1、中国生物医学文献服务系统(SinoMed)SinoMed介绍n由中国医学科学院医学信息研究所/图书馆开发研制,检索方法多样。n根据美国国立医学图书馆医学主题词表(MeSH)(中译本)、中国中医研究院中医药信息研究所中国中医药学主题词表,以及中国图书馆分类法医学专业分类表进行主题标引和分类标引。覆盖数据库1.中国生物医学文献数据库(CBM)2.中国医学科普文献数据库3.北京协和医学院博硕学位论文库4.西文生物医学文献数据库(WBM)5.日文生物医学文献数据库6.俄文生物医学文献数据库7.英文会议文摘数据库8.英文文集汇编文摘数据库n中国生物医学文献数据库(CBM)n收录1978以来1600余种中
2、国生物医学期刊,以及汇编、会议论文的文献题录530余万篇,全部题录均进行主题标引和分类标引等规范化加工处理。年增文献40余万篇,每月更新。n学科范围覆盖基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学和中药学等生物医学各领域。中国医学科普文献数据库中国医学科普文献数据库n收录2000年以来国内出版的医学科普期刊近百种,文献总量8万余篇,重点突显养生保健、心理健康、生殖健康、运动健身、医学美容、婚姻家庭、食品营养等与医学健康有关的内容。每月更新。北京协和医学院博硕学位论文北京协和医学院博硕学位论文库库n收录1981年以来协和医学院培养的博士、硕士研究生学位论文,学科范围涉及医学、药学各专业领域及其他相
3、关专业,内容前沿、丰富,可在线浏览全文。每季更新。数据库检索跨库检索n例:请在SinoMed中检索有关葛根素治疗心绞痛的中文文献资源。方法一方法一方法二方法二方方法法三三检索结果检索结果单库检索:中国生物医学文献数据库(CBM)CBM中的基本检索n实例1:检索2005年到2010年以来癫痫的文献,要求限于带摘要的综述,并且文献涉及到的实验对象为儿童(612岁)实例1:中国生物医学文献数据库(CBM)中的基本检索检索2005年到2010年以来癫痫的文献,要求限于带摘要的综述,并且文献涉及到的实验对象为儿童(612岁)智能检索n中国生物医学文献数据库(CBM)和西文生物医学文献数据库(WBM)在“
4、缺省字段”支持智能检索功能,即能够自动实现检索词、检索词对应主题词及该主题词所含下位词的同步检索。n如:在中国生物医学文献库(CBM)的“缺省”字段输入“艾滋病”,勾选“智能主题”后点击“检索”按钮,系统自动检出“中文标题”、“摘要”、“关键词”、“主题词”等字段中含“艾滋病”、“AIDS”和“获得性免疫缺陷综合征”的所有文献。n注意:智能检索不支持逻辑组配检索“缺省字段缺省字段”指什么?在各个数据库中的差指什么?在各个数据库中的差别别nSinoMed根据各个数据库的特点,对常用检索字段进行组合后设置了“缺省字段”检索入口。下表是不同数据库中“缺省字段”的具体含义。主题检索“主题检索主题检索”
5、与常说的与常说的“关键词检索关键词检索”有何不同有何不同?在?在SinoMed中如何进行主题检索?中如何进行主题检索?n所谓主题检索,指采取规范化的主题词基于主题概念进行检索。与“关键词检索”相比,“主题检索”能有效提高查全率和查准率。n在SinoMed中,CBM、WBM和北京协和医学院博硕学位论文库均支持主题检索。n从主题途径查找文献信息时,可以通过如下操作来实现:q(1)在中/英文主题词检索入口键入完整检索词或片段,查找浏览相关主题词注释信息和树形结构,选择确定您需要的恰当主题词;q(2)在选定主题词的注释信息显示界面,选择是否加权、是否扩展,添加相应副主题词后,点击“主题检索”即可。n主
6、题词表:主题词表:SinoMed依据中文医学主题词表进行“主题检索”。中文医学主题词包括两部分:美国国立医学图书馆医学主题词表(MeSH)中译本(由中国医学科学院医学信息研究所翻译出版)和中医药学主题词表(中国中医科学院中医药信息研究所出版)。n主题词主题词:主题词是自然语言的规范化用语,如主题词“获得性免疫缺陷综合征”涵盖了“艾滋病”“AIDS”“爱滋病”等词语。您在检索课题时,应尽可能采用规范化的主题词进行检索,以提高查全率和查准率。n副主题词副主题词:副主题词用于对主题词的某一特定方面加以限定,强调主题概念的某些专指方面。如:“肝/药物作用”表明文章并非讨论肝脏的所有方面,而是讨论药物对
