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IL6对细胞连接相关基因介导的肾癌患者生存影响.pdf

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资源描述

1、河南大学学报 医学版 基础医学研究I L 6对细胞连接相关基因介导的肾癌患者生存影响李鸿昊,李慧琳,许鸣广东省第二人民医院民航院区 内二科,广州5 1 0 0 0 0摘要 目的:探讨细胞连接相关基因在肾癌中的作用。方法:筛选细胞连接相关差异基因,L a s s o-C o x回归分析构建风险模型,对风险模型进行生存分析及临床病理特征分析,U C S C验证风险模型用于临床的可行性;R包计算风险基因与免疫细胞的相关性;基于风险模型基因采用C e l l M i n e r数据库发现潜在的肾癌治疗药物,G S VA寻找风险评分差异通路。筛选高低风险组间差异核心基因,分析核心基因的表达在肾癌中的临床

2、意义。初步探讨核心基因表达与风险评分高低及风险基因间的相关性。结果:基于细胞连接相关基因风险模型,高风险评分是肾癌患者生存预后的独立危险因素。白介素6(I L 6)为高低风险组间核心差异基因,I L 6高表达缩短高风险组肾癌生存预后而对低风险组肾癌患者生存预后无影响;I L 6及肾癌临床特征构建的列线图可用于评估肾癌患者的生存预后;I L 6与风险基因具有相关性。结论:I L 6高表达缩短细胞连接相关基因介导的肾癌患者生存预后。关键词 肾癌;细胞连接通路;风险模型;I L 6;生存预后中图分类号 R 7 3 7E f f e c t o f I L 6o nc e l l c o n n e

3、c t i o n-r e l a t e dg e n e-m e d i a t e ds u r v i v a l i nr e n a lc a n c e rp a t i e n t sL IH o ngh a o L IH u i l i n XU M i ngI n t e r n a lM e d i c i n eD e p a r t m e n t C i v i lA v i a t i o nC a m p u s G u a n g d o n gS e c o n dP r o v i n c i a lC e n t r a lH o s p i t a l

4、 G u a n g z h o u5 1 0 0 0 0 CHNA b s t r a c t O b j e c t i v e T oe x p l o r e t h e s i g n i f i c a n c eo f c e l l u l a r c o n n e c t i v i t y i nr e n a l c a n c e r M e t h o d s Ag e n e r i s km o d e lw a se s t a b l i s h e df o rw i d ec e l lc o n n e c t i v i t yp a t h w a

5、 y sb yL a s s o-C o xr e g r e s s i o na n a l y s i sa n dc l i n i c a ls u r v i v a ld a t a w a sd o w n l o a d e df r o m U C S Ct ov e r i f yt h ef e a s i b i l i t yo fr i s ks c o r e a n dt h e nt h es i g n i f i c a n c eo fr i s k m o d e lw a se x p l o r e di nk i d n e yc a n c

6、e r B a s e do nr i s km o d e l g e n e s C e l l M i n e rd a t a b a s ew a su s e dt od i s c o v e rp o t e n t i a lk i d n e yc a n c e r t h e r a p e u t i c sd r u g s a n dG S VAc h o s ed i f f e r e n t i a lp a t h w a y so nb a s eo fr i s ks c o r e D i f f e r e n t i a lg e n e sw

7、e r es c r e e n e db e t w e e nh i g ha n dl o wr i s kg r o u p sa n dt h ec o r eg e n ew a sd e t e r m i n e d N e x t w ee x p l o r e ds i g n i f i c a n c eo ft h ec o r eg e n ei nk i d n e yc a n c e r R e s u l t s B a s e do nt h eg e n er i s km o d e l o f e x t e n s i v ec e l l c

8、o n n e c t i v i t yp a t h w a y s h i g hr i s ks c o r ew a sa ni n d e p e n d e n t r i s kf a c t o r f o r t h e s u r v i v a l p r o g n o s i so f r e n a l c a n c e rp a t i e n t s a n dw a s a s s o c i a t e dw i t h i mm u n e c e l l i n f i l t r a t i o n I L 6w a s t h e c o r e

