医学文献检索技巧.ppt

,单击此处编辑母版标题样式,*,xx,*,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,2025/12/15 周一,xx,1,医学文献数据库,MEDLINE,2010.4,2025/12/15 周一,xx,2,一、数据库概况,（一）编制单位：美国国立医学图书馆,(NLM),。,（二）收录学科内容：,主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文献。,包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学、基础研究；临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。,2000,年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。,2025/12/15 周一,xx,3,（三）文献来源：,70,多个国家和地区；近,5000,种生物医学期刊,美国卫生研究院文献选择技术评估委员会,Literature Selection Technical Review,Committee(LSTRC,),评估挑选,NLM,和各专业协会的数据协作采集专家推荐。,近年数据涉及,37,种语种，回溯至,1949,年的数据涉及,60,种语种。,47%,为美国本土出版文献，,90%,为英文文献，,79%,的文献有文摘。,（以上由,2009,年,7,月数据库提供）,一、数据库概况,2025/12/15 周一,xx,4,二、,MEDLINE,的检索平台,广域网免费平台：,NCBI-,PubMed,（含非,MEDLINE,数据）,2025/12/15 周一,xx,5,校园网内可用平台（,IP,控制）：,Ovid SP,Web of Knowledge,EBSCO,OCLC First Search,二、,MEDLINE,的检索平台,2025/12/15 周一,xx,6,校园网内可用平台的,Medline,2025/12/15 周一,xx,7,PubMed,数据库检索,,www.pubmed.gov,2025/12/15 周一,xx,8,（一）开发机构：,NCBI,（美国国立生物技术信息中心）,,www.ncbi.nlm.nih.gov,NCBI,的任务,:,利用计算机信息处理技术，建立分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统，并开展相关先进方法的研究。,促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。,促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。,一、,PubMed,简介,2025/12/15 周一,xx,9,NCBI,网站,2025/12/15 周一,xx,10,NCBI,提供的数据库,检索大分子生物学数据,获取,GenBank,EMBL,等数据库的核酸序列；,获取,Swiss-,port,PIR,PRF,PDB,等蛋白质序列，从核酸序列翻译到蛋白质的序列；,获取基因和染色体图谱；蛋白质三维结构数据及大分子模式（,MMDB,）等其他生物信息数据库检索。,PubMed,等文献数据。,2025/12/15 周一,xx,11,广域网免费提供题录和文摘,提供与原文的网址链接,(,部分免费获取）,提供检索词智能转换匹配,界面简洁，操作简便,（二）,PubMed,的特点,2025/12/15 周一,xx,12,MEDLINE Indexed,1966 to,prensent,的,MEDLINE,已标引数据，有,MeSH,字段和摘要，每条记录标有：,PubMed,-indexed for MEDLINE,OldMEDLINE,1949-1965,年间的,MEDLINE,数据，无,MeSH,字段和摘要，每条记录标有：,PubMed,-OLDMEDLINE for Pre1966,（三）,PubMed,收录数据,2025/12/15 周一,xx,13,MEDLINE,Inprocess,最新的,MEDLINE,处理中数据，未标引，无,MeSH,字段。每条记录标有：,PubMed,-in process,。,Publisher-Supplied,出版商提供的电子文献题录，每条记录标有,:,PubMed,-as supplied by publisher,，分为两类：,MEDLINE,收录，逐步转为,In Process,Indexed,状态。,Not MEDLINE,：,PubMed,收录，,MEDLINE,不收录，一直标注,PubMed,-as supplied by publisher,或,PubMed,（三）,PubMed,收录数据,PubMed,记录状态子集,PubMed,记录状态子集,2025/12/15 周一,xx,16,二、,PubMed,的检索功能,基本检索输入框,检索限制,高级检索,检索指南,检索工具：,特定文献检索,临床查询,专题查询,其他资源：,规范词数据库,期刊数据库,临床试验等,个人空间,2025/12/15 周一,xx,17,检索栏可输入,一,个或多个检索词（系统默认空格为,AND,检索）,如：,aloe psoriasis,（芦荟治疗牛皮癣的文献）,三、,PubMed,基本检索规则,多个检索词输入,2025/12/15 周一,xx,18,检索栏可输入布尔逻辑运算式：（运算符须大写）如：,asthma AND(therapy OR treatment),字段限定符：,，空格按词组匹配,如：,aloe AND,psoriasisti,如：,Stem cell,transplantationti,三、,PubMed,基本检索规则,2025/12/15 周一,xx,19,逻辑运算式输入：,aloe AND,psoriasisti,牛皮癣出现在篇名中,2025/12/15 周一,xx,20,字段限定,stem cell,transplantationti,2025/12/15 周一,xx,21,著者检索：姓全称在前，名首字母在后，,au,。