计算化学9-常用计算化学应用软件及资源名师优质课获奖市赛课一等奖课件.ppt

,单击此处编辑母版标题样式,*,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,本幻灯片资料仅供参考，不能作为科学依据，如有不当之处，请参考专业资料。,惯用计算化学应用软件及资源,第1页,Gaussian 软件,Gaussian功效很强大,能够做,从头算,半经验,DFT,第2页,Gaussian 软件,可用来研究分子能量与几何结构,化学反应过渡态能量与几何结构,振动频率分析、红外与拉曼光谱;,分子热化学性质、键能,化学反应能,化学反应路径,第3页,研究分子轨道能量与性质,原子电荷分布（布居分析）和自旋密度分布,分子多极矩（永久偶极矩和四极至十六极矩）,NMR 屏蔽常数、化学位移及分子磁化率、振动园二色强度,电子亲和性与电离势、极化率与超极化率、静电势与电子密度分布等,第4页,第一步工作准备输入文件。Gaussian程序对输入文件有一定格式要求，如图显示了一个完整Gaussian输入文件,第5页,准备好输入文件后，便可在Gaussian程序中读入此输入文件进行计算,第6页,程序运算完后，Gaussian会给出正常结束信息。此时，可打开文本格式输出文件，提取所需信息。,第7页,第8页,MOPAC,软件,MOPAC 软件是一款大众化、功效强大,半经验,量化程序,能够计算分子、自由基、离子和聚合物电子结构、光谱，热化学性质、同位素取代效应和力常数等。其中一个过渡态定位程序和两个过渡态优化程序用于研究化学反应。,另外，它还惯用作定量结构性质（或活性）关系研究中结构参数计算。,第9页,第10页,ADF,软件,ADF能够进行单点计算、几何优化、寻找过渡态、计算力常数和热化学性质、跟踪反应路径、研究电子结构、经过比较离子激发态和基态而取得激发能。,新版本ADF包含了含时密度泛函理论，基组库中包含了1118号全部元素，而且对常见元素有不一样大小基组，从最小到高质量。,ADF软件在,材料科学,和生命科学都有应用，但更侧重于前者，尤其在重元素化学、无机化学、催化领域非常流行。最新版ADF加入了,QM/MM,方法，可用于生物大分子体系研究。,第11页,量子化学资源,International Journal of Quantum chemistry,Journal of molecular modeling,Journal of physical chemistry,Journal of chemical theory and computation（美国化学会年推出）,Journal of molecular structure(Theochem),Reviews in Computational Chemistry（丛书）,Journal of theoretical and computational chemistry,Theoretical chemical accounts,Journal of computational chemistry,第12页,Gaussian企业官方网站,第13页,国际上著名计算化学列表网站，开通较早，内有大量关于计算化学邮件列表。,第14页,北京大学化学系开设量化计算论坛,第15页,厦门大学化学系开设量化计算论坛,第16页,国内著名量子化学论坛,国内著名量子化学论坛,第17页,化学数据库（Data base）,分子结构库 晶体库 热力学数据库 药品库,高分子库 分子光谱、波谱图谱库,生物数据库（蛋白质、核酸、多糖库）,化学文件库,化学人工智能（需借助数据库）,计算机辅助分子结构解释 化学模式识别,结构活性关系分析,结构性质关系分析,神经网络算法与神经网络计算机,第18页,