蛋白质组学工作流程.doc

ProteomeWorksTM System
ProteomeWorksTM蛋白质组学工作步骤
RotoforTM cell制备电泳槽
Model 491 Prep cell 制备电泳槽
BioLogicTM Chromatography Systems层析系统
ReadyPrepTM Sequential Extraction 样品次序抽提试剂盒
样品制备
制备型电泳和层析可用于浓缩蛋白样。
次序抽提试剂盒可依据蛋白溶解度分离蛋白
层析系统可用于低丰度蛋白搜集

第一向
PROTEAN IEF Cell 等电聚焦电泳仪
ReadyPrepTM IPG strips
第二向各类电泳槽
Mini-PROTEAN 3, Mini-PROTEAN 3 Dodeca Cell
Criterion Cell, Criterion Dodeca Cell
PROTEAN IIXL Cell, PROTEAN Plus Dodeca Cell

双向电泳
第一向等电聚焦: 高通量易操作等电聚焦仪及多个规格预制胶条确保试验高分辨率和反复性。
第二向SDS-PAGE, 三种尺寸, 小规模及高通量电泳槽满足用户不一样需要。

蛋白染料
Bio-SafeTM Coomassie Stain
Silver Stain Plus Kit
SYPRO Ruby Fluorescent Gel Stain
染色
荧光染料, 考马斯兰染料, 银染多种染料

成像
多种规格图像仪满足光密度扫描、 荧光, 化学荧光, 化学发光, 同位素成像等不一样需要。

GS-800TM 光密度扫描仪
FX分子成像系列

分析软件
功效强大一维电泳和二维电泳分析软件, 图像获取, 图像优化, 比较分析, 数据库, 控制Spot cutter, 质谱数据连接均经过一个软件进行。

PDQuestTM 二维电泳图像分析软件
Quantity ONE一维电泳图像分析软件

ProteomeWorksTM Spot Cutter with Fluorescent
Spot Cutter 蛋白点切取工作站
MassPREP station

蛋白切取工作站和酶解

M@LDI 和Q-Tof质谱
蛋白点判定

WorksBase大型数据库生物信息平台
WorksBase生物信息处理平台

ProteomeWorksTM蛋白质组学处理方案

Bio-Rad蛋白质组系统致力于为科研工作者提供一套完整系统处理方案: 从样品制备->一维等电聚焦->二维蛋白电泳->图象采集->2D图象分析->蛋白点自动切取->质谱分析->生物信息学数据管理。系统高灵敏度, 高分辨率, 高反复性, 自动化控制性能确保以及功效强大专业软件支持是您研究工作顺利进行全方面保障。

1.样品制备
除传统层析方法, 等电点分离方法等样品提取方法外, Bio-Rad提供了独特样品序列抽提方案, 提升了样品处理灵敏度和分辨率。

2．一维等电聚焦系统及干胶条
Protean IEF系统是一体化一维等电聚焦系统, 它提供了10000V高电压, 以及10-25度正确温控。同时, IEF可同时容纳12根11, 17, 18, 24cm胶条,确保了试验高通量。对于试验室常常进行7cm预试验（探索条件等）, 它可提供每次跑24根胶高通量。
我们提供了不一样尺寸不一样pH值梯度IPG（immobilized pH gradient）干胶条。从尺寸分有7, 11, 17, 18cm、 24cm干胶条; 从pH值梯度分, 有宽梯度: 3-10线性, 3-10非线性; 有窄梯度: 3-6, 4-7, 5-8, 7-10; 有微梯度: 3.9-5.1,4.7-5.9,5.5-6.7,6.3-8.3。多个选择满足不一样试验需要。同时, PDQuest软件可将多根胶条进行拼接, 回复成一张更宽更多信息“全”胶。

3．二维蛋白电泳
一直以来, Bio-Rad是电泳市场领先者, 我们有多个独特设计确保电泳系统稳定可靠, 经久耐用。
不一样型号二维蛋白电泳可充足适应不一样需要: MP3,Protean II, Criterion系统满足用户对不一样尺寸需要; 高低通量电泳系统满足用户同时运行2～12块胶需求。

4．图象采集系统
Bio-Rad有多个图象采集系统满足用户从基因组到蛋白质组不一样需要, 其中我们为蛋白质组工作尤其推出GS-800校正型扫描系统。GS-800校正型扫描系统能以理想波长扫描任何样品（单向和双向凝胶、 比色斑点和狭线印迹膜、 以感光片为基础化学发光印迹膜、 放射自显影、 幻灯片和照片）以取得最好灵敏度及正确度。
FX Pro 分子成像系统, 经过直接激光激发提供高灵敏度、 高分辨率单色或多色荧光和化学荧光成像, 最适适用于蛋白质组学领域, 以及多种生物分子标识信号高灵敏度定量检测和多种相关分析, 满足您在分子成像和分析方面现在和未来研究需要。

5.专业软件支持
我们提供了Quantity One和PDQuest两套专业图象分析软件, 这两套软件都含有对图象采集系统控制功效。其中Quantity One是专业一维图象分析软件, 它能对蛋白质, DNA等凝胶, X-光片, 菌落, 96孔板等进行定量/定性分析。PDQuest是专业蛋白质组分析软件, 它可同时分析多达100幅图象, 也就是说它能够对图象采集系统如GS-800扫描而成多达100幅图象进行分析, 比较, 发觉其间有特异性表示蛋白质（如上升表示, 诱导表示, 关闭表示等）, 并建立数据库。相关数据/数据库可上网查询, 与网络上 数据库相连接比较。
我们为用户提供了教学软件。

6.Spot Cutter胶切取系统
Spot Cutter将凝胶上蛋白点切取下来以进行下一步生物判定, 得到最终结论。它高灵敏度, 高速以及全自动确保了样品无污染取得, 并用于判定。
6．1真正冷CCD成像技术
Spot Cutter采取了冷CCD成像技术, 首先它含有极高分辨率: 1392x1040像素（12位像素深度）; 其次因为它是真正“看到”图象, 而不是通常“感觉“图象, 所以它能对蛋白点切取过程进行跟踪, 确保蛋白点切取正确
6．2软件全程控制
我们所提供PDQuest软件不仅能够控制GS-800校正型扫描系统, 能够对多达100幅图象同时进行比较分析, 能够建立多个数据库并与其她数据库联络, 而且能够对Spot Cutter进行全程自动化控制。
此特点还表现经过软件（1）对重合斑点进行分离, 有限切取（2）依据样品比较建立小型数据库后, 专门对数据库里蛋白点进行自动切取, 并生成相关汇报。
6．3多个样品选择
除了传统蛋白凝胶外, Spot Cutter可对PVDF等膜进行切取工作
6.4 数据管理功效
PDQuest软件对Spot Cutter全程工作及数据进行全程跟踪, 确保数据可追溯性及管理。