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基于TCGA数据库分析lncRNA SNHG25在前列腺癌中的表达及其意义.pdf

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资源描述

1、224前列腺癌专题基于 TCGA 数据库分析 IncRNA SNHG25 在前列腺癌中的表达及其意义康海,刘晓颖,赵洁,周松,蒋湘勇1,李铁求1(湖南师范大学附属第一医院/湖南省人民医院:1.泌尿外科,2.病理科,湖南长沙410 0 0 2)Expression and significance of IncRNA SNHG25 in prostate cancer based on theTCGA databaseKANG Hai,LIU Xiaoying,ZHAO Jie?,ZHOU Song,JIANG Xiangyong,LI Tieqiu(1.Department of Urolog

2、y,2.Department of Pathology,The First Affiliated Hospital of Hunan NormalUniversity/Hunan Provincial Peoples Hospital,Changsha 410002,China)ABSTRACT:Objective To analyze the expression of IncRNA SNHG25 in prostate cancer and its significance,so as toexplore the biomarkers and potential therapeutic t

3、argets for the diagnosis and prognosis of this disease.Methods Based on theTCGA database,differential,survival,and clinical correlation analyses of SNHG25 were performed.SNHG25 expression inprostate cancer was analyzed in the UALCAN database to determine its relationship with the clinical and pathol

4、ogicalcharacteristics.The lncRNA-miRNA-mRNA correlation analysis was performed.The relevant ceRNA regulatory network wasconstructed.Prostate cancer samples were divided into high and low SNHG25 expression groups,and differential SNHG25related genes were filtered and then enriched.Results SNHG25 expr

5、ession was significantly upregulated in prostate cancerspecimens compared to normal prostate specimens(P0.001),and the progression-free survival of the low SNHG25 expressiongroup was significantly longer than that of the high SNHG25 expression group(P 0.05).Regulatory networks of SNHG25/miR-330-3p/D

6、LX1 and RPL22L1 wereconstructed.Conclusion SNHG25 is highly expressed in prostate cancer tissues and correlated with poor prognosis.SNHG25expression does not significantly correlate with age,T-stage,N-stage,and Gleason score.SNHG25/miR-330-3p/DLX1 andRPL22L1 regulatory networks may play an important

7、 role in the development of prostate cancer.SNHG25 may become abiomarker and potential therapeutic target for prostate cancer.KEY WORDS:lncRNA SNHG25;prostate cancer;TCGA database;ceRNA;enrichment analysis摘要:目的分析长链非编码RNA(IncRNA)SNH G 2 5在前列腺癌中的表达及其意义,挖掘前列腺癌诊断和预后的生物标志物和潜在的治疗靶点。方法基于TCGA数据库对目标基因 SNHG25

8、进行差异分析、生存分析和临床相关性分析;在UALCAN数据库中分析SNHG25在前列腺癌中的表达与临床及病理特征的关系;对SNHG25进行lncRNA-miRNA-mRNA相关性分析,在前列腺癌中构建相关ceRNA调控网络;将前列腺癌样本分为SNHG25的高低表达两组,筛选出与SNHG25相关的差异基因后进行富集分析。结果,SNHG25在前列腺癌样本中的表达相较于正常前列腺样本中的表达明显上调(P0.001),SNHG25低表达组患者的无进展生存期明显长于高表达组患者(P0.05)。对SNHG25进行lncRNA-miRNA-mRNA相关性分析构建出SNHG25/miR-330-3p/DLX1

9、、R PL 2 2 L 1调控网络。结论SNHG25在前列腺癌组织中高表达,与前列腺癌患者的不良预后相关;SNHG25的表达水平与前列腺癌患者年龄、T分期、N分期和Gleason评分无明显相关性SNHG25/miR-330-3p/DLX1、R PL 2 2 L 1调控网络在前列腺癌的发生发展中可能发挥重要作用,SNHG25可能成为前列腺癌诊断和预后的生物标志物和潜在的治疗靶点。关键词:长链非编码RNASNHG25;前列腺癌;TCGA数据库;内源竞争性RNA;富集分析中图分类号:R697.3J Mod Urol,Vol.29 No.3 Mar.2024文献标志码:AD0I:10.3969/j.i

