肝细胞癌中UBE2S互作蛋白的筛选及预后模型构建.pdf

第 50 卷 第 1 期2024年 1 月吉林大学学报（医学版）Journal of Jilin University（Medicine Edition）Vol.50 No.1Jan.2024DOI：10.13481/j.1671587X.20240121肝细胞癌中 UBE2S互作蛋白的筛选及预后模型构建王小燕1,2,张豪2,3,郭泽皓2,3,曹骏2,3,莫之婧2,3（1.桂林医学院智能医学与生物技术学院实验教学中心，广西 桂林 541199；2.桂林医学院 广西高校生物化学与分子生物学重点实验室，广西 桂林 541199；3.桂林医学院智能医学与生物技术学院生物化学教研室，广西 桂林 541199）摘要 目的目的：筛选泛素结合酶 E2S（UBE2S）互作蛋白并构建肝细胞癌（HCC）基于 UBE2S互作蛋白的预后 模 型（UIPM），分 析 UIPM 评 估 HCC 患 者 预 后 的 价值。方法方法：采用免疫共沉淀（Co-IP）技术筛选与Flag-UBE2S结合的蛋白复合体，经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）和 Western blotting法验证后，采用液相色谱-质谱联用仪（LC-MS）分析鉴定 UBE2S互作蛋白，并对互作蛋白进行基因本体论（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。采用 R 软件 survival包筛选癌症基因组图谱（TGGA）中 HCC 预后相关蛋白与 UBE2S 互作蛋白取交集，通过 LASSO 回归分析从交集蛋白中获取关键蛋白构建 UIPM，并建立预后模型风险评分公式，按照风险评分的中位值将 TGGA 中 HCC 患者分为高风险组和低风险组，通过受试者工作特征曲线（ROC）评估 UIPM 的预测准确性，并采用国际癌症基因组联盟（ICGC）数据库对 UIPM 预测准确性进行再次验证。采用单因素和多因素 Cox 回归分析评估 UIPM 风险评分是否为 HCC 的预后独立危险因素，并进一步构建列线图模型。结果结果：Co-IP 联合 LC-MS 分析得到 97 个 UBE2S 互作蛋白。GO 功能和 KEGG 信号通路富集分析，互作蛋白主要与半胱氨酸型内肽酶活性、氧化应激和细胞死亡有密切关联。TCGA 筛选出 5 163个 HCC 预后相关蛋白，与 UBE2S 互作蛋白取交集，获得 40个预后相关互作蛋白，LASSO 回归分析得到 7 个关键蛋白，包括 UBE2S、热休克蛋白家族 A 成员 8（HSPA8）、异质性胞核核糖核蛋白 H1（HNRNPH1）、含 TCP1伴侣蛋白亚基 3（CCT3）、真核翻译起始因子 2 亚基 1（EIF2S1）、活化蛋白 C 激酶 1 受体（RACK1）和肌动蛋白相关蛋白2/3复合体亚基 4（ARPC4），并构建了 UIPM，高和低风险组 HCC 患者生存率存比较差异有统计学意义（P0.05）。ROC 曲线，UIPM 预测 HCC 患者 1、2 和 3 年 UIPM 风险评分的 ROC 曲线下面积（AUC）值均大于0.7，表明预测模型准确度较高。ICGC 数据库数据也证实 UIPM 预测准确度较高。单因素和多因素Cox回归分析，UIPM 风险评分是 HCC 患者的独立预后危险因素（P0.05）。列线图预测 HCC 患者生存率与实际生存率之间有较好的一致性。结论结论：97个互作蛋白与 UBE2S 相互作用，可能通过氧化应激和铁死亡相关通路的失调促进 HCC 发生发展。UIPM 风险评分是 HCC 预后的独立危险因素，可以用于预测 HCC 患者预后。而 UBE2S、HSPA8、HNRNPH1、CCT3、EIF2S1、RACK1 和 ARPC4有望成为 HCC新的生物标志物和治疗靶点。关键词 泛素结合酶 E2S；肝细胞癌；免疫共沉淀；液相色谱-质谱联用仪；预后分析中图分类号 R735.7文献标志码 A文章编号 1671587X(2024)01016810收稿日期 20230328基金项目 国家自然科学基金项目（32060159）；广西壮族自治区科技厅自然科学基金项目（2020GXNSFAA159110）；广西壮族自治区教育厅广西高校中青年教师基础能力提升项目（2023KY0525）作者简介 王小燕（1983），女，江西省上饶市人，高级实验师，理学硕士，主要从事疾病分子机制方面的研究。通信作者 莫之婧，教授，硕士研究生导师（E-mail：）168王小燕，等.肝细胞癌中 UBE2S互作蛋白的筛选及预后模型构建Screening of UBE2S interacting protein and construction of prognostic model in hepatocellular carcinomaWANG Xiaoyan1,2,ZHANG Hao2,3,GUO Zehao2,3,CAO Jun2,3,MO Zhijing2,3（1.Department of Experimental Teaching Center，School of Intelligent Medicine and Biotechnology，Guilin Medical University，Guilin 541199，China；2.Key Laboratory of Biochemistry and Molecular Biology of Guangxi Institutions of Higher Learning，Gulin Medical University，Guilin 541199，China；3.Department of Biochemistry，College of Intelligent Medicine and