医学数据库介绍.ppt

Click to edit Title Slide,Click to edit Master text styles,Second level,Third level,Fourth level,Fifth level,Click to edit Title Slide,Click to edit Master text styles,Second level,Third level,Fourth level,Fifth level,medline,由美国国立医学图书馆(,NLM),编制的,Medline,数据库是世界上最具权威的医学文献 书目数据库。,Medline,收录内容包括基础医学、临床医学、护理学、牙科学、兽医学、药物学、卫生保健、营养卫生、职业卫生、卫生管理等，涉及生物学、人文科学、情报科学等。,medline,数据库内容与以下3种印刷型检索工具对应：,Index Medicus(,医学索引)，,International Nursing lndex(,国际护理索引)，,Index to Dental Literature(,牙科文献索引)。,Medline,收录了1966年至今的1千多万条记录，每月平均入库记录近4万条。,Medline,收录的期刊将近4 500种。以2001年的,Medline,数据为例，92的原文为英语，78的记录有文摘。网上,Medline,数据每周更新，光盘数据每月更新。,medline,Medline,有多种光盘产品，如,OVID,系统、,Cambridge,系统，还有,Dialog,系统，,EBSCO,系统等。国内使用最普遍的是,WinSPIRS,系统的“,SilverPlatter Medline on CD,”。,1997,年,6,月，由美国国立医学图书馆国家生物技术信息中心,(,NCBl),开发的,Medline,网络版,PubMed,挂上因特网供全球用户免费使用。,MeSH,词表,MeSH,词表中现有主题词,1.8,万个。通过,MeSH,词表可以查得：哪些是主题词、哪些不是主题词、主题词有哪些上位词下位词、主题词的历史变更和用法注释、主题词的相关词,(,see related),等。,MeSH,词表含字顺表和树形结构两大部分。,MeSH,词表的字顺表,(,alphabetic list),字顺表按主题词、款目词、副主题词的字母顺序排列。,举例：,Hepatitis,C.6.552.380+,Renal Dialysis,E2.870.300+E2.912800+,2001；see HEMODLALYSIS l967-2000,Acetylsalicylic Acid see Aspirin,AIDS see Acquired Immunodificiency Syndrome,MeSH,词表的字顺表,(,alphabetic list),这里，,Acetylsalicylic Acid(,乙酰水杨酸)和,AIDS(,艾滋病)都是款目词，,sec,表,示“用”,Aspirin(,阿司匹林)和,Acquired Immunodificiency Syndrome,是主题词。,树形结构号后面的“,+,”表示该主题词还有下位词，即概念比它更专指且隶属于它的主题词。如,Hepatitis(,肝炎,),有下位词“,Hepatitis,，,A1coho1,”,(,酒精性肝炎,),、“,Hepatitis,，,Human,，,Virus,”,(,人类病毒性肝炎,),等。,MeSH,词表的字顺表,(,alphabetic list),MeSH,词表中约有十分之一的主题词与自然词序相反，称为倒置主题词。例如“,Hepatitis,，,A1coholic,”,(,肝炎，乙醇性,),，“,Leukemia,，,Lymphocytic,，,Chronic,”,(,白血病，淋巴细胞，慢性,),。倒置主题词中，核心词在前，修饰词在后，用逗号表示倒置。主题词倒置的优点是：突出核心词；含有相同核心词的主题词在字顺表或索引中按字母顺序集中排在一起，方便选词。,MeSH,词表的字顺表,(,alphabetic list),款目词(,entry word，entry term),款目词是主题词的同义词或近义词，不,能直接用来进行主题词检索，而要用“,see”,引见的主题词去检索，因为只有主题词才是,MeSH,字段的标引词。例如：,MeSH,词表的树形结构,(,Tree Structures),树形结构表按主题词的分类属性编排，,它揭示了主题词之间的隶属关系和并列关,系，提供了从分类进行选词的途径。例如：,MeSH,词表的树形结构,(,Tree Structures),Digestive System Diseases(,消化系统疾病),C6,Liver Diseases(,肝病),C6.552,Hepatitis(,肝炎),C6.552.380,Hepatitis，Alcoholic(,乙醇性肝炎),C6.552.380.290,Hepatitis，Animal(,动物性肝炎),C6.552.380.315,Hepatitis，Toxic(,中毒性肝炎),C6.552.380.615,Hepatitis，Viral，Human(,人类病毒性肝炎),C6.552.380.705,Hepatitis A(,甲型肝炎),C6.552.380.705.422,Hepatitis B(,乙型肝炎,),C6.552.380.705.437,WinSPIRS,系统的,Medline,检索,陈小忠,Chen Xiaozhong,广东省人民医院图书馆,WinSPIRS,WinSPIRS,是运行于,Windows,环境下,的美国“银盘公司信息检索系统”,(,The,Silver Platter Information Retrieval,System),。