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生存分析SPSS讲解学习.ppt

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1、单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,Company Logo,*,生存分析SPSS,生存分析,(,Survival Analysis,),菜单,寿命表,(,Life Tables,),过程,Life tables,过程用于(,小样本和大样本资料,):,估计某生存时间的生存率,以及中位生存时间。,绘制各种曲线:如生存函数、风险函数曲线等。,对某一研究因素不同水平的生存时间分布的比较。,控制另一个因素后对研究因素不同水平的生存时间分布的比较。,对多组生存时间分布进行两两比较。,(比较总体生存时间分布采用,wilcoxon,检验),Company Lo

2、go,实例分析,例,1,:,为了比较不同手术方法治疗肾上腺肿瘤的疗效,某研究者随机将,43,例病人分成两组,甲组,23,例、乙组,20,例的生存时间(月)如下所示:,其中有“,+,”者是删失数据,表示病人仍生存或失访,括号内为死亡,人,数。,(,1,)计算,甲,、乙两法术后,10,月的生存,率,和,标准误。,(,2,)估计两组的中位生存期。,(,3,)绘制各组生存函数曲线。,(,4,)比较两组的总体生存时间分布有无差别。,Company Logo,一、建立数据文件(,data-01.sav,),定义,5,个变量:,生存时间变量:,t,,值标签“生存时间(月)”,生存状态变量:,status,,

3、取值“,1=,死亡,,0=,删失或存活”,频数变量:,freq,,值标签“人数”,分组变量:,group,,取值“,1=,甲组,,2=,乙组”,生存时间序号变量,(,可无):,i,二、操作过程,主菜单:分析,Analyze,生存,Survival,寿命表,Life tables,对话框参数设置:,时间,time,框:选入“,t,”。,显示时间间隔,Display time intervals,框:步长,by,前面填入最大生存时间的上限(必须包括生存时间最大值),步长,by,后面填入生存时间的组距。本例上限填“,60,”,组距填“,1,”。,状态,status,框:选入“,status,”,击,

4、define events,钮,在,single value,框填入“,1,”,因子,factor,框:选入“,group”,,定义最小值“,1,”,最大值“,2,”。,单击选项,option,按钮,弹出对话框:,1,),寿命表,系统默认。,2,)图:,生存函数,3,)比较第一个因子的水平:,整体比较,三、主要输出结果,10,月生存率的估计:,甲法,48%,,标准误,0.1,乙法,30%,,标准误,0.1,两组的中位生存期估计:,Company Logo,3.,绘制生存曲线:,Company Logo,4.,两组生存时间分布的比较:,Kaplan-Meier,过程,Kaplan-Meier,过

5、程用于,(,尤其小样本资料,):,估计各生存时间的生存率以及中位生存时间。,绘制各种曲线:如生存函数、风险函数曲线等。,比较某研究因素不同水平的生存时间有无差异。,控制某个分层因素后对研究因素不同水平的生存时间分布进行比较。,对多组生存时间分布进行两两比较。,(各总体分布比较采用,Log-rank,等非参数方法),Company Logo,实例分析,例,2,:(数据同例,1,),为了比较不同手术方法治疗肾上腺肿瘤的疗效,某研究者随机将,43,例病人分成两组,甲组,23,例、乙组,20,例的生存时间(月)如下所示:,其中有“,+,”者是删失数据,表示病人仍生存或失访,括号内为死亡,人,数。,(,

6、1,)计算,甲,、乙两法各生存时间的生存,率,和,标准误。,(,2,)估计两组的中位生存期。,(,3,)绘制各组生存函数曲线。,(,4,)比较两组的总体生存时间分布有无差别。,一、建立数据文件(同前),二、操作过程,主菜单:分析,Analyze,生存,SurvivalKaplan-Meier,对话框参数设置:,时间,time,框:选入“,t,”。,状态,status,框:选入“,status,”,击,define events,钮,在,single value,框填入“,1,”。,因子,factor,框:选入“,group”,。,单击选项,option,按钮,弹出对话框:,1,)统计量:,生存

