1、第38 卷第4期2023年10 月文章编号:2 0 96-47 49(2 0 2 3)0 4-0 42 5-10引文格式:郑建月,张杰,曾健勇,王华玲,李会平.不同发育阶段桑天牛细菌群落多样性分析 J.林业与生态科学,2 0 2 3,38(4):425-433,442.ZHENG Jianyue,ZHANG Jie,ZENG Jianyong,WANG Hualing,LI Huiping.Analysis of bacterial community diver-sity in different developmental stages of Apriona germariJJ.Fores
2、try and Ecological Sciences,2023,38(4):425-433,442.林业与生态科学FORESTRYANDECOLOGICAL SCIENCESDOI:10.13320/ki.hjfor.2023.0053Vol.38 No.4Oct.2 0 2 3不同发育阶段桑天牛细菌群落多样性分析郑建月1,张杰,曾健勇1.3,王华玲1.4,李会平1.4(1河北农业大学,河北保定0 7 10 0 0;2 山西农业大学植物保护学院,山西晋中0 30 6 0 0;3河北省林木种质资源与森林保护重点实验室,河北保定0 7 10 0 0;4河北省城市森林健康技术创新中心,河北保定0
3、7 10 0 0)摘要:为明确桑天牛各发育时期的菌群结构及多样性,利用16 SrRNA测序技术对桑天牛卵、初孵幼虫、老熟幼虫、雌雄成虫4个发育阶段的细菌群落进行研究。结果表明,桑天牛不同发育阶段的细菌群落多样性存在差异。初孵幼虫的Alpha多样性显著高于其他阶段。Beta多样性分析表明,雌雄成虫细菌群落高度相似。在门分类水平,卵期的优势菌门为放线菌门(6 4.7 8%),初孵幼虫期为变形菌门和厚壁菌门(38.40%、25.31%),老熟幼虫为变形菌门(93.47%),雌雄成虫为厚壁菌门(8 6.46%、8 6.35%)。在属分类水平,卵期的优势菌属为红球菌属,初孵幼虫为Muribaculace
4、ae科未知属,老熟幼虫为Gibbsiella属,雌雄成虫为乳球菌属。在功能方面,发酵、化学异养、好氧性化学异养在桑天牛各个发育阶段的占比都较高,并且与该阶段存在的菌落有关。本研究揭示了桑天牛不同发育阶段细菌群落差异,明确了各阶段优势肠菌,可为桑天牛的生物防治奠定基础。关键词:桑天牛;细菌;16 SrRNA;多样性;不同生长发育阶段中图分类号:S718.7Analysis of bacterial community diversity in differentdevelopmental stages of Apriona germariZHENG Jianyue,ZHANG Jie,ZENG
5、Jianyong,WANG Hualingl,LI Huiping.(1 Hebei Agricultural University,Baoding 071o00,China;2 College of Plant Protection,Shanci Agricultural University,Jinzhong 030600,China;3 Key Laboratory of Forest GermplasmResources and Forest Protection of Hebei Province,Baoding 071000,China;4 Urban Forest Health
6、Technology Innovation Center of Hebei Province,Baoding 071oo0,China)Abstract:In order to clarify the microflora structure and diversity of Apriona germari at dif-ferent developmental stages,the bacterial communities at four developmental stages of A.germari were studied,including eggs,newly hatched