,如,:smith,abau,“,paulsen,e”au,三、,PubMed,基本检索规则,逻辑运算式输入：,Paulsen E,撰写的芦荟治疗牛皮癣的文章,2025/12/15 周一,xx,22,刊名检索：全称或,MEDLINE,认可的标准缩写,so,如：,Journal of investigative,dermatologyso,J invest,dermatolso,三、,PubMed,基本检索规则,输入刊名检索发表在该刊上的文献（限定出处字段,SO,）,2025/12/15 周一,xx,23,PubMed,记录字段说明,文摘,第一著者单位地址,出版商提供文献识别号,著者群,版权说明,参考评论文献,合著者,文献参考评论,定稿版,校样版,输入日期,输入完成日期,电子出版日期,2025/12/15 周一,xx,24,电子出版日期,文献出版日期,数据加入,PubMed,日期,文献勘误,参考文献勘误,全部著者姓名,全部调研者姓名,作为文章主题的著者全称,文献相关注释,基金编号,基因符号,期编号,资助调研者,资助调研单位,国际标准期刊号,美国立医学图书馆识别号,期刊全称,2025/12/15 周一,xx,25,最后修订日期,规范词表词,规范词确立日期,系统组织的文摘,版权拥有者,题录提供机构的识别号,病史相关与原始记录,其他关键词,提供其他关键词的机构,数据提供者机构,文章总页数,出版商提供数据时间,期刊出版国,数据库文献编号,2025/12/15 周一,xx,26,作为主题词的个人姓名,出版状态,文献类型,出版模式（纸张或电子）,参考文献数,已撤回的文献,酶或化学物质代码,正在撤消中的文章,初版文献,修订和再版的文章,子专题文档,太空署提供的数据,二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号,原文来源,引用了病例的文献内部处理代码,标准期刊缩写,文献标题,翻译标题,更新文献,文献正在更新,期刊卷号,2025/12/15 周一,xx,27,截词检索：,treat*,可检出：,treat,treated,treatment.,强迫短语检索：“”，不进行自动转换匹配和扩展检索,如：“,acute low back pain”,“,ang,1”,（血管紧张素,1,缩写）检出,1085,篇,比较：,ang,1,检出,9956,篇，误检多，其中有：,三、,PubMed,基本检索规则,2025/12/15 周一,xx,28,2025/12/15 周一,xx,29,自动转换匹配检索词：,对常用医学名词自动在规范词索引（主题词、副主题词、物质名称）中转换、并默认在所有记录字段中匹配。,如：,renal failure kidney,failure,MESH,OR(,kidney,All,Fields,AND,failureAll,Fields)OR(,renalAll,Fields AND,failureAll,Fields),三、,PubMed,基本检索规则,2025/12/15 周一,xx,30,结果显示页右侧,Details,显示系统自动匹配转换的检索词,2025/12/15 周一,xx,31,自动转换匹配检索词：,如：,hypertension therapy,Details:,(,hypertension,MeSH,Terms,OR,hypertension,All,Fields,)AND,(,therapy,Subheading,OR,therapyAll,Fields OR,therapeutics,MeSH,Terms,OR,therapeuticsAll,Fields),三、,PubMed,基本检索规则,2025/12/15 周一,xx,32,四、,PubMed,检索限制：,Limits,PubMed,主页、结果显示页、高级检索界面均有,Limits,链接。,2025/12/15 周一,xx,33,全文、免费全文、摘要限定,出版日期限定,文献类型限定,语种限定,研究对象,人,/,动物限定,性别限定,年龄限定,各种专题的,子数据库限定,2025/12/15 周一,xx,34,五、,PubMed,高级检索功能,一个网页中集多种功能于一体,基本检索,检索细节,检索式编制,检索历史,其他检索资源,结果预览,检索框中只能输入检索词，不能输入检索式。,多个字段检索要分多次输入。,检索历史中显示历次检索式、时间和检出篇数。,可组配检索式，如：,#1 OR#2,，,#1 AND child,点击编号可对检索式进行删除、保存等操作。,在,History,中快速显示检索式与检出篇数,显示转换规范词及运算的详细过程，可确定规范词,2025/12/15 周一,xx,35,六、,PubMed,其他资源,1.Mesh Database,（规范化医学主题词表）,功能：,确定规范化主题词,查看主题词词义注释、树状结构表,选择副主题词、扩展下位主题词、指定主要主题词,进入途径：,MeSH,Database,链接：,PubMed,主页，,Advanced Search,界面,MeSH,选项：基本检索框前,Search,下拉菜单的,文章,A,著者用词：,肾衰竭,renal failure,规范主题词,MeSH,：,肾功能衰竭,kidney failure,文章,B,著者用词：,肾功能衰竭,Kidney failure,规范主题词,MeSH,：,肾功能衰竭,kidney failure,词表中：,肾衰竭,见,肾功能衰竭,renal failure,see,kidney failure,（,2,）医学主题词表（,MeSH,）,2025/12/15 周一,xx,37,进入,MeSH,2025/12/15 周一,xx,38,MeSH,词检索,例,1,：,2006-10,年关于舌根癌治疗的文献。