9、d i f f e r e n t i a l g e n eb e t w e e nh i g ha n dl o wr i s kg r o u p s h i g he x p r e s s i o no f I L 6s h o r t e n e dt h es u r v i v a l p r o g n o s i so fp a t i e n t s i nt h eh i g hr i s kg r o u p b u t h a dn oe f f e c t o n t h e s u r v i v a l o f p a t i e n t s i n t h

10、 e l o wr i s kg r o u p T h en o m o g r a mc o n s t r u c t e db y I L 6a n dc l i n i c a l f e a t u r e sh a s c l i n i c a l v a l u e i n t h ep r o g n o s i s o f k i d n e y c a n c e r I L 6w a s a s s o c i a t e dw i t hr i s kg e n e s C o n c l u s i o n T h ec e l lc o n n e c t i

11、o np a t h w a yr i s kg e n em o d e lh a si m p o r t a n tc l i n i c a la p p l i c a t i o nv a l u ei nk i d n e yc a n c e r a n dI L 6g e n ea f f e c t e dt h es u r v i v a lp r o g n o s i so fk i d n e yc a n c e rp a t i e n t sb y i n t e r a c t i n gw i t hr i s kg e n e s K e yw o r

12、 d s r e n a l c a n c e r c e l l u l a rc o n n e c t i v i t y r i s km o d e l I L 6 s u r v i v a l p r o g n o s i s201J o u r n a l o fH e n a nU n i v e r s i t y M e d i c a lS c i e n c e 2 0 2 3 4 2 2 收稿日期:2 0 2 2-1 1-2 1作者简介:李鸿昊(1 9 9 3-),男,硕士,住院医师。研究方向:肿瘤内科。通信作者,E-m a i l:g u i g u o g

13、u o 1 2 6.c o m 细胞与细胞之间、细胞与细胞外基质之间相互作用是维持机体内环境的重要保障,是促进细胞间相互交流的枢纽,细胞连接是细胞间发生关联的结构基础和基本方式,故细胞连接异常是细胞异常生长的重要原因。细胞连接包括三种主要的类型:紧密连接(T i g h t j u n c t i o n),黏着连接(A d h e r e n s j u n c-t i o n),间隙连接(G a pj u n c t i o n)1-4。紧密连接蛋白家族成员C l a u d i n-4、P A L S 1蛋白、紧密连接相关蛋白闭锁小带蛋白-1、C L N D 6的异常表达均会导致肾癌的发

14、生5-8;黏着连接在生命体活动过程中通过膜整合蛋白、肌动蛋白将细胞与细胞之间或细胞与细胞外基质连接起来,传递细胞信号,在细胞交流过程中发挥重要作用9。研究表明,紧密连接和黏着连接组成的顶端连接复合物对于肿瘤的诊断和治疗具有重要意义1 0。在胃癌、肾癌等类型中,黏着连接与上皮间质转化(EMT)之间紧密关联,促进肿瘤的进展,此外有关黏着连接在肾癌中的作用也尚未有明确共识1 1-1 4。间隙连接是可直接连接两个细胞的细胞质的一种特殊细胞间连接,是多种分子、离子在细胞间传递信号的直接通道,是多种器官正常发育的重要保障1 5-1 6。研究表明,通过改变间隙连接或可对肿瘤药物治疗产生直接影响1 7-1 9

15、。由此可见,三种细胞连接均与肿瘤的发生密切关联。目前,多数研究主要针对其中一种连接类型为主要探讨对象。白细胞介素在传递信息、激活与调节免疫细胞及在炎症反应中起到至关重要作用,故在研究领域中颇受关注。其中,I L-6在疾病包括肿瘤中的研究应用相对较多2 0-2 3,有关I L-6在肾癌中的研究分析也相对较多,但对于I L 6是如何促进肾癌发生发展的研究尚无明确定论2 4-2 5。我们从M s i g D B数据库下载三种细胞连接的相关基因,结合T C GA肾癌转录组数据,通过L a s s o-C o x回归分析构建了细胞连接通路的风险模型,并分别从临床相关性及功能富集分析、免疫相关性、药物敏感