Biotechnology，Guilin Medical University，Guilin 541199，China）ABSTRACT Objective：To screen the interacting protein of ubiquitin-conjugating enzyme E2S（UBE2S）and construct the hepatocellular carcinoma（HCC）based on UBE2S interacting protein prognosis model（UIPM），and to discuss the value of UIPM in assessing the prognosis of the HCC patients.Methods：Co-immunoprecipitation（Co-IP）was used to screen the protein complexes binding to Flag-UBE2S.After validation by sodium dodecyl sulphate-polyacrylamide gel electrophoresis（SDS-PAGE）and Western blotting methods；liquid chromatography-mass spectrometer（LC-MS）was used to identify the UBE2S interacting proteins；Gene Ontology（GO）functional enrichment analysis and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（KEGG）signaling pathway enrichment analysis were conducted on these proteins；the prognosis-related proteins from The Cancer Genome Atlas（TCGA）were cross-referenced with UBE2S interacting proteins by survival package of R software；the key proteins were extracted through LASSO regression analysis to build the UIPM；the prognostic model risk scoring formula was established.The HCC patients in TCGA were divided into high risk group and low risk group based on median value of the risk scores.The predictive accuracy of UIPM was evaluated by receiver operating characteristic curve（ROC），and the predictive accuracy was further validated by International Cancer Genome Consortium（ICGC）Database；univariate regression analysis and multivariate Cox regression analysis were used to detect whether the UIPM risk score was an independent prognostic factor for HCC.Furthermore，the nomogram model was built.Results：A total of 97 UBE2S interacting proteins were identified through Co-IP combined with LC-MS analysis.The GO functional enrichment analysis and KEGG signaling pathway enrichment analysis results showed that the interacting proteins were closely associated with cysteine-type endopeptidase activity，oxidative stress，and cell death.The TCGA revealed 5 163 HCC prognosis-related proteins；after intersecting with UBE2S interacting proteins，40 prognosis-related interacting proteins were found.Seven key proteins were determined through LASSO regression analysis，including UBE2S，heat shock protein family A member 8（HSPA8），heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1（HNRNPH1），chaperonin containing TCP1 subunit 3（CCT3），eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1（EIF2S1），receptor for activated C kinase 1（RACK1），and