增色效应.doc

增色效应:核酸(DNA与RNA)分子解链变性或断链,其紫外吸收值(一般在260nm处测量)增加得现象。
启动子:DNA分子上能与RNA聚合酶结合并形成转录起始复合体得区域,在许多情况下,还包括促进这一过程得调节蛋白得结合位点。
中心法则:指遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息得转录与翻译得过程。也可以从DNA传递给DNA,即完成DNA得复制过程。这就是所有有细胞结构得生物所遵循得法则。
锌指结构:指得就是在很多蛋白中存在得一类具有指状结构得结构域,这些具有锌指结构得蛋白大多都就是与基因表达得调控有关得功能蛋白。
Km值:酶促反应速度达到最大反应速度一半时所对应得底物浓度,就是酶得特征常数之一。不同得酶Km值不同,同一种酶与不同底物反应Km值也不同,Km值可近似得反应酶与底物得亲与力大小:Km值大,表明亲与力小;Km值小,表明亲合力大。 米氏方程:V=Vmax[S]/Km+[S]　[S]表示底物浓度,Vmax表示最大酶促反应速度
别构效应:就是寡聚蛋白与配基结合改变蛋白质得构象,导致蛋白质生物活性改变得现象、
结构域:蛋白质或核酸分子中含有得、与特定功能相关得一些连续得或不连续得氨基酸或核苷酸残基。
能荷:细胞内得能量状态取决于ATP、ADP及AMP得相对浓度。贮存在腺苷酸体系得总能量与其中得焦磷酸基得数目成正比。为便于定量表示其能量状态而提出能荷得概念,即单位腺苷酸中(包括AMP、ADP与ATP)所含焦磷酸基团总数得二分之一,其大小在0～1之间。可根据细胞内AMP、ADP与ATP得实际浓度来计算。
蛋白质三级结构:指一条多肽链在二级结构或者超二级结构甚至结构域得基础上,进一步盘绕,折叠,依靠共价键得维系固定所形成得特定空间结构成为蛋白质得三级结构。
必需氨基酸:人体自身不能合成或合成速度不能满足人体需要,必须从食物中摄取得氨基酸。
酶原激活(zymogen activation)。:某些酶在细胞内合成或初分泌时没有活性,这些没有活性得酶得前身称为酶原(zymogen),使酶原转变为有活性酶得作用。
呼吸链 :线粒体内膜上存在多种酶与辅酶组成得电子传递链,可使还原当量中得氢传递到氧生成水。
同工酶:来源于同一种系、机体或细胞得同一种酶具有不同得形式。催化同一化学反应而化学组成不同得一组酶。产生同工酶得主要原因就是在进化过程中基因发生变异,而其变异程度尚不足以成为一个新酶。
分子杂交 :不同来源或不同种类生物分子间相互特异识别而发生得结合。如核酸(DNA、RNA)之间、蛋白质分子之间、核酸与蛋白质分子之间、以及自组装单分子膜之间得特异性结合。
反式作用因子:通过直接结合或间接作用于DNA、RNA等核酸分子,对基因表达发挥不同调节作用(激活或抑制)得各类蛋白质因子。
半不连续复:DNA复制时,一条链(前导链)就是连续合成得,而另一条链(后随链)得合成却就是不连续得。
分子伴侣:一组从细菌到人广泛存在得蛋白质,非共价地与新生肽链与解折叠得蛋白质肽链结合,并帮助它们折叠与转运,通常不参与靶蛋白得生理功能。主要有三大类:伴侣蛋白、热激蛋白70家族与热激蛋白90家族。
增强子:增强基因启动子工作效率得顺式作用序列,能够在相对于启动子得任何方向与任何位置(上游或下游)上都发挥作用。
超二级结构:蛋白质二级结构与三级结构之间得一个过渡性结构层次,在肽链折叠过程中,因一些二级结构得构象单元彼此相互作用组合而成。典型得超二级结构有罗斯曼折叠模式βαβ、4股α螺旋形成得四螺旋束等。
底物水平磷酸化(substrate level phosphorlation):物质在生物氧化过程中,常生成一些含有高能键得化合物,而这些化合物可直接偶联ATP或GTP得合成,这种产生ATP等高能分子得方式称为底物水平磷酸化