16、性等多方面进行分析。此外,经计算筛选出影响细胞连接通路的关键基因I L 6,经分析发现I L 6表达仅对高风险组肾癌患者的生存预后造成影响,而对低风险组患者生存预后无影响,并构建了包含I L 6及肾癌临床特征的列线图。1 资料与方法1.1 筛选差异基因 从T C GA官网(h t t p s:/www.c a n c e r.g o v/)下载肾癌转转录组数据(包括肾乳头状癌、透明细胞癌、嫌色细胞癌)和肾癌患者的临床信息;从M S i g-D B官 网(h t t p s:/www.g s e a-m s i g d b.o r g/g s e a/m s i g d b)下载三种类型细胞连接

17、通路基(K E G G_A DHE R E N S_J UN C T I ON,K E G G_T I GHT_J UN C T I ON,K E G G_GA P_J UN C T I ON)。基 于T C GA肾癌基因表达数据矩阵,筛选细胞连接通路差异基因。设置条件为|L o g F C|1,F D R矫正后的P值0.0 5。单因素C o x回归筛选预后相关基因,对具有预后价值的差异基因进行L a s s o-C o x回归分析,用于构建风险模型。1.2构建风险基因预后模型R软件包运行L a s s o-C o x回归分析,风险模型通过下式计算:l nh(t)h0(t)=pn=0bnXn。

18、式中,h(t)和h0(t)分别为时间t的风险函数和基线危险函数,Xn和bn分别为基因n的表达量和偏回归系数。1.3 临床应用分析及功能分析根据风险模型,对每个肾癌病人进行风险评分,以风险评分中位数为临界值将肾癌患者分为高风险组和低风险组。由K a p l a n-M e i e r绘制生存曲线比较组间 总 生 存 率(O S);从U C S C X E NA数 据 库(www.g e n o m e.u c s c.e d u)下载肾癌生存数据,验证风险模型的可行性。受试者工作特征(R O C)曲线评估风险模型预测患者生存率的敏感性和特异性;运用P C A分析观察风险基因模型区分高低风险病人的

19、准确性。进一步探究风险模型与临床特征之间的相关性,采用R软件G S VA包探索高低风险组间的差异通路。1.4 免疫分析与药物敏感性C I B E R S O R T方法计算免疫浸润水平在高低风险组的病人分布情况,采用R包不同的计算方法分析风险基因与免疫细胞之间的相关性;用T I D E数据库(h t t p s:/c i s t r o m e.s h i n y a p p s.i o/t i m e r/)比较高低风险组对免疫治疗的反应效果。基于风险基因模型,用C e l l M i n e r数 据 库(h t t p s:/d i s c o v e r.n c i.n i h.g o

20、 v/c e l l m i n e r)筛选潜在的肾癌治疗药物。1.5 核心基因在肾癌中的临床应用分析基于高低风险组筛选差异基因,用S t r i n g数据301河南大学学报(医学版),2 0 2 3,4 2(2)河南大学学报 医学版 库(h t t p s:/s t r i n g-d b.o r g)绘制P P I蛋白互作网络图,用C y t o s c a p e(h t t p s:/c y t o s c a p e.o r g)筛选核心基因,分析核心基因的表达对肾癌生存预后的影响以及与临床特征之间的相关性。基于高低风险组进行分层分析,分别在高低风险亚组中将核心基因表达值中位数作

21、为临界点,分为核心基因高低表达组,K-M法绘制生存曲线比较核心基因表达对患者生存预后的影响。1.6 核心基因与风险基因的相关性用T I ME R数据库分析核心基因与风险基因的相关性。1.7 统计学分析所有的统计学分析基于R软件包与数据库计算,P1,F D R6 04 5 0 T 21 3 5性别 T 32 6 5 男6 2 1 T 41 5 女3 2 0病理级别 G 11 4N分期 G 22 3 0 N 03 3 7 G 32 0 7 N 14 5 G 47 8 N 26肿瘤分期 S t a g e4 9 4 S t a g e1 1 1M分期 S t a g e1 9 6 M 05 5 5