7、larvae,mature larvae,male adults,and female adults.The 16S rRNA sequencing technology was used to analyze the bacterial文献标志码:A收稿日期:2 0 2 3-0 4-0 3基金项目:河北省重点研发计划(2 0 32 6 514D);国家自然科学基金(32 17 17 99);河北省高校基本科研业务费研究项目(KY2022048)。第一作者:郑建月(1997-),女,河北唐山人,硕士研究生,研究方向为森林保护。通信作者:李会平(197 5-),女,河北新乐人,博士,教授,研究方
8、向为林木病虫害生物防治。426communities of A.germari.The results showed that there were differences in bacterial com-munity diversity at different developmental stages.The newly hatched larvae showed higherdiversity than that at other three developmental stages.Beta diversity analysis showed thatthe bacterial co
9、mmunities of male and female adults were similar.In terms of phylum classi-fication level,Actinobacteriota was the dominant bacteria in the egg stage(64.78%),Pro-teobacteria and Firmicutes in the newly hatched larvae(38.40%,25.31%),Proteobacteriain the mature larvae(93.47%),Firmicutes in male and fe
10、male adults(86.46%,86.35%).In terms of genus classification level,Rhodococcus was the dominant bacterial genus in eggstage,Muribaculaceae and unknown genus in the newly hatched larvae,Gibbsiella in the ma-ture larvae,and Lactococcus in the male and female adults.In terms of function,such as fer-ment
11、ation,chemical heterotrophy and aerobic chemical heterotrophy were mainly high pro-portions in different stages,and related to the existence of colonies in each stage.This studyrevealed the differences of bacterial communities in different developmental stages of A.ger-mari and identified the domina
12、nt intestinal bacteria at each stage,which could lay the foun-dation for biological control of A.germari.Keywords:Apriona germari;bacteria;16S rRNA;diversity;different developmental stages桑天牛又名粒肩天牛、桑褐天牛,属鞘翅目天牛科沟胫天牛亚科,是杨树、构树、桑树、苹果等多种林木的主要蛀干害虫,幼虫成虫都能对林木造成危害,严重威胁着林、果、蚕业的发展 1。为了寻求有效的防治桑天牛方法,国内外学者做了大量研究并
13、取得了显著成果。苏筱雨等总结多年研究成果,提出了一套桑天牛无公害控制技术:应用桑天牛卵长尾啮小蜂、白僵菌、灭幼脲和树种抗性等综合作用来防治不同时期的桑天牛 2 。随着技术的发展,关于肠道微生物的研究逐渐深入,学者们认为通过改良操纵昆虫肠道细菌实现害虫的防治是一个全新的视角 3。在协同进化过程中,昆虫体内形成了与宿主昆虫生命活动紧密相关的复杂的功能微生物群落。这些微生物可以协助宿主昆虫消化,为宿主提供营养物质,可以协助宿主昆虫降解有毒化合物,使宿主具有更强的环境适应能力 5-6 。但昆虫肠道微生物的多样性受到肠道特殊结构、昆虫性别、发育龄期等多种因素影响,即使是同一目的昆虫也具有不同的优势菌门及
