1、生化:第一单元蛋白质结构与功能1.氨基酸与多肽:半胱(巯基)、蛋(甲硫)半胱(巯基)、蛋(甲硫);酪丙苯色,酸雨天收谷子氨酸是所有必需氨基酸中唯一含有硫元素的氨基酸。含有苯环的氨基酸是苯丙氨酸和酪氨酸、色氨酸。酸性氨基酸是谷氨酸和天冬氨酸。谷胱甘肽(GSH)由谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸组成的三肽(谷-胱-甘),半胱氨酸巯基是其主要功能基团。2.蛋白质的结构1级肽键,羟氨脱水排列。2级氢键主链螺旋。3级空间范德华4级非共价键亚基解聚。核酸的一级结构:磷酸二酯键:蛋白质一级结构,氨基酸以肽键连接,氨基酸的排列顺序。二级结构:局部主链的空间构象。螺旋结构特征:1.多肽链主链围绕中心轴旋转;2.氢键维持
2、螺旋结构的稳定;3.右手螺旋。三级结构:亚基间相对的空间位置。一条多肽链中所有原子在三维空间的整体排布为三级结构。四级结构:由二条肽链以上多肽主链构成,每条肽链具有独立的三级结构,每条肽链称为一个亚基,各亚基间以非共价键维系,称四级结构。蛋白质的变性蛋白水解肽键1级无空间,变性空间。:蛋白质的空间结构(但不包括一级结构)遭到破坏。生物学活性丧失。第二单元核酸的结构与功能1.核酸:脱氧核糖核酸(DNA):遗传信息的贮存和携带者;核糖核酸(RNA):参与遗传信息的表达。2.DNA的结构与功能:腺嘌呤(A),鸟嘌呤(G),胞嘧啶(C),胸腺嘧啶(T),尿嘧啶(U)。A=T;C=G含量相同。两碱基之间
3、的氢键是维持双螺旋横向稳定的主要化学键。纵向则以碱基平面之间的碱基堆积力维持稳定。3.DNA变性及其应用:DNA变性:氢键断裂。高色效应:紫外吸收(260nm)增强。解链温度融解温度(Tm):UV吸收增值达到最大吸收增值50%时的温度,称Tm。G+C含量愈大,Tm愈高Km与亲和力成反比Tm 与G+C含量成正比治疗指数与安全成正比3.DNA变性的复性:DNA发生热变性后,经缓慢降温,恢复完整的双螺旋结构。核酸探针杂交。同一个体的DNA碱基组成不受年龄、营养和环境的影响。DNA碱基组成有种属特异性。P磷最稳定。4.RNA 的结构与功能DNA碱基有:A,T,C,GRNA碱基有:A,U,C,G妈m我5
4、的帽子里面怎么有个蛋呀。DNA变性氢键。RNA都在胞胞质,t最小(稀有氨基酸),r最多,P最稳:1.mRNA:5帽子(m7Gppp-),3尾巴,U代T。编码区是蛋白质合成的模板,三个碱基为一组构成1个氨基酸的密码。2.tRNA:稀有碱基,转运氨基酸,最小。反密码:先配对后反转。3.rRNA:最多。第三单元酶1.酶的催化作用:酶是蛋白质。1.催化作用特点:(1)催化效率高(2)特异性强(3)不稳定性(4)可调节性。2.辅酶与辅助因子:小分子,可用透析除去。维生素与辅酶的关系:焦磷酸硫胺素:TPP:B1;黄素腺嘌呤二核苷酸:FAD:B2;辅酶I/辅酶II:NAD+/NADP+:尼克酰胺;磷酸吡哆醛