22、S t a g e1 0 5 M 19 02.2 构建细胞连接通路基因风险模型通过单因素C o x回归筛选与生存预后相关的基因,进一步使用L a s s o-C o x回归构建风险模型。最终构建了包括1 2个基因的风险模型:L 1 C AM,b1=0.1 1 55;N R X N 3,b2=-0.3 0 25;C L D N 1 1,b3=0.4 4 44;C NT NA P 1,b4=0.3 5 32;MYH 3,b5=0.5 2 84;Y B X 3,b6=0.2 8 86;TU B A 1 B,b7=0.2 9 93;TU B A 8,b8=1.7 8 4;A D C Y 2,b9=-0

23、.8 1 40;MYH 1 0,b10=-0.1 3 13;C GN,b11=-0.1 5 35;C L D N 1 0,b12=-0.1 4 71。2.3 风险评分的预后分析从U C S C网 站 下 载 肾 癌 患 者 无 瘤 生 存 时 间(P F S)。如图1所示,K a p l a n-M e i e r曲线结果显示高风险组无进展期(P F S)短于低风险组,高风险组总生存时间(O S)明显缩短。接下来,我们对肾癌患者的临床特征及风险评分分别进行单因素与多因素C o x分析,结果提示高风险评分可作为肾癌患者的独立预后危险因素,见图2。P C A分析能准确区分高低风险组。对细胞通路基因

24、及风险组基因进行主成分(P C A)分析,结果提示模型基因表达量可准确区分高低风险组患者,见图3。图4显 示:1a时 的R O C曲 线 下 面 积(AU C)为0.8 4 9,3a时AU C为0.7 5 6,5a时AU C为0.7 6 5。对临床特征及风险评分均绘制R O C曲线,结果显示,风险评分曲线下面积最大。2.4 风险评分与临床特征间的关系根据风险评分中位数将患者分为高低风险组,分析风险模型与临床特征的关系。在肿瘤分级中,G 3组风险评分大于G 2组和G 1组,G 2组大于G 1组风险评分;在肿瘤分期中,S t a g e 的风险评分最高,S t a g e 的风险评分大于S t a

25、 g e;在T分期中,T 4组的风险评分大于T 3组,T 3组风险评分大于T 2组;在N分期中,N 1期风险评分大于N 0期;在M分期中,M 1组风险评分大于M 0组(P0.0 5)。2.5 风险模型与免疫细胞浸润之间的关系根据C I B E R S O R T算法,计算高低风险评分与免疫细胞浸润之间的关系,结果显示:在记忆B细胞、C D 8 T细胞、激活的C D 4 T细胞、滤泡辅助性T细胞、静止的NK细胞、M 1巨噬细胞中,高风险评分组分数较高;在M 2巨噬细胞、静止的肥大细胞中401J o u r n a l o fH e n a nU n i v e r s i t y M e d i

26、 c a lS c i e n c e 2 0 2 3 4 2 2 低风险评分组分数较高。基于不同的免疫浸润计算方法,计算风险基因与不同免疫细胞浸润之间的关系,结果显示:C NT NA P 1与癌症相关成纤维细胞呈正相关,C L D N 1 1与癌症相关成纤维细胞呈正相关,MYH 1 0与C D 4 T细胞呈负相关、与NK细胞呈负相关,Y B X 3与M 1巨噬细胞呈正相关,C L D N 1 0与中性粒细胞呈正相关。A:高风险组无进展期P F S缩短;B:高风险组生存时间O S明显缩短。图1 高低风险评分与肾癌生存预后的关系图2 单因素C o x回归森林图左与多因素C o x回归森林图右图3