7、肝脏的影响。实例2:利用SinoMed中的主题检索查找“骨结核治疗”方面的文献。n 在CBM“主题检索”界面,选择“中文主题词”检索入口后,在检索输入框中键入“结核 骨”进行查找,系统显示含“结核”、“骨”的主题词列表供您选择。n注:注:词条中带有“见见”字时,前面的词为主题词的款目词(同义词),后面的词为正式主题词;词条中无“见见”时,前后均为主题词。选择恰当的主题词“结核,骨关节”后,点击进入该主题词的注释信息显示界面,全面了解该主题词的各种注释信息和树形结构,以确认是否和检索主题一致。根据需要选择“加权检索”、“扩展检索”,添加组配相应的副主题词“治疗”后,点击“主题检索”按钮进行文献检
8、索。加权检索与非加权检索加权检索与非加权检索 n仅适用于主题词。n“加权检索”表示仅对加星号(*)主题词(主要概念主题词)检索。n“非加权检索”表示对加星号和非加星号主题词(非主要概念主题词)均进行检索。n系统默认状态为非加权检索,若进行加权检索请勾选“加权检索”选框。扩展检索与非扩展检索扩展检索与非扩展检索 n(1)主题词扩展检索与非扩展检索q主题词扩展检索指对当前主题词及其下位主题词进行检索;q主题词非扩展检索则仅限于对当前主题词进行检索。q系统默认状态为扩展检索,若不进行扩展检索选择“不扩展”选项。q如:对主题词“HIV感染”,扩展检索指对该主题词及其10个下位主题词检索,不扩展检索仅对
9、“HIV感染”进行查找。n(2)副主题词扩展检索与非扩展检索:q部分副主题词之间也存在上下位关系。如副主题词“副作用”的下位词有“毒性”、“中毒”。q副主题词扩展检索指对当前副主题词及其下位副主题词进行检索。q副主题词非扩展检索则仅限于对当前副主题词进行检索。q系统默认状态为扩展。中文期刊文献如何直接获取全文?中文期刊文献如何直接获取全文?n如果订购了维普中文数据库,就可以通过SinoMed提供的维普中文全文链接功能直接获取全文,具体操作如下:进入“中国生物医学文献数据库(CBM)”检索结果页面,点击标题后方的pdf图标。怎样才能阅读到博硕学位论文的全文?怎样才能阅读到博硕学位论文的全文?n为
10、阅读北京协和医学院博硕学位论文,SinoMed提供了在线原文阅读功能。进入北京协和医学院博硕学位论文库检索结果页面,点击标题下方的“原文阅读”图标,即可在线阅读学位论文全文。如何快速查找并获取免费外文原文?如何快速查找并获取免费外文原文?n为快捷地查找、利用互联网免费西文期刊文献,SinoMed对网络生物医学免费期刊及其文献进行了整理。通过在西文生物医学文献数据库(WBM)中进行“免费期刊”限定检索,可以快速地查找免费期刊文献线索并获取全文,具体操作步骤如下:n进入“西文生物医学文献数据库”检索页面。在检索输入框中输入检索词后,点击“更多限定”,选择“免费期刊”,即限定在免费西文期刊中进行有关
11、检索。n 在检索结果页面,每条检索结果的标题前方会有一个“”图标,用来标识这条记录有免费全文。n如果标题后方有“”图标,点击此图标,可直接获取该记录的pdf原文。n如果标题后方没有“”图标,请点击“相关链接”字段中的“原文链接”,直接进行免费全文链接。如何利用电子馆藏直接获取外文原文?如何利用电子馆藏直接获取外文原文?n通过SinoMed平台直接利用单位的电子馆藏。具体操作步骤如下:n 进入西文生物医学文献数据库(WBM)检索结果页面,点击题录信息中的“原文链接”。n从数据库服务商列表中选择您单位拥有的电子馆藏直接获取外文原文。获得检索帮助获得检索帮助美国医学文献数据库美国医学文献数据库Pub
12、Medhttp:/www.pubmed.org5/2/2024复旦大学图书馆文献检索教研室 概况PubMed(MedlinePubMed(Medline)由美国国立医学图书馆(由美国国立医学图书馆(NLMNLM)、国际)、国际MEDLARSMEDLARS成员(中国为第成员(中国为第1616个成员国)及合作的专业组织共同个成员国)及合作的专业组织共同研制开发,是目前国际上公认的检索生物医学文献最具权威、研制开发,是目前国际上公认的检索生物医学文献最具权威、利用率最高、影响最广的数据库,也是我国卫生部认定的科利用率最高、影响最广的数据库,也是我国卫生部认定的科技查新必须检索的国外医学数据库。技查新