5、B6焦硫B1TPP,2黄B2FD, B6吡哆,遍地A,辅酶I/II : NPP,K谷氨羟化酶。(2黄B2, B6吡哆,K谷羟化)焦磷酸叫TPP,维生部分是B1.B2黄素腺嘌呤,缩写就叫FAD.尼克酰胺(维生素PP)辅、,遍多酸跟辅酶A,吡多醛是VB6,辅酶12B12,生物素还生物素,四氢叶酸还叶酸。;辅酶A:CoASH:遍多酸。维生素K是谷氨酸-羧化酶的辅酶,参与凝血过程。3.酶促反应动力学:Km值越小,酶与底物的亲和力越大(Km与亲和力成反比)。4.酶的抑制作用:可逆抑制作用丙二酸对琥珀酸竞争性抑制Km,非竞争Vmax。:竞争性抑制:与底物竞争结合酶的同一部位。特点:Km, Vmax 不变非
6、竞争性抑制:与酶活性中心外必需基团结合。特点:Km不变,Vmax。丙二酸对琥珀酸脱氢酶的抑制作用是酶学一章所讲授的典型的竞争性抑制作用例子。第四单元糖代谢1.糖的分解代谢:糖酵解:无氧分解成乳酸的过程,胞液内。己糖激酶;6-磷酸果糖激酶-1;丙酮酸激酶。反应是不可逆的,称为关键酶。糖有氧氧化:供能:1分子乙酰辅酶A 进入三羧酸循环彻底氧化可净生成12分子ATP。1分子葡萄糖彻底氧化CO2和H2O可净生成38分子ATP。2.糖原的合成与分解:糖原肝内合成与分解关键酶:合成糖原合酶;分解磷酸化酶。肌内缺乏葡萄糖-6-磷酸酶,肌糖原仅能酵解。3.糖异生关键酶:糖异生,丙酮酸,羧化羧激记心间。果糖2块
7、葡萄6,接上磷酸就记全。糖异生的关键酶:丙酮酸羧化酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶、果糖二磷酸酶、葡萄糖6磷酸酶。4.磷酸戊糖途径:6-磷酸葡萄糖在6-磷酸葡萄糖脱氢酶(缺乏则蚕豆黄)的作用下生成5-磷酸核糖和NADPH。1.糖酵解:激酶,己6磷、果1丙糖小姐看见几个绿林好汉躲在果树下吃饼干。己糖激酶丙酮酸,6磷酸果糖激酶1(糖酵解在细胞液)。2.糖异生:丙羟,果2,葡6磷。3.三羧酸循环:2丙3乙(2丙3条),檬3酮,9草猫草。(一只黑猫两只虎,两个柠檬一只狐,一个苹果一桶醋(酮戊二酸脱氢酶)4.糖原:肝糖原和尚合媒姐画眉=肝糖原合成用糖原合酶,肝糖原分解用磷酸化酶。磷酸化酶分解,肌缺葡6磷。5.
8、磷酸戊糖:6磷脱氢成5磷。6.胆固醇合成的关键酶是HMG-CoA还原酶。7.酮体HMG-CoA合成酶糖异生糖酵解5.血糖及其调节:1.血糖来源胰岛素降糖,其他都是升糖。(1)食物;(2)肝糖原分解;(3)糖异生。2.胰岛素抑制糖原分解和糖异生而降糖。3.胰高血糖素抑制糖原合酶使肝糖分解加强,升高血糖。4.糖皮质激素:促进糖异生,升高血糖。第五单元 氧化磷酸化1.氧化磷酸化:从物质代谢脱下的氢经呼吸链传递与氧结合成水的氧化过程,与ADP磷酸化过程的偶联称为氧化磷酸。2.呼吸链:细胞色素(Cyt):b c1 c aa3 O2。NADH呼吸链可产生3分子ATP;FADH2呼吸链可产生2分子ATP。3
