微生物的分类和鉴定.pptx

微生物的分类和鉴定第 六 章概念概念:微生物分类学：按微生物亲缘关系将其排成多种分类单 位或分类群的科学。分类：将有关个体的大量资料经科学的归纳整理或反映 生物进化规律的自然分类系统。鉴定：检测未知纯种微生物的多种性状特征，查找分类 系统进行归类命名。命名：为新发现的微生物按国际命名法给出一个学名。一、微生物在生物界的地位 1.1.五界系统：五界系统：Whittaker（69年）提出 五界学说2.2.三域系统：三域系统：Woese提出三原界（域）学说 古菌界（产甲烷菌，极端嗜盐菌，嗜酸嗜热菌）细菌界（蓝细菌，除古细菌以外许多原核生物）真核生物界（原生动物，真菌，动植物）二、微生物的命名法 （一）分类单位：（一）分类单位：界、门、纲、目、科、属、种 种是最基本的分类单位，每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科.1.种：种是一个基本分类单位，是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌株的总称。这里的种仅仅是指种的模式种或典型种 2新种：发表文章时，确定为新种，在学名后加sp.nov(species nova)或nov.sp。指某一明显而稳定的特征与模式种不同的种，有时称小种。如：E.coli k12模式种（野生型）是不需要特殊aa的，而实验室变异后，可从k12获 得某aa的缺陷型，此即称为E.coli k12的 亚种或小种。3.亚种：（subspecies,subsp,ssp）：4.型（form）:同种微生物的各种类型。如：血清型、抗原型5菌株（strain）:又称品系：一种微生物的不同来源 的纯培养物。（二）命名（二）命名 1.1.双名法：双名法：林奈创立。此为国际命名法规，即：每一微生物的学名都依属与种而命名 属名+种名+（首次定名人）+现定名人+定名年份属名：拉丁文的名词或用作名词的形容词，字首大写，表示 微生物的主要特点，由微生物构造，形状或由科学家命名种名：为拉丁文形容词，为微生物次要特征，字首小写，为微生物色素、形状、来源或科学家姓名等。如：Escherichia coli 当文章中前面已出现学名时，后面可将属名缩写成一至三个字母。如:E.coli2 2三名法：三名法：种名后面加亚种，亚种可用正体 如：Staphylococcus aureus subsp3 3属名属名+sp(ssp)sp(ssp)，表示种名未定。表示种名未定。三、分类依据 （一）形态特征：大小，排列，分化，结构，染色等 （二）培养特征：营养要求，生长的物理环境（酸碱 度，温湿度），菌落，菌苔，液体 培养特征。（三）代谢特征：微生物生命活动的方式。如：I.M.Vit （四）化学组成特征：细胞主要特征性化学成分的鉴定 如：细胞壁成分、细胞内含物 （五）抗原特征：抗原成为化学组成的一个特殊方面，微 生 物具有许多不同类型的抗原。（六）生态特征：与其他生物的关系、自然界的分布、致 病性等现代分类依据还需补充：（七）细胞壁成分：（八）GC含量 某一特定种的DNA碱基组成是恒定的。GC含量以碱基全部克分子中G和C的摩尔百分数表示：G+C G+C+A+T100%=（G+C）mol%种内各株可差2.54.0%;若相差 10%为不同属。分类依据所得数值范围从2375方法：解链温度法原理：一定pH和离子强度下加热DNA，氢键打开；在260nm处，随着温度增加，双链变单链导致紫外吸收增加，引起增色效应。增色效应一半时的温度（热变性温度，Tm）可反映出不同的DNA中的（G+C）%值。Tm=69.3+0.41*(G+C)%（九）DNA杂交法：原理：根据DNA解链的可逆性和碱基配对的专一性。若同源性70%以上为种的水平，20%以上可能是属的水平。(十）16SrRNA在30多亿年生物进化的漫长历史中始终执行着相同的生理功能，所以碱基顺序变化很少，所以称其为保守结构。四、常用分类方法：1.经典分类法：将形态、结构特征作为初步特征，再比较生理、生化特征，采用双歧法整理结果，进行分类。2.数值分类法：根据数量特征进行分类，可根据5060个或100以上，用电脑进行计算统计。3.遗传分类法：主要依据GC含量及DNA杂交试样为依据