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医学数据统计处理及SAS软件的应用ppt课件.ppt

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单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,单击此处编辑母版标题样式,医学数据统计处理及,SAS,软件的应用,1,SAS,软件简介,SAS,是美国与西欧使用最为广泛的三大著名统计分析软件(,SAS,,,SPSS,和,SYSTAT,)之一,是目前国际上最为流行的一种大型统计分析系统,被誉为统计分析的标准软件。是国际上公认的最权威的统计软件。,以苛刻严格著称于世的美国,FDA,新药审批程序中,新药试验结果的统计分析规定只能用,SAS,进行,其他软件的计算结果一律无效,!,哪怕只是简单的均数和标准差也不行,!,由此可见,SAS,的权威地位。,2004,年开始中国新药临床试验结果规定应用,SAS,软件分析。,2,SAS,与,SPSS,比较,作为统计软件大家族里的“傻瓜相机”,,SPSS,的功能是最弱的,但易用性排在所有统计软件之首。,不过,SPSS,的易用性也极大的限制了它的功能和可扩展性。除了,SPSS,本身的菜单提供的功能,用户无法通过编程或者插件来扩展它的功能,而且,SPSS,提供的都只是最基本的常用的方法。,3,SAS,全球专业认证,SAS,专业认证是一项拥有极高国际声誉的专业认证,在欧美等国的职场上流行的一句话“,If you have a SAS certification,You will never lose your job”,。,销售模式:只租不售(每,5,年一个周期),财富,500,强中,97%,的企业都在使用,SAS,商业智能解决方案,4,5,2003,年,(301,医院与军事医科院博士生)各统计软件使用情况,6,Pubmed,检索,SCI,英文文献各统计软件使用情况,7,SAS,软件功能,进行数据管理,数据输入、建库、保存,进行统计分析,t,检验,方差分析,卡方检验,相关、回归,秩和检验,8,SAS,的安装,SAS8.12,版本是,windows,操作系统下的,32,位软件,和其他,windows,系统下的软件安装方法类似。用鼠标左键双击光盘根目录下的,setup,图标,然后按照提示安装。,9,SAS,的启动,单击开始菜单“程序”项。,桌面上双击此快捷方式也可启动,SAS,。,10,执行开始菜单中程序单项,【,程序,】,【The SAS,System】,【The SAS,System for Windows】,11,SAS,退出,方式,1,:选择关闭按钮,方式,2,:执行菜单命令,【File】【Exit】,方式,3,:在命令框执行,BYE,或,ENDSAS,命令,12,SAS,窗口,PGM,窗口(,Program Editor),:,提供编写,SAS,程序的文本编辑器,LOG,窗口:,显示执行程序过程中的相关信息,OUTPUT,窗口:,显示程序运行的结果,命令窗口与探索者窗口,13,程序编辑窗口,日志窗口,结果输出窗口,探索者窗口,命令窗口,14,15,16,17,SAS,程序的编写,一个完整的,SAS,程序一般由数据步(,DATA,步)和过程步(,PROC,步)两部分组成。,DATA,步以,DATA,语句开始,通过指定数据集名称、定义变量名及类型和读入数据等建立,SAS,数据集。,过程步以,PROC,语句开始,通过调用不同的分析模块来分析,SAS,数据集。,18,其它格式的数据库直接导入转换:,excel(.xls);dbase(.dbf);lotus(.wk),等,将数据读入系统,建立数据集(直接输入,Editor,窗口)。,SAS,数据集建立,19,外部数据导入,例:有一批体检数据,包括受检者的姓名、性别、年龄、身高、体重信息。要求按性别分别计算身高、体重的描述性统计量:均值、标准差、最大值、最小值。,该数据以,Excel.xls,文件形式储存。,文件名称:,tijiandata.xls,20,21,Import Data,22,23,24,25,库标记,导入的,SAS,数据库文件名,26,27,探索者窗口,28,29,30,在,Editor,程序编辑窗口输入源程序,数据步:将数据读入系统,建立数据集,:,DATA,语句开始,后面加上数据库的名字。,INPUT,语句描述数据变量,用,$,表示变量是字符型,CARDS,语句指示后面是数据,每行为一个观测数据,数据间无分号。,数据最后以“,;,”开头的空行结束。,每个语句都以“,;,”结束。,31,SAS,程序数据步格式,Data,;,Input,$.,;,Cards;,.,.,.,;,32,数据步,过程步,33,SAS,过程步,对数据集中数据进行分析、处理。,以,PROC,语句开始,调用,SAS,过程。,每个语句都以,“,;,”,结束。,整个程序最后要有,RUN,语句。,34,过程步,35,SAS,程序的书写格式,不分大小写,单个名称中不能空格,不同名称间必须空格,一行可写多条语句,用分号分割,一条语句可写多行,数据行后不加分号,数据最后单独加分号行,程序用“,RUN,;,”语句结束,36,运行,SAS,程序,方式一:鼠标点击执行按钮,方式二:按功能键“,F8”,方式三:执行菜单命令,RunSubmit,方式四:在命令框输入,SUBMIT,命令并执行,37,38,SAS,程序实例,例子 某学生上学期,8,门课程的分数分别为,88,,,90,,,87,,,76,,,92,,,78,,,80,,,86,。