10、ssn.1009-8291.2024.03.006收稿日期:2 0 2 3-0 8-0 6基金项目:长沙市自然科学基金项目(No.kq2208112);湖南省人民医院仁术重点项目(No.RS2022A13);湖南省卫健委科研项目(No.202204052798);湖南省卫生健康高层次人才支持计划资助项目(No.湘卫函2 0 2 37 8 号);湖南省中医药科研计划项目(No.2021041)。通信作者:李铁求,主任医师。E-mail:作者简介:康海,住院医师,硕士研究生。E-mail:修回日期:2 0 2 3-0 9-2 9http:/jmurology.xjtu.edu,cn;zgmnwk.

11、cug.top现代泌尿外科杂志前列腺癌是严重危害老年男性健康的常见恶性肿瘤。2 0 2 1 年癌症数据显示,在世界范围内,前列腺癌位居男性恶性肿瘤发病率第1位,占男性所有肿瘤的2 6%1。我国前列腺癌发病率虽低于欧美国家,但近些年的发病率呈现急剧上升趋势2。前列腺癌早期治疗选择广泛,主要包括手术治疗、内分泌治疗、放疗和化疗,且预后较好,但晚期治疗选择少且效果差3。前列腺癌患者早期的临床症状不明显,目前主要依靠前列腺特异性抗原(prostate specific antigen,PSA)进行前列腺癌的早期筛查,但是PSA诊断前列腺癌的特异度只有32.4%6 1.5%4。因此迫切需要探究前列腺癌的

12、病理分子机制,寻找有效的生物学标志物及治疗靶点,提高诊疗效率。近年来,基于生物信息学的技术取得了很大的进展,这些技术有助于寻找前列腺癌的潜在诊断和预后的生物标志物,可以提供有关疾病发生发展和治疗效果的有关信息5。非编码RNA可以作为基因表达的关键功能成分或调控分子,根据其特定的靶标可以在RNA翻译、剪接、复制和基因调控中起作用6 。本研究将通过生物信息学分析长链非编码RNA(l o n g n o n-c o d i n gRNA,lncRNA)SNHG25 在前列腺癌的表达及相关临床意义,为前列腺癌的诊断治疗提供有效的生物学标志物和分子靶点。1资料与方法1.1数据的下载与整理(https:/

13、portal.gdc.cancer.gov/)中下载前列腺样本的转录组数据(包括50 1个前列腺癌组织样本和52个正常前列腺样本)及前列腺癌患者的临床信息,包括生存状态、生存时间、年龄、性别、临床分期和TNM分期。使用Perl软件(https:/www.perl.org/)将临床信息整理成矩阵,将转录组数据整理成表达矩阵,将Ensembl ID转换为Gene Symbol。1.2差异分析与生存分析在R-4.3.0软件(https:/www.r-project.org/)使用“BiocManager“limmaggplot2“ggpubr包在前列腺样本中对目标基因 SNHG25进行差异分析,得到

14、 SNHG25在各个样本中的表达数据及 SNHG25在前列腺癌样本和正常前列腺样本中的差异表达情况。鉴于前列腺癌患者生存时间长,故本研究对其进行无进展生存分析。使用R包“limma“survival“survminer”分析SNHG25在各个前列腺癌样本中的表达量并以SNHG25表达量的中位值为界,将样本分为高、低表达两组,绘制生存曲线,进行无进展生存分析。1.3临床相关性分析对前列腺癌患者的临床数据2024年3月第2 9 卷第3期从TCGA数据库1.6差异基因富集分析“pheatmap将前列腺癌样本以SNHG25表达量的中位值为界,分为SNHG25高、低表达两组,基于前列腺癌样本中的基因表达