14、菌属 7。受发育龄期影响,甜菜夜蛾幼虫肠道中的优势菌属会随宿主龄期发生变化;其中不动杆菌属的相对丰度随宿主龄期的变化出现先下降后上升的趋势,在第5龄时相对丰度最大;而噬氢菌属和噬酸菌属的相对丰度则随着宿主的龄期变化呈现下降的趋势 8 。在梨小食心虫中则表现为早期幼虫(1 龄和2 龄)的细菌多样性显著高于末期幼虫(3龄至5龄);与末期幼虫相比,雄性蛹和成虫的细菌丰富度再次增加9。因此,发育龄期对昆虫微生物多样性具有很大影响,并且不同菌种在不同昆虫中会呈现出不同的变化趋势。在先前关于桑天牛林业与生态科学的研究中并未关注这一现象。目前关于桑天牛肠道微生物的研究主要集中在其生活史的某一发育阶段(成虫或
15、幼虫),但对不同发育阶段菌群组成及多样性变化的研究还未见报道。因此本研究利用16 SrRNA技术对桑天牛不同发育阶段(卵、初孵幼虫、老熟幼虫、雌雄成虫)的细菌群落多样性进行了探究,旨在明确桑天牛不同发育阶段的细菌群落组成,探究共生微生物在桑天牛生长中的重要作用,为通过生物途径防治桑天牛奠定基础。1材料与方法1.1供试虫源成虫:采集自河北农业大学标本园(河北保定),寄主植物为桑树。卵:将野外采集的成虫带回室内养虫笼中饲养,以1年生细嫩桑枝补充营养,另放人标本园内采集的2 3年生(直径13cm)毛白杨枝条用于产卵,1周后自产卵枝条中将卵取出 10 。初孵幼虫:自枝条中取出的卵放在含有湿润滤纸的无菌
16、培养血中让其孵化,随时观察,获得初孵幼虫。老熟幼虫:采集自河北农业大学标本园,寄主植物为毛白杨。1.2材料前期处理将采集的桑天牛初孵幼虫、老熟幼虫、雌雄成虫饥饿处理48 h。然后将雌雄成虫、幼虫以及卵的样本在7 5%乙醇中浸泡3min,然后用无菌水冲洗3遍,最后在超净工作台内用解剖镜及高温灭菌的镊子解剖幼虫及成虫,取出其整条肠道。将卵和解剖第38 卷第4期获得的肠道转移至含10 0 LPBS缓冲液的2 mL离心管中,用液氮速冻后转移至超低温冰箱保存备用 11。每个样本保留4个重复。1.3细菌16 S rRNA测序使用粪便DNA提取试剂盒(QIAampPowerF-ecal Pro DNA Ki
17、t)提取肠道内容物总 DNA。并用引物 341 F(5一ACTCCTACGGGAGGCAGCAG 3)和 8 0 6 R(5 G G A C T A C H V G G G T-WTCTAAT-3)进行PCR扩增 12 。PCR扩增体系(50 L)如下:PCR master mix(TaKaRa TaqqTM_Version 2.0 plus dye)25L,上下游引物各2 L,模板DNA1L,ddHO20L。PCR 反应程序为:94预变性3min,94变性30 s,55退火45s,72延伸45s,共3 0 个循环;7 2 延伸10 min,4终止反应。采用1%的琼脂糖进行电泳,用凝胶提取试剂
18、盒(QIAquick Gel Extraction kit)(Q I A-GEN)对PCR产物进行纯化。构建好的文库使用Ilumina MiSeq测序平台进行测序 13。1.4测序数据质控与OTU注释通过PEreads重叠关系,将配对后的reads以最小重叠长度为10 bp的标准合并为1个序列,最大允许错配比为2 0%。通过barcode分辨样本barcode错配允许个数为0,引物错配允许个数为2。用Usearch软件在97%的相似性水平上对序列进行OUT聚类。并利用UCHIME来识别和移除嵌合物去除嵌合体,根据Silva分类数据库进行分类注释 14。2.00015001000500Figur
19、e 1 Species accumulation curves and Rank-Abundance curves in different developmental stages of Apriona germari注:E代表卵;NL代表初孵幼虫;ML代表老熟幼虫;FA代表雌成虫;MA代表雄成虫。由图1可知,随样本量增大,物质积累曲线逐渐趋于平缓,说明抽样数据足够充分,可进行数据分析(图la)。初孵幼虫Rank-Abundance曲线水平方向跨度较大,垂直方向上平滑程度小(图1b),说明桑天郑建月,等:不同发育阶段桑天牛细菌群落多样性分析细菌多样性分析通过Mothur(v.1.2 1.1)
