第二微生物的进化和分类.pptx

Ribosomal RNAs as Evolutionary ChronometersnReasons:nAncient moleculesnFunctionally constantnUniversally distributednModerately well conserved in sequence across broad phylogenetic distancesThe 16S rRNA or 18S rRNA TechniquenIn Prokaryotes:n5S rRNA is too small,contains limited infon23S rRNA is too large,too difficult to managen16S rRNA has the right size for studiesnIn Eukaryotes:n18S rRNA is used for phylogenetic measurementsPhylogenetic Trees from DNA Sequences 第二节第二节 微生物的分类单位和命名微生物的分类单位和命名 一、种以上的系统分类单位一、种以上的系统分类单位 界 Kingdom （拉，Regnum）门 Phylum （拉，Phylum）亚门 纲 Class （拉，Classis）亚纲 目 Order （拉，Ordo）亚目 科 Family （拉，Familia）亚科 属 Genus （拉，Genus）亚属 种 Species (拉，Species）亚种第三节第三节 细菌分类的依据和方法细菌分类的依据和方法 一、形态学特征细胞形态 群体形态：平板菌落特征和液体培养特征 二、生理生化特征：1、利用营养物质的能力 2、细菌对生活环境的要求及抗逆性 3、生化反应和酶 4、营养类型 5、代谢产物 6、对抗生素的敏感性三、血清学试验与噬菌体分型四、氨基酸顺序和蛋白质分析五、核酸的碱基组成和分子杂交 1、DNA（G+C）mol/L 2、核酸杂交（DNA-DNA,DNA-rRNA,核酸探针）3、16SrRNA核苷酸分类目录六、遗传重组第四节第四节 细菌的分类系统和分类位置细菌的分类系统和分类位置 细菌的分类系统细菌的分类系统 微生物分类的国际性权威著作,从1923年来出版9个版本，新版为 Bergeys Manual of Determinative Bacteriology，9th 1994。QuestionsnWhy is Ribosomal RNAs used as Evolutionary ChronometersnWhy is 16S rRNA employed to study phylogenetics rather than the smaller 5S rRNR and the large 23S rRNA in Prokaryotics?nHow to sequence 16S rRNA from inside the cells?nHow to identify a prokaryotic or eukaryotic organism based on 16S or 18S rRNA?nHow to build Phylogenetic Trees from DNA Sequences?nWhy it is said the archaea closer to eukarya than bacteria is?nWhat is signature sequence and how can it be used?