27、 细胞连接通路基因P C A分析与模型基因P C A分析501河南大学学报(医学版),2 0 2 3,4 2(2)河南大学学报 医学版 图4 风险模型R O C曲线与临床特征构建R O C曲线2.6 药物敏感性T I D E数据库表明高风险评分的免疫治疗效果较差。我们进一步采用C e l l M i n e r数据库筛选可能应用于肾癌化疗的药物。药物敏感性与高低风险组的关系如图5所示:随着C L D N 1 0表达越高,患者对L O X O-1 0 1(拉罗替尼)、NM S-E 6 2 8(恩可替尼)越敏感;随着Y B X 3表达的增加,患者对D e l e u k i nd i f t i

28、t o x o n t a k(地尼白介素)、C i n c h o n i d i n e(辛可尼丁)的耐药程度增加;随着N R X N 3的表达增高,患者对B e l i n o s t a t(贝利司他)、M e t h o t r e x a t e(甲氨蝶呤)、M a l a c i d(苹果酸/乙胺嘧啶)、M e l b e x(肌苷单磷酸脱氢酶抑制剂)的 耐 药 性 增 加,对C y c l o b e n z a-p r i n eH y d r o c h l o r i d e(盐酸环苯扎林)的药物作用越敏感;A D C Y 2的表达增加,患者对D a b r a f e

29、n i b(达拉非尼)的治疗越敏感,对V e m u r a f e n i b(维莫非尼)的图5 风险基因与药物敏感性601J o u r n a l o fH e n a nU n i v e r s i t y M e d i c a lS c i e n c e 2 0 2 3 4 2 2 耐药性增加;C GN的表达增加,则患者对A c e t a l a x(乙二醇/醋酸氧苯沙丁)、B i s a c o d y l(比沙可啶)的治疗效 果 越 敏 感;TU B A 8的 表 达 则 使 患 者 对D o-c e t a x e l(多西他赛)的耐药性增强;随着C NT NA P 1

30、表达量的增加,患者对T e m s i r o l i m u s(坦西莫司)、B l e o m y c i n(博来霉素)的治疗效果越明显。2.7 功能分析G S VA探究风险评分潜在的作用通路。从图6可看出风险评分与多条作用通路存在相关性,风险评分与K E G G_B_C E L L_R E C E P TOR(B细胞受 体 通 路)、K E G G_CHEMOK I N E(趋 化 因 子通路)、K E G G_J AK_S TAT(酪 氨 酸 激 酶 转 录 因子通路)、K E G G_NOD_L I K E_R E C E P TOR(核苷酸寡居结构域样受体通路)、K E G G_

31、MA P K(丝裂原 活 化 蛋 白 激 酶 通 路)、K E G G_NOT CH(NOT CH基因信号通路)、K E G G_P 5 3(P 5 3信号通路)、K E G G_R I G_I 视黄酸(维甲酸)诱导基因蛋白I信号通路、K E G G_T_C E L L_R E C E P TOR(T细胞受 体 通 路)、K E G G_V E G F(血 管 内 皮 因子信 号 通 路)等 通 路 呈 正 相 关。风 险 评 分 与K E G G_WNT(WNT信 号 通 路)、K E G G_P P AR(过氧 化 物 酶 体 增 殖 物 激 活 受 体 信 号 通 路)、K E G G_

32、MTOR(雷 帕 霉 素 靶 蛋 白 信 号 通 路)、K E G G_I N S UL I N(胰岛素受体信号转导)、K E G G_GNRH(促性腺 激 素 释 放 激 素 受 体 信 号 通 路)、K E G G_E R B B(E r b b信 号 通 路)、K E G G_AD I P O-C YTOK I N E(脂肪因子信号通路)等呈负相关。*P0.0 5;*P0.0 1;*P0.0 0 1。图6 G S V A富集分析风险评分潜在的作用通路2.8 风险组间差异基因基于以上结果可看出包含1 2种基因的风险模型在肾癌中具有重要的研究价值。为了进一步分析风险评分是如何影响肾癌的进展,