20、软件分析获得多样性指数、Rank-Abundance曲线、物种累积曲线,并利用R语言工具包制作成图 15。本研究统计的多样性指数有 Chao 指数、Shannon 指数、Simpson 指数、ACE指数、测序深度指数和均匀度指数。采用维恩图(Venn)展示桑天牛细菌样本共有及特有OTU。利用R语言工具绘制样本聚类树与柱状图。使用R语言PCoA分析和vegan软件包进行主坐标分析(PCoA)分析和基于Beta多样性距离的非度量多维尺度分析(NMDS)。通过FAPROTAX软件进行功能预测分析。2结果与分析2.1桑天牛不同发育阶段细菌OUT聚类分析本试验中共有2 0 个样品,分为卵(E)、初孵幼虫
21、(NL)、老熟幼虫(ML)、雌成虫(FA)与雄成虫(MA)5个组,每组4个重复。测序文库共获得1536330条序列,其中有效序列有153350 9 条,每个样品至少产生2 8 916 条,平均产生512 11条,平均序列长度为42 3.8 9bp。结果显示测序数据质量较高,可以用作后续分析。关于桑天牛不同发育阶段的物种累积曲线和Rank-Abundance曲线见图l。1001010.10.010.001510Sites(a)图1桑天牛不同发育阶段的物种累积曲线和Rank-Abundance曲线4271.5丝-EIE3E4-FA1-FA2-FA3-FA4-MA1-MA2-MA3-MA4-MLI-
22、ML2-ML3-ML4-NLINL2-NL3-NL415200牛初孵幼虫时期肠道菌群组成比较丰富,但物种分布的均匀度较低。其余发育阶段样品在水平方向跨度较小,说明丰富度相对较低,均匀度相对较高。关于桑天牛不同发育阶段肠道组间OUT情况250OTUsrank(b)500750428统计见图2。Egg初孵幼虫330000Male雄成虫16图2 桑天牛不同发育阶段肠道组间的共有以及特有OTUsFigure 2Common and specific OTUs in differentdevelopmental stages of Apriona germariTable 1Reads number a
23、nd Alpha diversity index statistics in different developmental stages of Apriona germari样本ReadsSample卵31333928b初孵幼虫647568.505ab老熟幼虫809408 244a雌成虫500506234ab雄成虫375204001b注:表中不同字母表示差异性显著(P0.05)。由表1可知,测序深度指数coverage表明每个样本的覆盖率都达到99.8 4%以上,说明可检测出大多数物种,能客观反映各样本物种信息。桑天牛在初孵幼虫阶段的微生物 Chaol、Sh a n n o n、A C E指
24、数明显高于其他发育阶段,其次为卵和老熟幼虫阶段,而Simpson指数明显小于其他发育阶段,表0.70.60.50.40.30.20.10.00.1-0.2-0.3-0.40.70.60.50.40.30.20.10Figure 3 PCoA and NMDS plots of bacterial communities in different developmental stages of Apriona germari注:E代表卵;NL代表初孵幼虫;ML代表老熟幼虫;FA代表雌成虫;MA代表雄成虫。林业与生态科学由图2 可知,桑天牛在卵、初孵幼虫、老熟幼虫、Newlyhatched lar
25、vae初孵幼虫雌性成虫和雄性成虫中共有的细菌OTU仅为1400个,而卵、初孵幼虫、老熟幼虫、雌雄成虫特有OTUs2Maturelavae老熟幼虫20100117014Femaleadults雕成虫表1不同发育阶段桑天牛肠道菌群的样本测序数据结果及Alpha多样性分析Chao217.9121.97c969.7051.11a491.6377.26b327.8630.80c217.5017.80c0.10.20.30.40.5PC1(29.4324755712%)(a)PCOA 分析图图3桑天牛不同发育阶段的PCoA分析图与NMDS分析图第38 卷分别为33、40 0、6、14和16 个。说明桑天牛
