1、肿瘤个体化用药指导基因检测背景知识介绍靶向用药指导基因检测化疗用药指导基因检测常见肿瘤个体化用药基因检测其他肿瘤产品背景介绍背景介绍全国肿瘤防治研究办公室、国家癌症中心2015年10月首次发布中国居民癌症现患数据,我国5年内诊断为癌症且仍存活的病例数约为749万(其中男性患者368万人,女性患者381万人),总体5年癌症患病率为5.56(556/10万)。CancerLetters,NationalestimatesofcancerprevalenceinChina,20112015年中国癌症统计数据揭示,预计2015年有新发浸润性癌病例数429.2万,相当于平均每天新发12000例癌症,有2
2、81.4万癌症死亡病例,相当于平均每天7500人死于癌症。CA:ACancerJournalforClinicians,CancerStatisticsinChina,2015癌症的治疗手段癌症的治疗手段约约90%肿瘤患者在治疗过程中肿瘤患者在治疗过程中会用到抗肿瘤药物会用到抗肿瘤药物化疗药物在杀灭肿瘤的同时,对增生活跃的骨髓、胃肠道黏膜、生殖细胞、毛发和肝、肾等脏器均有不同程度的损伤;接受化疗的肿瘤患者有效率仅有30%;据美国的统计,因化疗的副作用及并发症引起的死亡率为3%10%2014年全国药品不良反应监测网络收到药品不良反应/事件报告表132.8万份严重药品不良反应/事件报告34.1万份
3、排名前5位的分别是抗微生物药、心血管系统用药、抗肿瘤药、消化系统用药、镇痛/解热/抗炎/抗风湿/抗痛风药肿瘤临床用药存在的问题肿瘤临床用药存在的问题精准医疗时代精准医疗时代肿瘤治疗需解决的核心问题肿瘤治疗需解决的核心问题个体化治疗个体化治疗设计针对性的用设计针对性的用药方案药方案个体化用药基因检测项目个体化用药基因检测项目靶向用药指导基因检测靶向用药指导基因检测化疗用药指导基因检测化疗用药指导基因检测常见肿瘤个体化用药基因检测常见肿瘤个体化用药基因检测肿瘤个体化治疗以疾病靶点基因诊断信息为基础,以循证医学研究结果为依据,为患者提供接受正确治疗方案的依据。临床研究证实,通过检测肿瘤患者生物样本中
4、生物标志物的基因突变、基因SNP分型、基因及其蛋白表达状态来预测药物疗效和评价预后,指导临床个体化治疗,能够提高疗效,减轻不良反应。肿瘤个体化治疗检测技术指南靶向用药指导基靶向用药指导基因检测因检测靶向药物是针对肿瘤基因开发的,识别由肿瘤细胞特有的基因所决定的突变位点,通过与之结合(或类似的其他机制),阻断肿瘤细胞内控制细胞生长、增殖的信号传导通路,从而杀灭肿瘤细胞、阻止其增殖。靶向药物疗效好,副作用小。背景知识背景知识以EGFR抑制剂为例解释靶向药物的作用机制中国上市的部分肿瘤靶向药物非小细胞肺癌(NSCLC)是最常见的肺癌种类。目前靶向治疗已经成为非小细胞肺癌临床治疗的重要手段。易瑞沙和特
5、罗凯作为表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs),是目前批准用于非小细胞肺癌靶向治疗的主要药物。大量研究和临床试验证明易瑞沙和特罗凯对EGFR基因突变的患者有效率显著优于化疗。易瑞沙(吉非替尼/Gefitinib)泛亚太临床研究(IPASS)结果表明,易瑞沙对EGFR突变患者的受益率达71.2%,效果明显优于化疗,而对无突变患者受益率仅为1.1%MokTSetal.GefitiniborCarboplatin-PaclitaxelinPulmonaryAdenocarcinoma.NEnglJMed2009;361:947-957.非小细胞肺癌靶向治疗效果非小细胞肺癌靶向治疗效果