13、必须检索的国外医学数据库。收录学科内容:收录学科内容:主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献。主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献。包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学,基础研包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学,基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。内容。20002000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。复
14、旦大学图书馆文献检索教研室概况 网址:网址:www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed 或或 www.pubmed.govPubMed收录的期刊最早追溯至收录的期刊最早追溯至1865年,共收录了年,共收录了70余个国余个国家家36000余种期刊,余种期刊,1900多万篇文献;多万篇文献;PubMed 的子集的子集Medline收录的文献最早追溯至收录的文献最早追溯至1902年,现年,现有记录有记录1760多万篇;多万篇;目前每年增加约目前每年增加约60余万条文献记录;余万条文献记录;在全部记录中有在全部记录中有76%的文献为英文;在的文献为英文;在2000年以来的记录中年以来的记录
15、中90%的文献为英文,共计收录国内出版的期刊的文献为英文,共计收录国内出版的期刊170余种。余种。复旦大学图书馆文献检索教研室复旦大学图书馆文献检索教研室数据库简介1.MEDLINE记录标注记录标注 PubMedPubMed-indexed for MEDLINE-indexed for MEDLINE2.PreMedline是临时性医学文献数据库,每天接收新数据,经是临时性医学文献数据库,每天接收新数据,经MeSHMeSH词表标引后,词表标引后,每周向每周向medlinemedline移加一次。移加一次。记录标注记录标注 PubMedPubMed-in process-in process
16、3.Publisher supplied citations 出版商直接向出版商直接向PubMedPubMed递送的电子记录中不被递送的电子记录中不被MedlineMedline收录的部分。收录的部分。记录标注记录标注 PubMedPubMed-as supplied by publisher-as supplied by publisher MEDLINEMEDLINEMEDLINEMEDLINE数据库由美国国家医学图书馆数据库由美国国家医学图书馆数据库由美国国家医学图书馆数据库由美国国家医学图书馆(National Library of MedicineNational Library o
17、f MedicineNational Library of MedicineNational Library of Medicine,简称,简称,简称,简称NLMNLMNLMNLM)编制,是印刷刊编制,是印刷刊编制,是印刷刊编制,是印刷刊Index Index Index Index MedicusMedicusMedicusMedicus(医学索(医学索(医学索(医学索引)、引)、引)、引)、Index to Dental LiteratureIndex to Dental LiteratureIndex to Dental LiteratureIndex to Dental Literat
18、ure(牙科(牙科(牙科(牙科文献索引)和文献索引)和文献索引)和文献索引)和InternationgalInternationgalInternationgalInternationgal Nursing Nursing Nursing Nursing IndexIndexIndexIndex(国际护理索引)的光盘版,数据摘自(国际护理索引)的光盘版,数据摘自(国际护理索引)的光盘版,数据摘自(国际护理索引)的光盘版,数据摘自3700370037003700种期刊,是生物医学的主要数据库。时间跨种期刊,是生物医学的主要数据库。时间跨种期刊,是生物医学的主要数据库。时间跨种期刊,是生物医学的主