9、.ATP合酶:复合体 I:NADH-泛醌还原酶;复合体 II:琥珀酸-泛醌还原酶;复合体 III:泛辊-细胞色素C 还原酶;复合体 IV:细胞色素C氧化酶;复合体 V:ATP合酶。复合体,分F1有催化生成ATP,F0线粒体内膜中的质子通道。4.氧化磷酸化的调节:ATP浓度的调节抑制剂:呼吸链抑制剂:抗霉素A,二硫基丙醇,CO。解偶联剂:二硝基酚。第六单元脂肪代谢脂肪代谢:必须脂肪酸:花生亚麻。脂肪酸:合成胞液,分解线粒体。合成原料:乙酰CoA:来自线粒体的柠檬酸。NADPH:磷酸戊糖途径。脂肪酸的分解:氧化,酮体:乙酰CoA;酶:HMG-CoA合成酶;乙酸丁酸跟丙酮;酮体是肝内生成肝外利用,供
10、能。胆固醇:乙酰CoA;NADPH; ATP。酶:HMG-CoA还原酶合成酮体还原胆固醇。1.脂类生理功能:脂肪即甘油三酯。食物供给:多不饱合脂肪酸如亚油酸、亚麻酸和花生四烯酸,体内不成合成,故称必需脂肪酸。脂肪酸的功能:1.储能和供能2.重要结构成分:生物膜3.代谢调节作用:前列腺素、类固醇激素,维生素D3。4.脂肪酸的合成代谢:脂肪酸的合成部位在胞液。脂肪酸的分解位在线粒体。合成部位:细胞液酶:脂肪酸合成酶系原料:乙酰辅酶A:来自线粒体的柠檬酸。NADPH:磷酸戊糖途径。5.脂肪的分解代谢氧化磷酸化:NADH呼吸链可产生3分子ATP;FADH2呼吸链可产生2分子ATP;三羧酸循环:2丙3乙
11、(2丙3条),檬3酮,9草猫草:脂肪酸的氧化:靠肉碱进入线粒体。经-氧化:脱氢(FAD)、加水、再脱氢(NAD)、硫解,生成脂酰CoA。乙酰CoA是合成脂肪酸、酮体及胆固醇的原料,但不能合成甘油及糖。(胆酮脂,乙胆玩酮脂,后悔莫及呀)。每次生成1 分子NADH,1分子FADH2和1分子乙酰CoA,经7次氧化可净生成129分子ATP。酮体:是脂肪酸在肝脏不完全氧化的中间产物,包括乙酰乙酸,-羟丁酸和丙酮(甲乙丙丁)。原料,部位:乙酰CoA;肝酶:HMG-CoA合成酶利用:肝外组织(肝脏不含利用酮体的酶,所以酮体是肝内生成肝外利用)意义:肌肉和脑组织的重要能源之一。第 七 单元磷脂、胆固醇及血浆脂
12、蛋白2.胆固醇代谢:胆固醇合成部位和合成原料:部位:肝细胞的胞液及内质网。原料:乙酰辅酶A; NADPH; ATP。调节:限速酶:HMG-CoA还原酶(-羟-甲戊二酸单酰CoA)。调节因素:饥饿与饱食,胆固醇,激素。胆固醇的去路:胆汁酸;类固醇激素;转化为7-脱氢胆固醇,以紫外线照射后转变为维生素D3;直接排泄。类固醇激素代谢终产物。在肝脏发生羟化、还原和结合反应。3.血浆脂蛋白代谢:超离心法分类a内胆固醇低,b内甘油极低,高低逆向转胆。ab胆油板油:CM-乳摩微粒: 大量甘油三酯;CM:转运外源性甘油三酯和胆固醇。极低密度脂蛋白VLDL(前-脂蛋白): 较多甘油三酯;VLDL:转运内源性甘油
13、三酯和胆固醇。低密度脂蛋白LDL(-脂蛋白): 较多胆固醇;LDL:转运内源性胆固醇。高密度脂蛋白HDL(-脂蛋白): 磷脂、胆固醇、蛋白质;HDL:逆向转运胆固醇。 CM,a LDL,b LDL,VLDL, IDL, VLDL,CM.VLDL第 八 单元氨基酸代谢必需氨基酸:赖氨酸、色氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苏氨酸、甲硫氨酸、苯丙氨酸(精组缬色,异亮蛋,赖苏苯)(赖色缬亮异亮苏,甲硫苯丙共8种)3.氨基酸的一般代谢氨基酸代谢:亮赖生酮,鸟氨瓜氨精氨生尿素,肌肉靠嘌呤,组丝甘色(株式会社)为了一碳四氢。B6吡哆转氨酶、血红素;谷子地(丁酸);B12钴蛋;吃酪丙喝茶;牛磺胱胆汁。:转氨酶