15、量,在高、低表达两组间对所有基因进行差异分析,筛选出与SNHG25相关的差异基因,筛选条件为差异倍数的对数(log2Foldchange)绝对值大于1,P0.05,绘制差异基因的热图。借助R软件对这些差异基因进行GO和KEGG富集分析,GO分析包括分子功能(molecular func-tion,MF)、生物过程(biological process,BP)和细胞组分(cellular component,CC),设置 Po.05。将分析结果绘制成柱状图。2结 果2.1差异分析与生存分析结果http:/jmurology.xjtu.edu,cn;zgmnwk.cug.top225和SNHG25

16、表达数据进行整理后,用R包“limma”ggpubr进行临床相关性分析,依据临床信息设置比较组,绘制SNHG25表达量与年龄、T分期、N分期的相关性箱线图。以SNHG25的表达量中位值为界,将前列腺癌患者分为 SNHG25 高、低表达两组,使用R包“limma“ComplexHeatmap,分析临床特征在SNHG25高、低表达两组之间是否有差异,绘制临床相关性分析热图。1.4UALCAN数据库分析在UALCAN数据库(https:/ualcan.path.uab.edu/)中分析 SNHG25在前列腺癌样本及正常前列腺样本中差异表达情况和在泛癌中的表达情况。基于TCGA数据库,分析SNHG25

17、在不同年龄、Gleason评分和分子特征的前列腺癌样本中的表达情况。1.5IncRNA-miRNA-mRNA相关性分析在 star-base数据库(https:/ ic r o R NA,m iR NA),对这些miRNA采用R包“limma“ggpubr“ggExtra进行相关性分析。基于前列腺癌样本中的基因表达量,筛选出和SNHG25有一定相关性的 miRNA,筛选条件为相关系数 cor0.2,P0.001。在 starbase数据库(https:/star- e s s e n g e r R NA,m R NA),对这些mRNA用R包 limmaggpubrggExtra进行相关性分析

18、,基于基因表达量,筛选出与miRNA具有一定相关性的mRNA,筛选条件为相关系数cor0.2,P0.001。构建lncRNA-miRNA-mRNA相互作用的内源竞争性RNA(c o m p e t i n g e n d o g e n o u sRNA,c e R NA)调控网络,并通过Cytoscape软件进行可视化。斤借助R包“limma”借助R软件对目226标基因IncRNASNHG25进行差异分析,有50 1个前列腺癌样本和52 个正常前列腺样本,得到SNHG25在各个样本中的表达数据及SNHG25在前列腺癌样本和正常前列腺样本的差异表达情况(图1A),SNH G 2 5在前列腺癌样

19、本中的表达量相对正常前列腺样本中的表达明显上调(P0.001)。SNHG25 的 log2Fold change 为 1.51。通过 SNHG25表达数据的分析,得到52 个正常前列腺样本中的SNHG25表达量最小值为0.0 8,最大值为2.38,平60A:SNH G 2 5在前列腺癌样本及正常前列腺样本中的差异表达,*P年龄申6 5岁申 6 5岁P=0.96L.4J Mod Urol,Vol.29 No.3 Mar.2024均值为0.8 0。50 1个前列腺癌样本中的SNHG25表达量最小值为0.2 3,最大值为5.6 4,平均值为2.15。SNHG25在前列腺癌样本中的表达量明显高于正常前

20、列腺样本中的表达量,根据SNHG25在前列腺癌样本中的表达量将样本分为高、低表达两组,绘制生存曲线进行无进展生存分析,SNHG25低表达组患者的无进展生存期明显长于高表达组(P0.001,图1B)。*1.00厂0.750.50F0.25P0.05)。T分期申T2申T3申T4N分期申NO申N18P=0.34P=0.45P=0.34SNHG25+高水平+低水平136时间年P=0.146:?91215202.3UALCAN数据库分析结果通过UALCAN数据库验证SNHG25在前列腺癌样本和正常前列腺样本中存在差异表达(P0.05图4B、C)。分子特征分析发现,SNHG25的表达水平与 ERG-fus