7、分析表,系统默认。,均值和中位生存时间,系统默认。,2,)图:,生存函数,5.,单击比较因子,Compare Factor,按钮,弹出对话框:,1,)检验统计量,Test Statistics,:,都用于检验时间分布是否相同。,对数秩,Log-rank,:各时间点的权重一样。,Breslow,:按各时间点的观察例数赋权。,Tarone-Ware,:按各时间点观察例数的平方根赋权。,二、操作过程,2,),水平间的两两比较。,6.,单击,Save,按钮,弹出保存新变量,Save new variables,对话框:,三、主要输出结果,生存表:略,两组的中位生存期估计:,3.,绘制生存曲线:,Com

8、pany Logo,4.,两组生存时间分布的比较:,Cox,回归,过程,Cox,回归过程用于:,1.,多个因素对生存时间的影响作用分析和比较,2.,生存(或死亡)风险预测,实例分析,例,3,:为,探讨某恶性肿瘤的预后,某研究者收集了,63,例患者的生存时间、生存结局及影响因素。影响因素包括病人年龄、性别、组织学类型、治疗方式、淋巴结转移、肿瘤浸润程度,生存时间以月计算。变量的赋值和所收集的资料分别见表,17-8,和表,17-9,。试用,Cox,回归模型进行分析。,No,X,1,X,2,X,3,X,4,X,5,X,6,t,Y,No,X,1,X,2,X,3,X,4,X,5,X,6,t,Y,1,54

9、,0,0,1,1,0,52,0,33,62,0,0,0,1,0,120,0,2,57,0,1,0,0,0,51,0,34,40,1,1,1,0,1,40,1,3,58,0,0,0,1,1,35,1,35,50,1,0,0,1,0,26,1,4,43,1,1,1,1,0,103,0,36,33,1,1,0,0,0,120,0,5,48,0,1,0,0,0,7,1,37,57,1,1,1,0,0,120,0,6,40,0,1,0,0,0,60,0,38,48,1,0,0,1,0,120,0,7,44,0,1,0,0,0,58,0,39,28,0,0,0,1,0,3,1,8,36,0,0,0,1,1

10、,29,1,40,54,1,0,1,1,0,120,1,9,39,1,1,1,0,1,70,0,41,35,0,1,0,1,1,7,1,10,42,0,1,0,0,1,67,0,42,47,0,0,0,1,0,18,1,11,42,0,1,0,0,0,66,0,43,49,1,0,1,1,0,120,0,12,42,1,0,1,1,0,87,0,44,43,0,1,0,0,0,120,0,13,51,1,1,1,0,0,85,0,45,48,1,1,0,0,0,15,1,14,55,0,1,0,0,1,82,0,46,44,0,0,0,1,0,4,1,15,49,1,1,1,0,1,76,0,

11、47,60,1,1,1,0,0,120,0,16,52,1,1,1,0,1,74,0,48,40,0,0,0,1,0,16,1,17,48,1,1,1,0,0,63,0,49,32,0,1,0,0,1,24,1,18,54,1,0,1,1,1,101,0,50,44,0,0,0,1,1,19,1,19,38,0,1,0,0,0,100,0,51,48,1,0,0,1,0,120,0,20,40,1,1,1,0,1,66,1,52,72,0,1,0,1,0,24,1,21,38,0,0,0,1,0,93,0,53,42,0,0,0,1,0,2,1,22,19,0,0,0,1,0,24,1,54,

12、63,1,0,1,1,0,120,0,23,67,1,0,1,1,0,93,0,55,55,0,1,1,0,0,12,1,24,37,0,0,1,1,0,90,0,56,39,0,0,0,1,0,5,1,25,43,1,0,0,1,0,15,1,57,44,0,0,0,1,0,120,0,26,49,0,0,0,1,0,3,1,58,42,1,1,1,0,0,120,0,27,50,1,1,1,1,1,87,0,59,74,0,0,0,1,1,7,1,28,53,1,1,1,0,0,120,0,60,61,0,1,0,1,0,40,1,29,32,1,1,1,0,0,120,0,61,45,1