actin related protein 2/3 complex subunit 4（ARPC4），and the UIPM was constructed.There was significant difference in survival rate of the patients between high risk group and low risk group（P0.05）.The ROC curve analysis results showed the area under ROC curve（AUC）values of UIPM for predicting 1-year，2-year，and 3-year survival risk scores of the HCC patients were all greater than 0.7，indicating the model had high predictive accuracy.This was also confirmed by ICGC Database data.The univariate and multivariate Cox regression analysis results showed that the UIPM risk score was an independent prognostic risk factor for the HCC patients（P0.05）.The nomogram results showed good consistency between predicted survival rate and actual survival rate of the patient.Conclusion：A total of 97 interacting proteins that interact with UBE2S may promote the occurence and devolopment of HCC through oxidative stress and dysregulation of 169第 50 卷 第 1 期 2024 年 1 月吉林大学学报（医学版）ferroptosis pathways.The UIPM risk score is an independent risk factor for the prognosis of HCC and can be used to predict the outcomes of the patients.UBE2S，HSPA8，HNRNPH1，CCT3，EIF2S1，RACK1，and ARPC4 could be regarded as the new biomarkers and therapeutic targets for HCC.KEYWORDS Ubiquitin-conjugating enzyme E2S；Hepatocellular carcinoma；Co-immunoprecipitation；Liquid chromatograph mass spectrometer；Prognostic analysis肝癌是全球癌症相关死亡的主要原因之一，全球肝癌的发病率和死亡率呈上升趋势，2020 年有905 677例新增病例和 830 180例死亡病例1，其中中国有 410 038 例新增病例和 391 152 死亡病例2。肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）是原发性肝癌中最常见的类型，占原发性肝癌病例的75%85%1，因此寻找相关靶分子并研究其作用机制对肝癌的防治十分重要。泛素结合酶 E2S（ubiquitin-conjugating enzyme E2S，UBE2S）是泛素结合酶家族成员，参与蛋白泛素化降解过程3。研究4-13 显示：UBE2S 与人类多种癌症有关，UBE2S 在胃肠道系统、泌尿系统、神经系统、女性生殖系统、肺和乳腺的肿瘤组织中过表达。UBE2S 驱动结肠癌4、膀胱癌5、胶质瘤6、卵巢癌7-8、宫颈癌9、乳腺13、人肺腺癌10-11和非小细胞肺癌12细胞的增殖、迁移和侵袭，并与其不良预后有关联。此外，研究6，8表明：UBE2S 可能与胶质母细胞瘤的化疗耐药性和卵巢癌奥拉帕尼耐药有关。UBE2S 还可作为一种新的 p16和-连环蛋白的泛素化调控因子，促进前列腺癌的骨转移14。研究15-17显示：UBE2S 可增强 p53和 p27的泛素化，促进 HCC 发展，并通过磷酸 酯 酶 与 张 力 蛋 白 同 源 物/蛋 白 激 酶 B（phosphatase and tensin homolog/protein kinase B，PTEN-AKT）信号通路促进 HCC 化疗耐药。本课题组前期研究18证实：UBE2S 高表达与 HCC 患者不良预后有明显相关性，UBE2S 高表达患者总生存率和无病生存率明显降低。但 UBE2S 主要与何种蛋白发生直接或间接作用，进而影响 HCC 患者的预后还需要进一步研究。本研究采用免疫共沉淀（co-immunoprecipitation，Co-IP）技 术 筛 选UBE2S 结合的蛋白复合体并进行液相色谱-质谱联用 仪（liquid chromatograph-mass spectrometer，LC-MS）分析，将经 LC-MS 获得的 UBE2S 互作蛋白进行基因本体论（Gene Ontology，GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）信号功 能 富 集 分 析，筛 选 出 关 键 蛋 白，构 建 基 于UBE2S 互作蛋白的预后模型（UBE2S interaction protein prognosis model，UIPM），分析 UIPM 评估HCC患者预后的价值。