21、ion、ET V 1-fusion、ET V4-f u s i o n、FO XA l-m u t a t i o n、SPO P-mutation等分子特征相关(P65岁AT2A年龄;B:T分期;C.N分期。析发现,在膀胱尿路上皮癌(bladderurothelialcarcinoma,BLCA)、结肠癌(colon adenocarcinoma,COAD)、胆管癌(cholangiocarcinoma,CHOL)、肝细胞癌(liver hepatocellular carcinoma,LIHC)和子宫内膜癌(uterine corpus endometrial carcinoma,UCEC

22、)等肿瘤中SNHG25的表达水平相对其正常组织明显上调(图4E)。T3T分期T4?NON分期N1C现代泌尿外科杂志20151050520151050-52024年3月第2 9 卷第3期SNHG25低表达高表达图3前列腺癌患者年龄、T分期、N分期与SNHG25表达的临床相关性热图*1510505正常前列腺前列腺癌样本(n=51)样本(n=498)*227SNHG25年龄T分期N分期年龄T分期65岁T265岁T3T4未知20r2520151005N分期NON1未知正常前列腺4160岁本(n=51)(n=218)*6180岁(n=269)14)?=4)FLIl-fusion(n=Gleason评分6

23、(n=46)Gleason评分8(n=64)Gleason评分7(n=247)Gleason评分9(n=137)正常前列腺样本(n=51)1007806040200Gleason评分10(n=4)肿瘤组织配对癌旁组织ERG-fusion(n=151)ETV1-fusion(n=27)ETV4-fusion(n=14正常前列腺样本(n=51)FOXAl-mutation(n=10)UAIDH1-mutation(n=3)SPOP-mutation(n=38)ECSNHG25在泛癌中的表达A:SNHG25在前列腺癌样本和正常前列腺样本中的差异表达;B:SNHG25表达水平与年龄的相关分析;C:SN

24、HG25表达水平与Gleason评分的相关分析;D:SNH G 2 5表达水平与分子特征的相关分析;E:SNHG25在各种肿瘤(泛癌)及相应正常组织中的表达情况。P0.001,P 0.0 5。BL CA:膀胱尿路上皮癌;BRCA乳腺癌;CESC:宫颈鳞癌和腺癌;COAD:结肠癌;CHOL:胆管癌;ESCA:食管癌;GBM:多形性胶质母细胞瘤;HNSC:头颈鳞状细胞癌;KICH:肾嫌色细胞癌;KIRC:肾透明细胞癌;KIRP:肾乳头状细胞癌;LIHC:肝细胞癌;LUAD:肺腺癌;LUSC:肺鳞癌;PAAD:胰腺癌;PCPG:嗜铬细胞瘤和副神经节瘤;PRAD:前列腺癌;READ:直肠腺癌;SARC

25、:肉瘤;STAD:胃癌;THCA:甲状腺癌;THYM:胸腺癌;UCEC:子宫内膜癌。图4基于UALCAN、T CG A 数据库分析SNHG25在前列腺癌各样本及泛癌中的表达http:/jmurology.xjtu.edu,cn;zgmnwk.cug.top2282.41IncRNA-miRNA-mRNA相关性分析结果在starbase数据库中预测可能与SNHG25结合的miRNA,再基于基因表达量进行相关性分析,筛选出和SNHG25具有一定相关性的miRNA,仅得到miR-330-3p1个满足筛选条件的miRNA。通过miRNA差异分析得到miR-330-3p在前列腺癌样本中表达下调,miR-

26、330-3p的log2Fold change为一0.41。在starbase数据库中预测可能与miR-330-3p结合的mRNA,再基于基因表达量进行相关性分析,筛选出和miR-330-3p具有一定相关性的mRNA,得到DLX1、R PL 2 2 L 1等52 个mRNA(图5A)。PABPN1TIMM13CDC34MRPS11TXNDC17FAM174BARFRP1FIS1IMP3LRP3ECHDC2RBX1SDHAF2hsa-miR-330-3pDAZAP1KIAA0895LPIGQHMG20BATP5IF1RPUSD1TIMM50TRIM11NXF1CDC37SYNGR2WDR830SS