26、的不同0000发育阶段的肠道细菌的种类有很大的差异。卵与初06孵幼虫共有OTUs为3个,初孵幼虫与老熟幼虫共有OTUs为13个,雌雄成虫共有OTUs为33个。卵与雌雄成虫共有OTUs为18 个。因此,桑天牛雌雄成虫细菌OTU相似度较高,其次为卵与雌雄成虫和初孵幼虫与老熟幼虫。2.2桑天牛不同发育阶段细菌Alpha多样性分析关于桑天牛肠道菌群的Alpha多样性分析见表1。ShannonSimpson3.520.41b0.210.05bc6.710.37a0.040.01c1.710.44c0.590.12a2.430.15bc0.390.06ab2.730.43bc0.360.09ab2.3不同
27、发育阶段细菌Beta多样性分析关于桑天牛不同发育阶段的Beta多样性分析见图3。NLMLEPAMAACE223.0222.12c966.9051.77a514.5772.62b336.7930.11c222.7717.34c明桑天牛初孵幼虫阶段的细菌多样性高于桑天牛卵期、老熟幼虫、雌雄成虫3个阶段。NLML0.2PA-MA0.0-0.2-0.4-0.50Evenness0.460.05b0.680.03a0.200.05d0.300.02cd0.360.05bc-0.250.00MDS1(b)NMDS 分析图coverage0.9990.9980.9980.9990.9990.250.50第4
28、期图3的PCoA与NMDS分析结果显示,桑天牛的雌雄成虫菌群有交叠在一起的现象,卵期、初孵幼虫期、与老熟幼虫期没有交互现象,说明桑天牛雌雄成虫的细菌群落结果较为相似,与其他3个发育阶Table 2 Statistics on the number of components at each classification level in different developmental stages of Apriona germari样本Sampleall卵初孵幼虫14.000.91a老熟幼虫9.500.87a雌成虫13.001.08a雄成虫12.252.50a注:表中同列不同字母表示差异性显
29、著(P0.05)。本研究共注释到2 6 门46 纲9 1目144科2 6 9属2 38 种桑天牛细菌。由表2 可知,在门与纲水平组成数目相同,从目到种水平出现差异,其中初孵幼郑建月,等:不同发育阶段桑天牛细菌群落多样性分析表2 桑天牛不同发育阶段在不同分类阶元的组成数目统计门纲PylumClass264612.252.50a19.755.36a19.251.11a15.501.50a24.752.93a19.254.03a429段间相互存在差异。2.4桑天牛不同发育阶段细菌组成分析关于桑天牛不同发育阶段不同分类阶元统计见表2。目科OrderFamily9114444.007.93ab65.25
30、11.24a49.002.27ab81.504.33a29.001.22b42.004.88b52.009.41a75.7514.48ab119.7522.89b31.508.43ab44.009.01b虫阶段的注释数目最多,明显高于其他发育阶段。关于桑天牛不同发育阶段样本聚类情况见图4。属Genus26991.5012.95bc180.757.32a81.0012.62bc65.758.56c种Species238115.75 15.27bc236.7512.20a98.0013.57c153.0027.08b88.258.12cFirmicutesProteobacteriaActinob
31、acteriotaBacteroidotaVerrucomicrobiotaDesulfobacterotaAcidobacteriotaChloroflexiMyxococcotaCyanobacteriaEisimicrobiotaPatescibacteriaFusobacteriotaCampylogacterotaWPS-2OthersEggNewly hatched larvaeMaturelarvaeFamaleadultsMaleadults注:Egg代表卵;Newlyhatched larvae代表初孵幼虫;Maturelarvae代表老熟幼虫Female adults代表雌