,WinSPIRS,检索系统供检索银,盘公司出版的,Medline,，,EMBase,，,BA,等多种光盘数据库。,WinSPIRS,WinSPIRS,WinSPIRS,WinSPIRS,WinSPIRS,WinSPIRS,检索操作,陈小忠,Chen Xiaozhong,广东省人民医院图书馆,Searches,在,Searches,状态下，直接在检索框内输入检索词或检索式，然后点击右边的,Search,按钮,(,或按,Enter,键,),。屏幕中间部分为检索历史区，显示输入的检索式和检出记录,数。屏幕下方为检索结果显示区。,检索框内输入的检索词可以是单词或词组，,也可以是含有运算符的检索式。用主题词,加副主题词检索的格式是：,stomach neoplasms/diagnosis,或者,stomach-neoplasms-diagnosis,Searches,用字段限定检索，检索词后加,in,后加字段标识符。例如，,hepatitis in ti,anemia in ti,mesh,smith-an in au smith-a-b in au,WinSPIRS,中的位置算符用,near,。,例如，,tongue near2 base,，,可以检索到含有,tongue base(,舌根,),的记录，也可以检索到含有,base of tongue,的记录，但检索不到含有,base of the tongue,的记录,(,用,near3,才能检索到,),。,Searches,searches,(,apoptotis IN MesH)AND (PT=review),AND(usa IN AD),美国学者撰写的有关细胞凋亡的综述,Searches,Searches,Searches,Searches,Searches,Searches,Searches,Searches,词表告诉我们，,Stroke,不是主题词，主题词是,Cerebrovascular Accident。,通过,Term Information,按钮或双击该主题词，可了解到主题词的定义、定义出处,注释、历史变化、树形结构号、上位词下位词等情况。,Searches,词表告诉我们，,Stroke,不是主题词，主题词是,Cerebrovascular Accident。,通过,Term Information,按钮或双击该主题词，可了解到主题词的定义、定义出处,注释、历史变化、树形结构号、上位词下位词等情况。,中国生物医学文献数据库(,CBMdisc),陈小忠,Chen Xiaozhong,广东省人民医院图书馆,一、数据库简介,中国生物医学文献数据库,(,China BioMedical Literature on discs,CBMdisc),是中国医学科学院医学信息研究所开发研制的文摘型光盘数据库。该数据库收录了,1978,年至今,1 000,多种中文生物医学期刊、汇编以及会议论文的题录与文摘，文献总量,250,余万条，年增长约,20,万条。该数据库涵盖了印刷型检索工具中文科技资料目录,(,医药卫生,),分册。,二、检索途径,CBMdisc,共有五条检索途径：基本检索、主题词表辅助检索、索引词表辅助检索、分类表检索、期刊表辅助检索。,1基本检索,基本检索界面如图所示。检索字段选择中的“缺省检索”表示在中文标题、文摘、主题词、特征词、关键词、期刊,6,个字段中搜词检索。其他的检索字段选择有：全部,(,字段,),、中文题目、英文题目、作者、参考文献等。,2001,年起,CBMdisc,增加的用于引文检索的“参考文献”，即通过被引用文献的著者检索得到引用文献情况。,二、检索途径,二、检索途径,主题词表辅助检索,中文生物医学期刊数据库（,CMCC,）,主题词表辅助检索,CHKD,检索的结果,外文生物医学库,PubMed,陈小忠,Chen Xiaozhong,广东省人民医院图书馆,概况,网址：,www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed,或,www.ncbi.nih.gov/pubmed,或,pubmed.gov,由美国国立医学图书馆（,National Library of Medicine,-,NLM）,国家生物技术信息中心（,NCBI）,向因特网用户提供免费,MEDLINE,检索服务(起始时间：1997-6-26),PubMed,PubMed(http,：,/WWW,ncbi.nlm,nih,gov,pubmed),是由美国国立医学图书馆,(,NLM),下属美国生物技术信息中心,(,NCBI),研制的基于,Web,的文献数据库，是,NCBI,检索系统数据库之一。在系统中可以与,NCBI,其他数据库如基因序列中心、电子期刊出版商网站链接，也可与美国图书馆馆藏资源链接。,PubMed,具有期刊收录生命科学文献范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点。