27、EC13TARBP2RNF126LRP3KIAA0895LMDH2RBX1RPL22L1SLC2A4RGARFRP1LSM4OAZ1GATD1ATP5IF1TIMM50URM1SNHG25hsa-miR-330-3pA:预测可能与miR-330-3p结合的mRNAB:SNHG25相关的ceRNA调控网络。2.5差异基因富集分析结果将前列腺癌样本分为SNHG25高、低表达两组,再进行差异分析,筛选出与SNHG25正相关的差异基因6 57 个,与 SNHG25负相关的差异基因16 2 个,将差异最显著的10 0 个基因绘制差异基因的热图(图6 A)。借助R软件对筛选出来的差异基因进行GO和KEGG

28、富集分析。GO分析显示:差异基因没有富集到具有意义的BP;J Mod Urol,Vol.29 No.3 Mar.2024通过上述mRNA差异分析得到的DLX1、RPL22L1在前列腺癌样本中表达明显上调,DLX1的log2Fold change为2.48,RPL22L1的log2Foldchange为1.14。由之前的差异分析得出,SNHG25在前列腺癌样本中表达上调,miR-330-3p在前列腺癌样本中表达下调,DLX1、R PL 2 2 L 1在前列腺癌样本中表达上调。SNHG25与miR-330-3p的表达水平呈负相关关系,DLX1、R PL 2 2 L 1与miR-330-3p的表达水

29、平呈负相关关系,以此构建 SNHG25相关的ceRNA调控网络,并通过Cytoscape软件进行可视化(图 5B)。ZFPM1CCNL2URM1TARBP2RPL22L1DUTRNF126MDH2COPS5DLX1OAZ1CHKAGATD1DDTARVCFRFNGMBD3C19orf25COPZ1LSM4SLC2A4RGMRFAP1CYBC1CCNL2DAZAP1FAM174BECHDC2TIMM13IMP3PIGQDDTRPUSD1TRIM11CDC37COX7A2NXF1C190rf25COPZ1SYNGR2TMEM250DLX1MRPS11WDR83OSZFPM1CDC34SDHAF2A

30、RVCFTRIB3PABPN1图5ceRNA调控网络示意图主要富集的MF包括激素活性、眼球晶状体的结构成分、丝氨酸型内肽酶活性、神经肽激素活性、丝氨酸型肽酶活性、丝氨酸水解酶活性、脂肪酸结合蛋白;主要富集的CC包括粗面内质网、细胞质小核糖体亚基、核糖体(图6 B)。K EG G 分析显示:差异基因主要富集在神经活性配体-受体相互作用、补体和凝血级联的通路(图 6 C)。TRIB3COX7A2TMEM250DUTCOPS5RFNGMBD3MRFAP1HMG20BCYBC1SEC13TXNDC17FIS1CHKAhttp:/;zgmnwk.cug.top现代泌尿外科杂志2024年3月第2 9 卷第

31、3期229类型类型APOHETM4SF20RN7SL180PAGE2BORD3APB13IR6859-1SP2AFPRT72CYP3A4ALBPRLHINC00486RPAMLB35-DTAS1D104DT-DTG1CSAG16BPNMA5AFA-AS1YGGGCBCAR4DDXHRSFAMD4P4C121050-5-10低表达高表达PFPAF1P17P4BP5RPP18AS1SLCO4C1UBAP13TRPCSCRNA5SP154HTR2CTGM4regulationoffibrinolysisresponsetodietary excessproteinactiyation cascade

32、lensdevelorpolyaminemetatcameracomplemenaltermatomatingcellularbiggcatabBYregulationofprostaglanroughendoplasmicreticulumsecretioncytosolicsmallribosomalsubunitbloodmicroparticleribosomeribosomalsubunitcytosolicribosomesmallribosomalsubunitcollagen-containingextracellularmatrixstereociliumtiphaptogl

