MEGA6使用教程——进化树的构建.docx

利用MEGA6建立进化树
一．NCBI中选择Protein数据库，搜索PD-1相关蛋白

二．选择兴趣蛋白，在Send to选项中选择File-FASTA格式

三.下载安装MEGA6,刚刚下载的FASTA文件变为可读,双击用MEGA6打开

四.展开上图得到下图,至此蛋白序列成功输入MEGA

五.选择菜单栏上Alignment-Align by Clustalw进行蛋白序列比对

六.得到比对后结果,菜单栏-Data-Export Alignment输出比对结果, 得到MEGA6源文件,接下来就可以进行进化树绘制

八.返回主程序界面,菜单栏选择Phylogeny-第二个选项Neighbor,选择刚刚输出的数据,在个性化界面按需要自己的做调整,最后得到所需进化树.