,收录,70余个国家4600余种生物医学期刊的题录与文摘，是世界上最权威的医学数据库,现有1950年以来的1400多万篇文献的记录,目前每年增加30多万条文献记录,85%的文献为英文，收录中文刊60余种,提供了与其他10多种数据库检索的无缝链接,新增跨库检索功能（,cross-database search）,概况,数据类型（状态）,Publisher Supplied Ctitations,：,出版商提供的文献数据，周二周六每天均有新数据加入，标识,PubMed-as supplied by publisher,In Process Citations,：,正在处理的文献数据，周二周六每天将处理完毕的数据向,MEDLINE,提供一次更新，标识,PubMed-in process,MEDLINE,：,处理完毕的文献数据。标识,PubMed-indexed for MEDLINE,PubMed,PubMed,PubMed,检索特点,词汇自动转换,逻辑运算符,AND、OR、NOT,须大写，运算顺序为从左至右,指定字段检索：检索词字段标识符,截词检索用星号（*），不超过150个词,使用双引号（“”）强制进行短语检索,可保存检索史，使用“#”来代替检索式,剪贴板功能（最多可保留500条记录）,Cubby,功能：保存检索策略供以后使用,摘要和免费全文链接图标,在题录（,Summary）,显示格式下，分别以如下图标表示该记录是否有摘要或是否可免费获得全文，并提供相应的链接,免费电子期刊查询,在因特网的免费资源中，学术性免费电子期刊是教学科研中最有价值的网络共享资源 之一。它具有跨时空性、可检索性、高整合性和易存贮性等特点，因此广受青睐。虽然免费学术期刊占整个电子期刊的比例较小，但其中不乏重要的专业期刊。熟悉免费电子期刊的查询是网络时代科研人员一项实用的检索技能。,一、免费电子期刊的类型,按免费电子期刊出版形式不同，有纯网络版电子期刊和平行出版物两种。纯网络版电子期刊直接在网上发布，不发行印刷本，如,BioMed Central,在线出版的系列期刊。大部分免费电子期刊属于后者，即在出版印刷版的同时，将期刊全部或部分卷期的全文发布于网上，供免费使用，如,Cancer Research,。,这类期刊中不乏高质量的学术期刊。,一、免费电子期刊的类型,按免费范围划分，可将电子期刊分为全刊免费、过刊免费、少量文献免费3种类型。全刊免费的电子期刊信息发布快，一般在出版日前几天就可在网上浏览到全刊，如,British Medical Journal。,另有不少学术价值较高的电子期刊属于第二种情况，即若干个月之前的 过刊免费，如,Journal of Virology。,第三类少量文献免费的期刊，只免费提供最新一期或某几期中的少量文献全文，如,JAMA,只免费提供最新一期中的一篇全文。,目前学术性免费电子期刊基本都是国外期刊，国内免费的医学电子期刊极为罕见。,提供期刊全文的网站,FreeMedicalJournals,(http：/WWW.freemedicalJ),提供医学免费电子期刊浏览与预告服务的专业网站，至2004年2月共收录英、法、德等19种语言的1 340多种医学免费电子期刊网址链接，其中约360种期刊被,Medline,收录。,在该网站主页上，将全部免费、出版,1,6,个月后免费、,1,年后免费、,2,年后免费,4,类期刊中影响因子较高的刊物分别列出，为用户判别期刊质量提供参考。,提供期刊全文的网站,查询时可按,Specialty(,专业,),或,Title(,刊名字顺,),浏览免费期刊刊名列表，刊名后标有期刊的免费范围，未标注范围的期刊表示全刊免费。刊名用粗体字显示，表示该刊被,Medline,所收录。,New Journals(,新增期刊,),可浏览最近,1,个月中新增的免费期刊。用户也可通过,Journal Alert(,新刊快报,),功能，免费注册自己的相关信息及,E-mail,地址，,FreeMedicalJournals,将直接把新增期刊的信息发送到用户的电子信箱中。,提供期刊全文的网站,提供期刊全文的网站,提供期刊全文的网站,提供期刊全文的网站,HighWire Press,HighWire,Press(highwire.org,或,highwire.stanford.edu),HighWire Press,于1995年由斯坦福大学图书馆创建，收录文献以生物医学为主，涉及物理学、社会科学等学科。至2003年6月止，共收录335个加盟期刊网站近56万篇免费全文，其中免费期刊约160种。,HighWire Press,自称是目前全球最大的免费自然科学全文文档。同时，它还收录了大量收费全文，提供全文订购服务，可回溯检索至1948年。,HighWire,的特色在于不仅可按刊名浏览免费期刊，还提供335个期刊网站和,Medline,全部文献的关键词检索与主题浏览，收录了4500种,Medline,期刊上的256万多篇全文。,FindArticles,该网站收录,1998,年以来各个学科的,700,多种免费期刊全文，其中医学期刊,103,种。提供刊名主题浏览、字顺浏览和文献关键词检索,3,种途径。关键词检索框可输入检索式，多个检索词间空格默认为逻辑“或”检索,(,OR),，“,+,”,表示逻辑“与”检索,(,AND)(,如：,+,lung+cancer),，,词组匹配使用半角双引号。检出文献不链接到期刊网站，直接在,FindArticles,服务器上读取全文，加快了传输速度。,电子图书,最好的免费图书网站,