1 材料与方法 1.1主要试剂和仪器主要试剂和仪器RIPA 裂解液（P0013B）、抗 Flag 抗体（AF519）、硝酸银快速银染试剂盒（P0017S）和 化 学 发 光 试 剂 BeyoECLPlus（P0018FM）（上海碧云天生物技术有限公司），辣 根 过 氧 化 物 酶（horseradish peroxidase，HRP）偶联的二抗（BA1056，武汉博士德生物工程有限公司），Flag-UBE2S 蛋白表达载体和 Co-IP 试剂盒（Bes3011-1）（广州伯信生物科技有限公司）。化学发光成像仪（美国伯乐公司）。1.2采用采用 Co-IP筛选与筛选与 Flag-UBE2S特异结合的蛋特异结合的蛋白白对 Flag-UBE2S 蛋白表达载体进行测序验证。将 Flag-UBE2S 质粒转染人肝癌 Hep3B 细胞（本研究室保留并传代），转染 48 h 后收获细胞提取总蛋白，分为 Input 组（阳性对照组，全细胞裂解液，不进行后续的 Co-IP）、Flag 组（实验组，使用抗Flag 抗体进行 Co-IP）和 IgG 组（阴性对照组，使用 IgG 进行 Co-IP），按照 Co-IP 试剂盒操作说明书进行，获得的蛋白沉淀物用于后续实验。1.3 十 二 烷 基 硫 酸 钠十 二 烷 基 硫 酸 钠-聚 丙 烯 酰 胺 凝 胶 电 泳聚 丙 烯 酰 胺 凝 胶 电 泳（sodium dodecyl sulphate-polyacrylamide gel electrophoresis，SDS-PAGE）和和 Western blotting 法法检测各组细胞中检测各组细胞中 Flag-UBE2S 蛋白表达情况蛋白表达情况分别取 Input组、Flag 组和 IgG 组的 Co-IP 产物 10 L 进行 SDS-PAGE 电泳，然后采用硝酸银快速银染试剂盒进行凝胶染色，分析各组蛋白表达情况。采用RIPA 裂解液提取各组 Hep3B 细胞中的总蛋白，采用抗 Flag 抗体进行特异性印迹，与 HRP 偶联的二抗孵育后，加入化学发光试剂 BeyoECLPlus，采用化学发光成像仪进行检测并获取图像，通过灰度值观察各组细胞中 Flag-UBE2S蛋白表达情况。1.4LC-MS 分析分析 UBE2S 互作蛋白互作蛋白将 Flag 组和IgG 组蛋白沉淀物送至广州伯信生物科技有限公司进行质谱定性鉴定分析，质谱原始文件转换为 mgf170王小燕，等.肝细胞癌中 UBE2S互作蛋白的筛选及预后模型构建格式文件，采用 Mascot软件检索 Uniprot数据库获取 UBE2S互作蛋白。1.5UBE2S 互作蛋白互作蛋白 GO 功能和功能和 KEGG 信号通路信号通路富集分析富集分析采采用 R软件 ClusteProfiler包（3.14.3版本）对 UBE2S 互作蛋白进行 GO 功能和 KEGG 信号通路富集分析，获得 UBE2S 互作蛋白的分子功能（molecular function，MF）、生 物 学 过 程（biological process，BP）和 细 胞 成 分（cellular components，CC）GO功能富集分析及 KEGG信号通路富集分析数据。1.6 UBE2S 互 作 蛋 白 与 癌 症 基 因 组 图 谱互 作 蛋 白 与 癌 症 基 因 组 图 谱（The Cancer Genome Atlas，TCGA）数据库中数据库中 HCC 预后预后相 关 蛋 白 的 韦 恩 图 分 析相 关 蛋 白 的 韦 恩 图 分 析 由 TCGA 数 据 库（https：/portal.gdc.cancer.gov/）中 获 取 374 例HCC 样本的转录表达数据和相对应的 HCC 患者临床信息。采用 R 软件 survival包（3.3.1）对数据进行生存分析（以中位值为分界线）获得 HCC 预后相关蛋白，以 P0.05为差异有统计学意义。采用R 软件 ggplot2（3.3.6）包和 VennDiagram 包对互作蛋白与 TCGA 数据库的 HCC 预后相关蛋白取交集并进行可视化，获得与 HCC 预后相关的互作蛋白。1.7UIPM 构建和验证构建和验证为建立 HCC 患者风险评分模型，采用 R 软件 glmnet 包对 TCGA 数据库中获取的 374 例 HCC 样本中预后相关互作蛋白转录表 达 数 据 和 相 对 应 的 HCC 患 者 临 床 信 息 进 行LASSO 回归分析，进行 1 000 次 LASSO 回归迭代和 10 倍交叉验证，以减少共线性的影响，提高模型 的 准 确 性19，从 而 将 互 作 蛋 白 缩 小 为 7 个 与HCC 预 后 相 关 的 关 键 互 作 蛋 白，选 取 1 000 次LASSO 回归迭代中最高的 LASSO 值作为 HCC 预后相关互作蛋白的 LASSO 系数，并对数据进行可视化得到 HCC的 UIPM。由 TCGA 数 据 库 和 国 际 癌 症 基 因 组 联 盟（International Cancer Genome Consortium，ICGC）数据库（https：/dcc.icgc.org/）分别下载 374 例和 212 例 HCC 样 本 基 因 转 录 表 达 数 据 和 相 应 的HCC 患者临床信息。根据 UIPM 对每例患者进行风险评分，按评分中位值将患者分为高风险组（374 例）和 低 风 险 组（212 例），采 用 R 软 件survival 包（3.14.3）通 过 Kaplan-Meier 分 析 和Log-rank检验比较高风险组和低风险组患者总生存时间（overall survival，OS）是否有差异来评估风险模型的预测准确性，并 绘 制 风 险 生 存 曲 线，以P0.05 为 差 异 有 统 计 学 意 义。