6、靶向治疗用药指导基因检测产品靶向治疗用药指导基因检测产品靶向药物靶向药物检测基因检测基因检测位点检测位点吉非替尼(易瑞沙)EGFREGFR18,19,20,21号外显子厄洛替尼(特罗凯)埃克替尼(凯美纳)西妥昔单抗(爱必妥)KRAS、BRAF、NRAS、PIK3CAKRAS12,13,61,146密码子BRAFV600ENRAS2,3,4号外显子PIK3CA9,20号外显子帕尼单抗(维克替比)维罗菲尼、曲美替尼、达拉非尼BRAFBRAFV600E伊马替尼(格列卫)C-KIT、PDGFRAC-KIT9,11,13,17号外显子PDGFRA12,18号外显子克唑替尼EML4-ALK,ROS1EML
7、42,3,6,13,14,15,17,18,20,21号外显子ALK20号外显子ROS12,4,6,8,10,13,16号外显子曲妥珠单抗(赫赛汀)PIK3CA、PTENPIK3CA9,20号外显子PTEN5号外显子拉帕替尼(泰克泊)靶向药物的临床意义及解读靶向药物的临床意义及解读靶向药物靶向药物检测项目检测项目临床意义临床意义结果解读结果解读吉非替尼(易瑞沙)、厄洛替尼(特罗凯)埃克替尼(凯美纳)EGFR(29种突变)EGFR小分子抑制剂(吉非替尼、厄洛替尼、埃克替尼)药效预测敏感突变:G719X、E19del、L858R、L861Q、S768I原发突变耐药:E20insEGFR(T790M
8、)T790M是EGFR20外显子的一个点突变,约占继发性耐药突变的50%,是目前较为认可的耐药机制之一。继发突变耐药:T790M西妥昔单抗(爱必妥)、帕尼单抗(维克替比)KRAS(突变)卫生部颁布的结直肠癌诊疗规范2010明确指出:确定为复发或转移性结直肠癌时,检测肿瘤组织KRAS基因状态,以确定合适的治疗方案KRAS突变疗效差BRAF(突变)美国国家癌症综合治疗联盟结直肠癌临床实践指南2011建议,在使用爱必妥或帕尼单抗等靶向药物时,须检测肿瘤组织KRAS基因状态,如果KRAS无突变,应考虑检测BRAF基因状态BRAF突变疗效差NRAS(突变)2013年CSCO年会中表明,在联合化疗使用帕尼
9、单抗/西妥昔单抗治疗mCRC患者前,需要了解患者更详细的基因背景,不仅仅是检测KRAS基因的突变热点第2外显子,还要检测其他外显子和NRAS基因NRAS突变疗效差PIK3CA(突变)PIK3CA基因突变导致PI3K/Akt信号通路持续性活化,导致肿瘤细胞对EGFR-TKI等药物的耐药,检测PIK3CA基因突变可以预测肿瘤患者对EGFR-TKI等药物的耐药性PIK3CA突变疗效差曲美替尼、达拉非尼、维罗非尼BRAF(突变)在黑色素瘤患者的治疗方面,BRAF基因在原发性黑色素瘤中突变率为80%,在转移性黑色素瘤中突变率为68%,在良性痣中的突变率高达82%。BRAF突变疗效好克唑替尼EML4-AL
10、K(融合)EML4-ALK融合基因存在与否与ALK激酶抑制剂的疗效有关,小分子酪氨酸激酶抑制剂克唑替尼对含有EML4-ALK融合基因突变的肺癌患者疗效显著。EML4-ALK融合用药疗效好ROS1(融合)临床研究表明,小分子酪氨酸激酶抑制剂克唑替尼对于ROS1融合阳性的非小细胞肺癌(NSCLC)患者有显著疗效,因此检测ROS1基因的融合状态是筛选克唑替尼适合患者的重要前提。ROS1融合用药疗效好伊马替尼(格列卫)C-KIT(突变)C-KIT是靶向药物格列卫作用的靶点,该基因大多数位点突变的胃肠间质瘤患者对格列卫治疗反应良好,但D816V突变与耐药有关。因此,检测肿瘤患者C-KIT基因突变情况可用