33、obin-hemoglobincomplexhormoneactivitystructuralconstituentofeyelensserine-typeendopeptidaseactivityneuropeptidehormoneactivitySerine-typepeptidaseactivityserinehydrolaseactivityfatty acid bindingreceptorligandactivitystructuralconstituentofriposomesignaling receptorinhibitoractivityA:前列腺癌中与SNHG25相关的

34、差异基因热图;B:SNHG25高低表达组差异基因的GO富集;C.SNHG25高低表达组差异基因的KEGG富集。3讨论lncRNA是一类长度大于2 0 0 个碱基的非编码RNA分子,大多表达在细胞核内及细胞质中,主要参与染色质修饰、基因组修饰、核内运输、转录干扰、转录激活等多种生物学过程,从而参与疾病的发生与发展7-8。lncRNA可调节蛋白质合成和稳定性,影响细胞增殖、分化和存活,可用作抑癌或促癌基因参与调控癌症信号通路9。SNHG25在神经母细胞瘤、上皮性卵巢癌、子宫内膜癌、直肠癌和前列腺癌等肿瘤中相对正常组织表达上调,促进肿瘤的发生发Neuroactiveligand-receptorin

35、teractionqualue0.20.40.605qualue0.0100.0150.0200.025Complementandcoagulationcascades1015Count图6 SNHG25相关的富集分析展10-13,这与本研究中对SNHG25的泛癌分析结果一致。LIU等14通过体外和体内研究表明,SNHG25在前列腺癌中高表达,并通过调节PI3K/AKT信号通路促进前列腺癌的发展,SNHG25可作为促癌基因来预测前列腺癌患者的肿瘤恶性程度和生存率。本研究通过生物信息学分析发现SNHG25在前列腺癌样本中的表达相对正常前列腺样本明显上调,并且 SNHG25低表达组患者的无进展生存

36、期明显长于高表达组,SNHG25的表达水平和患者的无进展生存期相关,这提示SNHG25的高表达预示着前列腺癌患者的不良预后。http:/;zgmnwk.cug.top200510Count1520230本研究对SNHG25表达水平进行了临床相关性分析,得到前列腺癌患者的年龄、T分期、N分期与SNHG25表达水平无明显相关性。将前列腺癌患者分为SNHG25高、低表达两组,再分析临床特征与SNHG25高、低表达的关系,结果发现在前列腺癌患者SNHG25高、低表达两组之间,年龄、T分期、N分期均无明显差异。通过UALCAN数据库分析验证SNHG25的表达水平与年龄、Gleason评分均无明显相关性。

37、这些结果提示,SNHG25的表达差异仅存在于前列腺癌样本和正常前列腺样本之间,SNHG25的表达水平用于诊断前列腺癌患者有一定价值,但不能用于评估前列腺癌患者的临床分期和 Gleason评分。分析SNHG25的表达水平和分子特征的关系发现,SNHG25的表达水平与ERG-fusion、ET V 1-fusion、ET V 4-fu s io n、FO XA 1-m u ta tio n、SPO P-mutation等分子特征相关,提示这些分子特征可能参与了前列腺癌的发生发展。ceRNA假说揭示了RNA相互作用的新机制,miRNA可以通过结合mRNA引起基因沉默,而ceRNA可以竞争性结合miR

38、NA调节基因表达,lncRNA即属于ceRNA家族的一员15。lncRNA通过竞争性结合miRNA而起到调控ceRNA的作用,ceRNA作为miRNA的“海绵”可起到缓冲并抑制其下游相关基因的表达16。本研究构建出SNHG25相关的ceRNA调控网络:SNHG25/miR-330-3p/DLX1、R PL 2 2 L 1。SNH G 2 5可能竞争性结合 miR-330-3p,抑制miR-330-3p对DLX1、R PL 2 2 L 1的表达沉默作用,从而间接调控编码基因DLX1、R PL 2 2 L 1的表达。SNHG25在前列腺癌中高表达,在前列腺癌的发生发展中发挥促肿瘤的作用。既往研究发