14、:催化某一氨基酸的-氨基转移到另一种-酮酸的酮基上,生成相应的氨基酸;原来的氨基酸则转变成-酮酸。其辅酶是磷酸吡哆醛,含维生素B6。1.谷丙转氨酶GPTPL谷丙,SO谷草,SOS是用冬虫夏草做的。 ( 丙氨酸转氨酶,ALT) 2.谷草转氨酶GOT ( 天冬氨酸转氨酶, AST)。氨基酸的脱氨基作用:1.氧化脱氨基作用:L-谷氨酸脱氢酶。2.联合脱氨基作用:酮戊二酸和嘌呤核苷酸循环。转氨基与谷氨酸氧化脱氨基的联合脱氨基作用主要发生在肝、肾组织,肌肉中氨基酸脱氨基主要是通过嘌呤核苷酸循环肌肉脱氨嘌呤核苷酸循环。肌缺葡6磷仅糖原酵解。体内生酮氨基酸包括:亮氨酸和赖氨酸。4.氨的代谢:尿素合成:鸟氨瓜
15、氨精氨尿素。氨的转运:肌组织中丙氨酸-葡萄糖循环。大多是谷氨酸+氨谷氨酰胺(肾脏可逆)。5.个别氨基酸的代谢:1.氨基酸的脱羧基作用:酶:脱羧酶谷氨酸-氨基丁酸(递质)组氨酸组胺(扩血管)色氨酸5-羟色胺(递质、收缩血管)半胱氨酸牛磺酸(胆汁酸)谷子丁酸尼古丁;B12钴蛋;吃酪丙喝茶;牛磺胱胆汁。鸟氨酸多胺(促进增殖)2.一碳单位概念和来源:概念:某些氨基酸在分解代谢过程中产生的含有一个碳原子的基团的总称。来源:丝氨酸、甘氨酸、组氨酸、色氨酸(丝甘组色)。载体:四氢叶酸(FH4)功能:参予嘌呤、嘧啶的合成。蛋氨酸循环:蛋氨酸甲基化成同型半胱氨酸,转甲基酶(VitB12甲基钴胺素)。苯丙氨酸和酪
16、氨酸代谢:酪氨酸(Tyr)可以由苯丙氨酸转变而来,半胱氨酸(Cys)可以由蛋氨酸转变而来半胱(巯基)、蛋(甲硫);酪丙苯色,酸雨天收谷子。体内先天缺乏苯丙氨酸羟化酶时,苯丙氨酸不能转变成酪氨酸,因而苯丙氨酸在体内堆积,进而大量转变成苯丙酮酸及苯乙酸等衍生物,此时尿里出现大量苯丙酮酸。第 九 单元核苷酸代谢嘌呤核苷酸嘌呤:天谷甘碳C,分解产物是尿酸。嘧啶:天谷C。嘌呤变尿酸,嘧啶水、碳、氨合成有两条途径:1.从头合成:嘌呤环的原料:天冬氨酸、谷氨酰胺、甘氨酸、一碳单位、CO2(天谷甘碳C)。关键酶:PRPP(磷酸核糖焦磷酸)合成酶,酰胺转移酶。2.补救合成:利用现成的嘌呤碱或嘌呤核苷合成嘌呤核苷
17、酸,称为补救合成。嘌呤碱的分解产物是尿酸,体内尿酸过多可引起痛风症。嘧啶核苷酸合成:1.从头合成:嘧啶环的原料:天冬氨酸、谷氨酰胺,CO2(天谷C)。关键酶:氨基甲酰磷酸合成酶;天冬氨酸转氨甲酰酶。2.补救合成:嘧啶 + PRPP 嘧啶核苷酸 + PPi。嘧啶分解代谢产物:-氨基异丁酸(T)、-丙氨酸(U、C)、NH3和CO2。抗核苷酸代谢药物的生化机制:6-巯基嘌呤(6-MP):抑制 IMP GMP,AMP。氮杂丝氨酸:抑制谷氨酰胺参加的反应。氨甲蝶呤(MTX):抑制二氢叶酸还原酶,干扰一碳单位代谢。5-FU:抑制胸苷酸合酶。dUMP转变成dTMP。第 十 单元遗传信息的传递DNA合成的原料