11、于判断格列卫治疗能否有效C-KIT9/11/13外显子突变疗效好,17外显子D816V突变疗效差PDGFRA(突变)PDGFRA基因D842V突变是导致胃肠间质瘤患者对格列卫原发耐药的原因,PDGFRA突变与C-KIT基因突变是相互独立的。因此,检测肿瘤患者PDGFRA基因突变情况可用于判断格列卫治疗是否有效PDGFRA18外显子D842V突变疗效差曲妥珠单抗(赫赛汀)拉帕替尼(泰克泊)PIK3CA(突变)PIK3CA突变常见于HER2阳性及ER阳性疾病,研究表明,HER2阳性的乳腺癌患者若PIK3CA突变,接受靶向治疗后完全缓解率偏低PIK3CA突变疗效差PTEN(突变)PTEN是PDK/A
12、KT信号级联途径的主要负调控蛋白,可通过拮抗PI3K蛋白酶的活性维持在正常的水平,在癌细胞中该抑制蛋白常常缺失或突变。导致PI3K/AKT信号通路持续活化剂赫赛汀耐药PTEN突变疗效差产品特点产品特点检测技术检测技术:采用ARMS-PCR法检测12种常规靶向药物相关基因的突变位点,指导临床靶向用药产品功能产品功能:预测靶向药物疗效指导临床靶向用药,协助医生制定个体化治疗方案适用人群适用人群:1.靶向药物治疗患者,为肿瘤治疗提供依据2.原有药物疗效不佳者,可调整用药方案服务流程服务流程:化疗用药指导基因检测化疗用药指导基因检测化疗是对抗肿瘤的主要武器,在临床治疗中约占70%。然而在肿瘤的化疗中,
13、无论是疗效还是毒性反应,都存在比较大的个体差异,这种差异与个体的基因型直接相关。因此,进行化疗用药前相关基因检测,提高化疗药物的敏感性,选用对个体毒副作用低的药物对癌症的治疗具有关键意义。吉西他滨铂类药物表柔比星紫杉醇伊立替康肿瘤常见化疗药物肿瘤常见化疗药物化疗药物基因检测在临床化疗药物基因检测在临床上的应用上的应用伊立替康(Irinotecan)是DNA拓扑异构酶I抑制剂,它可使断裂的DNA单链不能重新结合,阻滞DNA复制和RNA合成,进而造成细胞死亡。研究发现,UGT1A1启动子区域的多态性与伊立替康的毒副作用有相关性。如果盲目用药可造成中性粒细胞减少及腹泻的副作用。临床实验表明,当患者U
14、GT1A1为野生型时,使用伊立替康后毒副作用较低,但为突变型时,毒副作用明显提高。化疗用药指导基因检测产品化疗用药指导基因检测产品化疗药物 检测位点结果解读化疗药物检测位点结果解读铂类药物XRCC1(R194W)SNP-R194W:疗 效 CT、TTCC长春新碱MDR1(G2677T/A)药物敏感性GT、TTGGXRCC1(R399Q)SNP-R399Q:疗效GGGAAA环磷酰胺MDR1(G2677T/A)药物敏感性GT、TTGGERCC1(C118T)SNP-C118T:疗效CCCTTTXRCC1(R399Q)SNP-R399Q:疗效GGGAAAGSTP1(I105V)SNP-I105V:疗
15、效GGGAAA表柔比星GSTP1(I105V)SNP-I105V:疗效GGGAAA吉西他滨CDA(A79C)SNP-A79C:毒性CCCAAA5-氟尿嘧啶(5-FU)MTHFR(C677T)SNP-C677T:疗效TTCCCDA(G208A)SNP-G208A:毒性AAGAGGDPYD(IVS14+1GA)SNP-IVS14+1GA:毒性AAAGGG紫杉醇MDR1(C3435T)SNP-C3435T:疗效TTCC、CT 卡培他滨DPYD(IVS14+1GA)SNP-IVS14+1GA:毒性AAAGGGMDR1(G2677T/A)药物敏感性GT、TTGG伊立替康UGT1A1(启动子区TA重复序列
