1、
Trizol法提取RNA
注意:全程戴口罩,手套(PE手套,胶皮手套),离心注意放置方向。
所用所有物品全部为灭RNA酶的。
器材:
试剂:Trizol β—巯基乙醇 氯仿 75%乙醇 DEPC水 TAE Buffer 0.8%琼脂糖凝胶
1. 收集细胞:取对数期藻液 (2 ml )(2x4x106=8x106个),2500 r,3 min离心,弃上清。将沉淀转移至研钵中,锡纸包裹,-80 ℃过夜。
2. 将固体藻取出,研磨至细粉末状,加入1 ml Trizol,室温放置5 min。
3. 加入0.2 ml氯仿,涡旋15 sec,(剧烈震荡混匀)
2、室温静置3 min,4 ℃,12000 rpm,15 min离心。样品分三层,取上清至干净离心管。
4. RNA 沉淀:加入0.5 ml异丙醇,上下轻轻混匀,室温放置20 min,4 ℃,12000 rpm,10 min离心。出现凝胶状沉淀
5. RNA 洗涤:弃上清,加入至少1 ml 75 %乙醇,漩涡充分,4 ℃,7500 rpm,5 min离心,弃上清,室温干燥5 min。
6. 重新溶解RNA: 加入50 ul RNase-free水,轻吹几次,溶解,测浓度。跑胶验证,无需点maker。
反转录成cDNA
1. 200 ul PCR管中配制以下体系
3、25 ul体系)
提取的RNA 2 ug V=2 / CRNA X1000 = ul
Oligo d(T) 0.5 ug ul
add DEPC 水to 12ul
2. 70 ℃保温5 min,立即在冰上冷却2 min。(PCR仪或金属浴)
3. 在管中添加以下试剂
上一步骤中的变性液 12 ul
5 x MLV Buffer 5 ul
dNTP 5 ul
RNA酶抑制剂 0.5 ul
RNase-M-MLV酶 0.5 ul
DEPC 水 2 ul (补充成为25 ul 体系)
共计25 ul
4. 42 ℃保温1 h(若用PCR仪,最后4 ℃延伸)。