19、要数据库。时间跨度度度度1966196619661966年至今。年至今。年至今。年至今。复旦大学图书馆文献检索教研室5/2/202444基本检索输入框基本检索输入框工具与资源:提供工具与资源:提供期刊数据库检索、期刊数据库检索、规范词数据库检索、规范词数据库检索、特定文献检索等特定文献检索等PubMed 主页主页高级检索高级检索复旦大学图书馆文献检索教研室5/2/20241.可可以以在在检检索索栏栏中中输输入入一一个个或或多多个个检检索索词词(系统默认空格为(系统默认空格为AND检索)检索)如:如:placenta growth oxygen2.可可以以在在检检索索栏栏中中输输入入布布尔尔逻逻
20、辑辑运运算算式式(运运算符必须大写)算符必须大写)如如:asthma AND(therapy OR treatment)二、二、PubMedPubMed 基本检索规则基本检索规则复旦大学图书馆文献检索教研室二、二、PubMedPubMed 基本检索规则基本检索规则3.字段限定符:字段限定符:,按词组匹配,按词组匹配 如:如:Stem cell transplantationti4.截词符:截词符:treat*5.强迫短语匹配符:强迫短语匹配符:“brca 1”严格按输入形式匹配,不再自动转换匹配严格按输入形式匹配,不再自动转换匹配和扩展检索,常用于词组和专有名词检索。和扩展检索,常用于词组和专
21、有名词检索。5/2/2024复旦大学图书馆文献检索教研室6.自动转换匹配检索词:自动转换匹配检索词:PubMed对输入检索对输入检索框中的检索词进行智能框中的检索词进行智能化地校对,将其逐步地化地校对,将其逐步地与其数据库中的各类术与其数据库中的各类术语匹配的原则。语匹配的原则。MeSH Translation Table主题词注释表主题词注释表Journals Translation Table期刊注释表期刊注释表Common Phrase List常用词组表常用词组表Author Index作者索引表作者索引表No MappingNo Mapping检索词拆分检索词拆分AND复旦大学图书馆
22、文献检索教研室二、二、PubMed 基本检索规则基本检索规则7.自动扩展检索:自动扩展检索:系统自动对主题词、副主题词扩展检索。系统自动对主题词、副主题词扩展检索。如如:输输入入hypertension therapy,系系统统自自动检索高血压的药物治疗、饮食疗法动检索高血压的药物治疗、饮食疗法5/2/2024复旦大学图书馆文献检索教研室二、二、PubMed 基本检索规则基本检索规则8.著者检索著者检索(authors):姓全称在前,名首字母在后。姓全称在前,名首字母在后。加字段限定符加字段限定符如:如:genbacev oau moore amau2002年以后的文章可以查著者全名年以后的文
23、章可以查著者全名 如:如:joshua lederberg au5/2/2024复旦大学图书馆文献检索教研室二、二、PubMed 基本检索规则基本检索规则9.期刊检索(期刊检索(journals):):刊名全称检索刊名全称检索例例:new england journal of medicinesoMEDLINE认可的标准刊名缩写检索认可的标准刊名缩写检索例:例:N Engl J Medso国际标准期刊号检索国际标准期刊号检索例:例:0028-4793so5/2/2024复旦大学图书馆文献检索教研室常用字段标识符标识符 字段名称字段名称 中文释义中文释义TI Title 题目AU Author
24、作者AD Affiliation 作者单位AB Abstract 文摘LA Languages 出版日期TA Journal Title Abbreviation刊名缩写MH MeSH Terms 主题词PT Publication Type 出版类型复旦大学图书馆文献检索教研室基本检索举例5/2/2024复旦大学图书馆文献检索教研室5/2/2024综述综述免费全文免费全文输入多个检索词输入多个检索词placenta growth oxygen复旦大学图书馆文献检索教研室5/2/2024字段限定字段限定 stem cell transplantationti复旦大学图书馆文献检索教研室5/2/