采 用 pROC 包（1.17.0.1）对高风险组和低风险组样本进行时间依 赖 性 受 试 者 工 作 特 征 曲 线（receiver operating characteristic curve，ROC）分析，进一步评估风险模型的预测准确性，ROC 曲线下面积（area under curve，AUC）值 为 0.51.0 表 示 具 有 50%100%的预测能力。1.8独立危险因素分析和列线图模型构建独立危险因素分析和列线图模型构建采用单因素和多因素 Cox 回 归 分 析 对 不 同 临 床 特 征（T 分期、N 分期、肿瘤状态、种族、年龄及性别）和 UIPM 风险评分在 HCC 患者预后评估中的价值进行分析，并采用 ggplot2 包（3.3.3）构建森林图，以 P0.05 为差异有统计学意义。采用 RMS包（6.2-0）和 survival包（3.2-10）选取与 HCC患者预后明显相关的临床病理特征和 UIPM 风险评分，构建 HCC 患者 1、3 和 5 年生存率预测模型列线图和校准图，患者 1、3和 5年生存率通过由总点轴直线至结果轴画一条垂线来确定。2 结 果 2.1Co-IP 筛选筛选 Flag-UBE2S 蛋白蛋白Co-IP 产物的SDS-PAGE 银染结果显示：Input组和 Flag 组在相对 分 子 质 量 35 000 附 近 均 有 条 带（图 1A）。Western blotting 法检测结果显示：Input组和Flag 组均检测到 Flag-UBE2S蛋白（图 1B）。2.2LC-MS 分析分析 UBE2S 互作蛋白互作蛋白取 Co-IP 样品进行 LC-MS 分析，去除 IgG 组的非特异性蛋白后结果显示：潜在的 UBE2S 互作蛋白有 97个。得A：SDS-PAGE silver staining；B：Western blotting method.M：Marker；Lane 1：Input group；Lane 2：Flag group；Lane 3：IgG group.图图 1Co-IP产物检测结果产物检测结果Fig.1Detection results of Co-IP product171第 50 卷 第 1 期 2024 年 1 月吉林大学学报（医学版）分排名前 20位蛋白信息见表 1。2.3GO 功功能 和能 和 KEGG 信 号 通 路 富 集 分 析信 号 通 路 富 集 分 析对97 个 UBE2S 互作蛋白进行 GO 功能和 KEGG 信号通路富集分析，结果显示：与 BP 关联明显富集的共有 256条，包括氧化应激反应、凋亡信号通路的调控、细胞对氧化应激的反应和凋亡信号通路中半胱氨酸型内肽酶活性的调控等；与 CC 关联明显富集的共有 92 条，包括黏着斑、核糖体、肌动蛋白细胞骨架、中间丝和氧化还原酶复合体等；与 MF关联明显富集的共有 68 条，包括核糖体绑定、抗氧化活性、氧气结合、氧化还原酶活性和腺嘌呤核苷酸跨膜转运蛋白活性等；KEGG 信号通路明显富集的共有 22条，包括核糖体、氨基酸的生物合成、Fc受体（Fc receptor，FcR）介导的吞噬作用、肌 动 蛋 白 细 胞 骨 架 的 调 节 和 病 毒 致 癌 作 用 等。见图 2。2.4UBE2S 互作蛋白与互作蛋白与 TCGA 数据库中数据库中 HCC 预预后相关蛋白的韦恩图后相关蛋白的韦恩图TCGA 数 据 库 数 据 中 共 有5 163个与 HCC 预后明显相关的蛋白。97个潜在的UBE2S互作蛋白与 TCGA 数据库中 HCC预后蛋白取交集获得 40 个互作蛋白（图 3），排名前 20 位的蛋白见表 2。2.5UIPM 构建和验证构建和验证通过 LASSO 回归分析，对相关性较高的基因进行过滤，防止过度拟合，以达到减少构建模型所需基因的目的。在 LASSO 回归的 1 000 次迭代中出现的非零系数越高，该基因预测预后的能力就越强，从而筛选出 40 个交集蛋白中 的 关 键 蛋 白，并 得 到 其 最 佳 LASSO 系 数（图 4A）。通过交叉验证得到了 UBE2S、热休克蛋白 家 族 A 成 员 8（heat shock protein family A member 8，HSPA8）、异质性胞核核糖核蛋白 H1（heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1，HNRNPH1）、含 TCP1伴侣蛋白亚基 3（chaperonin containing TCP1 subunit 3，CCT3）、真核翻译起始 因 子 2 亚 基 1（eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1，EIF2S1）、活化蛋白 C 激酶 1 受体（receptor for activated C kinase 1，RACK1）和肌动蛋白相关蛋白 2/3 复合体亚基 4（actin related protein 2/3 complex subunit 4，ARPC4）7 个关键蛋白，用于构建 UIPM（图 4B）。