33、基于风险评分将肾癌 患 者 分 成 高 低 风 险 组,筛 选 组 间 差 异 基 因(L o g F C=2,F D R0.0 5),如图7为用S t r i n g数据库及C y t o s c a p e绘制的差异基因网络图,基于邻近基因节点数目的多少,使用C y t o H u b b a插件中D e-g r e em e t h o d计算方法筛选核心差异基因,得到I L 6为最显著核心基因。701河南大学学报(医学版),2 0 2 3,4 2(2)河南大学学报 医学版 A:基于高低风险组间差异基因绘制P P I网络图;B:C y t o h u b b功能筛选核心基因。图7 C y

34、 t o s c a p e筛选风险差异核心基因3 I L 6与肾癌临床特征的关系根据肾癌转录组数据表达矩阵将肿瘤患者分为I L 6高表达组与I L 6低表达组,K-M法绘制生存曲线,I L 6高表达组患者生存期短于I L 6低表达组。在肿瘤分级中,G 4组I L 6表达分别大于G 3组和G 2组中I L 6表达,G 3与G 2组的I L 6表达分别大于G 1组中I L 6的表达。3.1 构建列线图纳入I L 6、年龄、性别、肿瘤分级、肿瘤分期构建列线图(图8 A),用于预测肾癌患者的生存率。校准曲线(图8 B)评估列线图的准确性,C指数为0.7 7 5,提示列线图具有较准确的生存预测能力。3

35、.2 I L 6的表达分别对高低风险组预后的影响 在高低风险组中分别以I L 6的表达值中位数为801J o u r n a l o fH e n a nU n i v e r s i t y M e d i c a lS c i e n c e 2 0 2 3 4 2 2 临界点,将患者分成I L 6高低表达亚组。KM法绘制生存曲线,比较两亚组之间的生存差异。如图9所示,在高风险组中,I L 6高表达组生存时间短于I L 6低表达组;在低风险组中,I L 6高表达组与I L 6低表达组患者无生存差异。A:包含I L 6表达及临床特征因素的列线图;B:列线图校准曲线。图8 临床特征列线图901

36、河南大学学报(医学版),2 0 2 3,4 2(2)河南大学学报 医学版 A:在高风险组中,I L 6高表达组生存时间短于I L 6低表达组;B:在低风险组中,I L 6高表达组与I L 6低表达组患者无生存差异。图9 I L 6的表达对高低风险组预后的影响3.3 I L 6与风险基因的相关性基于上述结果,I L 6高表达对高风险评分组患者生存影响明显,而对低风险评分组患者无明显生存影响。采用T I ME R数据库进一步分析了I L 6与风险基因的相关性。在肾嫌色细胞癌病理类型中I L 6与C NT NA P 1正相关;在上皮乳头状癌类型中I L 6与C L D N 1 1、L 1 C AM正

37、相关;在透明细胞癌病理类型中I L 6与C GN呈负相关、I L 6与C L D N 1 1、C NT NA P 1、TU B A 1 B、B X 3(C S D A)正相关。4 讨论细胞连接在细胞间相互通讯及作用中发挥着重要作用,与多种疾病及肿瘤的发生密不可分2 6-2 7。本次研究以广泛细胞连接通路相关基因为研究目标,基于T C GA数据库下载的肾癌转录组数据(包括肾透明细胞癌、乳头上皮状癌、嫌色细胞癌)成功构 建 了 包 含L 1 C AM、N R X N、C L D N 1 1、C NT-NA P 1、MYH 3、Y B X 3、TU B A 1 B、TU B A 8、A D-C Y

38、2、MYH 1 0、C GN、C L D N 1 0等1 2个基因的风险模型,在U C S C数据库下载了肾癌生存数据,验证了高风险评分可作为肾癌独立预后危险因素的可行性,同时经过分析得出风险评分在肾癌的临床方面具有重要的临床价值;同时计算出风险评分与免疫浸润 及 免 疫 治 疗 效 果 间 均 存 在 密 切 关 联,通 过C e l l M i n e r数据库发掘了与风险基因相关的治疗药物。使用G S VA分析得出高低风险评分在多条重要通路间存在差异,所涉及通路多数为肿瘤发生发展直接相关的重要通路,如J AK-S T AT、NOT CH基因信号通路、P 5 3信号通路、B细胞受体通路、趋