25、2024stem cellti AND transplantationti比空格多检出比空格多检出400篇篇复旦大学图书馆文献检索教研室5/2/2024输入输入renal failure自动转换、匹配检索词扩展检索自动转换、匹配检索词扩展检索复旦大学图书馆文献检索教研室5/2/2024著者检索著者检索moore amau复旦大学图书馆文献检索教研室5/2/2024期刊检索期刊检索:New england journal of medicineso复旦大学图书馆文献检索教研室三、三、PubMed的高级检索的高级检索在一个网页中集基本检索、检索历史、多栏在一个网页中集基本检索、检索历史、多栏复合检
26、索、索引查询、逻辑算符选择、检索复合检索、索引查询、逻辑算符选择、检索限制于一体。限制于一体。基本检索栏中可按照基本检索规则输入检索基本检索栏中可按照基本检索规则输入检索词词/式。式。检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。数。多栏复合检索时,检索框中只能输入检索词,多栏复合检索时,检索框中只能输入检索词,不能输入检索式。不能输入检索式。5/2/2024复旦大学图书馆文献检索教研室检索历史(检索历史(SearchSearch HistoryHistory)以列表形式显示历次检索式、检索时间和检出篇数以列表形式显示历次检索式、检索时间和检出篇数复旦大学图书
27、馆文献检索教研室检索式检索式检索时间检索时间检出篇数检出篇数检索式编号可替代检索式进行输入检索如:检索式编号可替代检索式进行输入检索如:#17 AND therapy复旦大学图书馆文献检索教研室5/2/2024索引查询索引查询栏间逻辑组配栏间逻辑组配查找查找Patrick Concannon于于2009年发表在年发表在The New England Journal of Medicine上的综述。上的综述。多栏复合检索多栏复合检索concannon p栏内不能输算符,检索栏内不能输算符,检索词间空格默认词间空格默认AND运算运算复旦大学图书馆文献检索教研室索引查询(Index)5/2/2024
28、复旦大学图书馆文献检索教研室检索限制检索限制(Limit)(Limit)基本检索、高级检索中均可用。基本检索、高级检索中均可用。全文、免费全文、摘要全文、免费全文、摘要限定限定研究对象人研究对象人/动物限制动物限制性别限制性别限制文献类型限制文献类型限制语种限制语种限制子文档限制子文档限制年龄限制年龄限制复旦大学图书馆文献检索教研室5/2/2024全文、免费全文、摘要限定全文、免费全文、摘要限定Limit 检索限制检索限制研究对象研究对象人人/动物限定动物限定语种限定语种限定子文档限定子文档限定性别限定性别限定年龄限定年龄限定文献类型限定文献类型限定复旦大学图书馆文献检索教研室预览预览明细栏明
29、细栏检索史检索史高级检索界面高级检索界面下可以看到明下可以看到明细栏,预览,细栏,预览,检索史,限定检索史,限定和组合检索等和组合检索等姚开泰院士姚开泰院士2001年年以来被以来被Medline收录的文献收录的文献高级高级检索检索举例举例复旦大学图书馆文献检索教研室高级高级检索检索举例举例限定检索范围限定检索范围为发表在临床为发表在临床核心期刊上的核心期刊上的有全文链接的有全文链接的英文文献英文文献有全文链接有全文链接临床核心期刊临床核心期刊限定为英文限定为英文Limit限定限定复旦大学图书馆文献检索教研室检索范围限定检索范围限定为循证文献及为循证文献及被被Medline正正式收录的中老式收录
30、的中老年病例年病例高级高级检索检索举例举例Limit限定限定限定为循证等文献限定为循证等文献限定为中老年限定为中老年限定为限定为medline复旦大学图书馆文献检索教研室Details(检索的详细匹配过程)(检索的详细匹配过程)显示检索词转换匹配运算详细过程显示检索词转换匹配运算详细过程用途:转换、确定规范词用途:转换、确定规范词 如:如:liver cancer liver neoplasms修改检索策略修改检索策略5/2/2024复旦大学图书馆文献检索教研室5/2/2024检索明细检索明细数据库匹配过程数据库匹配过程检索词转换检索词转换显示用户输入的检索式显示用户输入的检索式复旦大学图书馆文献检索教研室检索演示1、利用CBM,查找肝癌的规范化主题词。2、在CBM中查找有关污水的处理及卫生方面的文献。3、在PubMed中查找维生素C对普通感冒的作用方面的文献。复旦大学图书馆文献检索教研室