16、)SNP-*6:毒性TTCTCCSNP-*28:毒性7/7TA6/7TA6/6TA甲氨碟呤MDR1(C3435T)SNP-C3435T:疗效TTCC、CT阿拉曲唑、来曲唑CYP19A1(G161T)SNP-G161T:疗 效 CCCA、AAMTHFR(C677T)SNP-C677T:疗效TTCC他莫昔芬CYP2D6(C100T)SNP-C100T:疗 效 CCCT、TT培美曲赛TYMS mRNA表达量高表达:疗效差,低表达:疗效好替莫唑胺MGMT甲基化甲基化:疗效好,未甲基化:疗效差产品特点产品特点检测技术检测技术:采用荧光-PCR法检测15种常规化疗药物相关基因的突变位点及表达量,指导临床化
17、疗用药产品功能产品功能:预测化疗药物对患者的疗效、耐药性和毒副作用协助医生制定个体化治疗方案,显著提高治疗的有效性适用人群适用人群:1.临床初诊需要进行化疗的肿瘤患者2.现用化疗药物效果不佳或毒副作用较大,希望更换治疗方案的肿瘤患者3.肿瘤治疗后复发或发生转移,治疗方案无效,需重新制定治疗方案的肿瘤患者服务流程服务流程:常见肿瘤个体化用药基因检测常见肿瘤个体化用药基因检测提供提供18种常见肿瘤个体化用药基因检测套餐种常见肿瘤个体化用药基因检测套餐肿瘤名称肿瘤名称肿瘤名称肿瘤名称非小细胞肺癌结直肠癌乳腺癌肝癌卵巢癌肾癌宫颈癌胰腺癌前列腺癌食管癌胃癌头颈癌胃肠道间质瘤膀胱癌黑色素瘤甲状腺癌脑胶质瘤
18、胆管癌检测内容检测内容:肿瘤靶向用药和化疗用药基因检测药物药物分类分类项目名称项目名称临床意义临床意义结果解读结果解读样本类型靶靶向向药药物物EGFR基因突变检测EGFR小分子抑制剂(吉非替尼、厄洛替尼、埃克替尼)药效预测突变可用药:G719X、E19del、L858R、L861Q、S768I原发突变耐药:E20ins,继发突变耐药:T790M石 蜡 包 埋肿瘤组织/新鲜组织KRAS基因突变检测单抗类EGFR抑制剂(西妥昔单抗、帕尼单抗)和EGFR小分子抑制剂(吉非替尼、厄洛替尼、埃克替尼)药效预测突变疗效差BRAF基因突变检测单抗类EGFR抑制剂(西妥昔单抗、帕尼单抗)药效预测突变疗效差NR
19、AS基因突变检测单抗类EGFR抑制剂(西妥昔单抗、帕尼单抗)和EGFR小分子抑制剂(吉非替尼、厄洛替尼、埃克替尼)药效预测突变疗效差EML4-ALK融 合 基因检测克唑替尼用药指导融合用药疗效好ROS1融合基因检测克唑替尼用药指导融合用药疗效好VEGFR基因表达分析贝伐单抗用药指导高表达:疗效好化化疗疗药药物物TP53基因突变检测预后评估突变耐药EDTA抗 凝外周血ERCC1基因表达量检测铂类化疗药物药效预测高表达:疗效差,低表达:疗效好TUBB3基因表达量检测微管类化疗药物(紫杉醇、多西他赛、长春瑞滨等)药效预测高表达:疗效差,低表达:疗效好RRM1基因表达量检测吉西他滨药效预测高表达:疗效
20、差,低表达:疗效好TYMS基因表达量检测氟类化疗药物及培美曲赛药效预测高表达:疗效差,低表达:疗效好UGT1A1多态性检测伊立替康毒副作用预测SNP-*6:毒性TTCTCCSNP-*28:毒性7/7TA6/7TA6/6TAMTHFR多态性检测氟类化疗药物药效和毒副作用预测SNP-C677T:疗效TTCCERCC1多态性检测铂类化疗药物药效预测SNP-C118T:疗效CCCTTTCYP2C8多态性检测抗微管类药物药效预测SNP-R139K:毒性AAAGGGSNP-K399R:毒性GGGAAA非小细胞肺癌个体化用药检测项目非小细胞肺癌个体化用药检测项目药物分类药物分类项目名称项目名称临床意义临床意
21、义结果解读结果解读样本类型样本类型靶靶向向药药物物HER-2基因表达量检测曲妥珠单抗(赫赛汀)药效预测高表达:疗效好,低表达:疗效差石蜡包埋肿瘤组织/新鲜组织PTEN基因突变检测靶向治疗药指导及预后评估突变疗效差PIK3CA基因突变检测靶向治疗药指导及预后评估突变疗效差VEGFR基因表达分析贝伐单抗用药指导高表达:疗效好化化疗疗药药物物TP53基因突变检测预后评估突变耐药EDTA抗凝外周血TUBB3基因表达量检测微管类化疗药物(紫杉醇、多西他赛、长春瑞滨等)药效预测高表达:疗效差,低表达:疗效好RRM1基因表达量检测吉西他滨药效预测高表达:疗效差,低表达:疗效好TYMS基因表达量检测氟类化疗药