32、成虫;Male adults代表雄成虫。由图4可知,桑天牛初孵幼虫与老熟幼虫样本聚类成簇,卵与雌雄成虫聚类成簇,说明初孵幼虫与老熟幼虫相似度较高,而卵与雌雄成虫相似度0图4桑天牛不同发育阶段样本聚类树与柱状图组合分析图(门水平)Figure 4 Microbial community barplot and sample cluster tree in different developmentalstages of Apriona germari(Phylum level)500010000RelativeAbundance较高。关于桑天牛不同发育阶段肠道中几种主要菌门的丰度差异见表3。15
33、0002000025000430Table3Difference analysis of main bacterial phyla of gut bacteria in different developmental stages of Apriona germari样本疣微菌门SampleVerrucomicrobiota卵0.040.02b初孵幼虫9.163.41a老熟幼虫0.050.02b雌成虫0.050.04b雄成虫0.000.00b注:表中不同字母表示差异性显著(P0.05)。在门分类水平共注释到了放线菌门、变形菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、疣微杆菌门、酸杆菌门、蓝细菌门、脱硫杆菌门、弯
34、曲杆菌门、梭菌门等2 6 个门。不同发育阶段的优势菌门有所不同(图3)。卵期的优势菌门为放线菌门(6 4.7 8%)、次优势菌门为变形菌门(31.0 2%),其次为拟杆菌门(2.0 7%)。初孵幼虫阶段的优势菌门为厚壁菌门(38.40%),其次为变形菌门(2 5.31%)、拟杆菌门(2 4.91%)、疣微杆菌门(9.16%)。在老熟幼虫阶段,变形菌门(93.47%)为优势菌门,其次为厚壁菌门(3.50%)和拟杆菌门(2.8 9%)。在雌雄成虫阶段优势菌门均为厚壁菌门(8 6.46%、8 6.35%),次优势菌门为变形菌门10.9-0.8-0.7-0.60.5-0.4-0.30.20.10林业与
35、生态科学表3桑天牛不同发育阶段肠道细菌主要菌门差异性分析拟杆菌门Bacteroidota2.070.96b24.911.90a2.891.68b1.640.53b2.220.57b第38 卷放线菌门变形菌门ActinobacteriotaProteobacteria64.7810.38a31.029.20b0.190.05b25.319.26bc0.020.01b93.471.41a0.950.47b10.004.15c0.840.26b10.223.38c(10.0 0%、10.2 2%)。桑天牛在不同发育阶段具有不同的优势菌门,相对丰度也有所差异,但厚壁菌门和变形菌门几乎存在于桑天牛的各个
36、发育阶段。变形菌门在卵、初孵幼虫、老熟幼虫3个阶段中丰度较高,其中老熟幼虫期占比显著高于卵期其他发育阶段。而厚壁菌门在初孵幼虫、雌雄成虫2 个阶段丰度都较高,其中雌雄成虫期占比最高。初孵幼虫时期的疣微杆菌门明显高于其他阶段,放线菌门卵时期明显高于其他阶段。关于属水平桑天牛不同发育阶段肠道细菌的组成见图5。LactococcusGibbsiellaRhodococcusEnterococcusAcinetobacterEnterobacterMuribaculaceaenorankPseudomonasLachnospiraceaceaeNK4A13AkkermansiaBradyrhizobi
37、umCitrobacterEscherichia-ShigellaMassiliaRuminococcusChryseobacteriumSphingobacteriumOthers厚壁菌门Firmicutes0.700.16c38.405.57b3.501.58c86.463.91a86.354.28a图5桑天牛不同发育阶段肠道细菌的组成(属水平)Figure 5 Composition of bacterial communities in different developmental stages of Apriona germari(Genus level)注:E代表卵;NL代表初孵
38、幼虫;ML代表老熟幼虫;FA代表雌成虫;MA代表雄成虫。在属水平,共注释到2 6 9属细菌。桑天牛卵期的细菌主要包括红球菌属(6 0.2 3%)、假单胞菌属(8.33%)、肠杆菌属(6.19%)、Massilia(4.11%)、慢生根瘤菌属(2.7 6%)、Corynebacteriales(2.7 3%)、M e t h y lo v ir g u la(1.97%)和不动杆菌(1.93%)等。初孵幼虫细菌组成为科未知属第4期(12.43%)、A k k e r ma n s i a (9.15%)、La c h n o s p i r a c e-ae NK4A136group(8.6 9