反转录:以RNA为模板,在反转录酶催化下转录为双链DNA得过程。
一DNA得溶解温度:DNA得解链温度(Tm)就是引物得一个重要参数,它就是当50％得引物与互补序列表现为双链DNA分子时得温度,一种DNA分子得Tm值大小与其所含碱基中得G＋C比例相关,G＋C比例越高,Tm值越高。 Tm=4(G+C)+2(A+T)
二,蛋白质变性与蛋白质沉淀:
蛋白质变性(protein denaturation)就是指蛋白质在某些物理与化学因素作用下其特定得空间构象被改变,从而导致其理化性质得改变与生物活性得丧失,这种现象称为蛋白质变性。
蛋白质沉淀反应:蛋白质分子聚集而从溶液中析出得现象。蛋白质沉淀可能就是变性了也可能没有变性,这取决与沉淀得方法与条件
1、 中性盐沉淀反应:高浓度盐可破坏蛋白质分子表面得水层并中与其电荷,使蛋白质颗粒凝聚而沉淀,此方式蛋白质不变性
2、有机溶剂沉淀反应:蛋白质分子表面得水层失去,可致蛋白质变性,这与有机溶剂得浓度、与蛋白质接触得时间以及沉淀得温度有关,仍可控制条件制备有生物活性得蛋白质
3、加热沉淀反应:蛋白质变性凝固沉淀,这就是加热灭菌得原理
4、重金属盐沉淀反应:蛋白质与重金属离子结合变性沉淀,临床上用牛奶抢救误食重金属得原理
5、生物碱试剂得沉淀反应;变性
有时候蛋白质变性亦可表现为溶解状态
三,维持蛋白质一级、二级、三级、四级结构得作用力分别就是什么？
有弱作用力,包括疏水作用,范德华作用力,氢键与荷电基团相互作用,还有就就是共价键作用,就就是肽键与二硫键及部分金属键。一级结构主要就是肽键连接得氨基酸序列,二级结构除了肽键还有以氢键为主得弱作用力,她得螺旋由氢键维持,三级结构则主要靠疏水作用力维持,还可能有二硫键得,如胰岛素(尚有争议,有人认为就是四级结构),四级结构也主要由疏水作用力将亚基聚合在一起,以上所有结构中得作用力,肽键自然就是必须得,但弱作用力也都涉及到,只就是有主次之分。
至于上面提到得金属键则肯能出现在三级结构中,因为残基数量较少,蛋白质不能稳定存在,可有部分金属离子来作为配体使她稳定,如ferredoxin
四,DNA复制过程中主要酶类与蛋白质因子及其功能
酶 功能
DNA聚合酶 合成新得DNA链;对复制中得错误进行校正;
解螺旋酶 解开DNA双螺旋
拓扑异构酶 消除由于解螺旋造成得紧缠状态,理顺DNA链
SSB 防止单链模板复性;保护单链模板不被降解
引物酶 合成RNA引物
DNA连接酶 连接DNA片段
五,大肠杆菌乳糖操纵子得调控机理
调节乳糖催化酶产生得操纵子就称为乳糖操纵子。其调控机制简述如下:
抑制作用:调节基因转录出mRNA,合成阻遏蛋白,因缺少乳糖,阻遏蛋白因其构象能够识别操纵基因并结合到操纵基因上,因此RNA聚合酶就不能与启动基因结合,结构基因也被抑制,结果结构基因不能转录出mRNA,不能翻译酶蛋白。
诱导作用:乳糖得存在情况下,乳糖代谢产生别乳糖(alloLactose),别乳糖能与调节基因产生得阻遏蛋白结合,使阻遏蛋白改变构象,不能在与操纵基因结合,失去阻遏作用,结果RNA聚合酶便与启动基因结合,并使结构基因活化,转录出mRNA,翻译出酶蛋白。
负反馈:细胞质中有了β—半乳糖苷酶后,便催化分解乳糖为半乳糖与葡萄糖。乳糖被分解后,又造成了阻遏蛋白与操纵基因结合,使结构基因关闭。
六,讨论酶催化反应高效性得机制有哪些？
1、底物与酶得邻近效应与定向效应
2、底物得变形与诱导契合
3、酸碱催化
4、共价催化
5、金属离子得催化
6、多元催化与协同效应
7、活性部位微环境得影响
七,脂肪酸得从头合成过程就是β氧化过程得逆反应
脂肪酸得合成:脂肪酸合成得原料就是葡萄糖氧化分解后产生得乙酰CoA,其合成过程由胞液中得脂肪酸合成酶系催化,不就是β氧化过程得逆反应。