13、,0,1,1,0,108,0,30,46,0,1,0,0,1,120,0,62,38,0,1,0,0,0,24,1,31,43,1,0,1,1,0,120,0,63,62,0,0,0,1,0,16,1,32,44,1,0,1,1,0,120,0,表,17-9 63,名某恶性肿瘤患者的生存时间(月)及影响因素,一、建立数据文件(,data-03.sav,),二、操作过程,主菜单:分析,Analyze,生存,SurvivalCox Regression,Cox,回归主对话框,二、操作过程,主对话框参数设置:,时间,time,框:选入“,t,”。,状态,status,框:选入“,y,”,击,defi

14、ne events,钮,在,single value,框填入“,1,”,协变量,Covariates,框:选入“,x1x6,”。,方法,Method,框:选择自变量进入,Cox,模型的方法,,SPSS,提供以下,7,种方法。,1.,分析例数描述,三、主要输出结果,2-1.,模型检验(全变量模型),结果提示:,(,1,)对模型总体检验有显著意义(,P=0.003,),即至少,有,1,个自变量的总体回归系数不为,0,。,2-2.,模型检验(逐步回归模型,,Method=,向前法,LR,,自变量进入,P0.05,,剔除,P0.10,),(,2,)采用逐步回归法进行,Cox,模型分析的结果提示:模型拟

15、合自变量进入和,剔除的检验水准分别为,0.05,和,0.1,时,筛选后的最佳模型包含两个协变量,,即,X4,(治疗方式)和,X5,(淋巴结是否转移),该拟合模型总体检验提示,具有统计学意义(整体卡方,=17.594,,,P0.10,),B,:偏回归系数,,SE,:偏回归系数的标准误,Wald,:用于检验总体偏回归系数与,0,有无显著差异,,v=1,时,,W=,(,B/SE,),2,。,Exp(B),:相对危险度估计(,RR,值),(,3,),X4,(治疗方式)对生存时间有影响,采用新疗法病人的死亡风险降至传统疗法的,17.2%,(,RR,的,95%CI,为,0.0590.503,)。,(,4,

16、),X5,(淋巴结是否转移)对生存时间也有影响,有淋巴结转移病人的死亡风险为无淋巴结转移病人的,2.538,倍(,RR,的,95%CI,为,1.0626.066,)。,4.,自,/,协变量的均值(选入,2,个变量的模型),5.,生存曲线(选入,2,个变量的模型),Company Logo,练习,1,:,某临床试验对,20,名第,或第,期黑色素瘤的患者进行随访研究,截至研究期结束,记录的生存资料见表,1,。应用,SPSS,软件建立数据文件,并计算,100,周生存率。,表,1 20,名第,或,期黑色素瘤患者的治疗后生存时间(周),12.8,15.6,24.0+,26.4,29.2,30.8+,39

17、.2,42.0,58.4+,72.0+,77.2,82.4,87.2+,94.4+,97.2+,106.0+,114.8+,117.2+,140.0+,168.0+,练习题,练习,2,:,某研究者随访收集了某地男性心绞痛患者,2418,例,其,生存时间数据,整理后,见,表,2,。,(,1,)建立,SPSS,数据文件。,(,2,)估计,该地男性心绞痛患者,的,2,年生存率和标准误,以及中位生存期,。,练习,3,:某研究者分别用免疫疗法、药物,+,免疫疗法治疗黑色素瘤患者,经随访得到各患者的生存时间(月)见数据文件,ex-03.sav,。,(,1,)试用,Kaplan-Meier,过程计算其生存率和标准误。,(,2,)对两组的生存率进行,log-rank,检验。,(,3,)绘制生存曲线,计算中位生存期。,此课件下载可自行编辑修改,仅供参考!感谢您的支持,我们努力做得更好!谢谢,

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