39、现miR-330-3p在肝癌、结肠癌、直肠癌、胃癌等肿瘤中均发挥抑肿瘤作用17-19,MI等2 0 1研究发现miR-330-3p在前列腺癌组织和获得的癌细胞系中表达不良,赖氨酸去甲基化酶5A通过抑制miR-330-3p表达和激活COPB2/PI3K/AKT轴以ETS1依赖的方式促进前列腺腺癌的进展。LI 等2 1研究发现miR-330-3p在前列腺癌组织中表达水平较低,环状RNA circ-0016068通过调控miR-330-3p/BMI-1轴作为ceRNA促进前列腺癌细胞的生长、迁移和侵袭。本研究发现miR-330-3p在前列腺癌样本中表达下调,这与之前的研究一致,且miR-330-3p

40、 的抑肿瘤作用可能受到SNHG25的负调控。既往多项研究发现DLX1在前列腺癌中过表达,在前列腺癌发生发展中发挥促肿瘤的作用2-2 4。LIANG等2 5研究证实了DLX1在前列腺癌中的表达增加,DLX1 是-连环蛋J Mod Urol,Vol.29 No.3 Mar.2024白的结合蛋白,促进前列腺癌细胞的生长和迁移,表明DLX1可能是治疗前列腺癌的靶点。既往研究发现RPL22L1 在肝细胞癌、卵巢癌、结直肠癌等肿瘤中呈高表达,RPL22L1的表达促进了肿瘤的发生发展2 6-2 8。LIANG等2 9和YI等30 1 通过实验研究发现RPL22L1促进了前列腺癌细胞的增殖和侵袭,在前列腺癌的

41、发生发展中发挥着重要作用。本研究结果与其一致,结合既往研究表明,DLX1、R PL 2 2 L 1 在前列腺癌样本中表达上调,发挥促肿瘤作用,均受到miR-330-3p的负调控,同时间接接受促癌基因SNHG25 的 调控。SNHG25/miR-330-3p/DLX1、RPL22L1调控网络在前列腺癌的发生发展中可能发挥重要作用。本文的GO富集分析发现,前列腺癌中SNHG25高、低表达组的差异基因主要富集的MF包括激素活性、眼球晶状体的结构成分、丝氨酸型内肽酶活性、神经肽激素活性、丝氨酸型肽酶活性、丝氨酸水解酶活性、脂肪酸结合蛋白,主要富集的CC包括粗面内质网、细胞质小核糖体亚基、核糖体。KEG

42、G分析显示:差异基因主要富集在神经活性配体-受体相互作用、补体和凝血级联的通路。在非裔和欧裔美国人的前列腺癌研究中发现,神经活性配体-受体相互作用信号通路是受显著影响的生物学通路,该通路包括G蛋白偶联受体、离子通道和配体31。MUAZZAM等32 通过功能富集分析表明,高表达的前列腺癌标记物参与了补体和凝血级联的通路。本研究KEGG富集分析表明,SNHG25在前列腺癌中的高表达参与神经活性配体-受体相互作用、补体和凝血级联的通路。值得注意的是,本研究也有一定的局限性。本研究目前主要集中于现有数据库的基因表达数据和临床资料分析,并且结合既往相关研究结果进行讨论分析,后期还需进一步的细胞生物学实验

43、验证SNHG25在前列腺癌发生发展中的作用机制,以及收集大量临床样本实验研究进行验证。因TCGA数据库建立于美国国家癌症研究所和美国国家人类基因组研究所,收集的患者中白种人占比偏大,故本文的研究结论具有一定的局限性。综上所述,SNHG25在前列腺癌组织中高表达,与前列腺癌患者不良预后相关;SNHG25 的表达水平与前列腺癌患者年龄、T分期、N分期和Gleason评分无明显相关性;SNHG25/miR-330-3p/DLX1、RPL22L1调控网络在前列腺癌的发生发展中可能发挥重要作用,还需进一步验证;SNHG25在前列腺癌中的高表达参与神经活性配体-受体相互作用、补体http:/jmurolo