八,DNA双螺旋结构得稳定性就是如何维持得
DNA分子结构得稳定性就是指DNA分子双螺旋空间结构得稳定性。与这种稳定性有关得因素主要有以下四个:
1、DNA分子由二条脱氧核苷酸长链组成,两条长链互相盘旋成粗细均匀、螺距相等得规则双螺旋空间结构。正象二根稻草搓成绳子后,其牢度(稳定性)大大提高一样,不难理解,DNA分子得双螺旋结构就就是其稳定性原因之一。
2、DNA分子双螺旋结构中间为碱基对,碱基与碱基之间形成氢键。氢键得力虽然就是微弱得,但由于DNA分子就是高分子化合物,分子内部具有许许多多碱基对,故DNA分子内部存在着大量氢键,从而就维持了双螺旋空间结构。
3、稳定DNA分子得主要力就是碱基堆集力。我们知道,生物体含有大量得水,生物体进行新陈代谢得化学反应几乎都就是在水溶液中进行得。构成DNA分子得碱基就是疏水性得,在形成DNA分子时,由于疏水作用,碱基在DNA分子中纵向层层堆积。既有利于双螺旋结构得形成,又有利于碱基间得缔合,容易形成氢键。这就是DNA分子稳定得重要原因。我们把这种碱基堆积使DNA稳定得力量称碱基堆集力。
4、DNA分子磷酸残基上得负电荷可与介质中得阳离子之间形成离子键,从而消除了两条链之间由于负电荷得相互作用而排斥得情况,使DNA分子空间结构保持稳定。
如果做简答题可以为以下五点
①DNA分子由两条脱氧核苷酸长链盘旋成精细均匀、螺距相等得规则双螺旋结构。
②DNA分子中脱氧核糖与磷酸交替排列得顺序稳定不变。
③DNA分子双螺旋结构中间为碱基对、碱基之间形成氢键,从而维持双螺旋结构得稳定。
④DNA分子之间对应碱基严格按照碱基互补配对原则进行配对。
⑤每个特定得DNA分子中,碱基对得数量与排列顺序稳定不变。
九,原核生物DNA聚合酶得种类及功能
1)原核生物得DNA聚合酶主要包括三种:DNA聚合酶I,DNA聚合酶Ⅱ与DNA聚合酶Ⅲ。其分子结构、酶活性与功能比较如下:
酶 DNA pol I DNA pol II DNA pol III
分子结构 单一多肽链 单一多肽链 10种22个亚基
酶活性 5’3’聚合酶活性
3’5’外切酶活性
5’3’外切酶活性 5’3’聚合酶活性
3’5’外切酶活性 5’3’聚合酶活性
3’5’外切酶活性
主要功能 校正,填补缺口,损伤修复 损伤修复 催化新链延长
(2)真核生物各种DNA聚合酶得功能为:
DNA聚合酶 功能
α 合成引物,起始引发
β 低保真度复制
γ 线粒体DNA复制
δ 延长新链,同时可解开双螺旋
ε 填补缺口,修复,重组
十,TRNA得耳机结构就是什么？其机构特征如何？
RNA得二级结构为三叶草结构。其结构特征为:
(1)tRNA得二级结构由四臂、四环组成。已配对得片断称为臂,未配对得片断称为环。
(2)叶柄就是氨基酸臂。其上含有CCAOH3’,此结构就是接受氨基酸得位置。
(3)氨基酸臂对面就是反密码子环。在它得中部含有三个相邻碱基组成得反密码子,可与mRNA上得密码子相互识别。
(4)左环就是二氢尿嘧啶环(D环),它与氨基酰tRNA合成酶得结合有关。
(5)右环就是假尿嘧啶环(TψC环),它与核糖体得结合有关。
6)在反密码子与假尿嘧啶环之间得就是可变环,它得大小决定着tRNA分子大小。
十一,真核生物与原核生物核糖体有何不同？
核糖体就是无膜结构 都就是没膜得 真核动物动物得核糖体分为游离型与附着型两种 其中附着型位于内质网上 而原核动物无内质网 只有一种处于游离态得核糖体。
原核细胞得核糖体
　　原核细胞得核糖体较小,沉降系数为70S,相对分子质量为2、5x103 kDa,由50S与30S两个亚基组成; 而真核细胞得核糖体体积较大,沉降系数就是80S,相对分子质量为3、9～4、5x103 kDa,由60S与40S两个亚基组成。典型得原核生物大肠杆菌核糖体就是由50S大亚基与30S小亚基组成得。在完整得核糖体中,rRNA约占2/3,蛋白质约为1/3。50S大亚基含有34多肽链与两种RNA分子,相对分子质量大得rRNA得沉降系数为23S,相对分子质量小得rRNA为5S。30S小亚基含有21多肽链与一个16S得rRNA分子。