18、dNTP(N代表AT-CG)遗传学的中心法则:DNA转录RNA翻译蛋白质。紫外线对DNA的损伤主要是引起TT二聚体。RNA 的生物合成:双链DNA分子中,各个基因的模板链并不全在同一条链上,因此称不对称转录。2.RNA聚合酶原核:2。原核:1)起始:因子识别起始部位,核心酶结合,形成第一个磷酸二酯键。蛋白质的生物合成:RNA分为三种RNA都在胞胞质,t最小,r最多,P最稳,tRNA具有携带氨基酸的功能;rRNA是合成蛋白质的场所;mRNA密码子,AUG:起动密码或蛋氨酸。UAA,UAG,UGA:终止密码。抗生素与蛋白质生物合成:阻断剂:抗生素:四环素,链霉素、氯霉素,放线菌素,嘌呤霉素。细菌植
19、物毒素:白喉毒素,蓖麻毒素,干扰素。第 十一 单元基因表达调控基因表达调控概述:1.基因表达的概念及基因调控的意义:概念:基因表达就是指基因转录和翻译的过程。意义:在内、外环境变化的情况下,机体通过基因表达,调节代谢,以适应环境的改变。2.基因表达的时间特异性和空间特异性:时间或阶段特异性:某一特定基因的表达随时间、环境而变化,严格按特定时间顺序发生。空间或组织特异性:同一基因产物在不同的组织器官含量不一样,是按一定空间顺序出现。3.基因的组成性(基本)表达、诱导与阻遏:组成性(基本)表达:有些基因产物在整个生命过程中都是需要的,在几乎所有细胞中持续表达。诱导与阻遏:有些基因表达受外环境变化升
20、高或降低。细菌经紫外线照射会发生DNA损伤,为修复这种损伤,细菌合成DNA修复酶的基因表达增强,这种现象称为诱导。DNA损伤:紫外线对DNA的损伤主要是引起TT二聚体,DNA修复叫诱导。真核基因的结构特点包括:基因组结构庞大,基因转录产物为单顺反子,真核基因组中普遍含重复序列,真核结构基因两侧及编码基因内部,尚有不被转录的非编码序列,因此真核基因具有基因不连续性。真核转录调节因子由某一基因表达后,通过与特异的顺式作用元件相互作用(DNA-蛋白质相作用)反式激活另一基因的转录,故称反式作用蛋白或反式作用因子。原核基因表达调控:乳糖操纵子:组成:大肠杆菌乳糖操纵子:Z、Y、A三个编码基因,操纵序列
21、(O),启动序列(P),调节基因(I),CAP位点。阻遏蛋白的负性调节:阻遏蛋白与O结合,抑制转录(解离,转录开始)。第 十二 单元信息物质、受体与信号传导细胞信息物质:概念:凡有细胞分泌的调节靶细胞生命活动的化学物质统称为细胞间信息物质。二、分类:1.局部化学介质:又称旁分泌信号。2.激素: 又称内分泌信号。3.神经递质:又称突触分泌信号。膜受体激素作为第一信使与膜受体结合,将信号传入胞内,然后通过第二信使传递,将信号逐级放大,产生生理、生化效应。膜受体激素信号传导机制:膜受体激素作为第一信使与膜受体结合,将信号传入胞内,然后通过第二信使传递,将信号逐级放大,产生生理、生化效应。蛋白激酶A(