基于 7 个关键蛋白 的 最 佳 LASSO 系 数 和 蛋 白 表 达 水 平，建 立UIPM 风险评分公式，UIPM 风险评分=0.105表表 1 1LC-MS分析得分排名前分析得分排名前 20位蛋白信息位蛋白信息TabTab.1 1Informations of top Informations of top 2020 ranked proteins by score analyzed by LC ranked proteins by score analyzed by LC-MS MS PF number 3 6 91113141516171820222425262730313233AccessionP08670P62736P13645Q92614P11142P06733P35527P35908P02533P08779P25705P11021Q9BQE3P06396P23396P07437A0A075B6S2P01023P52272P13929Score873588509385330314311294282277245231212195190175133125122117Mass53 67642 38159 020234 16871 08247 48162 25565 67851 87251 57859 82872 40250 54886 04326 84250 09513 249164 61377 74947 299Match242611 6 6 6 5 7 6 6 3 5 5 6 4 4 4 2 3 2Sequence1613 8 5 5 5 5 6 5 5 3 5 4 4 4 4 2 2 2 2emPAI3.173.490.820.090.310.500.290.410.450.450.170.250.370.250.600.290.580.040.130.14ProteinVIMACTA2KRT10MYO18AHSPA8ENO1KRT9KRT2KRT14KRT16ATP5F1AHSPA5TUBA1CGSNRPS3TUBBIGKV2D-29A2MHNRNPMENO3172王小燕，等.肝细胞癌中 UBE2S互作蛋白的筛选及预后模型构建UBE2S+0.057HSPA8+0.050HNRNPH1+0.229CCT3+0.074EIF2S1+0.023RACK1+0.172ARPC4。根 据 UIPM 风 险 评 分 的 中 位 值（5.076）将 TCGA 数据库中 374例患者分为高风险组和低风险组（图 4C）。高和低风险组 HCC 患者生 存 率 比 较 差 异 有 统 计 学 意 义（P0.01）（图 4D），表明根据 UIPM 进行分组，对患者预后进行预测具有一定的准确性。UIPM 的 ROC 曲线表表 2韦恩图中排名前韦恩图中排名前 20位蛋白信息位蛋白信息TabTab.2 2Informations of top Informations of top 2020 ranked proteins in Venn diagram ranked proteins in Venn diagramGene nameCCT3TUBA1CARPC4ENO1HNRNPH1PRDX1H2AZ1IDH3BRAB6ASLC2A1PKMEIF2S1SLC25A3YWHAZCAPZA2RPL18CALM1AKR1B10WTAPACTR3Gene IDENSG00000163468ENSG00000167553ENSG00000241553ENSG00000074800ENSG00000169045ENSG00000117450ENSG00000164032ENSG00000101365ENSG00000175582ENSG00000117394ENSG00000067225ENSG00000134001ENSG00000075415ENSG00000164924ENSG00000198898ENSG00000063177ENSG00000198668ENSG00000198074ENSG00000146457ENSG00000115091Gene biotypeProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingProtein codingHR2.0872.0402.0481.9821.9501.8991.9021.8401.8311.8131.8071.7741.7581.7581.7401.7231.7091.7111.7041.67095%CI1.4592.9851.4332.9041.4332.9281.3902.8261.3662.7841.3382.6961.3352.7101.2942.6151.2872.6051.2752.5771.2712.5681.2462.5241.2392.4951.2382.4961.2212.4771.2142.4471.2002.4321.1982.4441.1962.4271.1772.369PCox5.63687E-057.63003E-058.44439E-050.000 156 7230.000 236 7730.000 333 5020.000 369 2610.000 684 4820.000 769 8350.000 926 3580.000 975 4170.001 459 4540.001 574 1330.001 614 9560.002 150 2150.002 339 3290.002 938 2290.003 143 3540.003 170 2830.004 042 542图图 3UBE2S 互作蛋白与互作蛋白与 TCGA 数据库中数据库中 HCC 预后预后相关蛋白的韦恩图相关蛋白的韦恩图Fig.3Venn diagram of UBE2S interacting proteins and HCC prognostic-related proteins in TCGA Database图图 2UBE2S 互作蛋白的互作蛋白的 GO 功能和功能和 KEGG 信号通路富信号通路富集分析集分析Fig.2 GO functional and KEGG signaling pathway enrichment analysis on UBE2S interacting proteins173第 50 卷 第 1 期 2024 年 1 月吉林大学学报（医学版）结 果 显 示：该 模 型 预 测 HCC 患 者 1、2 和 3 年UIPM 风险评分的 AUC 值分别