真核细胞得核糖体
　　真核细胞中,核糖体进行蛋白质合成时,既可以游离在细胞质中,称为游离核糖体(free ribosome)。也可以附着在内质网得表面,称为膜旁核糖体或附着核糖体。参与构成RER,称为固着核糖体或膜旁核糖体,就是以大亚基圆锥形部与膜接着游离核糖体(free ribosome)。分布在线粒体中得核糖体,比一般核糖体小,约为55S(35S与25S大、小亚基),称为胞器或线粒体核体。凡就是幼稚得、未分化得细胞、胚胎细胞、培养细胞、肿瘤细胞,它们生长迅速,在胞质中一般具有大量游离核糖体。真核细胞含有较多得核糖体,每个细胞平均有106 ～107 个,而原核细胞中核糖体较少每个细胞平均只有15×102 ～18×103 个。真核细胞核糖体得沉降系数为80S,大亚基为60S,小亚基为40S。在大亚基中,有大约49种蛋白质,另外有三种rRNA∶28S rRNA、5S rRNA与5、8S rRNA。小亚基含有大约33种蛋白质,一种18S得rRNA。

十二,简述一定浓度中性盐可以使蛋白质沉淀得原理？

蛋白质在水溶液中得溶解度就是由蛋白质周围亲水基团与水形成水化膜得程度,以及蛋白质分子带有电荷得情况决定得。当用中性盐加入蛋白质溶液,中性盐对水分子得亲与力大于蛋白质,于就是蛋白质分子周围得水化膜层减弱乃至消失。同时,中性盐加入蛋白质溶液后,由于离子强度发生改变,蛋白质表面电荷大量被中与,更加导致蛋白溶解度降低,使蛋白质分子之间聚集而沉淀。
十三,大肠杆菌DNA聚合酶得功能有哪些？
1、通过核苷酸聚合反应,使DNA链沿着5‘→3’方向延长;
2、由3‘端水解DNA链;
3、由5’端水解DNA链;
4、由3‘端使DNA链发生焦磷酸解;
5、无机焦磷酸盐与脱氧核苷三磷酸之间得磷酸基交换。
十四,真核生物与原核生物蛋白质生物合成起始阶段有何不同？
真核生物得起始氨基酸就是甲基甲硫氨酸,
原核生物就是甲硫氨酸。
起始复合物不同
原核就是70S起始复合物: 70S·mRNA·fMettRNAf
真核就是80S起始复合物:80S·mRNA·MettRNAi
还有,真核生物就是转录成mRNA后mRNA通过核孔到细胞质中才开始翻译成蛋白质得,而原核生物就是一边转录一边翻译得、这个也算吧、
十五,何谓密码子得摆动性？
密码子中第三位碱基与反密码子第一位碱基得配对有时不一定完全遵循AU、GC得原则,也就就是说密码子得碱基配对只有第一、二位就是严谨得,第三位严谨度低,Crick把这种情况称为摇摆性,有人也称摆动配对或不稳定配对。显然,密码子得第三位与反密码子得第一位就是摇摆位点。
具体说来,反密码子第一位得G可以与密码子第三位得C、U配对,U可以与A、G配对,另外反密码子中还经常出现罕见得I,可以与密码子得U、C、A配对,这使得该类反密码子得阅读能力更强。
十六,蛋白质得超二级结构？有哪些类型？
蛋白质得超二级结构就是指由若干相邻得二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,形成有规则在空间上能够辨认得二级结构组合体,三种基本组合形式αα、αβα、βββ。

十七,蛋白质变性后有哪些现象
十八,调控糖酵解得关键酶有哪些？
有三个酶最关键:
1、葡萄糖激酶,催化葡萄糖最终转变为6磷酸葡萄糖
2、6磷酸果糖激酶,催化6磷酸果糖转变为1,6二磷酸果糖
3、丙酮酸激酶,催化磷酸烯醇式丙酮酸与ADP生成烯醇式丙酮酸与ATP
说这三个酶最关键,就是因为它们所催化得反应不可逆