22、物及培美曲赛药效预测高表达:疗效差,低表达:疗效好TOP2A基因表达量检测蒽环类化疗药物(多柔比星、表柔比星等)及依托泊苷药效预测高表达:疗效好,低表达:疗效差MTHFR多态性检测氟类化疗药物及培美曲赛药效预测SNP-C677T:疗效TTCCERCC1多态性检测铂类化疗药物药效预测SNP-C118T:疗效CCCTTTCYP2C8多态性检测抗微管类药物药效预测SNP-R139K:毒性AAAGGGSNP-K399R:毒性GGGAAACYP19A1多态性检测来曲唑和阿那曲唑药效评估SNP-RS4646:疗效CCCA、AA乳腺癌个体化用药检测项目乳腺癌个体化用药检测项目乳腺癌特色项目乳腺癌特色项目21
23、基因联合基因联合表达量检测表达量检测检测乳腺癌肿瘤组织中检测乳腺癌肿瘤组织中21个不同基因的表达水平,包含个不同基因的表达水平,包含16个乳腺癌个乳腺癌相关基因和相关基因和5个参考基因个参考基因1.为预测预后、复发、瘤灶转移乃至指导治疗提供信息;2.预测早期乳腺癌患者的化疗获益和10年内的远期复发风险结果解读:结果解读:高RS的患者(RS31)从化疗中极大地获益中复发风险者(8RS31)虽未显示出辅助化疗有明显获益,但并不能肯定无临床获益低复发风险者(RSCTCCSNP-*28:毒性7/7TA6/7TA6/6TAMTHFR多 态 性 检测氟类化疗药物药效和毒副作用预测SNP-C677T:疗效T
24、TCCERCC1多态性检测铂类化疗药物药效预测SNP-C118T:疗效CCCTTT结直肠癌个体化用药检测项目结直肠癌个体化用药检测项目药物分类药物分类项目名称项目名称临床意义临床意义结果解读结果解读样本类型样本类型靶靶向向药药物物EGFR基因突变检测EGFR小分子抑制剂(吉非替尼、厄洛替尼、埃克替尼)药效预测突变可用药:G719X、E19del、L858R、L861Q、S768I原发突变耐药:E20ins,继发突变耐药:T790M石蜡包埋肿瘤组织/新鲜组织HER-2基因表达量检测曲妥珠单抗(赫赛汀)药效预测高表达:疗效好低表达:疗效差PTEN基因突变检测靶向治疗药指导及预后评估突变疗效差PIK
25、3CA基因突变检测靶向治疗药指导及预后评估突变疗效差化化疗疗药药物物TP53基因突变检测预后评估突变耐药EDTA抗凝外周血TOP2A基因表达量检测蒽环类化疗药物(多柔比星、表柔比星等)及依托泊苷药效预测高表达:疗效好低表达:疗效差TYMS基因表达量检测氟类化疗药物及培美曲赛药效预测高表达:疗效差低表达:疗效好ERCC1基因表达量检测铂类化疗药物药效预测高表达:疗效差低表达:疗效好UGT1A1多态性检测伊立替康毒副作用预测SNP-*6:毒性TTCTCCSNP-*28:毒性7/7TA6/7TA6/6TAMTHFR多态性检测氟类化疗药物药效和毒副作用预测SNP-C677T:疗效TTCCERCC1多态
26、性检测铂类化疗药物药效预测SNP-C118T:疗效CCCTTTMDR1多态性检测阿霉素药效预测SNP-C3435T:疗效TTCC、CT胃癌胃癌/食管癌个体化用药检测项目食管癌个体化用药检测项目其他癌症产品介绍循环肿瘤循环肿瘤DNA(ctDNA)液体活检防癌检测)液体活检防癌检测基于ctDNA液体活检的肿瘤检测体系,通过对肿瘤细胞散落在血液中的“碎片”的获取与解读,发现癌症的早期踪迹,为肿瘤的早期干预和治疗赢得宝贵的时间。SciTranslMed.2014Feb19;6(224):224ra24.项目名称项目名称项目检测内容项目检测内容检测方法检测方法样本类型样本类型肺癌防癌特检肺癌特有驱动突变