,课题分析：,舌根癌的不同表达形式（,OR,）：,tongue base cancer,、,cancer/carcinoma/tumor of tongue base,、,cancer of the base of tongue,治疗的不同表达形式（,OR,）：,therapy/treat/treatment,surgery,radiotherapy,两个概念之间：舌根癌,AND,治疗,2025/12/15 周一,xx,39,输入自由词，查找规范词,未匹配到规范词,选择提示中相关上级概念词舌癌,2025/12/15 周一,xx,40,只查重点论述的文献,2025/12/15 周一,xx,41,系统自动扩展检索下位词，勾选后不检索下位词,树形结构,上位词,该词无下位词,2025/12/15 周一,xx,42,输入舌根的自由词检索式，进行,AND,运算。,2025/12/15 周一,xx,43,初步结果，未限定年份,2025/12/15 周一,xx,44,2025/12/15 周一,xx,45,设定的限制,2025/12/15 周一,xx,46,输入,(,tongueti,AND,baseti,AND(,cancerti,OR,carcinomati,OR,tumorti,)AND(therapy OR treat*OR surgery OR,radiotherap,*OR,rehabilitat,*),自由词检索查全文献,2025/12/15 周一,xx,47,加工中，无,MeSH,词,2025/12/15 周一,xx,48,比,MeSH,多,10,篇,2025/12/15 周一,xx,49,排序方式选择,Abstract,格式提供全文链接、规范词等信息,MEDLINE,格式提供所有字段信息,2025/12/15 周一,xx,50,点击标题显示文摘增强格式,文献归类功能,PMC,免费全文链接,2025/12/15 周一,xx,51,文摘增强格式,相关论文,MeSH,词、物质名、文献类型等信息,LinkOut,外部资源链接,全文链接，我校订购的数据库可链全文，需在校园网内设免费代理,相关的网上免费医学指南信息,全文链接，部分需连外网,2025/12/15 周一,xx,52,2025/12/15 周一,xx,53,输出方式选择,2025/12/15 周一,xx,54,输出方式选择（,send to,）,File,：保存检索结果为文本文件,Clipboard,剪贴板，多次检索，可暂存每次检索需下载的记录，最后一起保存。最多允许存储,500,条，保留,8,小时。,Email:,通过邮件发送,Collections,：将检索结果存到,My NCBI,中,Order,：全文传递服务，需帐号、收费。,2025/12/15 周一,xx,55,订阅最新结果,点击后点“,XML”,按钮,2025/12/15 周一,xx,56,需,IE7.0,以上版本,2025/12/15 周一,xx,57,定期点击链接，接收课题最新相关论文,2025/12/15 周一,xx,58,MeSH,词检索,例,2,：用,MeSH,检索,2003-09,年期间关于霉酚酸酯在肾衰竭治疗中疗效观察的文献。,课题分析：,匹配物质名称：,mycophenolate,mofetil,匹配主题词：,renal failure,treatment effect,（,AND,）,匹配副主题词：,drug therapy,surgery,therapy,2025/12/15 周一,xx,59,2025/12/15 周一,xx,60,2025/12/15 周一,xx,61,2025/12/15 周一,xx,62,2025/12/15 周一,xx,63,2025/12/15 周一,xx,64,2025/12/15 周一,xx,65,MeSH,检索的优点,查全同义词,:,如：,renal/kidney failure;tongue cancer/tumor,查全子概念,:,如：,chronic/acute kidney failure,ATN,自动扩展检索下位词,上位词,勾选后不扩展下位词,2025/12/15 周一,xx,66,MeSH,检索的优点,根据树形结构调整检索词,缩小：不扩展下位词，或选用某个下位词；,扩大：选用上位词，或选用多个同位词；,了解同一概念的同义词、近义词，供自由词检索参考,款目词：规范词所替代的不同表达形式的自由词,2025/12/15 周一,xx,67,MeSH,检索的优点,提高文献相关度,标有,MeSH,词的都是文章的主题，筛去非主题的文章,Major Topic Headings,（加权，重点论述的主题）,带*的是文献,重点论述的主题,2025/12/15 周一,xx,68,MeSH,检索的缺陷,人工标引费时，最新论文还未标,MeSH,词（,In Process,），用,MeSH,会漏检。,Medline,不收录的文献，,Supplied by publisher,的文献，不标,MeSH,词。,新词、一些很专指的概念没有对应的规范词。,如：,SARS,（,03,年词表中没有），舌根癌,查上述类型的文献需,结合自由词检索,2025/12/15 周一,xx,69,六、,PubMed,其他资源,2.Journal Database,（期刊信息库）,通过输入刊名全称或缩写、,ISSN,号等浏览期刊出版社等详细信息。,提供期刊：,在,PMC,中的免费全文链接,在,Nucleotide,，,Protein,，,Pubmed,等库中的记录链接。,相关的其他期刊,2025/12/15 周一,xx,70,输入待检期刊名,期刊详细信息,全文等链接,2025/12/15 周一,xx,71,七、,PMC(,PubMed,Central),生命科学免费期刊资源中心,免费提供,900,多种期刊的,10,多万篇全文,其中部分文献被,PubMed,涵盖,2025/12/15 周一,xx,72,进入,PubMed,Central,下拉主页滚动条至底,2025/12/15 周一,xx,73,PMC,首页进入高级检索,2025/12/15 周一,xx,74,查找肾衰竭的药物疗法,2025/12/15 周一,xx,74,全文链接,