DNA甲基化的特征.ppt

单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,*,单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,DNA甲基化的特征,一,.DNA,甲基化与羟甲基化,1.,胞嘧啶,2.,第五个,C,原子上,3.,甲基或羟甲基的修饰,2,二,.DNA,甲基化分布,DNA,甲基化发生在,CpG dinucleotides,低频率,!,在人基因组中的频率为,1%,，而含有,42%GC,，理论值上为（,0.21,*,0.21=4.41%,）,2.CpG island,I.,不被甲基化,II,.,长度为,500-2000bp,III.,常分布在,看家基因和特异性基因,启动子区域,3,二,.DNA,甲基化的分布,1,基因内甲基化抑制转录延伸，但与基因表达为正相关。,2 CpG island,不被甲基化可能与使得基因维持可以转录状态有关,4,二,.DNA,甲基化分布的特殊情况,1,.,在非,CpG,环境下的低水平甲基化（功能未知）,ES cells,oocytes,and brain,（不发生,DNA,复制）,2.,启动子中,CpG island,发生甲基化,imprinted and pluripotency-related genes,（长期转录沉默）,5,三,.DNA,羟甲基化的分布,cell,：,ES cells(0.03%),Purkinje neurons(0.59%),Gene:,CpG,transcription start sites(TSS),cis-regulatory elements,6,四,.DNMTs-,功能,7,大家应该也有点累了，稍作休息,大家有疑问的，可以询问和交流,8,四,.DNMTs-,结构,9,五,.TET,家族蛋白,-,功能,(5mC 5hmC),10,五,.TET,蛋白,-,结构,11,六,.Reprogramming of DNA methylation duringpreimplantation development,第一次卵裂前,几次卵裂后,12,不发生,Reprogramming of DNA methylation,：,1.imprinted loci,2.repeats,intracisternal A particles(IAPs),L1Md_A elements,LTR ERV1 elements,3.CpG islands,13,七,.Reprogramming of DNA methylation in gametes,Demethylation:,imprinting loci,gene bodies,intergenic regions,mobile elements,CpG island promoters,意义：,DNA,甲基化使得减数分裂相关的基因沉默，去甲基化可以使其恢复功能。,14,八,.Global demethylation in erythropoiesis,15,16,