39、化因子通路、酪氨酸激酶转录因子通路、WNT信号通路、T细胞 受体通路、血 管内皮因子 等 信 号 通路2 8-3 0。为了进一步分析风险基因在肾癌中的应用,基于高低风险评分,筛选组间差异基因,结果显示I L 6为风险评分的核心差异基因。I L 6作为趋化因子家族常见的成员之一,在多种类型肿瘤中具有重要的表达,在肾癌中的研究也有报道。我们首先验证了I L 6高低表达对肾癌患者的预后存在影响,且与临床特征构建的列线图在预测肾癌患者的生存率方面具有一定的临床应用价值。接下来进行分层分析,结果发现在高风险组患者中,I L 6高表达明显缩短患者生存预后,而对低风险组患者无生存预后影响,此 结 论 为 本

40、 文 的 创 新 点 所 在。最 后,使 用T I ME R数据库分析I L 6分别与1 2个风险基因的相关 性,结 果 发 现I L 6在 肾 癌 中 与C NT NA P 1、C L D N 1 1、L 1 C AM、TU B A 1 B、Y B X 3(C S D A)均呈现相关性。信号转导通路贯穿细胞生长的始终,从细胞膜上的信号分子到细胞核内的转录因子任何一个环节问题均可导致肿瘤的发生3 1。细胞间连接的主要作用在于增强细胞间的交流、对细胞间的物质交换,维持机体稳态起重要作用,在细胞连接通路中存在大量基因,我们通过差异分析及筛选最终得到包含L 1 C AM、N R X N 3、C L

41、D N 1 1、C NT NA P 1、MYH 3、Y B X 3、TU B A 1 B、TU B A 8、A D C Y 2、MYH 1 0、C GN、C L D N 1 0等1 2个基因的风险模型。L 1 C AM(L 1细胞黏附分子)属免疫球蛋白超家族成员,最初在神经组织中被发现,L 1 C AM在多种类型肿瘤中呈现高表达趋势,并且L 1 C AM与EMT、血管异常011J o u r n a l o fH e n a nU n i v e r s i t y M e d i c a lS c i e n c e 2 0 2 3 4 2 2 生成、肿瘤细胞的耐药性等多种肿瘤进展因素相关3

42、 2;N R X N 3可促进神经递质的释放,最早被发现在神经系统病中发挥关键作用,后在肿瘤中也有所报道,在肾癌中的研究相对较少3 3-3 4;C l a u d i n蛋白家族是细胞紧密连接的主要蛋白,在维持细胞动态平衡中起重要作用,与肿瘤细胞的侵袭、转移相关,此次在我们的模型中包含C L D N 1 1、C L D N 1 0两个C l a u d i n蛋白家族成员。已有报道证实C L D N 1 0低表达提示肾透明细胞癌的进展,C L D N 1 1高表达预示肾透明细胞癌较差的预后,我们的研究与报道相一致3 5-3 7;髓鞘粘连相关蛋白(C a s p r)家族是细胞信号转导和激活神经

43、元细胞内功能的一种跨膜蛋白,C NT NA P 1是该家族中被发现的第一个成员,尤其是与免疫浸润、功能之间的关系被广泛研究,有研究表明C NT NA P 1或可作为透明细胞癌潜在的治疗靶点,在我们的研究中提示C NT NA P 1高表达预示肾癌较差的预后3 8;肌球蛋白超家族在物质运输、肌肉收缩等多种生理活动中发挥重要作用,MYH 3作为其中一员主要与人类某些遗传病存在关联,然MYH 3在肿瘤中的研究相对较少3 9;Y B X 3作为近些年的热点转录因子,编码具有高度保守的冷休克结构域的蛋白质,在代谢过程中具有重要作用,在多种类型的肿瘤中均有所报道,且与MA P K、P I 3/A k t等