试用,SAS,编程求其平均分数。,(,1,)在,PGM,窗口键入下列程序,data fenshu;,input chengji;,cards;,88 90 87 76 92 78 80 86,;,proc means;,var chengji;,run;,过程步,数据步,39,查看结果(,output,窗口),Analysis Variable:chengji,N Mean Std Dev Minimum Maximum,-,8 84.6250000 5.8782286 76.0000000 92.0000000,-,从结果看出,该学生上学期,8,门课程的平均成绩为,84.625,。,40,查看运行过程及出错信息,激活,LOG,窗口,(F6),黑色文字,:源程序及运行情况,蓝色文字,:程序运行情况的说明信息,红色文字,:出错信息,绿色文字,:警告信息,41,42,保存,SAS,程序,及其他窗口内容,激活相应窗口,然后选择:,方式一:鼠标点击“存盘”工具按钮,方式二:执行菜单命令,【File】【Save】/【Save as】,可保存程序、数据文件、运行结果、日志等。,SAS,保存成纯文本格式文件(,.txt,),。,43,保存的文件的名,44,在,SAS,系统内打开已保存的文件,只能在,Program Edit,窗口打开文件,选择:,方式一:鼠标点击“打开”工具按钮,方式二:执行菜单命令,【File】【Open】,可打开以前保存的程序、数据文件、运行结果、日志等文件及其他文本格式的文件。,45,SAS,程序主要关键词,means;,(n,mean,std,Q1,Q3,CV,median,clm),univariate normal;,(,正态性检验,均数是否为,0,的,假设检验:参数与非参数检验),ttest;,(,两个样本均数比较的,t,检验),anova;,(,各样本含量相等的方差分析),glm;,(,各样本含量不等的方差分析),npar1way;,(,非参数检验),reg;,(,线性回归方程:单元或多元),corr;,(,线性相关:线性相关或秩相关),freq;,(,卡方、,Fisher,检验),logistic;,(,非线性回归),lifetest;,(,生存分析),proc,46,定量资料的描述性分析,47,分析结果,48,定量资料的正态性检验,49,正态性检验结果,50,配对设计的,t-test,为了比较两种方法对乳酸饮料中脂肪的含量测定结果是否不同,随机抽取了,10,份乳酸饮料制品,分别采用哥特里,-,罗紫法和脂肪酸水解法测定其结果,问两种方法检测结果是否不同?,编号,哥特里,-,罗紫法,脂肪酸水解法,1,0.840,0.580,2,0.591,0.509,3,0.674,0.500,4,0.632,0.316,5,0.687,0.337,6,0.978,0.517,7,0.750,0.454,8,0.730,0.512,9,1.200,0.997,10,0.870,0.506,51,52,53,成组设计资料的,t-test,国产药,进口药,-5,-17,64,48,63,47,77,60,74,58,-2,-14,89,72,77,48,63,61,70,54,36,22,82,66,-14,采用国产药物和进口药物治疗绝经后妇女骨质疏松症,试比较两种药物的疗效是否有差别,54,55,56,完全随机设计资料的方差分析(,教科书,73,页),安慰剂组,2.4g,组,4.8g,组,7.2g,组,3.53,2.42,2.86,0.89,4.59,3.36,2.28,1.06,4.34,4.32,2.39,1.08,2.66,2.34,2.28,1.27,3.59,2.68,2.48,1.63,3.13,2.95,2.28,1.89,4.04,2.63,2.32,1.74,3.53,2.86,2.61,2.16,3.65,2.93,3.64,3.37,3.85,2.17,2.58,2.97,4.07,2.72,3.65,1.69,3.93,2.22,3.68,2.11,4.19,2.90,2.65,2.81,2.96,2.97,3.02,2.52,57,58,方差齐性检验,59,60,61,62,63,64,65,四格表资料的,2,-test,组别,有效,无效,合计,有效率,胞磷胆碱,46,6,52,88.5%,神经节苷脂,18,8,26,69.2%,合计,64,14,78,82.1%,某医师欲比较胞磷胆碱与神经节苷脂治疗脑血管疾病的疗效,将,78,例脑血管疾病患者随机分为两组,试比较两种药物的疗效,66,67,68,69,配对四格表资料的,2,-test,配对设计的卡方检验,70,71,72,73,非参数检验(配对),74,75,76,非参数检验,9D,11C,DSC,2,5,3,2,5,5,2,6,6,3,6,6,4,6,6,4,7,7,4,8,7,5,10,9,7,12,10,7,11,11,比较小白鼠接种三种不同菌型伤寒杆菌,9D,、,11C,、,DSC1,后存活的日数。,77,78,79,80,81,82,直线相关与回归,年龄,尿肌酐含量,13,3.54,11,3.01,9,3.09,6,2.48,8,2.56,10,3.36,12,3.18,7,2.65,某地方病研究所调查了,8,名正常儿童的尿肌酐含量,试估计尿肌酐含量对其年龄的回归方程。,83,回归,相关,84,85,86,
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