22、PKA)通路,蛋白激酶C (PKC)通路PKC可使靶蛋白上的丝氨酸/苏氨酸羟基磷酸化。依赖cAMP的蛋白激酶是PKA(PKAAMP,PKC丝/苏和Ca),酪氨酸蛋白激酶通路。G蛋白是一种转导体,有三种亚基、。G蛋白的亚基具有内在GTP酶活性。膜受体被外来信息分子激活后,受体空间构象改变,与G蛋白相互作用,使G蛋白与GTP结合而活化,并进一步激活腺苷酸环化酶。霍乱毒素可使G蛋白的亚基失去GTP酶活性,使G蛋白持续激活。蛋白激酶如PKC、PKA和TPK可使蛋白质的特异位点发生磷酸化,磷酸化位点主要为丝氨酸残基、苏氨酸残基和酪氨酸残基上的羟基。第 十三 单元重组DNA技术作为载体的DNA必须具有自我
23、复制功能,才能携带外源基因进行增殖与表达。质粒是细菌染色体外的DNA分子,能在宿主细胞独立自主地进行复制,可作为克隆载体。限制性内切酶的作用是特异切开双链DNA。第 十四 单元癌基因与生长因子概念一、癌基因概念:一类编码关键性调控蛋白质的正常细胞基因,主要功能是调节细胞的增殖与分化。二、抑癌基因概念:一类抑制细胞增殖并能潜在抑制癌变的基因,这类基因的缺受或失活导致细胞癌变。生长因子:一类调节细胞生长的多肽类物质,是导致细胞生长的信息分子。第 十五 单元血液生化非蛋白质含氮物质:非蛋白质含氮物质所含的氮总称为非蛋白氮(NPN),包括尿素、尿酸、肌酸、肌酐、氨基酸、氨和胆红素俺们鸡鸡尿尿淡红色。红
24、细胞的代谢:一、血红素的合成:1.关键酶:ALA合酶,辅酶是磷酸吡哆醛酶:血红素、转氨酶吡哆B6;原料:甘氨酸;琥珀酰辅酶A;Fe2+(干煸虎皮青椒)血红素和转氨酶比哪个多。2.原料:甘氨酸;琥珀酰辅酶A;Fe2+ 。3.合成部位:胞液,线粒体。二、成熟红细胞的代谢特点:(1)主要是糖酵解,具有2,3-DPG支路(2)磷酸戊糖途径:生成NADPH。成熟的红细胞因为缺少线粒体等亚细胞结构,所以只保留对其生存和功能发挥至关重要的糖酵解、2,3-DPG支路和磷酸戊糖旁路三条代谢途径。红细胞内的抗氧化物主要是谷胱甘肽(GSH)由谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸组成的三肽(谷-胱-甘),半胱氨酸巯基是其主要功能
25、基团:红细胞中谷胱甘肽的含量远高于各种游离氨基酸,而且几乎完全以还原型(GSH)的形式存在。GSH的主要功能是保护红细胞免受内外源性氧化剂损害,并在此过程中被氧化为GSSG。磷酸戊糖通路可以产生足够的NADPH把GSSG还原成GSH以保证红细胞维持正常的结构和功能。第 十六 单元肝胆生化氨的代谢:尿素合成:鸟氨瓜氨精氨尿素。肝细胞中存在鸟氨酸循环(尿素循环),可将有毒的氨转变为无毒的尿素排出体外。胆汁酸代胆汁酸:关键酶:7-羟化酶;初级:胆酸、鹅脱氧胆酸;次级:石、脱氧胆酸。谢:关键酶:7-羟化酶。初级胆汁酸(肝脏生成):胆酸,鹅脱氧胆酸,与甘氨,牛磺酸的结合物次级胆汁酸:初级胆汁酸经肠道转变生成石胆酸,脱氧胆酸。(初级胆酸、鹅脱氧胆酸;次级石脱氧胆酸)。辅酶功能:、传氢A传酰,B2也把原子搬。四氢12转移碳,转氨基用比多醛。