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1、PubMed及其EBM文献检索天津医科大学图书馆 何怡 1.一、PubMedPubMed概述1.简介2.PubMed收录范围3.PubMed特点4.检索途径与使用方法基本检索、高级检索、主题词检索期刊检索、题录检索、定题检索基本检索规则、注册2.二、循证医学文献的查找1.临床查询(Clinical Queries)(1)Clinical Study Categories(临床研究类文献)(2)Systematic Reviews(系统评价)(3)Medical Genetics(医学遗传学)2.MeSH:MeSH Clinical Queries3.Limits限定选项 4.直接以system

2、atic review、Cochrane、meta-analysis、Randomized Controlled Trial等为关键词进行检索。5.Clinical Trials(http:/clinicaltrials.gov/)三、临床案例 3.PubMed是生物医学领域最重要和权威的数据库之一,由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)下属美国生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)研制开发,可通过网络免费访问(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov

3、/sites/entrez)。2.PubMed收录范围 PubMed收录全世界包括美国在内80多个国家的5000余种生物医学期刊的文摘及题录数据,内容涉及基础医学以及护理学、牙科学、兽医学、药理学、保健系统等医学各个领域,现有文献2100万余条,时间起自20世纪50年代。一、PubMedPubMed概述1.简介4.PubMed提供部分免费全文,包括 NLM开发的免费生物医学数字化期刊全文数据库PubMed Central(PMC);开放获取(Open Access,OA)期刊的文献;部分出版商提供的免费期刊文献。PubMed每条记录均有惟一的识别号PMID(PubMed Unique Iden

4、tifier)。MEDLINEMEDLINE:PubMed:PubMed主体部分,记录均标有PubMed-indexed for PubMed-indexed for MEDLINEMEDLINE In Process CitationIn Process Citation:又称Pre-Pre-MEDLINE,MEDLINE,记录均标有PubMed-in PubMed-in processprocessPublisher-Supplied CitationPublisher-Supplied Citation:记录均标有PubMed-as supplied by PubMed-as suppl

5、ied by publisherpublisher一、PubMedPubMed概述 2.PubMed收录范围5.PubMed-indexed for MEDLINEPubMed-indexed for MEDLINEPubMed-as supplied by publisherPubMed-as supplied by publisherPubMed-in processPubMed-in process6.一、PubMedPubMed概述 3.PubMed 3.PubMed 特点(1)收录文献范围广、内容齐全、回溯年限长(2)免费提供题录、文摘及部分全文(3)检索功能完善,使用简单方便(4)

6、提供检索词自动转换匹配功能检索词自动转换匹配功能、MeSHMeSH主题词检索主题词检索(5)提供相关文献链接:Related citations、Linkout(6)更新速度快:数据实时更新(7)个性化服务(My NCBI)7.检索词自动转换匹配功能检索词自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping,ATM)PubMed对键入的检索词自动进行分析、匹配、转换并检索,是一种智能化的检索过程。MeSH转换表(MeSH Translation Table)protein c protein cMeSH Terms OR protein cAll Fields期刊转换表(Journa

7、ls translation table)new england journal of medicine N Engl J MedJournal OR new england journal of medicineAll Fields作者索引及转换表(full author translation table)Smith JA Smith JAAuthor 8.一、PubMedPubMed概述 4.检索途径与使用方法 基本检索 高级检索 主题词检索 题录检索 期刊检索 定题检索 基本检索规则 注册9.检索途径1.基本检索2.高级检索3.主题词检索4.题录检索5.期刊检索 evidence-ba

8、sed medicine,EBM文献10.例1:检索2008年至今有关肾衰(renal failure)诊断方面的文献。要求:英文、综述基本检索11.12.13.14.15.16.(renal insufficiencyMeSH Terms OR(renalAll Fields AND insufficiencyAll Fields)OR renal insufficiencyAll Fields OR(renalAll Fields AND failureAll Fields)OR renal failureAll Fields)AND(diagnosisSubheading OR diag