39、%)、不动杆菌属(7.8 9%)、柠檬酸细菌属(5.2 0%)、埃希氏志贺氏菌菌属(4.2 8%)、拟杆菌属(3.41%)、瘤胃球菌属(3.35%)、肠球菌属(2.7 6%)、金黄杆菌属(2.6 2%)、G i b b s i e lla (2.47%)、普氏菌属(1.8 9%)、乳杆菌属(1.6 4%)和假单胞菌属(1.35%)等,其种类比较丰富,但丰度都相对较低。在老熟幼虫中为Gibbsiella(7 7.94%)、肠杆菌属(6.35%)、不动杆菌属(4.7 6%)、鞘氨醇杆菌属(1.8 2%)、柠檬酸细菌属(1.54%)和肠球菌属(1.38%)等。雌雄成虫的优势菌均为乳球菌属,占比分别为
40、7 5.15%、8 5.14%。但其次优势菌属不相同,雌成虫的次优势菌属为肠球菌属(10.2 5%)、郑建月,等:不同发育阶段桑天牛细菌群落多样性分析methanoloxidationmethylotrophysulfaterespirationrespirationofsulfurcompoundsarsenatedetoxificationdissimilatoryarsenatereductionnitratedenitrificationnitritedenitrificationnitrousoxidedenitrificationdenitrificationchitinolysi
41、sdark hydrogenoxidationnitrogenfixationnitrateammonificationnitriteammonificationnitrite respirationcellulolysisxylanolysisdarkthiosulfateoxidationdarkoxidationofsulfurcompoundsmanganese oxidationligninolysisfermentationareobic chemoheterotrophyhuman pathogenssepticemiahuman pathogens pneumoniahuman
42、 pathogens nosocomiahuman pathogensmeningitishuman pathogens gastroenteritishuman pathogens diarrheahuman pathogens allhuman guthuman associatedmammal gutanimal parasitesorsymbiontsplantpathogenoilbioremediationaromatichydrocarbondegradationaromaticcompounddegradationaliphaticnon methanehydrocarbon
43、degradationhydrocarbondegradationnitrate respirationnitratereductionnitrogenrespirationfumarate respirationintracellularparasiteschloratereducerspredatoryorexoparasiticchloroplastsnonphotosyntheticcyanobacteriaphotoheterotrophyphototrophyplasticdegradationureolysisreductiveacetogenesischemoheterotro
44、phy431Gibbsiella(5.62%)和慢生根瘤菌属(1.32%)。雄成虫的次优势菌属为慢生根瘤菌属(3.2 5%)和Methylovirgula(2.38%)。假单胞菌属在卵期、初孵幼虫期均存在,并且占比有减少趋势。不动杆菌属在卵、初孵幼虫、老熟幼虫3个阶段均存在,占比先升高后降低。柠檬酸细菌属同时存在于初孵和老熟2 幼虫阶段,有降低趋势。肠球菌属在初孵幼虫、老熟幼虫与雌成虫肠道内均存在,在雌成虫中占比较高。Gibbsiella 在初孵幼虫、老熟幼虫与雌成虫肠道内均存在,占比有先升高后降低趋势。Methylov-irgula存在于卵与雄成虫,二者占比相似。2.5纟细菌功能预测关于桑天