44、一 些 重 要 的 通 路 相 关 联4 0-4 2;微 管 蛋 白(TU B A 1 B)是构成细胞骨架的主要成分之一,参与构成细胞骨架、物质交换和转运,在肿瘤中同样存在微管蛋白的异常表达,如在结肠癌中TU B A 1 B高表达,是C D 8 T细胞耗竭的重要原 因,微管蛋白 8(TU B A 8)则在肿瘤中的研究相对较少4 3;A D C Y 2属于膜相关蛋白酶,与肿瘤免疫微环境及生存预后相关,且在多种类型肿瘤中均为风险基因4 4-4 5;有多篇文献报道,MYH 1 0在肾癌中低表达,其表达水平影响肾癌患者生存预后,在我们的研究中,MYH 1 0高表 达 是 肾 癌 的 一 种 保 护 性

45、 因 素,与 报 道 相 符合4 6-4 7;C GN在肿瘤中的表达作用也有报道,但在肾癌中的研究相对较少4 8-4 9。作为一种炎性细胞因子,I L 6在防御病原体和调节人体免疫系统方面起着不可替代的作用,其表达缺失或增加均可导致人类疾病的发生,包括肿瘤的发生。在此次的研究中,当对所有的肾癌患者分析时,I L 6高表达提示患者预后不良。而进行分层分析后,我们发现I L 6高表达仅影响高风险组患者生存时间。此外,I L 6-J AK-S T AT通路在细胞增殖分化、炎症反应、肿瘤生长中均为重要通路。此次发现在高低风险组中J AK-S T AT为 差 异 通 路,风 险 基 因 是 否 与I L

46、 6-J AK-S T AT通路相互作用而影响肾癌的发展有待进一步研究。基于上述研究分析,我们认为I L 6通过与风险基因相互作用进而影响患者的生存预后,日后将进一步采取实验验证。参考文献 1 L E NN EPF R U P P R E CHTJF V I A S NO F FV C e l lj u n c t i o nm e c h a n i c sb e y o n dt h eb o u n d so fa d h e s i o na n dt e n s i o n J D e vC e l l 2 0 2 1 5 6 2 2 0 2-2 1 2 2 陈泽洋 王鹏远 刘玉村

47、微小R NA对肠黏膜紧密连接蛋白表达的调节研究进展 J 中国现代普通外科进展 2 0 2 2 2 5 1 1 8 9 0-8 9 3 3 HA S H I MOT O Y T A CH I B ANA K KON D OH M T i g h t j u n c t i o nm o d u l a t o r sf o rd r u gd e l i v e r yt ot h ec e n-t r a l n e r v o u ss y s t e m J D r u gD i s c o vT o d a y 2 0 2 0 2 5 8 1 4 7 7-1 4 8 6 4 Z HAOX

48、J Z E N G HL L E IL e ta l T i g h t j u n c t i o n sa n dt h e i r r e g u l a t i o nb yn o n-c o d i n gR NA s J I n tJB i o lS c i 2 0 2 1 1 7 3 7 1 2-7 2 7 5 徐珀 紧密连接相关蛋白在肾癌中的表达情况及其临床意义 J 黑龙江医药 2 0 2 0 3 3 2 4 4 8-4 5 0 6 QU H N J I NQ QUANCS C L D N 6 f r o mt r a d i t i o n-a lb a r r i e r

49、f u n c t i o nt oe m e r g i n gr o l e s i nc a n c e r s J I n t JM o lS c i 2 0 2 1 2 2 2 4 1 3 4 1 6 7 OWA R IT S A S AK IT F U J I IK e t a l R o l e o f n u c l e a rc l a u d i n-4i nr e n a lc e l lc a r c i n o m a J I n tJ M o lS c i 2 0 2 0 2 1 2 1 8 3 4 0 8 L IP P L AN P L I U S e ta l

50、C e l lp o l a r i t yp r o t e i np a l s 1-a s s o c i a t e dt i g h t j u n c t i o ne x p r e s s i o ni saf a v o r a b l ep r o g n o s t i cm a r k e r i nc l e a rc e l l r e n a lc e l lc a r c i n o m a J F r o n tG e n e t 2 0 2 0 1 1 9 3 1 9 D A IW NA D A D URRD B R E NNANJA e t a l Z O

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