收藏 分销(赏)

TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解培训课件.ppt

上传人:二*** 文档编号:12600865 上传时间:2025-11-09 格式:PPT 页数:29 大小:2MB 下载积分:5 金币
下载 相关 举报
TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解培训课件.ppt_第1页
第1页 / 共29页
本文档共29页,全文阅读请下载到手机保存,查看更方便
资源描述
单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,*,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,目录,2,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,前言,01,the Cancer genome ATLAS,4,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,癌症种类丰富,样本量大,34 kinds of cancer,325 samples on average,5,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,6,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,cancergenome.nih.gov/,7,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,数据产生历程,02,组织样本和临床数据来源网站(TSS)收集的数据发送到Biospecimen核心资源(BCRs)。,2.BCRs提交临床数据和元数据到数据协调中心(DCC)和测序中心(GSCs),获取组织变异数据,然后提交给DCC。,3.GSCs提交跟踪文件,序列比对后文件到癌症基因组学中心(CGHub)。,4.提交给DCC和CGHub的数据可供研究团队和基因组数据分析中心(GDACs)使用。,5.分析pipeline以及由GDACs产生的数据结果通过DCC保存到研究社区(community)中。,,cancergenome.nih.gov/abouttcga/overview,9,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,barcode,解读,03,TYPES AND LEVELS,04,TYPES,13,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,Data Level,Level Type,Description,1,Raw,Low-level data for single sample,单个样本的低级数据,Not normalized,未标准化,2,Processed,Normalized single sample data,标准化的单个样本,Interpreted for presence or absence of specific molecular abnormalities,解释异常的个体,3,Segmented/Interpreted,Aggregate of processed data from single sample,单个样本整合在了一起,Grouped by probed loci to form larger contiguous regions(in some cases),根据probe的位置分组,4,Summary/Regions of Interest(ROI),Quantified association across classes of samples,量化关联类的样本,Associations based on two or more,两个或多个的关联,Molecular abnormalities,分子水平的异常,Sample characteristics,样本特性,Clinical variables,临床变异,DATA LEVLES,14,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,目前已有的癌症种类,05,16,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,癌症种类丰富,样本量大,34 kinds of cancer,325 samples on average,17,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,详细见:,TCGA publication guideline,cancergenome.nih.gov/publications/publicationguidelines,18,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,数据下载及解读,06,4,文件内容,File_manifest.txt,,对所下载文件的说明,27,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,临床数据解读,CDE,:,Common Data Elements,https:/tcga-data.nci.nih.gov/docs/dictionary/,28,TCGA癌症数据库介绍专题医学知识讲解,THANKS,
展开阅读全文

开通  VIP会员、SVIP会员  优惠大
下载10份以上建议开通VIP会员
下载20份以上建议开通SVIP会员


开通VIP      成为共赢上传

当前位置:首页 > 教育专区 > 初中其他

移动网页_全站_页脚广告1

关于我们      便捷服务       自信AI       AI导航        抽奖活动

©2010-2026 宁波自信网络信息技术有限公司  版权所有

客服电话:0574-28810668  投诉电话:18658249818

gongan.png浙公网安备33021202000488号   

icp.png浙ICP备2021020529号-1  |  浙B2-20240490  

关注我们 :微信公众号    抖音    微博    LOFTER 

客服