44、gy.xjtu.edu,cn;zgmnwk.cug.top现代泌尿外科杂志和凝血级联的通路。SNHG25可能成为前列腺癌诊断和预后的生物标志物和潜在的治疗靶点。参考文献:1王小芹,汪彬,路孟鑫.基于前列腺特异抗原筛查初诊前列腺癌患者的临床特征J/OL.武汉大学学报(医学版):1-42 0 2 4-1-27.http:/doi.org/10.14188/j.1671-8852.2023.0086.2 陆璐,谢光宇,冯耀宁,等.基于TCGA和GEPIA数据库分析CENPK基因在前列腺癌中的表达及临床意义J.检验医学与临床,2 0 2 3,2 0(4):455-459.3范辉阳,赖义明,周杰,等.R

45、AI14高表达促进前列腺癌骨转移并与不良预后相关.岭南现代临床外科,2 0 2 3,2 3(2):12 7-134.4邹钧,潘兆君,邹自灏,等.NHLH1在前列腺癌组织中的表达及意义J.广州医科大学学报,2 0 2 2,50(4):1-5.5J KUMAR S,SHUAIB M,ALASMARI AF,et al.GNL3 andPA2G4 as prognostic biomarkers in prostate cancerJJ.Cancers,2023,15(10):2723.6 ZEUSCHNER P,LINXWEILER J,JUNKER K.Non-codingRNAs as bio

46、markers in liquid biopsies with a special emphasis onextracellular vesicles in urological malignanciesEJJ.Expert RevMol Diagn,2020,20(2):151-167.7 孙少康,伊琳,黄勇,等.长链非编码RNACYTOR在人类癌症中调控机制研究进展J中国药理学通报,2 0 2 3,39(3):419-424.8 李冰,田元元,孙晓宁,等.IncRNAMAFG-AS1在癌症中的研究进展J/OL.海南医学院学报:1-6 2 0 2 4-1-2 7.http:/d o i.o

47、r g/10.13210/ki.jhmu.20230530.001.9董春燕,王翠英,李日彩,等.LncRNASNHG25在直肠癌细胞中的表达及其调节miR-330-3p/SMYD3轴对直肠癌细胞迁移及侵袭的影响.现代消化及介入诊疗,2 0 2 2,2 7(2):17 9-18 4.10J ZENG H,PAN J.HU C,et al.SNHG25 facilitates SNORA50Caccumulation to stabilize HDAC1 in neuroblastoma cellsJJ.CellDeath Dis,2022,13(7):597.11J LIU Y,XU B,LI

48、U M,et al.Long non-coding RNA SNHG25promotes epithelial ovarian cancer progression by up-regulatingCOMPJJ.J Cancer,2021,12(6):1660.12 HE Y,XU S,QI Y,et al.Long noncoding RNA SNHG25promotes the malignancy of endometrial cancer by spongingmicroRNA-497-5p and increasing FASN expressionLJJ.J Ovari-an Re

49、s,2021,14(1):1-13.13J ZHANG ZY,ZHOU Q,SONG Z,et al.Small nucleolar RNAhost gene 25 is a long non-coding RNA helps diagnose and pre-dict outcomes in prostate cancerJJ.Cancer Treat Res Commun,2023,35100687.14J LIU Z,KE S,WANG Q,et al.Analyzing roles of small nucleolarRNA host gene 25 from clinical,mol

50、ecular target and tumor for-mation in prostate cancer LJ.Exp Cell Res,2023,429(2):113686.15】姬进忠,陈铭,胡盼,等.DENV-2感染HUVECs的基因表达谱分析及ceRNA调控网络的构建J.西安交通大学学报(医学版),2 0 2 3,44(4):532-541.16 郭居斗,杜振宗,宋剑非.LncRNA作为ceRNA调控miRNA在NSCLC中的作用J.医学信息,2 0 2 2,35(15):148-152.2024年3月第2 9 卷第3期http:/;zgmnwk.cug.top231.17J JIN

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