9、nosisAll Fields OR diagnosisMeSH Terms)AND(Reviewptyp AND Englishlang AND(2008PDAT:2011PDAT)17.18.19.20.21.22.发送频率23.24.25.26.27.28.29.30.31.高级检索例2:检索天津医科大学孙保存教授2001年以来发表的文献32.33.34.35.36.37.例3:通过主题词途径检索2008年至今有关肾衰(renal failure)方面的英文文献主题词检索38.39.急性肾损伤肾功能不全MeSH主题词倒置形式Kidney Failure,Chronic40.41.副主题词

10、主题词加权检索、不扩展检索选项例4:通过主题词途径检索2008年至今有关肾衰诊断方面的英文文献42.43.44.泌尿系疾病男性泌尿生殖系统疾病女性泌尿生殖系统疾病和妊娠并发症 女性泌尿生殖系统疾病肾小管坏死,急性慢性肾功能不全主题词下位主题词下位主题词主题词45.例5:通过主题词途径检索有关肾衰诊断方面的文献。要求:主题词加权检索46.47.只对主题词进行加权检索48.49.50.51.52.53.题录检索、期刊检索54.题录检索55.期刊检索56.57.58.59.60.基本检索规则作者姓名字段标识符Justau61.刊名字段标识符scienceta62.截词检索注意:检索词自动转换匹配功能

11、关闭63.词组检索注意:检索词自动转换匹配功能关闭64.检索式:common cold AND(vitamin c OR zinc)65.禁用词表66.注册67.68.二、循证医学文献的查找1.临床查询(Clinical Queries)(1)Clinical Study Categories(临床研究类文献)(2)Systematic Reviews(系统评价)(3)Medical Genetics(医学遗传学)2.MeSH:MeSH Clinical Queries3.Limits限定选项 4.直接以systematic review、Cochrane、meta-analysis、Rand

12、omized Controlled Trial等为关键词进行检索。5.Clinical Trials(http:/clinicaltrials.gov/)三、临床病例 69.二、循证医学文献的查找 1.临床查询(Clinical Queries)70.例:临床医生想检索心肌炎(myocarditis)诊断方面的文献,要求检索结果比较准确71.72.(1)Clinical Study Categories(临床研究类文献)73.74.75.76.(2)Systematic Reviews(系统评价)77.78.(3)Medical Genetics(医学遗传学)79.80.二、循证医学文献的查找

13、 2.MeSH:MeSH Clinical Queries81.82.83.84.二、循证医学文献的查找 3.Limits限定选项 85.86.87.88.89.90.91.二、循证医学文献的查找 4.直接以systematic review、Cochrane、meta-analysis、Randomized Controlled Trial等为关键词进行检索。92.93.94.二、循证医学文献的查找 5.Clinical Trials(http:/clinicaltrials.gov/)95.美国国立医学图书馆研制开发的临床试验数据库。收录了美国及世界170多个国家经注册登记的8万多条临床试

14、验的详细信息,是十分重要的循证医学信息资源。96.二、循证医学文献的查找 6.检索示例 检索阿司匹林(aspirin)治疗脑血管意外(cerebrovascular accident)的随机对照试验(randomized controlled trial)文献主题词检索97.98.99.100.101.102.103.104.检索式:cerebrovascular accident AND aspirin AND randomized controlled trial自由词检索105.106.107.108.109.110.111.112.主题词检索:主题词检索:Stroke/drug the

15、rapymh AND aspirin/tumh AND randomized controlled trialpt 81篇 自由词检索:自由词检索:cerebrovascular accident AND aspirin AND randomized controlled trial (strokeMeSH Terms OR strokeAll Fields OR(cerebrovascularAll Fields AND accidentAll Fields)OR cerebrovascular accidentAll Fields)AND(aspirinMeSH Terms OR aspi

16、rinAll Fields)AND(randomized controlled trialPublication Type OR randomized controlled trials as topicMeSH Terms OR randomized controlled trialAll Fields OR randomised controlled trialAll Fields)1113篇Clinical QueriesClinical Queries:Therapy/Narrowfilter AND(strokeMeSH Terms OR strokeAll Fields OR(cerebrovascularAll Fields AND accidentAll Fields)OR cerebrovascular accidentAll Fields)AND(aspirinMeSH Terms OR aspirinAll Fields)AND Randomized Controlled Trialptyp 643篇113.114.火狐浏览器115.

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