27、检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml肝癌防癌特检肝癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml胰腺癌防癌特检胰腺癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml胃癌防癌特检胃癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml食道癌防癌特检食道癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml肾癌防癌特检肾癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml甲状腺癌防癌特检甲状腺癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2
28、ml结直肠癌防癌特检结直肠癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml膀胱癌防癌特检膀胱癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml黑色素瘤防癌特检黑色素瘤特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml胆管癌防癌特检胆管癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml脑胶质瘤防癌特检脑胶质瘤特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml卵巢癌防癌特检卵巢癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml乳腺癌防癌特检乳腺癌特有驱动突变
29、检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml宫颈癌防癌特检宫颈癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml前列腺癌防癌特检前列腺癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml胆囊癌防癌特检胆囊癌特有驱动突变检测实时荧光定量PCR法EDTA抗凝管血液4ml/血浆2ml检测项目检测项目项目名称项目名称检测内容检测内容临床意义临床意义样本要求样本要求Septin9甲基化检测甲基化检测检测血浆游离DNA中septin9基因启动子区的CPG岛的甲基化情况1.结直肠癌及癌前病变(包括息肉、腺瘤等)辅助诊断2.结直肠癌术后复发监控3.结直肠癌家族史及高危人群筛查血浆、石蜡、新鲜组织DR-70肿瘤蛋白标志物肿瘤蛋白标志物检测检测人纤维蛋白原降解产物DR-70定量检测1.肝癌、胃癌、肺癌等13种癌症的早期筛查2.患者术后复发监控3.术后用药疗效评估1ml以上血清样本PCA3膀胱癌检测膀胱癌检测尿液中PCA3 RNA表达量1.前列腺癌筛查和辅助诊断2.评估前列腺活检必要性,避免过度穿刺3.前列腺癌复发监控和疗效评估前列腺按摩后,尿液(20-30ml)辅助诊断类项目辅助诊断类项目