45、牛不同发育阶段肠道细菌菌群功能预测结果见图6。methanotrophy43210图6 桑天牛不同发育阶段肠道细菌菌群功能预测Figure 6 Functional predictions of the gut bacteria communities in different developmental stages of Apriona germari注:E代表卵;NL代表初孵幼虫;ML代表老熟幼虫;FA代表雌成虫;MA代表雄成虫;右侧数值0 一4代表log10计算的不同功能丰度。432图6 功能预测结果表明,化学异养、发酵及好氧性化学异养在桑天牛各个发育阶段的占比都比较丰富。除此之外,硝
46、酸盐呼吸、动植物及人类病原体、动物肠道等也几乎存在于桑天牛各个阶段。甲醇氧化、甲基营养、锰氧化、硝酸盐还原、尿素分解、芳香烃降解、芳香族化合物降解、脂肪族非甲烷烃降解、烃降解、木质素分解、塑料降解、暗硫化物氧化、暗硫代硫酸盐氧化等功能在桑天牛卵期较为明显,其中甲醇氧化与甲基营养还存在于雄成虫内,芳香烃降解存在于雌成虫内,芳香族化合物降解存在于老熟幼虫。氮呼吸、亚硝酸氨化、延胡索酸呼吸、硫酸呼吸、硫化合物呼吸、纤维素水解等在初孵幼虫中较为丰富。固氮作用在卵和雌雄成虫阶段较为明显。参与调控需氧化能异养的细菌种类繁多但占比都不高,主要有不动杆菌属、假单胞菌属、慢生根瘤菌属、金黄杆菌属、埃希氏志贺氏菌
47、属、柠檬酸细菌属。化能异养功能受红球菌属、拟杆菌属、瘤胃球菌属、金黄杆菌属、埃希氏志贺氏菌属、Akkermansia、乳杆菌属、乳球菌属、不动杆菌属、肠杆菌属、肠球菌属等多菌属作用。拟杆菌属、瘤胃球菌属、埃希氏志贺氏菌属、Akkermansia、乳杆菌属、柠檬酸细菌属、肠杆菌属、肠球菌属、乳球菌属都对发酵功能有贡献,其中乳球菌属、拟杆菌属、瘤胃球菌属占比较大。固氮作用主要受慢生根瘤菌属影响。植物病原体主要受乳球菌属、假单胞菌属影响。假单胞菌属主要控制暗硫代硫酸盐氧化、暗硫化物氧化、锰氧化等氧化作用和木质素分解功能。与动物肠道相关的菌主要有肠杆菌属、拟杆菌属、瘤胃球菌属、埃希氏志贺氏菌属、柠檬酸
48、细菌属。与动物寄生体或共生体相关细菌为肠杆菌属、Massilia、普氏菌属、拟杆菌属、瘤胃球菌属、埃希氏志贺氏菌属、假单胞菌属。芳香烃降解功能由红球菌属和假单胞菌属2 菌属控制。芳香族化合物降解受不动杆菌属、红球菌属、假单胞菌属调控。芳香族非甲烷烃降解只受沙雷氏菌属调控。烃降解的调控菌主要有沙雷氏菌属、假单胞菌属。氮呼吸、硝酸盐呼吸和硝酸盐还原功能主要受假单胞菌属、埃希氏志贺氏菌属、肠杆菌属3菌调控;在前两个呼吸作用中3菌丰度都较低,而在还原作用中肠杆菌属占比较高。塑料降解主要受假单胞菌属控制。由此可见,细菌群落在桑天牛各发育阶段发挥着不同的作用。3讨论随着宏基因组及测序技术的快速发展,关于桑
49、林业与生态科学天牛微生物的研究也更加深入,但关于不同发育阶段之间菌群差异的研究还未见报道。本研究利用16SrRNA测序技术对桑天牛卵、初孵幼虫、老熟幼虫、雌雄成虫的肠道细菌进行高通量测序探究了不同发育阶段天牛细菌多样性。由于桑天牛生活史较长,且本试验室并未完成其世代连续培养,因此各阶段材料来源并不完全一致,为减小环境因素影响,本研究尽量保持桑天牛寄主一致,室内饲养天牛枝条与田间采集枝条来源一致。本研究中不同阶段桑天牛由不同菌群组成,初孵幼虫包含不动杆菌属、柠檬酸细菌属、拟杆菌属等 13个属的细菌;而卵期有 8个菌属,老熟幼虫有6 个菌属,雌成虫有4个菌属,雄成虫3个菌属。初孵幼虫可能是由于刚刚
50、破除卵壳,发育还不稳定,因此需要种类繁多的菌群来补足自身发育需求,但由于本试验中初孵幼虫来自于湿润培养皿而不是来自树木,可能会导致补充菌群不足,因此出现丰度较低的现象。与本研究结果相似,在草地贪夜蛾的整个生命周期中微生物多样性会随着发育在大阶段(变态)间逐步降低,但不同的是它在不同龄的幼虫间多样性逐步增加。草地贪夜蛾的卵期微生物多样性最高,孵化成幼虫后多样性急剧下降,但其体内微生物种类随幼虫发育逐渐增多,到6 龄时多样性最高,而成虫期群落丰富度最低 16 。细菌丰度随年龄逐渐减少的趋势在其他昆虫中也有所体现。大分舌蜂随着幼虫生长阶段的递进,其肠道微生物的多样性会出现逐步降低的现象,这可能与昆虫
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