊,4.2.6,浏览检索,4.Adis,核心药学电子期刊,检索结果管理,4.Adis,核心药学电子期刊,检索助手,4.Adis,核心药学电子期刊,5.1,概述,Thieme,是具有百年历史的国际性科学和医学出版社，是德国最大的医学出版社之一，内容集中于医学和生物化学。,到目前为止，,Thieme,出版了,130,多种印刷版本和电子版本的医学和科学期刊，其中,60,多种是代表各专业学会出版的。,5.Thieme,期刊数据库,5.2,检索方法,5.2.1,按学科（,Subject List,）浏览检索,5.Thieme,期刊数据库,5.Thieme,期刊数据库,5.2.2 Alphabetical List,5.Thieme,期刊数据库,5.2.3 Quick Search,5.Thieme,期刊数据库,5.2.4 Advanced Search,5.Thieme,期刊数据库,6.1,概述,由美国国立医学图书馆（,NLM,）所属的国家生物技术信息中心（,NCBI,）开发的生物医学文献检索系统。从,1997,年,6,月起，,PubMed,在网上免费向用户开放。,www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed,6.PubMed,数据库,6.2 MeSH,检索,6.PubMed,数据库,可选副主题词,6.PubMed,数据库,该主题词所替代的非规范词形式,6.PubMed,数据库,检索结果,可参见的短语,6.PubMed,数据库,检索细节,检索历史,6.PubMed,数据库,6.3,高级检索,6.PubMed,数据库,为了促进专利信息的利用，帮助世界范围的用户 从网上获取免费的专利信息资源，,1998,年夏，欧洲专利局、欧洲专利组织成员国及欧洲委员会共同研究开发了欧洲专利局专利数据库网站这一网上免费检索系统。,2005,年，该网站进行了全新改版，可使用英、德、法三种语言检索,EP,、,WO,（,PCT,）、,JP,及世界范围的专利文献。,7.,欧洲专利数据库,(Quick Search,7.,欧洲专利数据库,7.2 Advanced Search,7.,欧洲专利数据库,7.3 Number Search,7.,欧洲专利数据库,8.Google Scholar,Google Scholar,是网络搜索领域的领头羊。,Google,公司于,2004,年,11,月,18,日推出的一项新的搜索服务，它能帮助用户查找包括期刊论文、学位论文、书籍、预印本、摘要和科技报告等在内的学术文献，内容涉及诸多学科，并且经过了业内专家的评审，具有一定的权威性。,它以“站在巨人的肩膀上”为服务理念，通过知识链接功能提供了文章的引用次数及链接，人们可以利用它查找文献的被引用情况，这是目前为止除,web of science,、,scopus,外的另一个可以检索英文文献被引情况的检索工具。,2006,年,1,月,11,日,Google,推出了,Google,中文学术搜索，用于搜索网上的中文学术文献,.,Google Scholar,提供检索结果按相关度排序，文章的作者、出版者知名度和文献引用量等都是,Google Scholar,对其进行排序的重要依据，如该篇文章或该本书的作者越著名，其学术专业的价值地位就越高，在排序时就越靠前。这种排序方式可显示内容最相关的文献，节省了选择文献的时间。,Google Scholar,检索结果中，每篇文献后都会显示该篇文献被引用的次数以及引用文献 的相关链接。由于其收录的数据多，提供的被引用文献的数量也多。,8.1 Google Scholar,结果排序方式,为用户自动提供动态的文献信息提示，减少了用户跟踪课题检索文献的时间。提醒功能一般包括检索提示,(,同一个检索式有新的检索结果,),、引文提示,(,某一篇文章又被新的文章所引用,),、期刊提示,(,关注的期刊新的一期的出版,),、主题提示,(,关注的主题有新的文章发表,),。当数据库有新的符合用户要求的文献时，数据库就会自动以邮件的形式给用户发送提醒。,8.2 Google Scholar,设有提醒功能,8.3 Google Scholar,检索方法,8.3.1,简单检索,题目为“,The dietary flavonoids myricetin and fisetin act as dual inhibitors of DNA topoisomerases I and II in cells”,的文献被以下,5,篇文献引用。,题目为“,The dietary flavonoids myricetin and fisetin act as dual inhibitors of DNA topoisomerases I and II in cells”,的文献有如下两个版本。,com,不能下载全文,gov,能下载全文,19,美元,/,篇外文,10,元,/,篇,.,。,8.3.2,高级检索,8.3.3 Alert,提醒功能,8.4,学术搜索设置,综上，,Google Scholar,和图书馆购买的文献数据库都是科研人员获取文献的主要途径，但在获取文献方面有些不同。由于,Google Scholar,缺少一些特殊功能设置，读者在进行检索时，一定要将,Google Scholar,与文献数据库并重。最好以文献数据库为主、,Google Scholar,作为补充。这样可以获取更多的文献信息和与检索课题有关的深层信息。,为了解学科领域一些动态信息，还可以访问,丁香园等网站,得到更多实验方法上的帮助。,VPN,丁香园,:,